MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Pseudoalteromonas sp. SM9913 chromosome I

Total Repeats: 1130

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014803	TTTTAG	2	12	3455	3466	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	315125114
2	NC_014803	AAGGAA	2	12	11048	11059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315125120
3	NC_014803	TCCGGT	2	12	11209	11220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315125120
4	NC_014803	CGCCAG	2	12	13018	13029	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315125122
5	NC_014803	TCAGCC	2	12	48146	48157	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	315125152
6	NC_014803	AGCATT	2	12	49780	49791	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	315125154
7	NC_014803	GGGCAA	2	12	56026	56037	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	315125163
8	NC_014803	CAGGTT	2	12	57894	57905	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	315125164
9	NC_014803	GATAAT	2	12	68837	68848	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	315125177
10	NC_014803	AAACCT	2	12	69814	69825	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	315125177
11	NC_014803	AGCTTC	2	12	71189	71200	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	315125178
12	NC_014803	TATATC	2	12	71703	71714	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	315125179
13	NC_014803	AGCAAA	2	12	73154	73165	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	315125180
14	NC_014803	AATTGC	2	12	78880	78891	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	315125187
15	NC_014803	ATTAAT	2	12	79161	79172	50 %	50 %	0 %	0 %	315125188
16	NC_014803	AATATT	2	12	84072	84083	50 %	50 %	0 %	0 %	315125189
17	NC_014803	ATTGCA	2	12	89254	89265	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	315125192
18	NC_014803	GTATTG	2	12	109013	109024	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	315125215
19	NC_014803	GCCCAT	2	12	111974	111985	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	315125218
20	NC_014803	GTTATT	2	12	115627	115638	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	315125221
21	NC_014803	CTTCAG	2	12	119795	119806	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	315125224
22	NC_014803	TGAGGT	2	12	120213	120224	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	315125224
23	NC_014803	ATTACT	2	12	121267	121278	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	315125225
24	NC_014803	AGCTTA	2	12	124634	124645	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	315125227
25	NC_014803	AAATAG	2	12	141504	141515	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	315125235
26	NC_014803	CCTGCT	2	12	142364	142375	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	315125235
27	NC_014803	GTGGTT	2	12	143412	143423	0 %	50 %	50 %	0 %	315125237
28	NC_014803	CGTCAA	2	12	150475	150486	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	315125244
29	NC_014803	GCTTTT	2	12	154439	154450	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	315125247
30	NC_014803	AGATAA	2	12	161210	161221	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	315125251
31	NC_014803	CTAAAT	2	12	166593	166604	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	315125257
32	NC_014803	GCTTGG	2	12	170402	170413	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	315125260
33	NC_014803	TAAAGG	2	12	172252	172263	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	315125262
34	NC_014803	GAAGTA	2	12	173316	173327	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	315125264
35	NC_014803	CAAGAG	2	12	175602	175613	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	315125268
36	NC_014803	GTAAAG	2	12	175924	175935	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	315125269
37	NC_014803	CTGCCA	2	12	177722	177733	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	315125272
38	NC_014803	TTAGGT	2	12	179216	179227	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	315125273
39	NC_014803	CAGGTA	2	12	180156	180167	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	315125273
40	NC_014803	TGATGG	2	12	183102	183113	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	315125275
41	NC_014803	CAGTAA	2	12	186136	186147	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	315125278
42	NC_014803	CGGCTT	2	12	186247	186258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315125278
43	NC_014803	TTTTTA	2	12	191444	191455	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	315125285
44	NC_014803	CACTGG	2	12	192134	192145	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	315125285
45	NC_014803	ATACTA	2	12	192618	192629	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	315125286
46	NC_014803	GTAACG	2	12	195708	195719	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	315125289
47	NC_014803	ATTCGT	2	12	196641	196652	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	315125289
48	NC_014803	CAAGCG	2	12	201872	201883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315125296
49	NC_014803	TTTGAT	2	12	210992	211003	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	315125305
50	NC_014803	TGACGA	2	12	211114	211125	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	315125305
51	NC_014803	AGCCAG	2	12	212495	212506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315125307
52	NC_014803	AAAAGC	2	12	213657	213668	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	315125308
53	NC_014803	CACCAG	2	12	213803	213814	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	315125308
54	NC_014803	ACCTAC	2	12	215715	215726	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	315125308
55	NC_014803	TTTAGC	2	12	216983	216994	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	315125310
56	NC_014803	TGTATG	2	12	217777	217788	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	315125310
57	NC_014803	TTCACG	2	12	220506	220517	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	315125313
58	NC_014803	GAAGTA	2	12	223670	223681	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	315125317
59	NC_014803	ATTTAA	2	12	224538	224549	50 %	50 %	0 %	0 %	315125317
60	NC_014803	TATCAT	2	12	226594	226605	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	315125319
61	NC_014803	GCCGCT	2	12	228346	228357	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	315125320
62	NC_014803	TAAACT	2	12	229924	229935	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	315125323
