MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium gilvum Spyr1 plasmid pMSPYR101

Total Repeats: 189

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014811	CGGC	2	8	163	170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014811	ATGA	2	8	4282	4289	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014811	TCCG	2	8	6182	6189	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014811	CTGC	2	8	8857	8864	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014811	CGTA	2	8	8995	9002	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014811	GCAG	2	8	10008	10015	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014811	CGCC	2	8	13853	13860	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8	NC_014811	ACTG	2	8	15452	15459	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014811	GATG	2	8	19365	19372	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014811	CATC	2	8	22050	22057	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_014811	GATC	2	8	24504	24511	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014811	CAGA	2	8	24695	24702	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014811	GAAG	2	8	32746	32753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014811	GCCG	2	8	32937	32944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_014811	GGCA	2	8	34341	34348	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014811	TTGG	2	8	34407	34414	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014811	ATCA	2	8	34476	34483	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014811	CCCA	2	8	35978	35985	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_014811	TACG	2	8	36318	36325	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014811	ACGT	2	8	36392	36399	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014811	ATGA	2	8	36594	36601	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014811	GGCC	2	8	37520	37527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014811	GCAG	2	8	37533	37540	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014811	CCGG	2	8	39227	39234	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014811	ACGC	2	8	39285	39292	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014811	GACG	2	8	40754	40761	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014811	CCCA	2	8	40788	40795	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
28	NC_014811	CGTC	2	8	44635	44642	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014811	GGCT	2	8	44699	44706	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014811	CTTG	2	8	47215	47222	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014811	GCAG	2	8	49546	49553	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014811	GGCC	2	8	49786	49793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014811	TGGG	2	8	52213	52220	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014811	GATG	2	8	52226	52233	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014811	GTCA	2	8	54361	54368	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014811	TGAT	2	8	54680	54687	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014811	CTGC	2	8	54763	54770	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014811	GTGC	2	8	55163	55170	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014811	TCGA	2	8	55294	55301	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014811	GTCG	2	8	55834	55841	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014811	CCCA	2	8	57408	57415	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
42	NC_014811	TATG	2	8	59461	59468	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014811	GCTT	2	8	61428	61435	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014811	CGCT	2	8	61774	61781	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_014811	CCGG	2	8	61921	61928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_014811	CACC	2	8	62288	62295	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
47	NC_014811	GCCT	2	8	62586	62593	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014811	CACC	2	8	62622	62629	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
49	NC_014811	GGCG	2	8	65556	65563	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014811	GATA	2	8	65659	65666	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014811	CACC	2	8	65945	65952	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
52	NC_014811	ACGG	2	8	66038	66045	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014811	GGCA	2	8	66137	66144	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_014811	TGGG	2	8	66387	66394	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014811	CCCA	2	8	70393	70400	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
56	NC_014811	AAGA	2	8	70697	70704	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014811	CGTG	2	8	70781	70788	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_014811	CGCC	2	8	70950	70957	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
59	NC_014811	GCTG	2	8	70970	70977	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_014811	GTAC	2	8	72431	72438	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_014811	GGCG	2	8	72549	72556	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014811	TGCT	2	8	72620	72627	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014811	TCCA	2	8	72658	72665	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014811	CGTA	2	8	76135	76142	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_014811	CATC	2	8	76371	76378	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_014811	ATGT	2	8	78046	78053	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014811	CGAC	2	8	78300	78307	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_014811	CGCC	2	8	81637	81644	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
69	NC_014811	GGAA	2	8	81690	81697	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014811	CTGG	2	8	85665	85672	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_014811	GCGG	2	8	85741	85748	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014811	CGGC	2	8	88904	88911	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_014811	CGTC	2	8	88912	88919	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014811	CCAG	2	8	88946	88953	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014811	GTAC	2	8	88968	88975	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014811	CCAC	2	8	89334	89341	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
77	NC_014811	TAGT	2	8	91979	91986	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014811	AGGG	2	8	93301	93308	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014811	ACCC	2	8	98003	98010	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
80	NC_014811	GACG	2	8	98033	98040	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_014811	GGCT	2	8	98229	98236	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_014811	TGCC	2	8	100198	100205	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_014811	ACGG	2	8	102060	102067	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_014811	CTGG	2	8	103378	103385	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_014811	GACC	2	8	105393	105400	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_014811	CGGT	2	8	105420	105427	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_014811	GCGT	2	8	107891	107898	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_014811	TCGC	2	8	108744	108751	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014811	GACG	2	8	108756	108763	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_014811	CGCC	2	8	109606	109613	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
91	NC_014811	GGTG	2	8	111309	111316	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014811	TGAT	2	8	112813	112820	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014811	ACCA	2	8	112881	112888	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_014811	CGCC	2	8	113096	113103	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
95	NC_014811	CGCC	2	8	113221	113228	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
