MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium gilvum Spyr1 plasmid pMSPYR102

Total Repeats: 345

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014812	GCA	2	6	303	308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441673
2	NC_014812	CGA	2	6	348	353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441673
3	NC_014812	TCG	2	6	404	409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441673
4	NC_014812	CAT	2	6	459	464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315441673
5	NC_014812	AGG	2	6	521	526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315441673
6	NC_014812	TCG	2	6	972	977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441674
7	NC_014812	CCT	2	6	1032	1037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315441674
8	NC_014812	CAC	2	6	1048	1053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315441674
9	NC_014812	CGG	2	6	1111	1116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441674
10	NC_014812	TCG	2	6	1134	1139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441674
11	NC_014812	CCA	2	6	1197	1202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315441674
12	NC_014812	GCC	2	6	1217	1222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441674
13	NC_014812	GCC	2	6	1302	1307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441674
14	NC_014812	AGT	2	6	1408	1413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315441674
15	NC_014812	ACC	3	9	1451	1459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315441674
16	NC_014812	TAC	2	6	1483	1488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315441674
17	NC_014812	CAC	2	6	1511	1516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315441674
18	NC_014812	CCG	2	6	1592	1597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441674
19	NC_014812	CGG	2	6	1647	1652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441674
20	NC_014812	CCG	2	6	1653	1658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441674
21	NC_014812	CGG	2	6	1668	1673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441674
22	NC_014812	TGG	2	6	1686	1691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315441674
23	NC_014812	CTG	2	6	1748	1753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441674
24	NC_014812	GCT	2	6	1759	1764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441674
25	NC_014812	CGC	2	6	1804	1809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441674
26	NC_014812	CGA	2	6	1813	1818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441674
27	NC_014812	GCC	2	6	1865	1870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441674
28	NC_014812	CCG	2	6	1879	1884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441674
29	NC_014812	GCC	3	9	1916	1924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441674
30	NC_014812	CGG	2	6	1998	2003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441674
31	NC_014812	CCG	3	9	2004	2012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441674
32	NC_014812	CGA	2	6	2026	2031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441674
33	NC_014812	GCG	2	6	2061	2066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441674
34	NC_014812	GAC	2	6	2069	2074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441674
35	NC_014812	CTA	2	6	3219	3224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315441675
36	NC_014812	GCC	2	6	3271	3276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441675
37	NC_014812	TAC	2	6	3295	3300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315441675
38	NC_014812	CGG	2	6	3393	3398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441675
39	NC_014812	GCG	2	6	3418	3423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441675
40	NC_014812	CGC	2	6	3510	3515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441675
41	NC_014812	GCT	2	6	3531	3536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441675
42	NC_014812	GGC	2	6	3600	3605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441675
43	NC_014812	TGG	2	6	3692	3697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315441675
44	NC_014812	ATC	2	6	3844	3849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315441675
45	NC_014812	CGA	2	6	3909	3914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441675
46	NC_014812	GCA	2	6	3953	3958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441675
47	NC_014812	TCG	4	12	4013	4024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441675
48	NC_014812	CCG	2	6	4037	4042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441675
49	NC_014812	AGC	2	6	4088	4093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441675
50	NC_014812	CGC	2	6	4167	4172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441675
51	NC_014812	GCG	2	6	4249	4254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441675
52	NC_014812	GTC	2	6	4270	4275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441675
53	NC_014812	ACG	2	6	4301	4306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441675
54	NC_014812	CGC	2	6	4353	4358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441675
55	NC_014812	AGG	2	6	4442	4447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315441675
56	NC_014812	CGC	2	6	4464	4469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441675
57	NC_014812	CGC	3	9	4638	4646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441675
58	NC_014812	CGG	2	6	4691	4696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441675
59	NC_014812	GTG	2	6	4798	4803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315441675
60	NC_014812	GTC	2	6	4804	4809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441675
61	NC_014812	TGG	2	6	4823	4828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315441675
62	NC_014812	GCT	2	6	4848	4853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441675
