MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Mycobacterium gilvum Spyr1 plasmid pMSPYR101

Total Repeats: 441

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014811	GC	3	6	746	751	0 %	0 %	50 %	50 %	315441476
2	NC_014811	CG	3	6	1322	1327	0 %	0 %	50 %	50 %	315441476
3	NC_014811	GC	3	6	1851	1856	0 %	0 %	50 %	50 %	315441476
4	NC_014811	GT	3	6	1967	1972	0 %	50 %	50 %	0 %	315441476
5	NC_014811	GC	4	8	2149	2156	0 %	0 %	50 %	50 %	315441476
6	NC_014811	CG	3	6	2885	2890	0 %	0 %	50 %	50 %	315441478
7	NC_014811	TG	3	6	3006	3011	0 %	50 %	50 %	0 %	315441478
8	NC_014811	CG	3	6	3444	3449	0 %	0 %	50 %	50 %	315441478
9	NC_014811	CG	3	6	3804	3809	0 %	0 %	50 %	50 %	315441478
10	NC_014811	GC	3	6	4656	4661	0 %	0 %	50 %	50 %	315441479
11	NC_014811	GC	3	6	4749	4754	0 %	0 %	50 %	50 %	315441479
12	NC_014811	GC	3	6	4806	4811	0 %	0 %	50 %	50 %	315441479
13	NC_014811	GC	3	6	5200	5205	0 %	0 %	50 %	50 %	315441479
14	NC_014811	GC	4	8	5688	5695	0 %	0 %	50 %	50 %	315441480
15	NC_014811	GT	3	6	5832	5837	0 %	50 %	50 %	0 %	315441480
16	NC_014811	AC	3	6	6074	6079	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014811	CG	3	6	7069	7074	0 %	0 %	50 %	50 %	315441482
18	NC_014811	AC	3	6	7135	7140	50 %	0 %	0 %	50 %	315441482
19	NC_014811	GC	3	6	7700	7705	0 %	0 %	50 %	50 %	315441482
20	NC_014811	GC	3	6	7781	7786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014811	GC	3	6	7800	7805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_014811	CG	3	6	7810	7815	0 %	0 %	50 %	50 %	315441483
23	NC_014811	CG	4	8	7852	7859	0 %	0 %	50 %	50 %	315441483
24	NC_014811	AC	3	6	7947	7952	50 %	0 %	0 %	50 %	315441483
25	NC_014811	GC	3	6	8687	8692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014811	CG	3	6	8754	8759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014811	CG	3	6	9110	9115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014811	CG	3	6	9599	9604	0 %	0 %	50 %	50 %	315441484
29	NC_014811	CG	3	6	9621	9626	0 %	0 %	50 %	50 %	315441484
30	NC_014811	TG	3	6	10020	10025	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014811	GC	3	6	10129	10134	0 %	0 %	50 %	50 %	315441485
32	NC_014811	CG	3	6	10150	10155	0 %	0 %	50 %	50 %	315441485
33	NC_014811	GC	3	6	10567	10572	0 %	0 %	50 %	50 %	315441486
34	NC_014811	CA	3	6	11065	11070	50 %	0 %	0 %	50 %	315441486
35	NC_014811	GC	3	6	11493	11498	0 %	0 %	50 %	50 %	315441486
36	NC_014811	GC	3	6	12025	12030	0 %	0 %	50 %	50 %	315441486
37	NC_014811	GT	3	6	12252	12257	0 %	50 %	50 %	0 %	315441486
38	NC_014811	GC	3	6	12347	12352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014811	GT	3	6	12731	12736	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014811	GC	3	6	12863	12868	0 %	0 %	50 %	50 %	315441487
41	NC_014811	GC	3	6	13065	13070	0 %	0 %	50 %	50 %	315441487
42	NC_014811	GC	3	6	13257	13262	0 %	0 %	50 %	50 %	315441487
43	NC_014811	TG	3	6	13934	13939	0 %	50 %	50 %	0 %	315441488
44	NC_014811	GC	3	6	13992	13997	0 %	0 %	50 %	50 %	315441488
45	NC_014811	TC	3	6	14147	14152	0 %	50 %	0 %	50 %	315441488
46	NC_014811	TG	3	6	14408	14413	0 %	50 %	50 %	0 %	315441488
47	NC_014811	GC	3	6	14784	14789	0 %	0 %	50 %	50 %	315441488
48	NC_014811	GT	3	6	15385	15390	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014811	GC	3	6	15734	15739	0 %	0 %	50 %	50 %	315441489
50	NC_014811	GA	3	6	16696	16701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014811	TC	3	6	16891	16896	0 %	50 %	0 %	50 %	315441491
52	NC_014811	CG	3	6	17501	17506	0 %	0 %	50 %	50 %	315441491
