MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni ICDCCJ07001 chromosome

Total Repeats: 325

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014802	TTTTA	2	10	6526	6535	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014802	TAAAA	2	10	6618	6627	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014802	AAAAT	2	10	17916	17925	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014802	ACCAA	2	10	21599	21608	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_014802	AAAAT	2	10	21740	21749	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014802	GTTAA	2	10	21767	21776	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014802	TTTTA	2	10	25476	25485	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014802	TATAT	2	10	36863	36872	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014802	CTTTT	2	10	37152	37161	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014802	CTTTT	2	10	37323	37332	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014802	GGTAA	2	10	37634	37643	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014802	TCGTG	2	10	38430	38439	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014802	TCTTT	2	10	39459	39468	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014802	CCGTA	2	10	41406	41415	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_014802	ATTAT	2	10	43469	43478	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014802	AAAAT	2	10	73332	73341	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014802	ATTAC	2	10	73689	73698	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014802	AAAAT	2	10	74589	74598	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014802	TCTCT	2	10	79989	79998	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_014802	TAGGA	2	10	86726	86735	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014802	AAAAT	2	10	86752	86761	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014802	ATTTT	2	10	86762	86771	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014802	CAAAA	2	10	88113	88122	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014802	TAAAA	3	15	88165	88179	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014802	TTAAT	2	10	89532	89541	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014802	TATTT	2	10	89600	89609	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014802	GTATA	2	10	89616	89625	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014802	TTAAA	2	10	94358	94367	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014802	CTTGA	2	10	96669	96678	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_014802	TTGGC	2	10	99730	99739	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014802	AAGAT	2	10	99817	99826	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014802	TTATT	2	10	101533	101542	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014802	TTAAA	2	10	102559	102568	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014802	CTTTG	2	10	111129	111138	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_014802	TAGTA	2	10	123235	123244	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014802	TAAAA	2	10	146786	146795	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014802	TATTT	2	10	157821	157830	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014802	GGTTT	2	10	158205	158214	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014802	TTATT	2	10	172032	172041	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014802	AAAGC	2	10	177673	177682	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_014802	TATTT	2	10	184303	184312	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014802	TTTTC	2	10	186097	186106	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014802	TAAAA	2	10	194493	194502	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014802	AAAAT	2	10	198661	198670	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014802	AAGTG	2	10	201545	201554	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014802	AGGAT	2	10	202732	202741	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014802	TAAAA	2	10	204090	204099	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014802	GTGTA	2	10	211656	211665	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014802	TCATT	2	10	228994	229003	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014802	CGTTG	2	10	229250	229259	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_014802	AAAAT	2	10	229386	229395	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014802	AAATT	2	10	231217	231226	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014802	CTTTT	2	10	231262	231271	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_014802	AAAAT	2	10	231363	231372	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014802	CATAA	2	10	239725	239734	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_014802	AAAGC	2	10	243103	243112	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_014802	ATATT	2	10	250595	250604	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014802	ATTAA	2	10	253873	253882	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014802	CAAAG	2	10	254142	254151	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_014802	TTAAT	2	10	255789	255798	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014802	ATAAA	2	10	274153	274162	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014802	AAATT	2	10	277973	277982	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014802	CATTT	2	10	285547	285556	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_014802	CAAAT	2	10	301064	301073	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_014802	CTCTT	2	10	304777	304786	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_014802	TTAAA	2	10	305652	305661	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014802	TTTTA	2	10	324572	324581	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014802	ATCTT	2	10	326288	326297	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_014802	AGAAT	2	10	334922	334931	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014802	ATTAA	2	10	340648	340657	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014802	ATTAA	2	10	343140	343149	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014802	TAAAA	2	10	349477	349486	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014802	AATTT	2	10	366376	366385	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014802	ATTTT	2	10	367510	367519	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014802	ATTTT	2	10	380224	380233	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014802	AAAAT	2	10	380713	380722	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014802	AAATT	2	10	381598	381607	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014802	CTTTT	2	10	398179	398188	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_014802	CTTTT	2	10	398350	398359	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_014802	GGTAA	2	10	398661	398670	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014802	TCGTG	2	10	399457	399466	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_014802	TCTTT	2	10	400485	400494	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_014802	CCGTA	2	10	402432	402441	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_014802	AGTTA	2	10	408439	408448	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014802	CTTAT	2	10	409534	409543	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_014802	ATTTT	2	10	414060	414069	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014802	CTTTT	2	10	420638	420647	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_014802	TAAAT	2	10	435343	435352	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014802	TTGCT	2	10	438705	438714	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_014802	TAAAT	2	10	442818	442827	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014802	GATTT	2	10	452541	452550	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014802	TTTTA	2	10	460085	460094	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014802	CTTTT	2	10	461851	461860	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_014802	TACCT	2	10	498599	498608	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_014802	AAAAT	2	10	505010	505019	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014802	GTTTT	2	10	508103	508112	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014802	AAATA	2	10	508412	508421	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014802	CATTC	2	10	509130	509139	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
