MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter felis ATCC 49179 chromosome

Total Repeats: 1090

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014810	CTTTT	2	10	189	198	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014810	AGAGG	2	10	1505	1514	40 %	0 %	60 %	0 %	332309248
3	NC_014810	CCTTG	2	10	3683	3692	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_014810	ATTTA	2	10	4088	4097	40 %	60 %	0 %	0 %	315452432
5	NC_014810	GCGTG	2	10	4639	4648	0 %	20 %	60 %	20 %	315452432
6	NC_014810	AAGGA	2	10	5473	5482	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014810	GACTT	2	10	9928	9937	20 %	40 %	20 %	20 %	315452441
8	NC_014810	CCCTC	2	10	10799	10808	0 %	20 %	0 %	80 %	315452442
9	NC_014810	AATCT	3	15	13242	13256	40 %	40 %	0 %	20 %	315452446
10	NC_014810	CTTTT	2	10	13496	13505	0 %	80 %	0 %	20 %	315452447
11	NC_014810	CAAAC	2	10	15845	15854	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_014810	TAGGG	2	10	16348	16357	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014810	CACCC	2	10	16549	16558	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
14	NC_014810	CGCCC	2	10	18483	18492	0 %	0 %	20 %	80 %	332309251
15	NC_014810	ATGGG	2	10	18701	18710	20 %	20 %	60 %	0 %	332309251
16	NC_014810	TTGAA	2	10	23173	23182	40 %	40 %	20 %	0 %	315452455
17	NC_014810	CTAGG	2	10	26110	26119	20 %	20 %	40 %	20 %	315452463
18	NC_014810	TCCAC	2	10	27018	27027	20 %	20 %	0 %	60 %	315452464
19	NC_014810	GAGCG	2	10	27876	27885	20 %	0 %	60 %	20 %	315452465
20	NC_014810	TAGCC	2	10	28314	28323	20 %	20 %	20 %	40 %	315452465
21	NC_014810	GATCA	2	10	28468	28477	40 %	20 %	20 %	20 %	315452465
22	NC_014810	GCGGG	2	10	29993	30002	0 %	0 %	80 %	20 %	315452465
23	NC_014810	CCCTA	2	10	32618	32627	20 %	20 %	0 %	60 %	315452467
24	NC_014810	GTTTG	2	10	33121	33130	0 %	60 %	40 %	0 %	315452467
25	NC_014810	ACAAA	2	10	33904	33913	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014810	CCCCA	2	10	33997	34006	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
27	NC_014810	TAAAT	2	10	35059	35068	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014810	CTTGC	2	10	36247	36256	0 %	40 %	20 %	40 %	315452470
29	NC_014810	ATTTT	3	15	36962	36976	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014810	ATTTT	2	10	39378	39387	20 %	80 %	0 %	0 %	315452473
31	NC_014810	GCTTG	2	10	40010	40019	0 %	40 %	40 %	20 %	315452473
32	NC_014810	GGGGT	2	10	40222	40231	0 %	20 %	80 %	0 %	315452473
33	NC_014810	CTCTT	2	10	45629	45638	0 %	60 %	0 %	40 %	315452477
34	NC_014810	TGGCA	2	10	47208	47217	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_014810	CTTGG	2	10	47821	47830	0 %	40 %	40 %	20 %	315452479
36	NC_014810	TTGAT	2	10	48596	48605	20 %	60 %	20 %	0 %	315452479
37	NC_014810	ACCCC	2	10	49384	49393	20 %	0 %	0 %	80 %	315452480
38	NC_014810	CTGCC	2	10	49415	49424	0 %	20 %	20 %	60 %	315452480
39	NC_014810	GCGTG	3	15	51522	51536	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
40	NC_014810	TCGTT	2	10	53560	53569	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_014810	GGCGT	2	10	53784	53793	0 %	20 %	60 %	20 %	315452486
42	NC_014810	AAGAG	2	10	56745	56754	60 %	0 %	40 %	0 %	315452492
43	NC_014810	CTCTT	2	10	59526	59535	0 %	60 %	0 %	40 %	315452495
44	NC_014810	TAAGT	2	10	62284	62293	40 %	40 %	20 %	0 %	315452499
45	NC_014810	CTTTT	2	10	63079	63088	0 %	80 %	0 %	20 %	315452499
46	NC_014810	TTGCA	2	10	63431	63440	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_014810	GTTTG	2	10	63583	63592	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014810	AATTT	2	10	63837	63846	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014810	AAAAG	2	10	64450	64459	80 %	0 %	20 %	0 %	315452501