63	NC_014803	CTATCG	2	12	236841	236852	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	315125327
64	NC_014803	TTAAAC	2	12	242433	242444	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	315125333
65	NC_014803	AAAATC	2	12	242969	242980	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	315125333
66	NC_014803	CGACTG	2	12	244210	244221	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	315125334
67	NC_014803	CAATAC	2	12	244718	244729	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	315125334
68	NC_014803	CTTTTA	2	12	245390	245401	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	315125334
69	NC_014803	CTGGCG	2	12	251414	251425	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	315125340
70	NC_014803	TATTCA	2	12	254360	254371	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	315125341
71	NC_014803	TACATG	2	12	255552	255563	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	315125341
72	NC_014803	AAGGCG	2	12	257562	257573	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	315125342
73	NC_014803	AGCTGA	2	12	257968	257979	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	315125342
74	NC_014803	TAATCC	2	12	260603	260614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315125343
75	NC_014803	GTTGAA	2	12	262823	262834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315125345
76	NC_014803	CCAGAG	2	12	264115	264126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315125346
77	NC_014803	AATTAG	2	12	270647	270658	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	315125352
78	NC_014803	TTTGTG	2	12	271820	271831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315125353
79	NC_014803	TTTATT	2	12	277214	277225	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	315125357
80	NC_014803	GTAAAC	2	12	279114	279125	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	315125358
81	NC_014803	ACCGAC	2	12	280285	280296	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	315125360
82	NC_014803	TCAATT	2	12	283802	283813	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	315125362
83	NC_014803	TATAAA	2	12	284631	284642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315125362
84	NC_014803	ATTTTA	2	12	286027	286038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315125363
85	NC_014803	GATTAA	2	12	288610	288621	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	315125367
86	NC_014803	CTGCAT	2	12	293239	293250	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	315125370
87	NC_014803	AGGTAA	2	12	295732	295743	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	315125371
88	NC_014803	TAAAGC	2	12	296566	296577	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	315125371
89	NC_014803	TTTATC	2	12	297618	297629	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	315125372
90	NC_014803	TGAAGA	2	12	301465	301476	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	315125377
91	NC_014803	TAAAGT	2	12	303151	303162	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	315125379
92	NC_014803	GAATAT	2	12	303382	303393	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	315125379
93	NC_014803	ATTCAC	2	12	308463	308474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315125383
94	NC_014803	CATGGA	2	12	309217	309228	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	315125385
95	NC_014803	ATCGCC	2	12	311094	311105	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	315125385
96	NC_014803	AGCAAT	2	12	313760	313771	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	315125389
97	NC_014803	AGCAAT	2	12	316889	316900	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	315125391
98	NC_014803	GGTTTT	2	12	318834	318845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315125393
99	NC_014803	TCTTCA	2	12	325039	325050	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	315125398
100	NC_014803	ATCAAT	2	12	325821	325832	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	315125398
101	NC_014803	TCAGAA	2	12	337645	337656	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	315125407
102	NC_014803	ATTGAA	2	12	339107	339118	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	315125408
103	NC_014803	CCAGAA	2	12	341209	341220	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	315125411
104	NC_014803	TTGTGC	2	12	351844	351855	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	315125422
105	NC_014803	TTGCTT	2	12	352385	352396	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	315125423
106	NC_014803	CTTGCT	2	12	355408	355419	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	315125425
107	NC_014803	TAAAGC	2	12	356772	356783	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	315125426
108	NC_014803	TGCGAT	2	12	359575	359586	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	315125427
109	NC_014803	TAATGG	2	12	360591	360602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315125428
110	NC_014803	CAAATG	2	12	360844	360855	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	315125428
111	NC_014803	AAAAAC	2	12	361822	361833	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	315125429
112	NC_014803	TATAGC	2	12	361887	361898	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	315125429
113	NC_014803	TTGATG	2	12	363419	363430	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	315125430
114	NC_014803	TTTAGC	2	12	367871	367882	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	315125435
115	NC_014803	TGGTAG	2	12	371623	371634	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	315125439
116	NC_014803	AATATA	2	12	373250	373261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315125439
117	NC_014803	TTGAAT	2	12	374028	374039	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	315125439
118	NC_014803	GGTTGT	2	12	375330	375341	0 %	50 %	50 %	0 %	315125440
119	NC_014803	AGGTGT	2	12	377072	377083	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	315125441
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223	NC_014803	CCATTG	2	12	736673	736684	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	315125786
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226	NC_014803	CCAATA	2	12	745868	745879	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	315125793
227	NC_014803	AGATGC	2	12	753839	753850	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	315125798
