MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni ICDCCJ07001 plasmid pTet

Total Repeats: 114

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014801	GATT	2	8	364	371	25 %	50 %	25 %	0 %	315123580
2	NC_014801	ATTT	2	8	737	744	25 %	75 %	0 %	0 %	315123581
3	NC_014801	AAAG	2	8	1789	1796	75 %	0 %	25 %	0 %	315123582
4	NC_014801	ATAA	2	8	2124	2131	75 %	25 %	0 %	0 %	315123582
5	NC_014801	GAAC	2	8	2600	2607	50 %	0 %	25 %	25 %	315123583
6	NC_014801	AAAT	2	8	2845	2852	75 %	25 %	0 %	0 %	315123583
7	NC_014801	TCAA	2	8	2854	2861	50 %	25 %	0 %	25 %	315123583
8	NC_014801	ATCT	2	8	3044	3051	25 %	50 %	0 %	25 %	315123583
9	NC_014801	AGAT	2	8	3064	3071	50 %	25 %	25 %	0 %	315123583
10	NC_014801	TAAA	2	8	3156	3163	75 %	25 %	0 %	0 %	315123583
11	NC_014801	ATTT	2	8	3540	3547	25 %	75 %	0 %	0 %	315123583
12	NC_014801	TAAG	2	8	4209	4216	50 %	25 %	25 %	0 %	315123583
13	NC_014801	CAAA	2	8	4515	4522	75 %	0 %	0 %	25 %	315123583
14	NC_014801	ACAA	2	8	5013	5020	75 %	0 %	0 %	25 %	315123583
15	NC_014801	ATTT	2	8	5061	5068	25 %	75 %	0 %	0 %	315123583
16	NC_014801	ATTT	2	8	5169	5176	25 %	75 %	0 %	0 %	315123583
17	NC_014801	TAAA	2	8	5580	5587	75 %	25 %	0 %	0 %	315123583
18	NC_014801	AACA	2	8	5835	5842	75 %	0 %	0 %	25 %	315123583
19	NC_014801	ATTA	2	8	5995	6002	50 %	50 %	0 %	0 %	315123583
20	NC_014801	AATT	2	8	6310	6317	50 %	50 %	0 %	0 %	315123583
21	NC_014801	ACTT	2	8	6591	6598	25 %	50 %	0 %	25 %	315123583
22	NC_014801	TAAA	2	8	6825	6832	75 %	25 %	0 %	0 %	315123583
23	NC_014801	TAAA	2	8	8208	8215	75 %	25 %	0 %	0 %	315123583
24	NC_014801	GATT	2	8	10193	10200	25 %	50 %	25 %	0 %	315123585
25	NC_014801	CTTT	2	8	10953	10960	0 %	75 %	0 %	25 %	315123585
26	NC_014801	AATC	2	8	11199	11206	50 %	25 %	0 %	25 %	315123585
27	NC_014801	ATGG	2	8	11260	11267	25 %	25 %	50 %	0 %	315123585
28	NC_014801	CCAG	2	8	11621	11628	25 %	0 %	25 %	50 %	315123585
29	NC_014801	ATTT	2	8	11639	11646	25 %	75 %	0 %	0 %	315123585
30	NC_014801	ATTA	2	8	13306	13313	50 %	50 %	0 %	0 %	315123586
31	NC_014801	ATCC	2	8	13380	13387	25 %	25 %	0 %	50 %	315123586
32	NC_014801	TTTC	2	8	13866	13873	0 %	75 %	0 %	25 %	315123587
33	NC_014801	CTTT	2	8	14099	14106	0 %	75 %	0 %	25 %	315123587
34	NC_014801	ATTT	2	8	14381	14388	25 %	75 %	0 %	0 %	315123587
35	NC_014801	CCTT	2	8	14700	14707	0 %	50 %	0 %	50 %	315123587
36	NC_014801	TAAT	2	8	14797	14804	50 %	50 %	0 %	0 %	315123587
37	NC_014801	ATTT	2	8	15169	15176	25 %	75 %	0 %	0 %	315123588