96	NC_014811	GGCT	2	8	113248	113255	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_014811	TGCG	2	8	113706	113713	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_014811	AATG	2	8	114018	114025	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014811	GGGC	2	8	114045	114052	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
100	NC_014811	CGTA	2	8	115742	115749	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_014811	CCAC	2	8	116095	116102	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
102	NC_014811	GACC	2	8	116766	116773	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_014811	GTGC	2	8	116868	116875	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_014811	ACGT	2	8	116926	116933	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_014811	CGCA	2	8	118736	118743	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_014811	TACG	2	8	121358	121365	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_014811	TGGC	2	8	122108	122115	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_014811	GGCT	2	8	130189	130196	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_014811	GCCA	2	8	135997	136004	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_014811	CCGG	2	8	136359	136366	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_014811	CGCC	2	8	136733	136740	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
112	NC_014811	ATCA	2	8	136749	136756	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_014811	CCGC	2	8	136844	136851	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
114	NC_014811	GCGG	2	8	137195	137202	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
115	NC_014811	GGTG	2	8	137397	137404	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014811	TGAT	2	8	138901	138908	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014811	ACCA	2	8	138969	138976	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_014811	AGCC	2	8	139142	139149	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_014811	CGGT	2	8	139719	139726	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_014811	ACCC	2	8	139737	139744	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
121	NC_014811	CCGA	2	8	140651	140658	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_014811	GCCG	2	8	140743	140750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_014811	ATCG	2	8	140773	140780	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_014811	CGGC	2	8	140964	140971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_014811	CTGG	2	8	141075	141082	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_014811	TACC	2	8	144556	144563	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_014811	GGTC	2	8	146724	146731	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_014811	CGTC	2	8	147489	147496	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_014811	CCGA	2	8	147828	147835	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_014811	TAGT	2	8	147985	147992	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014811	TGTA	2	8	148855	148862	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014811	GTCG	2	8	148934	148941	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_014811	ATCG	2	8	149461	149468	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014811	GCCA	2	8	149791	149798	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_014811	GGTG	2	8	150099	150106	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014811	GGCT	2	8	151615	151622	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_014811	TAGG	2	8	154795	154802	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014811	GGGC	2	8	154875	154882	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
139	NC_014811	TGGC	2	8	155055	155062	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_014811	CTGT	2	8	156636	156643	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_014811	GGGT	2	8	157128	157135	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014811	GCCT	2	8	157198	157205	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_014811	CGGT	2	8	158574	158581	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_014811	CGGT	2	8	158641	158648	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_014811	CGCC	2	8	159223	159230	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
146	NC_014811	CCGG	2	8	159322	159329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_014811	CGCC	2	8	160554	160561	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
148	NC_014811	CCGG	2	8	160653	160660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_014811	CGCC	2	8	161716	161723	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
150	NC_014811	CGCC	2	8	162430	162437	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
151	NC_014811	CGGG	2	8	162536	162543	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
152	NC_014811	GGGT	2	8	163158	163165	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014811	GCCT	2	8	163228	163235	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
154	NC_014811	CGCC	2	8	165271	165278	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
155	NC_014811	CGCC	2	8	165903	165910	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
156	NC_014811	GGGT	2	8	167276	167283	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
157	NC_014811	GCCT	2	8	167346	167353	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
158	NC_014811	GTGG	2	8	168692	168699	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
159	NC_014811	CGGA	2	8	169300	169307	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
160	NC_014811	CGCC	2	8	169466	169473	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
161	NC_014811	CGGC	2	8	169534	169541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
162	NC_014811	GGGT	2	8	170601	170608	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
163	NC_014811	CGCC	2	8	172053	172060	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
164	NC_014811	CGCC	2	8	173334	173341	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
165	NC_014811	TGGC	2	8	173411	173418	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
166	NC_014811	GAGC	2	8	174186	174193	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
167	NC_014811	CGGA	2	8	176383	176390	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
168	NC_014811	GAAA	2	8	178458	178465	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
169	NC_014811	GGTC	2	8	178641	178648	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
170	NC_014811	GGGC	2	8	178730	178737	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
171	NC_014811	CGGG	2	8	179891	179898	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
172	NC_014811	CCCG	2	8	181540	181547	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
173	NC_014811	CGGG	2	8	181609	181616	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
174	NC_014811	GCGT	2	8	181768	181775	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
175	NC_014811	GAAT	2	8	183333	183340	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
176	NC_014811	CTAG	2	8	190734	190741	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
177	NC_014811	CGGC	2	8	191705	191712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
178	NC_014811	ACGC	2	8	191722	191729	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
179	NC_014811	GGAA	2	8	194183	194190	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
180	NC_014811	CCAT	2	8	194572	194579	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
181	NC_014811	CGTG	2	8	194659	194666	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
182	NC_014811	CAGT	2	8	194689	194696	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
183	NC_014811	TCGG	2	8	195587	195594	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
184	NC_014811	AGCC	2	8	197795	197802	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
185	NC_014811	TCAC	2	8	198556	198563	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
186	NC_014811	GGCC	2	8	200895	200902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
187	NC_014811	TTCA	2	8	200946	200953	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
188	NC_014811	AGCC	2	8	208526	208533	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
189	NC_014811	GGCT	2	8	211733	211740	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.