MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni ICDCCJ07001 chromosome

Total Repeats: 179

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014802	TAAAAT	2	12	1455	1466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014802	AATTTA	2	12	19228	19239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014802	TTTTCT	2	12	21617	21628	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_014802	TATTTT	2	12	25431	25442	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014802	CATTTT	2	12	26471	26482	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_014802	TATTTA	2	12	39312	39323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014802	TTTATT	2	12	43128	43139	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014802	TGCGTT	2	12	59557	59568	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014802	TTTAAA	2	12	84445	84456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014802	TTTTTG	2	12	96918	96929	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014802	TTTTAT	2	12	100568	100579	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014802	CTGCTC	2	12	158559	158570	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014802	ATTTTT	2	12	171465	171476	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014802	AGCTTT	2	12	171761	171772	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014802	ATATTA	2	12	177751	177762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014802	AATATT	2	12	177893	177904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014802	AAAGGC	2	12	211349	211360	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014802	GTTTAT	2	12	211613	211624	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014802	TCAAAA	2	12	214137	214148	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014802	TTTGAA	2	12	214315	214326	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014802	TATTTT	2	12	214415	214426	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014802	TTAATT	2	12	229301	229312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014802	TATATT	2	12	229874	229885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014802	AAAAAT	2	12	231278	231289	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014802	TATATT	2	12	246048	246059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014802	TATAAA	2	12	246186	246197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014802	AAATGA	2	12	257085	257096	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014802	TTGATG	2	12	262588	262599	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014802	AAAATT	2	12	274200	274211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014802	ATTTAA	2	12	280639	280650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014802	TATTGA	2	12	285762	285773	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014802	ATTTAT	2	12	318974	318985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014802	GCAAAA	2	12	326273	326284	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014802	TCTCTA	2	12	327623	327634	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014802	ATCAGG	2	12	327670	327681	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_014802	TATTTT	2	12	367721	367732	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014802	TATTTT	2	12	368012	368023	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014802	TGTGTT	2	12	375442	375453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014802	TATTTA	2	12	400338	400349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014802	TTTATT	2	12	404154	404165	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014802	GATGCA	2	12	414201	414212	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014802	TAAAAA	2	12	442796	442807	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014802	AATTTA	2	12	472604	472615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014802	ATAGCT	2	12	484171	484182	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014802	AAAATA	2	12	488968	488979	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014802	ACAAGA	2	12	498632	498643	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014802	AAATGA	2	12	498680	498691	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014802	TTTTAA	2	12	517548	517559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014802	TAAAGC	2	12	521226	521237	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014802	CCTTAT	2	12	522200	522211	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014802	AAAGAA	2	12	542683	542694	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014802	AATTTA	2	12	570711	570722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014802	ATTTTC	2	12	584411	584422	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_014802	TAATAG	2	12	608786	608797	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014802	ATTTAA	2	12	617728	617739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014802	TCAGGA	2	12	623763	623774	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_014802	ATTGCT	2	12	625665	625676	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014802	CTAATG	2	12	625729	625740	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_014802	TTTATT	2	12	627871	627882	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014802	TAAATT	2	12	627940	627951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014802	TGTTAA	2	12	628262	628273	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014802	ATTTTT	2	12	634119	634130	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014802	GGGTGA	2	12	655091	655102	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014802	TTTAAT	2	12	655188	655199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014802	ATAATT	2	12	657736	657747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014802	CTTTCG	2	12	659997	660008	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014802	CTTAAA	2	12	668096	668107	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_014802	AATTTA	2	12	670140	670151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014802	TTTAAA	2	12	670184	670195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014802	TTAATT	2	12	678263	678274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014802	GCTTTA	2	12	689275	689286	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_014802	GAAAAT	2	12	689287	689298	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014802	AGAAAA	2	12	701327	701338	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014802	TTAAAA	2	12	702475	702486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014802	TTAAAT	2	12	716340	716351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014802	TATTTA	2	12	726564	726575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014802	TCTTAT	2	12	730353	730364	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_014802	GGGTTG	2	12	730669	730680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014802	GTTTGG	2	12	730850	730861	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014802	CTTCTA	2	12	732656	732667	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014802	GGAAGT	2	12	743228	743239	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014802	AGCTGA	2	12	743653	743664	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_014802	ACAAAA	2	12	744086	744097	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_014802	GGAAAA	2	12	748447	748458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014802	TTGTAT	2	12	775848	775859	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014802	CACTTT	2	12	783926	783937	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014802	TCTTTT	2	12	784922	784933	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014802	AAATTT	2	12	804093	804104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014802	ATTGGC	2	12	810603	810614	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_014802	AATTTT	2	12	817384	817395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014802	GTATAG	2	12	826672	