63	NC_014812	TCG	2	6	4889	4894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441675
64	NC_014812	CGG	2	6	4929	4934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441675
65	NC_014812	CCG	2	6	5058	5063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441675
66	NC_014812	GCC	4	12	5122	5133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441675
67	NC_014812	CGC	2	6	5157	5162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441675
68	NC_014812	CTG	2	6	5176	5181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441675
69	NC_014812	CAC	2	6	5238	5243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315441675
70	NC_014812	CAT	2	6	5295	5300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315441675
71	NC_014812	CCA	2	6	5321	5326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315441675
72	NC_014812	CAC	2	6	5347	5352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315441675
73	NC_014812	CGA	2	6	5412	5417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441675
74	NC_014812	ACC	2	6	5419	5424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315441675
75	NC_014812	GCT	2	6	5434	5439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441675
76	NC_014812	GCC	2	6	5615	5620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441675
77	NC_014812	CGG	2	6	5652	5657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441675
78	NC_014812	GAT	2	6	5745	5750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315441675
79	NC_014812	CGC	2	6	5857	5862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441675
80	NC_014812	GCC	2	6	5875	5880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441675
81	NC_014812	CCA	2	6	5913	5918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315441675
82	NC_014812	GCA	2	6	5951	5956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441675
83	NC_014812	TCA	2	6	6161	6166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315441676
84	NC_014812	CGG	2	6	6185	6190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441676
85	NC_014812	CGC	2	6	6222	6227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441676
86	NC_014812	GCC	2	6	6267	6272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441676
87	NC_014812	TCG	2	6	6283	6288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441676
88	NC_014812	GGT	2	6	6309	6314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315441676
89	NC_014812	CGG	2	6	6332	6337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441676
90	NC_014812	GGC	2	6	6432	6437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441676
91	NC_014812	CAG	3	9	6608	6616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441677
92	NC_014812	TGC	2	6	6639	6644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441677
93	NC_014812	ACG	3	9	6655	6663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441677
94	NC_014812	GCA	2	6	6802	6807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441677
95	NC_014812	GCG	2	6	6808	6813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441677
96	NC_014812	GGC	2	6	6929	6934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441677
97	NC_014812	GCG	2	6	6976	6981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441677
98	NC_014812	ACG	2	6	6987	6992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441677
99	NC_014812	GGT	2	6	7013	7018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315441677
100	NC_014812	CGG	2	6	7051	7056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441677
101	NC_014812	GCC	2	6	7076	7081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441677
102	NC_014812	CCA	2	6	7153	7158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315441677
103	NC_014812	ACG	2	6	7190	7195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441677
104	NC_014812	CAC	2	6	7295	7300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315441677
105	NC_014812	TCA	2	6	7372	7377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315441677
106	NC_014812	CTC	2	6	7379	7384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315441677
107	NC_014812	CAG	2	6	7406	7411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441677
108	NC_014812	CGC	2	6	7439	7444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441677
109	NC_014812	GCC	2	6	7455	7460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441677
110	NC_014812	ACC	2	6	7479	7484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315441677
111	NC_014812	CGA	2	6	7520	7525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441677
112	NC_014812	GCC	3	9	7554	7562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441677
113	NC_014812	CGG	2	6	7604	7609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441677
114	NC_014812	CAT	2	6	7640	7645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315441677
115	NC_014812	GGC	2	6	7695	7700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441677
116	NC_014812	CCG	2	6	7719	7724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441677
117	NC_014812	GGC	3	9	7815	7823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441677
118	NC_014812	ACC	3	9	7832	7840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315441677
119	NC_014812	AGG	2	6	7877	7882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315441677
120	NC_014812	CGC	2	6	7898	7903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441677
121	NC_014812	CGC	2	6	7922	7927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441677
122	NC_014812	CGA	2	6	7931	7936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441677
123	NC_014812	CGC	2	6	7943	7948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441677
124	NC_014812	CCA	2	6	7959	7964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315441677
125	NC_014812	CAC	2	6	7981	7986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315441677