99	NC_014802	TTTAA	2	10	509165	509174	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014802	AATTT	2	10	515109	515118	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014802	TTTTA	2	10	517418	517427	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014802	AAAAT	2	10	517452	517461	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014802	AATTA	2	10	519915	519924	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014802	AATAT	2	10	522212	522221	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014802	TTTGA	2	10	534624	534633	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014802	ATTTG	2	10	535785	535794	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014802	GTAAG	2	10	541602	541611	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014802	TAAAA	2	10	549650	549659	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014802	CAAAA	2	10	570771	570780	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_014802	TGTAG	2	10	572260	572269	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014802	GAAAA	2	10	579405	579414	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014802	AAGGC	2	10	584230	584239	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_014802	ATGAT	2	10	584796	584805	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014802	GAAAA	2	10	589241	589250	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014802	TTTGC	2	10	592762	592771	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_014802	TGATT	2	10	607422	607431	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014802	AATTA	2	10	608804	608813	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014802	GCTTA	2	10	610390	610399	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_014802	ATCAC	2	10	611124	611133	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_014802	TGATT	2	10	611221	611230	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014802	TTTAA	2	10	617787	617796	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014802	CTTTG	2	10	619445	619454	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_014802	TACAA	2	10	623597	623606	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_014802	AATCA	2	10	628154	628163	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_014802	ATTTA	2	10	632170	632179	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014802	TAAAA	3	15	644454	644468	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014802	ATAAA	2	10	645278	645287	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014802	ATTTA	2	10	646864	646873	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014802	TTTAA	2	10	654192	654201	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014802	GTTTT	2	10	654484	654493	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014802	AAAAT	2	10	668030	668039	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014802	AAAAT	2	10	668051	668060	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014802	ATTTT	2	10	668077	668086	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014802	AAACT	2	10	670411	670420	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_014802	TTAAA	2	10	673377	673386	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014802	TCGCT	2	10	673417	673426	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_014802	AAGAA	2	10	673871	673880	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014802	ATTTT	2	10	678246	678255	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014802	ATATT	2	10	678337	678346	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014802	ACTAT	2	10	679875	679884	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_014802	TTTTA	2	10	689187	689196	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014802	CTTTA	2	10	691108	691117	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_014802	ATTTT	2	10	701534	701543	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014802	TTACT	2	10	703669	703678	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_014802	TTTTG	2	10	703691	703700	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014802	ATTTT	2	10	704433	704442	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014802	TATTT	2	10	706570	706579	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014802	AAAAG	2	10	707115	707124	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014802	TAAAA	2	10	716287	716296	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014802	AAAAT	2	10	716357	716366	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014802	ATTTT	2	10	716378	716387	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014802	ATTTT	2	10	716450	716459	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_014802	CTTTT	2	10	724575	724584	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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183	NC_014802	TTTTA	2	10	845294	845303	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_014802	AAAAT	2	10	858805	858814	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_014802	ATTTA	2	10	861614	861623	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_014802	TACAA	2	10	1451670	1451679	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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287	NC_014802	TAAAA	3	15	1490273	1490287	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_014802	ATACT	2	10	1507560	1507569	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
289	NC_014802	AAATT	2	10	1510958	1510967	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_014802	ATTTT	2	10	1511195	1511204	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_014802	ATTTT	2	10	1511371	1511380	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_014802	AATTT	2	10	1511605	1511614	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_014802	ATTTT	2	10	1514090	1514099	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_014802	ATTTT	2	10	1514180	1514189	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_014802	TAAAA	2	10	1516782	1516791	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_014802	TAAAA	2	10	1517002	1517011	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_014802	TTAAT	2	10	1517070	1517079	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
298	NC_014802	TTTAA	2	10	1520135	1520144	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_014802	AAATT	2	10	1535766	1535775	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_014802	CAAAA	2	10	1538500	1538509	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
301	NC_014802	CAAAA	2	10	1538863	1538872	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
302	NC_014802	TAAAA	2	10	1540499	1540508	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
303	NC_014802	TAAAA	2	10	1566562	1566571	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
304	NC_014802	TATTT	2	10	1566714	1566723	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
305	NC_014802	AAATT	2	10	1574720	1574729	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
306	NC_014802	ACTTT	2	10	1575841	1575850	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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319	NC_014802	AATAA	2	10	1634877	1634886	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
320	NC_014802	TTTAA	2	10	1639385	1639394	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
321	NC_014802	TATCA	2	10	1641932	1641941	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
322	NC_014802	ATTTT	2	10	1650407	1650416	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
323	NC_014802	AAAAT	2	10	1656010	1656019	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
324	NC_014802	TATAT	2	10	1657593	1657602	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
325	NC_014802	ATATT	2	10	1658165	1658174	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.