MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni ICDCCJ07001 plasmid pTet

Total Repeats: 123

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014801	CTA	2	6	500	505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014801	TAA	2	6	512	517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014801	TAA	2	6	529	534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014801	ATA	2	6	575	580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014801	TAG	2	6	1038	1043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014801	TTA	2	6	1152	1157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014801	AGA	2	6	1207	1212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014801	TAA	2	6	1238	1243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014801	AAT	2	6	1260	1265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014801	TAA	2	6	1340	1345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014801	ATG	2	6	1357	1362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014801	TTA	2	6	1380	1385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014801	GAA	2	6	1440	1445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014801	TTA	2	6	1515	1520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014801	AAG	2	6	2250	2255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014801	TAG	2	6	2264	2269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014801	TTA	2	6	8271	8276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014801	TTC	2	6	8364	8369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014801	TCT	2	6	8380	8385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014801	GCT	2	6	8392	8397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014801	TTC	3	9	8402	8410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014801	GCT	2	6	8428	8433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014801	TCA	2	6	8558	8563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014801	TTC	2	6	8634	8639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014801	ACC	2	6	8646	8651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_014801	TCT	2	6	9215	9220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014801	ATT	2	6	9411	9416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014801	GAT	2	6	9429	9434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014801	TAT	2	6	9521	9526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014801	TAA	2	6	9536	9541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014801	AGG	2	6	9778	9783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014801	ATG	2	6	11763	11768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014801	TAA	2	6	11813	11818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014801	GAT	2	6	11852	11857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014801	CGC	2	6	11971	11976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_014801	ATC	2	6	11978	11983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014801	GTT	2	6	12001	12006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014801	ATA	2	6	12247	12252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014801	TTA	2	6	12589	12594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014801	ATT	2	6	12623	12628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014801	AAT	2	6	13587	13592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014801	ATA	2	6	13608	13613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014801	ATA	2	6	13644	13649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014801	ATT	2	6	15713	15718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014801	ATT	2	6	15739	15744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014801	ACT	2	6	15765	15770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014801	ATA	2	6	15776	15781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014801	AGA	2	6	15835	15840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014801	ATG	2	6	15855	15860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014801	TAA	2	6	18038	18043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014801	TAT	2	6	18049	18054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014801	TTA	2	6	18124	18129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014801	AAT	2	6	18459	18464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014801	TTA	2	6	18494	18499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014801	TAA	2	6	18735	18740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014801	TAA	2	6	18901	18906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014801	ATT	2	6	18996	19001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014801	ATT	2	6	19017	19022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014801	TTG	2	6	19071	19076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014801	TGC	2	6	19135	19140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014801	ATC	2	6	19216	19221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014801	ATT	3	9	19254	19262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014801	GAA	2	6	19335	19340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014801	AAG	2	6	19357	19362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014801	GAA	2	6	19395	19400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014801	ATT	2	6	19407	19412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014801	ATT	2	6	19431	19436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014801	AAG	2	6	19481	19486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014801	AAC	2	6	19619	19624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014801	CTT	2	6	21502	21507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014801	TTA	2	6	21534	21539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014801	TCA	2	6	22918	22923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014801	AAT	2	6	22977	22982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014801	TAA	3	9	23025	23033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014801	TTA	2	6	23103	23108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014801	TGG	2	6	23132	23137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014801	TGG	2	6	23192	23197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014801	CAA	2	6	27280	27285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014801	AGA	2	6	27761	27766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014801	TTC	2	6	27836	27841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014801	AAT	2	6	27872	27877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014801	TCT	2	6	27921	27926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014801	AAG	2	6	27934	27939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014801	ATG	2	6	30049	30054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014801	AAT	2	6	30063	30068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014801	ATA	2	6	33850	33855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014801	AAT	2	6	33947	33952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014801	AAT	2	6	34168	34173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014801	AAG	2	6	34244	34249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014801	CAA	2	6	35544	35549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014801	AGA	2	6	35578	35583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014801	TTA	3	9	38380	38388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014801	TTA	2	6	38390	38395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014801	ATA	2	6	38408	38413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014801	TAA	2	6	39104	39109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014801	TAA	2	6	39120	39125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014801	TAT	2	6	39127	39132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014801	TAA	2	6	39147	39152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014801	TGG	3	9	41301	41309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014801	TAT	2	6	41346	41351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014801	ATA	2	6	41373	41378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014801	TAA	2	6	41391	41396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014801	TAA	2	6	41431	41436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014801	ATA	2	6	41437	41442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014801	TAA	2	6	41448	41453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014801	TAT	2	6	41575	41580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014801	TAT	2	6	41654	41659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014801	ATA	2	6	41733	41738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014801	ATG	2	6	41885	41890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014801	ATG	2	6	41900	41905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014801	TAT	2	6	41918	41923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014801	ATT	2	6	43411	43416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014801	AGA	2	6	43427	43432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014801	AGA	2	6	43460	43465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014801	GAA	2	6	43620	43625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014801	AAG	2	6	43680	43685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014801	ATG	2	6	43809	43814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014801	ATA	2	6	43823	43828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014801	AGA	2	6	43915	43920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014801	AGA	2	6	43930	43935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014801	TAT	2	6	44015	44020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014801	TGA	2	6	44055	44060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014801	ATA	2	6	44064	44069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.