38	NC_014801	ATTT	2	8	15438	15445	25 %	75 %	0 %	0 %	315123588
39	NC_014801	GTTT	2	8	15538	15545	0 %	75 %	25 %	0 %	315123588
40	NC_014801	ATTC	2	8	15613	15620	25 %	50 %	0 %	25 %	315123588
41	NC_014801	TAAA	2	8	16219	16226	75 %	25 %	0 %	0 %	315123589
42	NC_014801	TAAT	2	8	16384	16391	50 %	50 %	0 %	0 %	315123589
43	NC_014801	TGAA	2	8	16648	16655	50 %	25 %	25 %	0 %	315123589
44	NC_014801	TAAA	2	8	16672	16679	75 %	25 %	0 %	0 %	315123589
45	NC_014801	ATGG	2	8	17000	17007	25 %	25 %	50 %	0 %	315123590
46	NC_014801	GTGA	2	8	17840	17847	25 %	25 %	50 %	0 %	315123590
47	NC_014801	TTCG	2	8	20241	20248	0 %	50 %	25 %	25 %	315123591
48	NC_014801	GCTT	2	8	20282	20289	0 %	50 %	25 %	25 %	315123591
49	NC_014801	AATG	2	8	20487	20494	50 %	25 %	25 %	0 %	315123591
50	NC_014801	ATTT	2	8	21332	21339	25 %	75 %	0 %	0 %	315123591
51	NC_014801	GATA	2	8	21666	21673	50 %	25 %	25 %	0 %	315123592
52	NC_014801	ATTA	2	8	21942	21949	50 %	50 %	0 %	0 %	315123592
53	NC_014801	AATT	2	8	22564	22571	50 %	50 %	0 %	0 %	315123593
54	NC_014801	AATC	2	8	22692	22699	50 %	25 %	0 %	25 %	315123594
55	NC_014801	AATT	2	8	23713	23720	50 %	50 %	0 %	0 %	315123595
56	NC_014801	CAAA	2	8	24916	24923	75 %	0 %	0 %	25 %	315123595
57	NC_014801	TAAA	2	8	24961	24968	75 %	25 %	0 %	0 %	315123595
58	NC_014801	ATTT	2	8	25131	25138	25 %	75 %	0 %	0 %	315123595
59	NC_014801	GAAA	2	8	25380	25387	75 %	0 %	25 %	0 %	315123595
60	NC_014801	ATTT	2	8	25540	25547	25 %	75 %	0 %	0 %	315123595
61	NC_014801	TTAA	2	8	25941	25948	50 %	50 %	0 %	0 %	315123595
62	NC_014801	TTAT	2	8	26558	26565	25 %	75 %	0 %	0 %	315123596
63	NC_014801	TAAT	2	8	26842	26849	50 %	50 %	0 %	0 %	315123597
64	NC_014801	ATCA	2	8	27147	27154	50 %	25 %	0 %	25 %	315123597
65	NC_014801	CAAT	2	8	27539	27546	50 %	25 %	0 %	25 %	315123598
66	NC_014801	AAAG	2	8	28791	28798	75 %	0 %	25 %	0 %	315123599
67	NC_014801	AATG	2	8	29002	29009	50 %	25 %	25 %	0 %	315123599
68	NC_014801	ACTT	2	8	29185	29192	25 %	50 %	0 %	25 %	315123600
69	NC_014801	ATGG	2	8	29270	29277	25 %	25 %	50 %	0 %	315123600
70	NC_014801	GGAT	2	8	29648	29655	25 %	25 %	50 %	0 %	315123600
71	NC_014801	TACT	2	8	30260	30267	25 %	50 %	0 %	25 %	315123601
72	NC_014801	TACT	2	8	30449	30456	25 %	50 %	0 %	25 %	315123601
73	NC_014801	AAGT	2	8	30548	30555	50 %	25 %	25 %	0 %	315123601
74	NC_014801	TTTA	2	8	31022	31029	25 %	75 %	0 %	0 %	315123602
75	NC_014801	TAAA	2	8	31309	31316	75 %	25 %	0 %	0 %	315123602
76	NC_014801	AAAG	2	8	31470	31477	75 %	0 %	25 %	0 %	315123602