228	NC_014803	TCCTAA	2	12	754749	754760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315125800
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230	NC_014803	TTTATT	2	12	759765	759776	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	315125806
231	NC_014803	TTTGAG	2	12	763162	763173	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	315125807
232	NC_014803	TTATTG	2	12	768867	768878	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	315125813
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235	NC_014803	GTGAAT	2	12	787155	787166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315125824
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334	NC_014803	GAGTGT	2	12	1075729	1075740	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	315126106
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338	NC_014803	GACATT	2	12	1085873	1085884	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	315126116
339	NC_014803	AGCCGA	2	12	1087306	1087317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315126116
340	NC_014803	CTGTTG	2	12	1087675	1087686	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	315126117
341	NC_014803	GCATTG	2	12	1088512	1088523	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	315126118
342	NC_014803	AGCGTG	2	12	1090528	1090539	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	315126120
343	NC_014803	CTTTTT	2	12	1093175	1093186	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	315126123
344	NC_014803	TAAAAA	2	12	1110239	1110250	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	315126137
345	NC_014803	TATTGC	2	12	1111726	1111737	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	315126139
346	NC_014803	AAAGTA	2	12	1112913	1112924	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	315126140
347	NC_014803	ATTCCA	2	12	1114016	1114027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315126142
348	NC_014803	TCAGAG	2	12	1117019	1117030	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	315126143
349	NC_014803	GTTTAA	2	12	1117048	1117059	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	315126143
350	NC_014803	TAAATA	2	12	1117585	1117596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315126143
351	NC_014803	AAATTG	2	12	1125880	1125891	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	315126150
352	NC_014803	CAATAT	2	12	1127064	1127075	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	315126152
353	NC_014803	AGCTTG	2	12	1128633	1128644	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	315126154
354	NC_014803	TTTGGG	2	12	1129802	1129813	0 %	50 %	50 %	0 %	315126155
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357	NC_014803	CAGATC	2	12	1134502	1134513	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	315126158
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362	NC_014803	TGCTAA	2	12	1144662	1144673	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	315126165
363	NC_014803	GTATTT	2	12	1146038	1146049	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	315126167
364	NC_014803	AAAGCC	2	12	1149819	1149830	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	315126173
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366	NC_014803	CAAATG	2	12	1152151	1152162	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	315126174
367	NC_014803	GTTGAG	2	12	1152343	1152354	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	315126175
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369	NC_014803	GCTAAT	2	12	1159167	1159178	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	315126182
370	NC_014803	CTAAAT	2	12	1162764	1162775	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	315126186
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372	NC_014803	TCAGCT	2	12	1169426	1169437	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	315126192
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386	NC_014803	GTTATC	2	12	1201759	1201770	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	315126223
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441	NC_014803	TAAGCA	2	12	1358659	1358670	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	315126348
442	NC_014803	TTAGGC	2	12	1363083	1363094	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	315126352
443	NC_014803	CCCAGG	2	12	1365647	1365658	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	315126354
444	NC_014803	CAAATA	2	12	1366322	1366333	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	315126355
445	NC_014803	TTTCAA	2	12	1371117	1371128	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	315126359
446	NC_014803	TGGTGA	2	12	1375225	1375236	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	315126363
447	NC_014803	AAAGAT	2	12	1379038	1379049	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	315126365
448	NC_014803	CAGCTA	2	12	1379582	1379593	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	315126365
449	NC_014803	CTTACC	2	12	1383843	1383854	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	315126369
450	NC_014803	GTTTTG	2	12	1385419	1385430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315126370
451	NC_014803	TAAAAA	2	12	1385474	1385485	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	315126370
452	NC_014803	TACCTC	2	12	1385675	1385686	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	315126370
453	NC_014803	CGGGTG	2	12	1391094	1391105	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	315126375
454	NC_014803	ATGGTG	2	12	1396281	1396292	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	315126378
455	NC_014803	TGATAG	2	12	1400875	1400886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315126382
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481	NC_014803	GGCGTA	2	12	1498020	1498031	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	315126464
482	NC_014803	GCATTA	2	12	1498286	1498297	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	315126465
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487	NC_014803	CGCTGG	2	12	1522118	1522129	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	315126484
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499	NC_014803	ATCGAC	2	12	1553816	1553827	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	315126514
500	NC_014803	AGCAAA	2	12	1553997	1554008	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	315126514

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