126	NC_014812	CCG	3	9	8043	8051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441677
127	NC_014812	CCG	2	6	8079	8084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441677
128	NC_014812	CCG	2	6	8086	8091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441677
129	NC_014812	CGC	2	6	8260	8265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441677
130	NC_014812	GTG	2	6	8314	8319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315441677
131	NC_014812	GCG	2	6	8362	8367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441677
132	NC_014812	CCG	2	6	8397	8402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441677
133	NC_014812	TTG	2	6	8417	8422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315441677
134	NC_014812	CGC	2	6	8449	8454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441677
135	NC_014812	GGC	2	6	8489	8494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441677
136	NC_014812	CGG	4	12	8542	8553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441677
137	NC_014812	TGA	2	6	8557	8562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315441677
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139	NC_014812	CGC	2	6	8591	8596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441677
140	NC_014812	GAT	2	6	8613	8618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315441677
141	NC_014812	GCT	2	6	8619	8624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441677
142	NC_014812	TTG	2	6	8633	8638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315441677
143	NC_014812	TTC	2	6	8654	8659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315441677
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251	NC_014812	CCA	3	9	15081	15089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315441683
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253	NC_014812	CCG	2	6	15135	15140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441683
254	NC_014812	CCG	2	6	15240	15245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441683
255	NC_014812	ACA	2	6	15246	15251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315441683
256	NC_014812	TCG	2	6	15350	15355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441683
257	NC_014812	CCT	2	6	15360	15365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315441683
258	NC_014812	ACC	2	6	15416	15421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315441683
259	NC_014812	CAG	2	6	15435	15440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441683
260	NC_014812	AGA	2	6	15509	15514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315441683
261	NC_014812	CGC	2	6	15694	15699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441684
262	NC_014812	CGA	2	6	15718	15723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441684
263	NC_014812	CCG	2	6	15843	15848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441684
264	NC_014812	CCG	2	6	15987	15992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441684
265	NC_014812	CAC	2	6	16141	16146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315441684
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270	NC_014812	CAG	2	6	16383	16388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441685
271	NC_014812	CGG	2	6	16555	16560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441685
272	NC_014812	ATC	2	6	16580	16585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315441685
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274	NC_014812	GAC	2	6	16930	16935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441685
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276	NC_014812	CAA	2	6	17317	17322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315441686
277	NC_014812	GGC	2	6	17462	17467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441686
278	NC_014812	TGC	2	6	17470	17475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441686
279	NC_014812	GTG	3	9	17499	17507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315441686
280	NC_014812	GCC	2	6	17697	17702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441686
281	NC_014812	AGC	2	6	17773	17778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441686
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283	NC_014812	GTG	2	6	18150	18155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315441687
284	NC_014812	ACC	2	6	18461	18466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315441688
285	NC_014812	CGT	2	6	18676	18681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441688
286	NC_014812	GGC	2	6	18686	18691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	315441688
287	NC_014812	GGA	2	6	18745	18750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315441688
288	NC_014812	CAC	2	6	18763	18768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315441688
289	NC_014812	AGC	2	6	18792	18797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441688
290	NC_014812	GAC	2	6	18903	18908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441689
291	NC_014812	CGC	2	6	18968	18973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441689
292	NC_014812	CGC	2	6	19002	19007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441689
293	NC_014812	CGT	2	6	19038	19043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441689
294	NC_014812	CTG	2	6	19125	19130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441689
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322	NC_014812	CCG	2	6	21151	21156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315441692
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344	NC_014812	TGG	2	6	23039	23044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315441695
345	NC_014812	ACC	2	6	23055	23060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315441695

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.