53	NC_014811	GT	3	6	17579	17584	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014811	CG	3	6	17887	17892	0 %	0 %	50 %	50 %	315441492
55	NC_014811	AC	3	6	18934	18939	50 %	0 %	0 %	50 %	315441494
56	NC_014811	TG	3	6	19436	19441	0 %	50 %	50 %	0 %	315441495
57	NC_014811	CG	3	6	19707	19712	0 %	0 %	50 %	50 %	315441495
58	NC_014811	CG	3	6	19818	19823	0 %	0 %	50 %	50 %	315441495
59	NC_014811	GC	3	6	20040	20045	0 %	0 %	50 %	50 %	315441495
60	NC_014811	GC	3	6	20100	20105	0 %	0 %	50 %	50 %	315441496
61	NC_014811	GT	3	6	20892	20897	0 %	50 %	50 %	0 %	315441497
62	NC_014811	GC	3	6	21102	21107	0 %	0 %	50 %	50 %	315441497
63	NC_014811	CG	3	6	21267	21272	0 %	0 %	50 %	50 %	315441497
64	NC_014811	GC	3	6	22578	22583	0 %	0 %	50 %	50 %	315441500
65	NC_014811	GC	3	6	23372	23377	0 %	0 %	50 %	50 %	315441500
66	NC_014811	GC	3	6	23705	23710	0 %	0 %	50 %	50 %	315441500
67	NC_014811	CG	3	6	24210	24215	0 %	0 %	50 %	50 %	315441500
68	NC_014811	GC	3	6	24216	24221	0 %	0 %	50 %	50 %	315441500
69	NC_014811	GC	3	6	24366	24371	0 %	0 %	50 %	50 %	315441500
70	NC_014811	CG	3	6	24794	24799	0 %	0 %	50 %	50 %	315441501
71	NC_014811	CG	3	6	24867	24872	0 %	0 %	50 %	50 %	315441501
72	NC_014811	GT	3	6	25251	25256	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014811	CG	3	6	27884	27889	0 %	0 %	50 %	50 %	315441505
74	NC_014811	CG	4	8	27946	27953	0 %	0 %	50 %	50 %	315441505
75	NC_014811	AC	3	6	28095	28100	50 %	0 %	0 %	50 %	315441506
76	NC_014811	TC	3	6	28190	28195	0 %	50 %	0 %	50 %	315441506
77	NC_014811	AT	3	6	28547	28552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014811	AT	3	6	28590	28595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014811	CG	3	6	29438	29443	0 %	0 %	50 %	50 %	315441508
80	NC_014811	TG	3	6	29701	29706	0 %	50 %	50 %	0 %	315441508
81	NC_014811	GT	3	6	30050	30055	0 %	50 %	50 %	0 %	315441508
82	NC_014811	GC	4	8	32002	32009	0 %	0 %	50 %	50 %	315441509
83	NC_014811	GC	4	8	32041	32048	0 %	0 %	50 %	50 %	315441509
84	NC_014811	CG	3	6	32107	32112	0 %	0 %	50 %	50 %	315441509
85	NC_014811	CG	3	6	32208	32213	0 %	0 %	50 %	50 %	315441509
86	NC_014811	CG	3	6	32312	32317	0 %	0 %	50 %	50 %	315441509
87	NC_014811	GC	3	6	32427	32432	0 %	0 %	50 %	50 %	315441509
88	NC_014811	CG	3	6	33041	33046	0 %	0 %	50 %	50 %	315441510
89	NC_014811	TG	3	6	34887	34892	0 %	50 %	50 %	0 %	315441511
90	NC_014811	TG	3	6	36535	36540	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014811	CG	4	8	37100	37107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_014811	CG	3	6	37624	37629	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014811	GC	3	6	40983	40988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_014811	GC	3	6	41055	41060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_014811	TG	3	6	41428	41433	0 %	50 %	50 %	0 %	315441516
96	NC_014811	CG	3	6	41568	41573	0 %	0 %	50 %	50 %	315441516
97	NC_014811	AG	3	6	42419	42424	50 %	0 %	50 %	0 %	315441517
98	NC_014811	CG	3	6	42685	42690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014811	CG	3	6	42897	42902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_014811	GC	3	6	42909	42914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_014811	CG	3	6	42993	42998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_014811	GC	3	6	43024	43029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_014811	AC	3	6	45287	45292	50 %	0 %	0 %	50 %	315441519
104	NC_014811	TG	3	6	45380	45385	0 %	50 %	50 %	0 %	315441519
105	NC_014811	CG	3	6	45482	45487	0 %	0 %	50 %	50 %	315441519
