MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter felis ATCC 49179 chromosome

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014810	CTTTT	2	10	189	198	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014810	CCTTG	2	10	3683	3692	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_014810	AAGGA	2	10	5473	5482	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014810	CAAAC	2	10	15845	15854	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_014810	TAGGG	2	10	16348	16357	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014810	CACCC	2	10	16549	16558	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
7	NC_014810	ACAAA	2	10	33904	33913	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014810	CCCCA	2	10	33997	34006	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
9	NC_014810	TAAAT	2	10	35059	35068	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014810	ATTTT	3	15	36962	36976	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014810	TGGCA	2	10	47208	47217	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_014810	GCGTG	3	15	51522	51536	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014810	TCGTT	2	10	53560	53569	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014810	TTGCA	2	10	63431	63440	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_014810	GTTTG	2	10	63583	63592	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014810	AATTT	2	10	63837	63846	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014810	CTAGC	2	10	115962	115971	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_014810	TAAAA	2	10	116509	116518	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014810	GTTTG	2	10	120009	120018	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014810	TACCC	2	10	120236	120245	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
21	NC_014810	TTCAA	2	10	122828	122837	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014810	CTCAT	2	10	123058	123067	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_014810	ACTAA	2	10	124839	124848	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014810	TTAAG	2	10	136694	136703	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014810	TCAAG	2	10	180298	180307	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014810	GACTT	2	10	193367	193376	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014810	TTTTA	2	10	219493	219502	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014810	CTCTT	2	10	227771	227780	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_014810	CCACT	2	10	284810	284819	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
30	NC_014810	TTGCA	2	10	288319	288328	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014810	ACCCC	2	10	291474	291483	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
32	NC_014810	TAGGA	2	10	296840	296849	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014810	ATTTT	2	10	392608	392617	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014810	AGCAT	2	10	413138	413147	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_014810	GTATA	2	10	415708	415717	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014810	TTTGA	2	10	420185	420194	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014810	TTAAA	2	10	435302	435311	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014810	GGGGT	2	10	441669	441678	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014810	TTAAA	2	10	444218	444227	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014810	AATTT	2	10	498066	498075	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014810	AAGTC	2	10	506591	506600	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_014810	ATTGC	2	10	561229	561238	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014810	TCTTA	2	10	561411	561420	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_014810	ATACA	2	10	561485	561494	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_014810	AATTT	2	10	566536	566545	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014810	AGACA	2	10	567859	567868	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_014810	ATAAA	2	10	567888	567897	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014810	ACTAA	2	10	568705	568714	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_014810	GTTCT	2	10	570995	571004	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014810	TCGTG	2	10	583851	583860	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_014810	AGCAA	2	10	655271	655280	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_014810	TTGAC	2	10	655302	655311	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_014810	AAAGT	2	10	655322	655331	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014810	AAGAA	2	10	663636	663645	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014810	CAACA	2	10	680325	680334	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_014810	CTTTT	2	10	712414	712423	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_014810	TTTTC	2	10	716679	716688	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_014810	AAGTA	2	10	724792	724801	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014810	AGCGT	2	10	740556	740565	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_014810	ATTAT	2	10	761499	761508	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014810	AAAAT	2	10	814451	814460	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014810	TAATT	2	10	829805	829814	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014810	AGTTT	2	10	829848	829857	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014810	TTTCA	2	10	830684	830693	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_014810	TTTGT	2	10	868745	868754	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014810	GGCAG	2	10	874141	874150	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
67	NC_014810	TTGTT	2	10	963629	963638	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014810	AAACC	2	10	993076	993085	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_014810	CTTTT	2	10	1020403	1020412	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_014810	GACTA	2	10	1029488	1029497	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_014810	GCGTG	2	10	1032134	1032143	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
72	NC_014810	TAAGC	2	10	1035950	1035959	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_014810	ATTAG	2	10	1178227	1178236	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014810	TTTTG	2	10	1199618	1199627	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014810	TCGTG	2	10	1202338	1202347	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_014810	GTGTT	2	10	1203662	1203671	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014810	GCAGG	2	10	1258402	1258411	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
78	NC_014810	GAAAA	2	10	1321773	1321782	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014810	ATTAT	2	10	1332866	1332875	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014810	TCTTT	2	10	1341163	1341172	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_014810	TTAAT	2	10	1341297	1341306	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014810	GAAGA	2	10	1345611	1345620	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014810	TTATT	2	10	1374744	1374753	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014810	TTTGC	2	10	1375017	1375026	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_014810	AAAAT	3	15	1405804	1405818	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014810	TAAAT	2	10	1406978	1406987	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014810	CTTTT	2	10	1415000	1415009	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_014810	TGATA	2	10	1422792	1422801	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014810	AGAGG	2	10	1476809	1476818	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014810	TAGCG	2	10	1479701	1479710	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_014810	TGCTA	2	10	1492184	1492193	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_014810	TCAAA	2	10	1517520	1517529	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_014810	AAAGT	2	10	1517753	1517762	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014810	ACGAT	2	10	1520198	1520207	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_014810	GAAGC	2	10	1550480	1550489	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_014810	AGTTT	2	10	1571982	1571991	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014810	ATGAG	2	10	1605104	1605113	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014810	CAACA	2	10	1606110	1606119	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
99	NC_014810	TCTCA	2	10	1606176	1606185	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
100	NC_014810	ACTTC	2	10	1607340	1607349	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_014810	CGAAA	2	10	1610187	1610196	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_014810	GAAGT	2	10	1611415	1611424	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014810	CTTGA	2	10	1611486	1611495	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_014810	TGAGA	2	10	1612555	1612564	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014810	CAAAG	2	10	1612777	1612786	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_014810	TAAAA	2	10	1616253	1616262	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014810	AACAC	2	10	1622173	1622182	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_014810	CACTT	2	10	1622470	1622479	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_014810	CTTCT	2	10	1623701	1623710	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
110	NC_014810	CTCCA	2	10	1627788	1627797	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
111	NC_014810	GTTTT	2	10	1631316	1631325	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014810	CTCCA	2	10	1631428	1631437	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
113	NC_014810	TATAA	2	10	1636660	1636669	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014810	TGGAG	2	10	1637275	1637284	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014810	GATGC	2	10	1637901	1637910	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_014810	ATGCA	2	10	1638139	1638148	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_014810	GAAAG	2	10	1638930	1638939	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014810	TTGTT	2	10	1639097	1639106	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014810	CAATG	2	10	1645236	1645245	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_014810	AATTT	2	10	1648242	1648251	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014810	AACGC	2	10	1670184	1670193	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_014810	GAAGG	2	10	1670453	1670462	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014810	CCCTT	2	10	1671901	1671910	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
124	NC_014810	CGTGC	2	10	1671994	1672003	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
125	NC_014810	CTGCG	2	10	1672250	1672259	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.