77	NC_014801	ATAA	2	8	31656	31663	75 %	25 %	0 %	0 %	315123602
78	NC_014801	TGGG	2	8	31809	31816	0 %	25 %	75 %	0 %	315123603
79	NC_014801	TGAT	2	8	32742	32749	25 %	50 %	25 %	0 %	315123603
80	NC_014801	ATTT	2	8	33816	33823	25 %	75 %	0 %	0 %	315123604
81	NC_014801	TTTA	3	12	34378	34389	25 %	75 %	0 %	0 %	315123605
82	NC_014801	TTAT	2	8	34548	34555	25 %	75 %	0 %	0 %	315123605
83	NC_014801	TTAT	2	8	34565	34572	25 %	75 %	0 %	0 %	315123605
84	NC_014801	TACA	2	8	34721	34728	50 %	25 %	0 %	25 %	315123605
85	NC_014801	ATTT	2	8	34974	34981	25 %	75 %	0 %	0 %	315123606
86	NC_014801	CTAT	2	8	35102	35109	25 %	50 %	0 %	25 %	315123606
87	NC_014801	ATCA	2	8	35162	35169	50 %	25 %	0 %	25 %	315123606
88	NC_014801	CAAG	2	8	36287	36294	50 %	0 %	25 %	25 %	315123608
89	NC_014801	AGTT	2	8	36705	36712	25 %	50 %	25 %	0 %	315123608
90	NC_014801	CTTA	2	8	37459	37466	25 %	50 %	0 %	25 %	315123609
91	NC_014801	AAAG	2	8	37495	37502	75 %	0 %	25 %	0 %	315123609
92	NC_014801	TGAA	2	8	37644	37651	50 %	25 %	25 %	0 %	315123609
93	NC_014801	ACAA	2	8	37768	37775	75 %	0 %	0 %	25 %	315123610
94	NC_014801	AAGG	2	8	37795	37802	50 %	0 %	50 %	0 %	315123610
95	NC_014801	AATT	2	8	38078	38085	50 %	50 %	0 %	0 %	315123610
96	NC_014801	ATTT	2	8	38704	38711	25 %	75 %	0 %	0 %	315123611
97	NC_014801	GTAG	2	8	39764	39771	25 %	25 %	50 %	0 %	315123612
98	NC_014801	AATT	2	8	39973	39980	50 %	50 %	0 %	0 %	315123612
99	NC_014801	AATT	2	8	40429	40436	50 %	50 %	0 %	0 %	315123612
100	NC_014801	TATC	2	8	40563	40570	25 %	50 %	0 %	25 %	315123612
101	NC_014801	CAAA	2	8	40622	40629	75 %	0 %	0 %	25 %	315123612
102	NC_014801	AAGT	2	8	40821	40828	50 %	25 %	25 %	0 %	315123612
103	NC_014801	TTAA	2	8	40874	40881	50 %	50 %	0 %	0 %	315123612
104	NC_014801	AAAC	2	8	41059	41066	75 %	0 %	0 %	25 %	315123612
105	NC_014801	AGCA	3	12	41215	41226	50 %	0 %	25 %	25 %	315123612
106	NC_014801	TAAT	2	8	42157	42164	50 %	50 %	0 %	0 %	315123613
107	NC_014801	TCTT	2	8	42197	42204	0 %	75 %	0 %	25 %	315123613
108	NC_014801	TTTG	2	8	42366	42373	0 %	75 %	25 %	0 %	315123614
109	NC_014801	TCAA	2	8	42383	42390	50 %	25 %	0 %	25 %	315123614
110	NC_014801	GATT	2	8	42534	42541	25 %	50 %	25 %	0 %	315123614
111	NC_014801	ACAA	2	8	43108	43115	75 %	0 %	0 %	25 %	315123615
112	NC_014801	TAGA	2	8	43228	43235	50 %	25 %	25 %	0 %	315123615
113	NC_014801	AAAT	2	8	43321	43328	75 %	25 %	0 %	0 %	315123615
114	NC_014801	ATTT	2	8	43373	43380	25 %	75 %	0 %	0 %	315123615

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.