MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydophila psittaci RD1 plasmid pRD1

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014797	AT	3	6	286	291	50 %	50 %	0 %	0 %	409191176
2	NC_014797	TA	3	6	426	431	50 %	50 %	0 %	0 %	409191176
3	NC_014797	AG	3	6	558	563	50 %	0 %	50 %	0 %	409191176
4	NC_014797	AG	3	6	801	806	50 %	0 %	50 %	0 %	409191176
5	NC_014797	TA	3	6	1086	1091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014797	TG	3	6	1336	1341	0 %	50 %	50 %	0 %	409191177
7	NC_014797	AC	3	6	1495	1500	50 %	0 %	0 %	50 %	409191177
8	NC_014797	AT	3	6	1798	1803	50 %	50 %	0 %	0 %	409191177
9	NC_014797	AC	3	6	1841	1846	50 %	0 %	0 %	50 %	409191177
10	NC_014797	CA	4	8	2162	2169	50 %	0 %	0 %	50 %	409191177
11	NC_014797	AT	3	6	2410	2415	50 %	50 %	0 %	0 %	409191178
12	NC_014797	AT	3	6	2431	2436	50 %	50 %	0 %	0 %	409191178
13	NC_014797	AG	3	6	3056	3061	50 %	0 %	50 %	0 %	409191178
14	NC_014797	TC	3	6	4122	4127	0 %	50 %	0 %	50 %	409191179
15	NC_014797	AT	3	6	4477	4482	50 %	50 %	0 %	0 %	409191179
16	NC_014797	TC	3	6	5398	5403	0 %	50 %	0 %	50 %	409191180
17	NC_014797	AT	3	6	5491	5496	50 %	50 %	0 %	0 %	409191180
18	NC_014797	AT	3	6	5555	5560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014797	GA	3	6	5618	5623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014797	TG	3	6	6396	6401	0 %	50 %	50 %	0 %	409191182
21	NC_014797	GA	3	6	6997	7002	50 %	0 %	50 %	0 %	409191183
22	NC_014797	GT	3	6	7328	7333	0 %	50 %	50 %	0 %	409191183

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.