106	NC_014811	GC	3	6	46513	46518	0 %	0 %	50 %	50 %	315441520
107	NC_014811	CG	3	6	47446	47451	0 %	0 %	50 %	50 %	315441521
108	NC_014811	GC	3	6	47486	47491	0 %	0 %	50 %	50 %	315441521
109	NC_014811	AG	3	6	47849	47854	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014811	CG	3	6	47980	47985	0 %	0 %	50 %	50 %	315441522
111	NC_014811	CA	3	6	48609	48614	50 %	0 %	0 %	50 %	315441522
112	NC_014811	GT	3	6	48754	48759	0 %	50 %	50 %	0 %	315441523
113	NC_014811	GT	3	6	49858	49863	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014811	CG	3	6	50175	50180	0 %	0 %	50 %	50 %	315441524
115	NC_014811	GT	3	6	50542	50547	0 %	50 %	50 %	0 %	315441525
116	NC_014811	GT	3	6	50772	50777	0 %	50 %	50 %	0 %	315441525
117	NC_014811	GC	3	6	53459	53464	0 %	0 %	50 %	50 %	315441526
118	NC_014811	GC	3	6	53599	53604	0 %	0 %	50 %	50 %	315441526
119	NC_014811	AC	3	6	54038	54043	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_014811	CA	3	6	55340	55345	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_014811	TC	3	6	55648	55653	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_014811	CG	3	6	56540	56545	0 %	0 %	50 %	50 %	315441527
123	NC_014811	CG	3	6	57042	57047	0 %	0 %	50 %	50 %	315441527
124	NC_014811	GC	3	6	57175	57180	0 %	0 %	50 %	50 %	315441528
125	NC_014811	CG	3	6	57376	57381	0 %	0 %	50 %	50 %	315441528
126	NC_014811	TG	3	6	57812	57817	0 %	50 %	50 %	0 %	315441529
127	NC_014811	AC	3	6	58511	58516	50 %	0 %	0 %	50 %	315441529
128	NC_014811	CG	3	6	58839	58844	0 %	0 %	50 %	50 %	315441529
129	NC_014811	CG	3	6	59119	59124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_014811	CG	3	6	61496	61501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_014811	CG	3	6	62159	62164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_014811	CG	3	6	62517	62522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_014811	GC	3	6	63964	63969	0 %	0 %	50 %	50 %	315441533
134	NC_014811	TC	3	6	66542	66547	0 %	50 %	0 %	50 %	315441534
135	NC_014811	CG	3	6	66609	66614	0 %	0 %	50 %	50 %	315441534
136	NC_014811	CA	3	6	67188	67193	50 %	0 %	0 %	50 %	315441534
137	NC_014811	CG	3	6	68595	68600	0 %	0 %	50 %	50 %	315441535
138	NC_014811	GA	3	6	69668	69673	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014811	CG	3	6	70357	70362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_014811	GC	3	6	71288	71293	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_014811	GC	3	6	71510	71515	0 %	0 %	50 %	50 %	315441537
142	NC_014811	CG	3	6	71937	71942	0 %	0 %	50 %	50 %	315441537
143	NC_014811	GC	3	6	73101	73106	0 %	0 %	50 %	50 %	315441538
144	NC_014811	TG	3	6	74513	74518	0 %	50 %	50 %	0 %	315441539
145	NC_014811	GC	3	6	74726	74731	0 %	0 %	50 %	50 %	315441540
146	NC_014811	TG	3	6	74954	74959	0 %	50 %	50 %	0 %	315441540
147	NC_014811	CT	3	6	75938	75943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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433	NC_014811	CG	3	6	208211	208216	0 %	0 %	50 %	50 %	315441667
434	NC_014811	GC	3	6	208907	208912	0 %	0 %	50 %	50 %	315441668
435	NC_014811	TC	4	8	208930	208937	0 %	50 %	0 %	50 %	315441668
436	NC_014811	GC	3	6	209075	209080	0 %	0 %	50 %	50 %	315441668
437	NC_014811	GC	3	6	209324	209329	0 %	0 %	50 %	50 %	315441668
438	NC_014811	AC	3	6	210221	210226	50 %	0 %	0 %	50 %	315441669
439	NC_014811	AC	3	6	210669	210674	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
440	NC_014811	CG	3	6	211534	211539	0 %	0 %	50 %	50 %	315441671
441	NC_014811	CG	3	6	211786	211791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.