MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter felis ATCC 49179 chromosome

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014810	ATTGAG	2	12	3555	3566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014810	TTGGGG	2	12	12730	12741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014810	TGGCTT	2	12	34486	34497	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_014810	TTCTAA	2	12	34969	34980	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014810	TAAAGA	2	12	36078	36089	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014810	GTGTTG	2	12	53309	53320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014810	TTGGGT	2	12	61961	61972	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014810	TGCAAG	2	12	63765	63776	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014810	TACCCT	2	12	118877	118888	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014810	TATCAA	2	12	136642	136653	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014810	TTTTAA	2	12	166825	166836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014810	AATCCA	2	12	252938	252949	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014810	ATTAAA	2	12	287905	287916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014810	ATTTTT	2	12	310065	310076	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014810	TAAGCT	2	12	497337	497348	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_014810	ATTTTA	2	12	571012	571023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014810	TTTTTG	2	12	582707	582718	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014810	GTGCTT	2	12	625557	625568	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014810	ATTTAG	2	12	698539	698550	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014810	ATTTAG	2	12	702852	702863	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014810	AAGCTA	2	12	1028828	1028839	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014810	TAAACT	2	12	1028898	1028909	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014810	GTAGCC	2	12	1032177	1032188	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014810	TTTTTG	2	12	1201194	1201205	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014810	CAAGCT	2	12	1204221	1204232	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014810	TTTAGC	2	12	1251265	1251276	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_014810	GCATGC	2	12	1341331	1341342	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014810	GCGCGA	2	12	1356499	1356510	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014810	TACGGC	2	12	1373837	1373848	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014810	GCCTAC	2	12	1477487	1477498	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014810	TTTTTG	2	12	1484279	1484290	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014810	TTGGGG	2	12	1520252	1520263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014810	AAGCCA	2	12	1528948	1528959	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014810	CACAGA	2	12	1554106	1554117	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014810	AGAAAG	2	12	1598762	1598773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014810	GATGTG	2	12	1606616	1606627	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014810	CCCAAC	2	12	1606920	1606931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_014810	TTGCGT	2	12	1608036	1608047	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014810	TTTGTT	2	12	1612133	1612144	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014810	TTAAAA	2	12	1622021	1622032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014810	TTGCGT	2	12	1623508	1623519	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014810	GGGTTG	2	12	1626798	1626809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014810	ATAAAA	2	12	1631335	1631346	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014810	GCTTTA	2	12	1640427	1640438	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014810	TTAGCT	2	12	1649572	1649583	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014810	TGGAAA	2	12	1659182	1659193	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014810	GTAATG	2	12	1670391	1670402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014810	CGTGCG	2	12	1671729	1671740	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.