MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni ICDCCJ07001 plasmid pTet

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014801	AT	3	6	332	337	50 %	50 %	0 %	0 %	315123580
2	NC_014801	AT	4	8	541	548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014801	TA	3	6	582	587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014801	TA	4	8	590	597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014801	TC	4	8	882	889	0 %	50 %	0 %	50 %	315123581
6	NC_014801	TA	3	6	1532	1537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014801	TA	3	6	2347	2352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014801	AG	3	6	2675	2680	50 %	0 %	50 %	0 %	315123583
9	NC_014801	AG	3	6	2800	2805	50 %	0 %	50 %	0 %	315123583
10	NC_014801	AT	3	6	3483	3488	50 %	50 %	0 %	0 %	315123583
11	NC_014801	TA	3	6	3749	3754	50 %	50 %	0 %	0 %	315123583
12	NC_014801	TA	4	8	5470	5477	50 %	50 %	0 %	0 %	315123583
13	NC_014801	AC	3	6	5756	5761	50 %	0 %	0 %	50 %	315123583
14	NC_014801	AT	3	6	6118	6123	50 %	50 %	0 %	0 %	315123583
15	NC_014801	AT	3	6	6205	6210	50 %	50 %	0 %	0 %	315123583
16	NC_014801	CA	3	6	6739	6744	50 %	0 %	0 %	50 %	315123583
17	NC_014801	TA	3	6	6930	6935	50 %	50 %	0 %	0 %	315123583
18	NC_014801	GA	3	6	7210	7215	50 %	0 %	50 %	0 %	315123583
19	NC_014801	AT	3	6	7559	7564	50 %	50 %	0 %	0 %	315123583
20	NC_014801	AC	3	6	7827	7832	50 %	0 %	0 %	50 %	315123583
21	NC_014801	TA	3	6	7890	7895	50 %	50 %	0 %	0 %	315123583
22	NC_014801	CT	3	6	8370	8375	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014801	CT	3	6	8628	8633	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_014801	AT	3	6	8750	8755	50 %	50 %	0 %	0 %	315123584
25	NC_014801	AT	3	6	8800	8805	50 %	50 %	0 %	0 %	315123584
26	NC_014801	AT	3	6	10355	10360	50 %	50 %	0 %	0 %	315123585
27	NC_014801	TA	4	8	10598	10605	50 %	50 %	0 %	0 %	315123585
28	NC_014801	TG	3	6	10672	10677	0 %	50 %	50 %	0 %	315123585
29	NC_014801	TA	4	8	11045	11052	50 %	50 %	0 %	0 %	315123585
30	NC_014801	TC	3	6	11441	11446	0 %	50 %	0 %	50 %	315123585
31	NC_014801	TG	3	6	11992	11997	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014801	AG	3	6	12183	12188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014801	AC	4	8	12413	12420	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014801	TA	3	6	12443	12448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014801	TC	3	6	12660	12665	0 %	50 %	0 %	50 %	315123586
36	NC_014801	AT	3	6	12727	12732	50 %	50 %	0 %	0 %	315123586
37	NC_014801	TA	3	6	13038	13043	50 %	50 %	0 %	0 %	315123586
38	NC_014801	TA	3	6	13630	13635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014801	AT	3	6	13668	13673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014801	CT	3	6	13924	13929	0 %	50 %	0 %	50 %	315123587
41	NC_014801	TC	4	8	13950	13957	0 %	50 %	0 %	50 %	315123587
42	NC_014801	GT	3	6	13976	13981	0 %	50 %	50 %	0 %	315123587
43	NC_014801	AT	4	8	15214	15221	50 %	50 %	0 %	0 %	315123588
44	NC_014801	TA	3	6	15553	15558	50 %	50 %	0 %	0 %	315123588
45	NC_014801	TA	4	8	15907	15914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014801	AT	3	6	16292	16297	50 %	50 %	0 %	0 %	315123589
47	NC_014801	TA	3	6	17593	17598	50 %	50 %	0 %	0 %	315123590
48	NC_014801	AT	3	6	18005	18010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014801	AT	3	6	18025	18030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014801	AG	3	6	18348	18353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014801	TA	3	6	20681	20686	50 %	50 %	0 %	0 %	315123591
52	NC_014801	TC	3	6	20837	20842	0 %	50 %	0 %	50 %	315123591
53	NC_014801	AT	3	6	21003	21008	50 %	50 %	0 %	0 %	315123591
54	NC_014801	AT	3	6	21372	21377	50 %	50 %	0 %	0 %	315123591
55	NC_014801	TA	3	6	21487	21492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014801	AT	3	6	22171	22176	50 %	50 %	0 %	0 %	315123592
57	NC_014801	TA	4	8	22707	22714	50 %	50 %	0 %	0 %	315123594
58	NC_014801	AT	3	6	25187	25192	50 %	50 %	0 %	0 %	315123595
59	NC_014801	CA	3	6	25244	25249	50 %	0 %	0 %	50 %	315123595
60	NC_014801	TA	3	6	26791	26796	50 %	50 %	0 %	0 %	315123597
61	NC_014801	CT	3	6	27072	27077	0 %	50 %	0 %	50 %	315123597
62	NC_014801	AC	3	6	27078	27083	50 %	0 %	0 %	50 %	315123597
63	NC_014801	AT	3	6	28497	28502	50 %	50 %	0 %	0 %	315123599
64	NC_014801	AG	3	6	28986	28991	50 %	0 %	50 %	0 %	315123599
65	NC_014801	CA	3	6	29485	29490	50 %	0 %	0 %	50 %	315123600
66	NC_014801	GT	3	6	30004	30009	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014801	GA	3	6	31084	31089	50 %	0 %	50 %	0 %	315123602
68	NC_014801	AG	3	6	31650	31655	50 %	0 %	50 %	0 %	315123602
69	NC_014801	GA	3	6	33834	33839	50 %	0 %	50 %	0 %	315123604
70	NC_014801	TA	3	6	34936	34941	50 %	50 %	0 %	0 %	315123606
71	NC_014801	AG	3	6	35266	35271	50 %	0 %	50 %	0 %	315123606
72	NC_014801	CA	3	6	35902	35907	50 %	0 %	0 %	50 %	315123607
73	NC_014801	GA	3	6	36077	36082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014801	GA	3	6	36699	36704	50 %	0 %	50 %	0 %	315123608
75	NC_014801	TA	3	6	37465	37470	50 %	50 %	0 %	0 %	315123609
76	NC_014801	TA	3	6	37661	37666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014801	TA	3	6	38460	38465	50 %	50 %	0 %	0 %	315123611
78	NC_014801	AT	3	6	38651	38656	50 %	50 %	0 %	0 %	315123611
79	NC_014801	AT	3	6	38834	38839	50 %	50 %	0 %	0 %	315123611
80	NC_014801	TA	3	6	39110	39115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014801	AT	3	6	39274	39279	50 %	50 %	0 %	0 %	315123612
82	NC_014801	GA	3	6	40408	40413	50 %	0 %	50 %	0 %	315123612
83	NC_014801	AG	3	6	40808	40813	50 %	0 %	50 %	0 %	315123612
84	NC_014801	TA	3	6	40814	40819	50 %	50 %	0 %	0 %	315123612
85	NC_014801	AT	4	8	41403	41410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014801	TA	3	6	43084	43089	50 %	50 %	0 %	0 %	315123615
87	NC_014801	AT	4	8	43192	43199	50 %	50 %	0 %	0 %	315123615
88	NC_014801	TA	3	6	43314	43319	50 %	50 %	0 %	0 %	315123615
89	NC_014801	CA	3	6	43537	43542	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.