MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium gilvum Spyr1 plasmid pMSPYR102

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014812	CTGA	2	8	247	254	25 %	25 %	25 %	25 %	315441673
2	NC_014812	ACCT	2	8	445	452	25 %	25 %	0 %	50 %	315441673
3	NC_014812	AGCG	2	8	1248	1255	25 %	0 %	50 %	25 %	315441674
4	NC_014812	CGCC	2	8	2053	2060	0 %	0 %	25 %	75 %	315441674
5	NC_014812	ACCT	2	8	3610	3617	25 %	25 %	0 %	50 %	315441675
6	NC_014812	TCGA	2	8	3799	3806	25 %	25 %	25 %	25 %	315441675
7	NC_014812	CGGG	2	8	4206	4213	0 %	0 %	75 %	25 %	315441675
8	NC_014812	TGGT	2	8	4573	4580	0 %	50 %	50 %	0 %	315441675
9	NC_014812	CGCC	2	8	4595	4602	0 %	0 %	25 %	75 %	315441675
10	NC_014812	CGAC	2	8	5088	5095	25 %	0 %	25 %	50 %	315441675
11	NC_014812	CTAC	2	8	5481	5488	25 %	25 %	0 %	50 %	315441675
12	NC_014812	ACCA	2	8	5623	5630	50 %	0 %	0 %	50 %	315441675
13	NC_014812	ATGC	2	8	5779	5786	25 %	25 %	25 %	25 %	315441675
14	NC_014812	GCCG	2	8	6142	6149	0 %	0 %	50 %	50 %	315441676
15	NC_014812	GCCA	2	8	6238	6245	25 %	0 %	25 %	50 %	315441676
16	NC_014812	TAGA	2	8	6563	6570	50 %	25 %	25 %	0 %	315441677
17	NC_014812	CCGG	2	8	6683	6690	0 %	0 %	50 %	50 %	315441677
18	NC_014812	GGTG	2	8	6784	6791	0 %	25 %	75 %	0 %	315441677
19	NC_014812	GTCT	2	8	6864	6871	0 %	50 %	25 %	25 %	315441677
20	NC_014812	GCGG	2	8	7797	7804	0 %	0 %	75 %	25 %	315441677
21	NC_014812	GGTG	2	8	8153	8160	0 %	25 %	75 %	0 %	315441677
22	NC_014812	CGTC	2	8	8386	8393	0 %	25 %	25 %	50 %	315441677
23	NC_014812	GATT	2	8	8757	8764	25 %	50 %	25 %	0 %	315441677
24	NC_014812	CTGT	2	8	8770	8777	0 %	50 %	25 %	25 %	315441677
25	NC_014812	CCAG	2	8	8917	8924	25 %	0 %	25 %	50 %	315441677
26	NC_014812	GTCG	2	8	9754	9761	0 %	25 %	50 %	25 %	315441679
27	NC_014812	CGGG	3	12	9803	9814	0 %	0 %	75 %	25 %	315441679
28	NC_014812	TGCG	2	8	10333	10340	0 %	25 %	50 %	25 %	315441680
29	NC_014812	GCTG	2	8	10710	10717	0 %	25 %	50 %	25 %	315441680
30	NC_014812	TGGT	2	8	10792	10799	0 %	50 %	50 %	0 %	315441680
31	NC_014812	GTGG	2	8	11313	11320	0 %	25 %	75 %	0 %	315441681
32	NC_014812	CGGG	2	8	12147	12154	0 %	0 %	75 %	25 %	315441681
33	NC_014812	CGCC	2	8	12299	12306	0 %	0 %	25 %	75 %	315441681
34	NC_014812	CCAG	2	8	13290	13297	25 %	0 %	25 %	50 %	315441683
35	NC_014812	GACC	2	8	13800	13807	25 %	0 %	25 %	50 %	315441683
36	NC_014812	ACCG	2	8	14275	14282	25 %	0 %	25 %	50 %	315441683
37	NC_014812	ACCC	2	8	14857	14864	25 %	0 %	0 %	75 %	315441683
38	NC_014812	CCGC	2	8	15195	15202	0 %	0 %	25 %	75 %	315441683
39	NC_014812	CGGG	2	8	15405	15412	0 %	0 %	75 %	25 %	315441683
40	NC_014812	ACCA	2	8	15449	15456	50 %	0 %	0 %	50 %	315441683
41	NC_014812	CCCA	2	8	16187	16194	25 %	0 %	0 %	75 %	315441684
42	NC_014812	GCTT	3	12	16463	16474	0 %	50 %	25 %	25 %	315441685
43	NC_014812	GGCC	2	8	16590	16597	0 %	0 %	50 %	50 %	315441685
44	NC_014812	GGGC	2	8	16698	16705	0 %	0 %	75 %	25 %	315441685
45	NC_014812	GTCA	2	8	16807	16814	25 %	25 %	25 %	25 %	315441685
46	NC_014812	CCAG	2	8	17404	17411	25 %	0 %	25 %	50 %	315441686
47	NC_014812	ACCG	2	8	17445	17452	25 %	0 %	25 %	50 %	315441686
48	NC_014812	ATCG	2	8	17514	17521	25 %	25 %	25 %	25 %	315441686
49	NC_014812	CCGG	2	8	17626	17633	0 %	0 %	50 %	50 %	315441686
50	NC_014812	CTAT	2	8	17858	17865	25 %	50 %	0 %	25 %	315441686
51	NC_014812	CTAG	2	8	17879	17886	25 %	25 %	25 %	25 %	315441686
52	NC_014812	CAAC	2	8	19183	19190	50 %	0 %	0 %	50 %	315441689
53	NC_014812	CTCG	2	8	19435	19442	0 %	25 %	25 %	50 %	315441689
54	NC_014812	TCGG	2	8	20376	20383	0 %	25 %	50 %	25 %	315441690
55	NC_014812	ATGA	2	8	21020	21027	50 %	25 %	25 %	0 %	315441691
56	NC_014812	TGGT	2	8	21771	21778	0 %	50 %	50 %	0 %	315441693
57	NC_014812	GATC	2	8	21877	21884	25 %	25 %	25 %	25 %	315441693
58	NC_014812	GCCA	2	8	22311	22318	25 %	0 %	25 %	50 %	315441694
59	NC_014812	CTGC	2	8	22372	22379	0 %	25 %	25 %	50 %	315441694
60	NC_014812	ACGG	2	8	22388	22395	25 %	0 %	50 %	25 %	315441694
61	NC_014812	CGCC	2	8	23012	23019	0 %	0 %	25 %	75 %	315441695

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.