50	NC_014810	GCCCT	2	10	65494	65503	0 %	20 %	20 %	60 %	315452502
51	NC_014810	AAAAG	2	10	65867	65876	80 %	0 %	20 %	0 %	315452503
52	NC_014810	GTTTA	2	10	67705	67714	20 %	60 %	20 %	0 %	315452505
53	NC_014810	TAGTG	2	10	67835	67844	20 %	40 %	40 %	0 %	315452505
54	NC_014810	GGCTT	2	10	74209	74218	0 %	40 %	40 %	20 %	315452512
55	NC_014810	AAAGC	2	10	75193	75202	60 %	0 %	20 %	20 %	315452513
56	NC_014810	GGCTT	2	10	76308	76317	0 %	40 %	40 %	20 %	315452514
57	NC_014810	GATTT	2	10	77252	77261	20 %	60 %	20 %	0 %	315452514
58	NC_014810	TCCCT	2	10	78110	78119	0 %	40 %	0 %	60 %	315452514
59	NC_014810	GCGCC	2	10	78679	78688	0 %	0 %	40 %	60 %	315452515
60	NC_014810	AAGCC	2	10	79212	79221	40 %	0 %	20 %	40 %	315452516
61	NC_014810	AACCC	2	10	79467	79476	40 %	0 %	0 %	60 %	315452517
62	NC_014810	CTTTG	2	10	79884	79893	0 %	60 %	20 %	20 %	315452518
63	NC_014810	CCACT	2	10	79937	79946	20 %	20 %	0 %	60 %	315452518
64	NC_014810	AAACC	2	10	81116	81125	60 %	0 %	0 %	40 %	315452519
65	NC_014810	TTTGC	2	10	82733	82742	0 %	60 %	20 %	20 %	315452521
66	NC_014810	ACCCC	2	10	88972	88981	20 %	0 %	0 %	80 %	315452527
67	NC_014810	CAAGA	2	10	89198	89207	60 %	0 %	20 %	20 %	315452527
68	NC_014810	AGTGG	2	10	89455	89464	20 %	20 %	60 %	0 %	315452528
69	NC_014810	TTTGA	2	10	90205	90214	20 %	60 %	20 %	0 %	315452529
70	NC_014810	TTTGG	2	10	90721	90730	0 %	60 %	40 %	0 %	315452529
71	NC_014810	AATCA	2	10	98111	98120	60 %	20 %	0 %	20 %	315452536
72	NC_014810	ACGCC	2	10	98719	98728	20 %	0 %	20 %	60 %	315452537
73	NC_014810	TTTGG	2	10	99263	99272	0 %	60 %	40 %	0 %	315452537
74	NC_014810	ATGGC	2	10	101243	101252	20 %	20 %	40 %	20 %	315452539
75	NC_014810	GGGCA	2	10	103523	103532	20 %	0 %	60 %	20 %	315452542
76	NC_014810	CAAAG	2	10	104462	104471	60 %	0 %	20 %	20 %	315452542
77	NC_014810	GGGGC	2	10	105397	105406	0 %	0 %	80 %	20 %	315452542
78	NC_014810	GTGGG	2	10	106526	106535	0 %	20 %	80 %	0 %	315452544
79	NC_014810	CATGG	2	10	107072	107081	20 %	20 %	40 %	20 %	315452544
80	NC_014810	GCGAT	2	10	107951	107960	20 %	20 %	40 %	20 %	315452545
81	NC_014810	TGGCA	2	10	111802	111811	20 %	20 %	40 %	20 %	315452550
82	NC_014810	CCTGT	2	10	114501	114510	0 %	40 %	20 %	40 %	315452553
83	NC_014810	AGCGA	2	10	114683	114692	40 %	0 %	40 %	20 %	315452553
84	NC_014810	CGATG	2	10	114802	114811	20 %	20 %	40 %	20 %	315452553
85	NC_014810	ATCGC	2	10	115344	115353	20 %	20 %	20 %	40 %	315452553
86	NC_014810	CGTGG	2	10	115691	115700	0 %	20 %	60 %	20 %	315452553
87	NC_014810	CTAGC	2	10	115962	115971	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_014810	TAAAA	2	10	116509	116518	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014810	GTTTG	2	10	120009	120018	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014810	TACCC	2	10	120236	120245	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
91	NC_014810	TTCAA	2	10	122828	122837	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_014810	CTCAT	2	10	123058	123067	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_014810	ACTAA	2	10	124839	124848	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_014810	TGGTG	2	10	127165	127174	0 %	40 %	60 %	0 %	315452562
95	NC_014810	AGGCG	2	10	128452	128461	20 %	0 %	60 %	20 %	315452564
96	NC_014810	CCGCG	2	10	128821	128830	0 %	0 %	40 %	60 %	315452564
97	NC_014810	CCCCG	2	10	129554	129563	0 %	0 %	20 %	80 %	315452564
98	NC_014810	GAGCG	2	10	129703	129712	20 %	0 %	60 %	20 %	315452564
99	NC_014810	AATTT	2	10	132400	132409	40 %	60 %	0 %	0 %	315452568
100	NC_014810	AAAAG	2	10	132948	132957	80 %	0 %	20 %	0 %	315452568
