MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium gilvum Spyr1 plasmid pMSPYR101

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014811	ACACCC	2	12	3948	3959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315441478
2	NC_014811	ACACGC	2	12	8407	8418	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	315441483
3	NC_014811	GCACAG	2	12	8527	8538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441483
4	NC_014811	GTCATG	2	12	12277	12288	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	315441486
5	NC_014811	CGTGCT	2	12	13626	13637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441487
6	NC_014811	CCGCCA	2	12	19033	19044	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	315441494
7	NC_014811	CCGGCG	2	12	19158	19169	0 %	0 %	50 %	50 %	315441494
8	NC_014811	GTCGCG	2	12	19956	19967	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	315441495
9	NC_014811	GGTCGA	2	12	20240	20251	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	315441496
10	NC_014811	GCGATC	2	12	21526	21537	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	315441498
11	NC_014811	GCCGAC	2	12	21825	21836	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315441498
12	NC_014811	GCGAGC	2	12	21856	21867	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	315441498
13	NC_014811	TGCGGC	2	12	22504	22515	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	315441500
14	NC_014811	AGGTGA	2	12	27476	27487	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	315441505
15	NC_014811	CGGCGA	2	12	28397	28408	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	315441506
16	NC_014811	GGGTGC	2	12	30188	30199	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	315441508
17	NC_014811	GCGCTG	2	12	34719	34730	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	315441511
18	NC_014811	TGCCGG	2	12	38268	38279	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	315441513
19	NC_014811	GGCGAA	2	12	42136	42147	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	315441517
20	NC_014811	GCTGGT	2	12	43996	44007	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	315441518
21	NC_014811	CACCGC	2	12	44335	44346	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	315441518
22	NC_014811	CGCCAG	2	12	45126	45137	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315441519
23	NC_014811	GATCAG	2	12	45165	45176	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	315441519
24	NC_014811	CGTAGC	2	12	45656	45667	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	315441519
25	NC_014811	TCGCGG	2	12	48898	48909	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	315441523
26	NC_014811	CGGCGA	2	12	48980	48991	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	315441523
27	NC_014811	CCGGTG	2	12	50556	50567	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	315441525
28	NC_014811	GACCAG	2	12	58154	58165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441529
29	NC_014811	GGTGCG	2	12	60027	60038	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	315441530
30	NC_014811	CATTCT	2	12	63360	63371	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	315441532
31	NC_014811	GTGGCC	2	12	67383	67394	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	315441535
32	NC_014811	CCACCG	2	12	69094	69105	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	315441536
33	NC_014811	CGGTGG	2	12	72132	72143	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	315441537
34	NC_014811	CCGACG	2	12	76906	76917	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315441541
35	NC_014811	TTGGAC	2	12	79635	79646	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	315441543
36	NC_014811	CTCGGG	2	12	85070	85081	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	315441548
37	NC_014811	GGCCAC	2	12	85325	85336	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315441548
38	NC_014811	CGATGG	2	12	87993	88004	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	315441550
39	NC_014811	CACCTG	2	12	97844	97855	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	315441564
40	NC_014811	GTGATC	2	12	103524	103535	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	315441572
41	NC_014811	GCCGTC	2	12	105245	105256	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	315441573
42	NC_014811	AGTGGG	2	12	107673	107684	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	315441575
43	NC_014811	GGCGTC	2	12	110755	110766	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	315441579
44	NC_014811	CAGCGC	2	12	112566	112577	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315441580
45	NC_014811	CAAGGC	2	12	117390	117401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441583
46	NC_014811	ACGTGC	2	12	118928	118939	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	315441585
47	NC_014811	GCGGCC	2	12	119305	119316	0 %	0 %	50 %	50 %	315441585
48	NC_014811	GCAATG	2	12	120372	120383	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	315441585
49	NC_014811	CGATCC	2	12	123573	123584	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	315441589
50	NC_014811	TCACCG	2	12	123807	123818	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	315441589
51	NC_014811	CGGCGA	2	12	126200	126211	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	315441590
52	NC_014811	CGCGGC	2	12	127601	127612	0 %	0 %	50 %	50 %	315441590
53	NC_014811	TGCGGG	2	12	127639	127650	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	315441590
54	NC_014811	CGACAT	2	12	128959	128970	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	315441592
55	NC_014811	GCTGTT	2	12	131069	131080	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	315441593
56	NC_014811	CAGCGC	2	12	138654	138665	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315441597
57	NC_014811	GCATTC	2	12	142438	142449	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	315441599
58	NC_014811	ATGGGC	2	12	143124	143135	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	315441599
59	NC_014811	CCGACG	2	12	144606	144617	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315441601
60	NC_014811	TTCGGC	2	12	152040	152051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315441605
61	NC_014811	CGAGCA	2	12	153182	153193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315441605
62	NC_014811	TCCAGA	2	12	153700	153711	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	315441605
63	NC_014811	TCGGCG	2	12	156774	156785	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	315441608
64	NC_014811	CCGCAC	2	12	157755	157766	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	315441609
65	NC_014811	CGACGG	2	12	159771	159782	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	315441611
66	NC_014811	CGGGGG	2	12	159783	159794	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	315441611
67	NC_014811	CCGCAC	2	12	163785	163796	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	315441616
68	NC_014811	GGTCGG	2	12	166335	166346	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	315441619
69	NC_014811	CCGCAC	2	12	167903	167914	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	315441622
70	NC_014811	GGCCAG	2	12	168806	168817	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	315441623
71	NC_014811	TGCGGG	2	12	171233	171244	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	315441626
72	NC_014811	GACGGC	3	18	173982	173999	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	315441629
73	NC_014811	CCAGCG	2	12	176879	176890	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315441634
74	NC_014811	ATGGTG	2	12	178309	178320	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	315441634
75	NC_014811	CGTCGA	2	12	179017	179028	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	315441635
76	NC_014811	TGATGG	2	12	186078	186089	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	315441641
77	NC_014811	GTCGCG	2	12	187293	187304	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	315441642
78	NC_014811	GGCCGC	2	12	187343	187354	0 %	0 %	50 %	50 %	315441642
79	NC_014811	ACCGGC	2	12	190123	190134	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315441646
80	NC_014811	ACTGGG	2	12	190513	190524	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	315441647
81	NC_014811	CGATCC	2	12	192316	192327	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	315441649
82	NC_014811	AACTCG	2	12	192594	192605	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	315441649
83	NC_014811	GAGGCC	2	12	192788	192799	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	315441649
84	NC_014811	ATCACC	2	12	192974	192985	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	315441649
85	NC_014811	ACCCCC	2	12	193088	193099	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	315441649
86	NC_014811	CGCCGA	2	12	194372	194383	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315441651
87	NC_014811	TCGGTG	3	18	199856	199873	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	315441658
88	NC_014811	ACCCGC	2	12	204762	204773	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	315441663
89	NC_014811	GAGGTC	2	12	205038	205049	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	315441663
90	NC_014811	CACCGA	2	12	206365	206376	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	315441664
91	NC_014811	GCGACG	2	12	209386	209397	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	315441668

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.