826683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014802	TTTATA	2	12	828660	828671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014802	TTTATT	2	12	828726	828737	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014802	TGTTGA	2	12	829022	829033	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014802	ATCTTC	2	12	830644	830655	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014802	TAAATT	2	12	832597	832608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014802	ATATTT	2	12	841322	841333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014802	ATTAAA	2	12	842518	842529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014802	AAATTA	2	12	845115	845126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014802	CTAAAG	2	12	855268	855279	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_014802	ACAAAG	2	12	858733	858744	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_014802	TTTTTA	2	12	861210	861221	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014802	TTTTCA	2	12	861780	861791	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_014802	CAGTAG	2	12	884869	884880	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_014802	AATAAA	2	12	907611	907622	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014802	AATTTC	2	12	910160	910171	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_014802	TCAAAT	2	12	913938	913949	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_014802	TAAAAA	2	12	914020	914031	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014802	ATCTTA	2	12	942744	942755	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_014802	ATTATA	2	12	945696	945707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014802	CATTAA	2	12	947147	947158	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_014802	TATAAA	2	12	948413	948424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014802	ATCTTA	2	12	948439	948450	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_014802	ATTTTG	2	12	999561	999572	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014802	TTTTTA	2	12	1009104	1009115	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014802	TAATGC	2	12	1010129	1010140	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_014802	GCATTA	2	12	1010338	1010349	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_014802	TTAAAA	2	12	1043366	1043377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014802	ATTTTG	2	12	1045809	1045820	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014802	GAACAT	2	12	1053282	1053293	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_014802	TAGCCA	2	12	1061890	1061901	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014802	ATTTTA	2	12	1072067	1072078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014802	TAAAAA	2	12	1083400	1083411	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014802	AAATTA	2	12	1083417	1083428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014802	ATAAAA	2	12	1087420	1087431	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014802	AAAGCA	2	12	1106489	1106500	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_014802	AAATTC	2	12	1114012	1114023	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_014802	CTCTGG	2	12	1139326	1139337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014802	TGTTTT	2	12	1144643	1144654	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014802	GACTTG	2	12	1144805	1144816	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_014802	TTTTTG	2	12	1168102	1168113	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014802	TTAATT	2	12	1169055	1169066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014802	ATTTAA	2	12	1180710	1180721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014802	AAAAGA	2	12	1180825	1180836	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014802	AAGCCC	2	12	1182050	1182061	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
136	NC_014802	ACTGAA	2	12	1191461	1191472	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_014802	TTAATT	2	12	1197164	1197175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014802	TAAAAA	2	12	1214963	1214974	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014802	AAATTT	2	12	1227127	1227138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014802	AATTTT	2	12	1232611	1232622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014802	TTTATT	2	12	1247796	1247807	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014802	TAAAAT	2	12	1251909	1251920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014802	TGATTT	2	12	1252063	1252074	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014802	AAAATG	2	12	1290025	1290036	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014802	TTTGTT	2	12	1309140	1309151	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014802	TGAAGA	2	12	1309376	1309387	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014802	CAAAAA	2	12	1342563	1342574	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_014802	TTAATT	2	12	1352616	1352627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014802	TAAAAA	2	12	1361342	1361353	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014802	ATATCA	2	12	1380671	1380682	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_014802	AAAAGG	2	12	1385571	1385582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014802	AAGCTC	2	12	1437467	1437478	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_014802	TTTTCT	2	12	1448671	1448682	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_014802	ACTAAA	2	12	1481750	1481761	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
155	NC_014802	CTTTGT	2	12	1488225	1488236	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_014802	AAAACT	2	12	1488374	1488385	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
157	NC_014802	TTTGAT	2	12	1488963	1488974	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014802	TATAAT	2	12	1490138	1490149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_014802	ATATAA	2	12	1509853	1509864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_014802	TTTTTA	2	12	1517012	1517023	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_014802	ATAAAA	2	12	1517875	1517886	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_014802	CTAAAT	2	12	1521354	1521365	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
163	NC_014802	CTTTTT	2	12	1521405	1521416	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
164	NC_014802	AAAAGT	2	12	1524616	1524627	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
165	NC_014802	AATTGA	2	12	1547905	1547916	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
166	NC_014802	AAAGTA	2	12	1548041	1548052	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
167	NC_014802	TAAAAA	2	12	1551244	1551255	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_014802	GCAAAA	2	12	1584429	1584440	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
169	NC_014802	TAAAAA	2	12	1592488	1592499	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_014802	GAGATA	2	12	1592526	1592537	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
171	NC_014802	TAGAAC	2	12	1592925	1592936	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
172	NC_014802	AAATCA	2	12	1594634	1594645	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
173	NC_014802	TTTTTG	2	12	1598879	1598890	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
174	NC_014802	TATCTT	2	12	1602638	1602649	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
175	NC_014802	ATTTTT	2	12	1609464	1609475	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_014802	ATAAAA	2	12	1634851	1634862	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_014802	TAAAAA	2	12	1650345	1650356	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_014802	TAAAAT	2	12	1661283	1661294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_014802	AAGCCT	2	12	1661387	1661398	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.