101	NC_014810	AGTTT	2	10	136287	136296	20 %	60 %	20 %	0 %	315452573
102	NC_014810	TTGCA	2	10	136625	136634	20 %	40 %	20 %	20 %	315452573
103	NC_014810	TTAAG	2	10	136694	136703	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014810	GATTT	2	10	138264	138273	20 %	60 %	20 %	0 %	315452575
105	NC_014810	AAAAT	2	10	141260	141269	80 %	20 %	0 %	0 %	315452577
106	NC_014810	GTTTT	2	10	144797	144806	0 %	80 %	20 %	0 %	315452579
107	NC_014810	GTTTT	2	10	150598	150607	0 %	80 %	20 %	0 %	315452584
108	NC_014810	TGAAA	2	10	152280	152289	60 %	20 %	20 %	0 %	315452588
109	NC_014810	AAAGT	2	10	156572	156581	60 %	20 %	20 %	0 %	315452591
110	NC_014810	AAAGA	2	10	159616	159625	80 %	0 %	20 %	0 %	315452594
111	NC_014810	GACCT	2	10	159646	159655	20 %	20 %	20 %	40 %	315452594
112	NC_014810	GCAGG	2	10	162450	162459	20 %	0 %	60 %	20 %	315452598
113	NC_014810	ATTGA	2	10	163367	163376	40 %	40 %	20 %	0 %	315452599
114	NC_014810	AGAGC	2	10	164059	164068	40 %	0 %	40 %	20 %	315452599
115	NC_014810	AGATC	2	10	168470	168479	40 %	20 %	20 %	20 %	315452604
116	NC_014810	GCTCA	2	10	168672	168681	20 %	20 %	20 %	40 %	315452604
117	NC_014810	ACAAG	2	10	169505	169514	60 %	0 %	20 %	20 %	315452604
118	NC_014810	TATCC	2	10	169657	169666	20 %	40 %	0 %	40 %	315452604
119	NC_014810	GATCA	2	10	172815	172824	40 %	20 %	20 %	20 %	315452607
120	NC_014810	AACGC	2	10	177526	177535	40 %	0 %	20 %	40 %	315452612
121	NC_014810	TCAAG	2	10	180298	180307	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_014810	CCTTA	2	10	186726	186735	20 %	40 %	0 %	40 %	315452622
123	NC_014810	GGCAC	2	10	190229	190238	20 %	0 %	40 %	40 %	315452626
124	NC_014810	TTGCG	2	10	191729	191738	0 %	40 %	40 %	20 %	315452628
125	NC_014810	GACTT	2	10	193367	193376	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_014810	TCCCA	2	10	196276	196285	20 %	20 %	0 %	60 %	315452633
127	NC_014810	ATTTT	2	10	198372	198381	20 %	80 %	0 %	0 %	315452637
128	NC_014810	GCTAT	2	10	201519	201528	20 %	40 %	20 %	20 %	315452639
129	NC_014810	ATGGA	2	10	203171	203180	40 %	20 %	40 %	0 %	315452641
130	NC_014810	AGGCG	2	10	203299	203308	20 %	0 %	60 %	20 %	315452641
131	NC_014810	ACCAC	2	10	204179	204188	40 %	0 %	0 %	60 %	315452642
132	NC_014810	GGTGT	2	10	206724	206733	0 %	40 %	60 %	0 %	315452644
133	NC_014810	ATCGG	2	10	209399	209408	20 %	20 %	40 %	20 %	315452647
134	NC_014810	AAAAT	2	10	210170	210179	80 %	20 %	0 %	0 %	315452648
135	NC_014810	GAAAA	2	10	210606	210615	80 %	0 %	20 %	0 %	315452648
136	NC_014810	GGGGC	2	10	212357	212366	0 %	0 %	80 %	20 %	315452650
137	NC_014810	AATCG	2	10	213711	213720	40 %	20 %	20 %	20 %	315452652
138	NC_014810	ATAAA	2	10	214330	214339	80 %	20 %	0 %	0 %	315452652
139	NC_014810	TCTCT	2	10	215773	215782	0 %	60 %	0 %	40 %	315452655
140	NC_014810	CCATT	2	10	217880	217889	20 %	40 %	0 %	40 %	315452657
141	NC_014810	AAATC	2	10	218690	218699	60 %	20 %	0 %	20 %	315452658
142	NC_014810	CAATA	2	10	218738	218747	60 %	20 %	0 %	20 %	315452658
143	NC_014810	TGCAC	2	10	218961	218970	20 %	20 %	20 %	40 %	315452658
144	NC_014810	AAATG	2	10	219226	219235	60 %	20 %	20 %	0 %	315452659
145	NC_014810	TTTTA	2	10	219493	219502	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014810	CCACT	2	10	220396	220405	20 %	20 %	0 %	60 %	315452660
147	NC_014810	CTAAA	2	10	221429	221438	60 %	20 %	0 %	20 %	315452661
148	NC_014810	ACACC	2	10	222084	222093	40 %	0 %	0 %	60 %	315452662
149	NC_014810	TAATG	2	10	224644	224653	40 %	40 %	20 %	0 %	315452664
150	NC_014810	CTCTT	2	10	227771	227780	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
151	NC_014810	GTCTA	2	10	228608	228617	20 %	40 %	20 %	20 %	315452670
152	NC_014810	CAGAA	2	10	230756	230765	60 %	0 %	20 %	20 %	315452674
