MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni ICDCCJ07001 plasmid pTet

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014801	CGCTA	2	10	3125	3134	20 %	20 %	20 %	40 %	315123583
2	NC_014801	AAAGC	2	10	4859	4868	60 %	0 %	20 %	20 %	315123583
3	NC_014801	CAATT	2	10	6172	6181	40 %	40 %	0 %	20 %	315123583
4	NC_014801	AAAGC	2	10	7293	7302	60 %	0 %	20 %	20 %	315123583
5	NC_014801	AAGGC	2	10	7697	7706	40 %	0 %	40 %	20 %	315123583
6	NC_014801	AAAAG	2	10	8078	8087	80 %	0 %	20 %	0 %	315123583
7	NC_014801	GTCTT	2	10	8437	8446	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014801	AAAGC	2	10	10224	10233	60 %	0 %	20 %	20 %	315123585
9	NC_014801	AAAAT	2	10	12019	12028	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014801	ATTTT	2	10	12108	12117	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014801	TGAAA	2	10	12294	12303	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014801	CAAAT	2	10	12973	12982	60 %	20 %	0 %	20 %	315123586
13	NC_014801	ATTTA	2	10	14357	14366	40 %	60 %	0 %	0 %	315123587
14	NC_014801	AATTT	2	10	15972	15981	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014801	ATAAA	2	10	16026	16035	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014801	CTCTT	2	10	18484	18493	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_014801	ATTAA	2	10	21220	21229	60 %	40 %	0 %	0 %	315123591
18	NC_014801	AAATC	2	10	22620	22629	60 %	20 %	0 %	20 %	315123594
19	NC_014801	ACAAA	2	10	22995	23004	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_014801	AATTA	2	10	23005	23014	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014801	AAAAT	2	10	23079	23088	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014801	TAACT	2	10	26397	26406	40 %	40 %	0 %	20 %	315123596
23	NC_014801	TATTT	2	10	29990	29999	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014801	TTGTA	2	10	32347	32356	20 %	60 %	20 %	0 %	315123603
25	NC_014801	TTTGT	2	10	34048	34057	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014801	TCTTA	2	10	34732	34741	20 %	60 %	0 %	20 %	315123605
27	NC_014801	TTATT	2	10	35003	35012	20 %	80 %	0 %	0 %	315123606
28	NC_014801	GTAAA	2	10	35604	35613	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014801	ATTTT	2	10	36045	36054	20 %	80 %	0 %	0 %	315123607
30	NC_014801	TCGTT	2	10	37317	37326	0 %	60 %	20 %	20 %	315123609
31	NC_014801	TGAAA	2	10	38253	38262	60 %	20 %	20 %	0 %	315123610
32	NC_014801	CAAAA	2	10	40319	40328	80 %	0 %	0 %	20 %	315123612
33	NC_014801	TGACA	2	10	40909	40918	40 %	20 %	20 %	20 %	315123612
34	NC_014801	GCAAT	2	10	41083	41092	40 %	20 %	20 %	20 %	315123612
35	NC_014801	AAACA	2	10	41205	41214	80 %	0 %	0 %	20 %	315123612
36	NC_014801	GCAAT	2	10	41249	41258	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_014801	AAAAG	2	10	41523	41532	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014801	GCAAA	2	10	41789	41798	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014801	GAAAA	2	10	41864	41873	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014801	AAATT	2	10	43356	43365	60 %	40 %	0 %	0 %	315123615

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.