MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Pseudoalteromonas sp. SM9913 chromosome I

Total Repeats: 123

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014803	ACGTTT	2	12	41621	41632	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014803	TGAAAT	2	12	43709	43720	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014803	TATGTT	2	12	84317	84328	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014803	AAATTG	2	12	86584	86595	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014803	TAAAAA	2	12	125548	125559	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014803	ACGTTT	2	12	132559	132570	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014803	TGAAAT	2	12	134647	134658	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014803	GTAAAA	2	12	136139	136150	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014803	TACAAA	2	12	142738	142749	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014803	AACTTA	2	12	157564	157575	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014803	TTCATT	2	12	159021	159032	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_014803	ATATTT	2	12	159057	159068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014803	TTTTAG	2	12	278156	278167	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014803	AAAAAT	2	12	352738	352749	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014803	TTCTTA	2	12	381732	381743	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_014803	TTTTAA	2	12	396442	396453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014803	TAAAAA	2	12	498201	498212	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014803	AGAAGT	2	12	500013	500024	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014803	TTAAAA	2	12	542038	542049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014803	TTTTAA	2	12	610001	610012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014803	ATGTAA	2	12	639423	639434	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014803	ACCTTA	4	24	711528	711551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014803	TATTGA	3	18	714120	714137	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014803	TGAAAT	2	12	777789	777800	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014803	TGAAAT	2	12	808190	808201	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014803	TTTAAA	2	12	809357	809368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014803	AAAAAG	2	12	815235	815246	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014803	AAAATA	2	12	944876	944887	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014803	TGTTTT	2	12	945069	945080	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014803	TTCCGC	2	12	959981	959992	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014803	TAAAAA	2	12	1038952	1038963	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014803	TTTAAG	2	12	1041889	1041900	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014803	TGGCAA	2	12	1071565	1071576	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014803	ATGGCT	2	12	1097247	1097258	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014803	TATGAG	2	12	1152515	1152526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014803	ACGTTT	2	12	1209538	1209549	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_014803	TGAAAT	2	12	1211626	1211637	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014803	GTATTA	2	12	1333426	1333437	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014803	AAGTAT	2	12	1406546	1406557	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014803	GTTTAA	2	12	1451812	1451823	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014803	TTAATT	2	12	1520334	1520345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014803	AAATTA	2	12	1584178	1584189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014803	AACTAA	2	12	1612299	1612310	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014803	TAAAAA	2	12	1613864	1613875	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014803	GTAAAG	2	12	1623770	1623781	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014803	CGTAAA	2	12	1623950	1623961	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014803	TAATGA	2	12	1631971	1631982	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014803	ATATAA	2	12	1644694	1644705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014803	TAAAAA	2	12	1656139	1656150	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014803	TTTTTA	2	12	1665026	1665037	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014803	GTAAGG	2	12	1709752	1709763	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014803	TATATC	2	12	1773508	1773519	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_014803	ATTTAA	2	12	1782400	1782411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014803	TAGAGA	2	12	1805161	1805172	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014803	ATTGTA	2	12	1820396	1820407	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014803	AAAAAT	2	12	1833956	1833967	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014803	AACAAA	2	12	1841400	1841411	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014803	AATTAA	2	12	1875425	1875436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014803	ACGTAA	2	12	1935672	1935683	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_014803	TAAAAA	2	12	1935946	1935957	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014803	GCTTAC	2	12	1991657	1991668	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014803	ACATAT	2	12	1999346	1999357	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_014803	ATAAAA	2	12	2043156	2043167	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014803	GGGGAG	2	12	2057090	2057101	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014803	ATATGA	2	12	2078914	2078925	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014803	TTTAAC	2	12	2146688	2146699	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_014803	CATTTA	2	12	2148140	2148151	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_014803	AAAAAT	2	12	2156059	2156070	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014803	TATAAA	2	12	2169129	2169140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014803	CAATTC	2	12	2199992	2200003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014803	GTTTAG	2	12	2205052	2205063	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014803	ATTAAA	2	12	2247863	2247874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014803	TAAAAA	2	12	2255893	2255904	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014803	ACAAAA	2	12	2269080	2269091	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_014803	CAATCA	2	12	2325973	2325984	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014803	TTAATT	2	12	2326027	2326038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014803	AAACAA	2	12	2359258	2359269	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_014803	AGCTAA	2	12	2369453	2369464	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_014803	TTTTTA	2	12	2372664	2372675	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014803	CCTCTC	2	12	2391388	2391399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_014803	CTATAT	2	12	2508166	2508177	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_014803	AACCAA	2	12	2511761	2511772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014803	TCACAC	2	12	2553460	2553471	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014803	TGTATT	2	12	2563195	2563206	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014803	TTTTTA	2	12	2581908	2581919	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014803	AATAAA	2	12	2603794	2603805	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014803	ATTAAT	2	12	2603833	2603844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014803	TCTTAA	2	12	2607348	2607359	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_014803	ACTTTT	2	12	2628004	2628015	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_014803	CTAAAA	2	12	2674900	2674911	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_014803	TTTTAG	2	12	2680855	2680866	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014803	ATTTTT	2	12	2698683	2698694	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014803	ACCGTT	2	12	2711823	2711834	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014803	CTTTAG	2	12	2796097	2796108	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_014803	TTTAAA	2	12	2796374	2796385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014803	TCAATC	2	12	2806121	2806132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014803	AAACTT	2	12	2806762	2806773	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_014803	TTAACC	2	12	2814814	2814825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014803	CATGTT	4	24	2829233	2829256	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_014803	GTAGGC	2	12	2831377	2831388	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_014803	TAGCAA	2	12	2870450	2870461	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_014803	AAAAAC	2	12	2879818	2879829	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_014803	ACCATG	2	12	2901457	2901468	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014803	TTGCAC	2	12	2904479	2904490	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014803	TTAACT	2	12	2911774	2911785	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_014803	CTATTA	2	12	2958607	2958618	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_014803	AATTAA	2	12	2965359	2965370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014803	TTAAAA	2	12	2979243	2979254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014803	GGTTAT	2	12	2981914	2981925	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014803	ATTTCA	2	12	3026991	3027002	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_014803	CTTTTA	2	12	3062481	3062492	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_014803	ATTTCA	2	12	3063895	3063906	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_014803	GTTGAT	2	12	3068638	3068649	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014803	TATAAA	2	12	3105720	3105731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014803	TAAAAA	2	12	3136582	3136593	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014803	AAATTA	2	12	3164455	3164466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014803	TTTAGT	2	12	3176886	3176897	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014803	ATTTAT	2	12	3189344	3189355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014803	TTTTTA	2	12	3190400	3190411	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014803	ATAAAA	2	12	3253925	3253936	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014803	AATACC	2	12	3254722	3254733	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014803	ATTTCA	2	12	3300741	3300752	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_014803	GTTAAA	2	12	3332460	3332471	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.