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155	NC_014810	CGCCA	2	10	234109	234118	20 %	0 %	20 %	60 %	315452677
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159	NC_014810	TGGGT	2	10	244976	244985	0 %	40 %	60 %	0 %	315452686
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161	NC_014810	TCCTT	2	10	246647	246656	0 %	60 %	0 %	40 %	315452688
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169	NC_014810	AACCT	2	10	256099	256108	40 %	20 %	0 %	40 %	315452696
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176	NC_014810	TTTCT	2	10	261480	261489	0 %	80 %	0 %	20 %	315452701
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185	NC_014810	CTTTT	2	10	277331	277340	0 %	80 %	0 %	20 %	315452710
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196	NC_014810	CCCCG	2	10	288908	288917	0 %	0 %	20 %	80 %	315452719
197	NC_014810	AAAGT	2	10	290552	290561	60 %	20 %	20 %	0 %	315452720
198	NC_014810	TTTTA	2	10	291171	291180	20 %	80 %	0 %	0 %	315452722
199	NC_014810	ATCAA	2	10	291336	291345	60 %	20 %	0 %	20 %	315452722
200	NC_014810	ACCCC	2	10	291474	291483	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
201	NC_014810	AAATT	2	10	292990	292999	60 %	40 %	0 %	0 %	315452725
202	NC_014810	TAGGA	2	10	296840	296849	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
203	NC_014810	TTTAG	2	10	300175	300184	20 %	60 %	20 %	0 %	315452736
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223	NC_014810	TTTAG	2	10	332444	332453	20 %	60 %	20 %	0 %	315452769
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243	NC_014810	TTGTA	2	10	371733	371742	20 %	60 %	20 %	0 %	315452801
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246	NC_014810	TCGAC	2	10	373217	373226	20 %	20 %	20 %	40 %	315452802
247	NC_014810	TTAGG	2	10	378047	378056	20 %	40 %	40 %	0 %	315452808
248	NC_014810	AGGGG	2	10	378388	378397	20 %	0 %	80 %	0 %	315452809
249	NC_014810	AACGA	2	10	379545	379554	60 %	0 %	20 %	20 %	315452810
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251	NC_014810	TTTTA	2	10	381682	381691	20 %	80 %	0 %	0 %	315452811
252	NC_014810	ATGCG	2	10	384422	384431	20 %	20 %	40 %	20 %	315452816
253	NC_014810	TGGGG	2	10	386436	386445	0 %	20 %	80 %	0 %	315452818
254	NC_014810	AACAA	2	10	389692	389701	80 %	0 %	0 %	20 %	315452820
255	NC_014810	ATTTT	2	10	392608	392617	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_014810	CTTTC	2	10	392907	392916	0 %	60 %	0 %	40 %	315452822
257	NC_014810	GCAGG	2	10	396404	396413	20 %	0 %	60 %	20 %	315452826
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259	NC_014810	GAGAG	2	10	400278	400287	40 %	0 %	60 %	0 %	315452830
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261	NC_014810	CTAGG	2	10	401402	401411	20 %	20 %	40 %	20 %	315452833
262	NC_014810	TGCCC	2	10	402748	402757	0 %	20 %	20 %	60 %	315452834
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264	NC_014810	ACCCG	2	10	407716	407725	20 %	0 %	20 %	60 %	315452840
265	NC_014810	GTGTT	2	10	409527	409536	0 %	60 %	40 %	0 %	315452841
266	NC_014810	GATTT	2	10	411442	411451	20 %	60 %	20 %	0 %	315452844
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268	NC_014810	TAGAT	2	10	412511	412520	40 %	40 %	20 %	0 %	315452845
269	NC_014810	AGCAT	2	10	413138	413147	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
270	NC_014810	AAATA	2	10	414425	414434	80 %	20 %	0 %	0 %	315452848
271	NC_014810	GTATA	2	10	415708	415717	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
272	NC_014810	ACTTC	2	10	415878	415887	20 %	40 %	0 %	40 %	315452850
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