MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium gilvum Spyr1 plasmid pMSPYR101

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014811	ACGGG	2	10	4038	4047	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014811	CGGCG	2	10	9085	9094	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3	NC_014811	GCCGC	2	10	9155	9164	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4	NC_014811	CGAGC	2	10	15221	15230	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_014811	CGCGG	2	10	34287	34296	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6	NC_014811	GTGCG	2	10	36356	36365	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_014811	GACAG	2	10	36763	36772	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014811	TGACC	2	10	49252	49261	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_014811	AACTC	2	10	54810	54819	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_014811	CGGAC	2	10	54952	54961	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_014811	CGGGT	2	10	55771	55780	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_014811	AGCGC	2	10	59234	59243	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_014811	CGATC	2	10	60776	60785	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_014811	GTGGC	2	10	60815	60824	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_014811	CCCGT	2	10	60903	60912	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_014811	GCGCT	2	10	61359	61368	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_014811	CACGC	2	10	62370	62379	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
18	NC_014811	GACGC	2	10	65427	65436	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_014811	ATCGG	2	10	65525	65534	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_014811	GGCGT	2	10	66259	66268	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014811	ATTGC	2	10	69700	69709	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014811	GCGCC	2	10	69911	69920	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
23	NC_014811	CACAA	2	10	70605	70614	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_014811	CCCAT	2	10	70979	70988	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
25	NC_014811	GTACG	2	10	72388	72397	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014811	ACGTG	2	10	76480	76489	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014811	GGCGA	2	10	79126	79135	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
28	NC_014811	GGGAC	2	10	79312	79321	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014811	ATGGG	2	10	85618	85627	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014811	GCACG	2	10	93314	93323	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_014811	GGCGG	2	10	108598	108607	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
32	NC_014811	TCTCC	2	10	108951	108960	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
33	NC_014811	TTCGA	2	10	110097	110106	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_014811	GCCAC	2	10	110234	110243	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
35	NC_014811	TGCTG	2	10	111298	111307	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_014811	GAAAC	2	10	113670	113679	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_014811	GCGTG	2	10	113831	113840	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
38	NC_014811	CGGCC	2	10	117997	118006	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
39	NC_014811	GCGCG	2	10	122013	122022	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
40	NC_014811	CCGAG	2	10	123013	123022	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_014811	CGATG	2	10	130151	130160	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_014811	TGCTG	2	10	137386	137395	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014811	GATCC	2	10	140679	140688	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_014811	GTTGT	2	10	141216	141225	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014811	GCGTT	2	10	141639	141648	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_014811	GCGGT	2	10	141691	141700	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
47	NC_014811	CGGTG	2	10	146692	146701	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
48	NC_014811	CGGCG	2	10	149261	149270	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
49	NC_014811	CGGCG	2	10	151121	151130	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
50	NC_014811	AGCGG	2	10	154803	154812	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
51	NC_014811	ACACC	2	10	159285	159294	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
52	NC_014811	ACACC	2	10	160616	160625	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
53	NC_014811	ACCCA	2	10	165261	165270	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
54	NC_014811	GCCGG	2	10	165374	165383	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
55	NC_014811	ACCCA	2	10	165893	165902	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
56	NC_014811	GGCCC	2	10	166923	166932	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
57	NC_014811	ACCCA	2	10	169456	169465	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
58	NC_014811	GTGGG	2	10	170305	170314	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014811	GGGAG	2	10	171140	171149	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014811	ACCGC	2	10	172118	172127	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
61	NC_014811	GGTGT	2	10	172131	172140	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014811	CGCAG	2	10	179958	179967	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NC_014811	GCGGA	2	10	179986	179995	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
64	NC_014811	CGCAG	2	10	181676	181685	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
65	NC_014811	GCGGA	2	10	181704	181713	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014811	GCGCC	2	10	181866	181875	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
67	NC_014811	GCAAG	2	10	194984	194993	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_014811	CCCTT	2	10	208630	208639	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.