MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydophila psittaci RD1

Total Repeats: 780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014796	GAAAA	2	10	3356	3365	80 %	0 %	20 %	0 %	392376217
2	NC_014796	AGGAG	2	10	4413	4422	40 %	0 %	60 %	0 %	392376217
3	NC_014796	TGTTT	2	10	6761	6770	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014796	AACAT	2	10	7325	7334	60 %	20 %	0 %	20 %	392376219
5	NC_014796	ATAAA	2	10	13046	13055	80 %	20 %	0 %	0 %	392376221
6	NC_014796	AACTC	2	10	13490	13499	40 %	20 %	0 %	40 %	392376221
7	NC_014796	GTTTT	2	10	13560	13569	0 %	80 %	20 %	0 %	392376221
8	NC_014796	GAAAC	2	10	14328	14337	60 %	0 %	20 %	20 %	392376222
9	NC_014796	AACAA	2	10	15357	15366	80 %	0 %	0 %	20 %	392376222
10	NC_014796	AATAG	2	10	17069	17078	60 %	20 %	20 %	0 %	392376224
11	NC_014796	GCCTA	2	10	19904	19913	20 %	20 %	20 %	40 %	392376226
12	NC_014796	AGTGT	2	10	21118	21127	20 %	40 %	40 %	0 %	392376227
13	NC_014796	GCCAC	2	10	29447	29456	20 %	0 %	20 %	60 %	392376231
14	NC_014796	ATAAA	2	10	34287	34296	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014796	AAGGA	2	10	38579	38588	60 %	0 %	40 %	0 %	392376241
16	NC_014796	CCATA	2	10	38786	38795	40 %	20 %	0 %	40 %	392376241
17	NC_014796	CTTTA	2	10	38952	38961	20 %	60 %	0 %	20 %	392376241
18	NC_014796	CTTTC	2	10	43215	43224	0 %	60 %	0 %	40 %	392376247
19	NC_014796	ACAAA	2	10	43877	43886	80 %	0 %	0 %	20 %	392376248
20	NC_014796	TATGG	2	10	44287	44296	20 %	40 %	40 %	0 %	392376249
21	NC_014796	TCTTT	2	10	46096	46105	0 %	80 %	0 %	20 %	392376251
22	NC_014796	AGCCC	2	10	47093	47102	20 %	0 %	20 %	60 %	392376252
23	NC_014796	TCAAA	2	10	47448	47457	60 %	20 %	0 %	20 %	392376252
24	NC_014796	TCTAT	2	10	49567	49576	20 %	60 %	0 %	20 %	392376254
25	NC_014796	TTTGG	2	10	51481	51490	0 %	60 %	40 %	0 %	392376254
26	NC_014796	TTTTG	2	10	52490	52499	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014796	TTTTC	2	10	55350	55359	0 %	80 %	0 %	20 %	392376257
28	NC_014796	GTAAG	2	10	57398	57407	40 %	20 %	40 %	0 %	392376260
29	NC_014796	TTAAT	2	10	57970	57979	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014796	TCTTT	2	10	59414	59423	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014796	AAAAT	2	10	60220	60229	80 %	20 %	0 %	0 %	392376262
32	NC_014796	TAGTT	2	10	62822	62831	20 %	60 %	20 %	0 %	392376262
33	NC_014796	GAATG	2	10	62838	62847	40 %	20 %	40 %	0 %	392376262
34	NC_014796	TTGTT	2	10	63824	63833	0 %	80 %	20 %	0 %	392376263
35	NC_014796	TCCTA	2	10	64888	64897	20 %	40 %	0 %	40 %	392376264
36	NC_014796	AGAAA	2	10	70144	70153	80 %	0 %	20 %	0 %	392376268
37	NC_014796	GGATA	2	10	70952	70961	40 %	20 %	40 %	0 %	392376269
38	NC_014796	CACTT	2	10	71135	71144	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_014796	ATAGC	2	10	74391	74400	40 %	20 %	20 %	20 %	392376273
40	NC_014796	GCACA	2	10	77224	77233	40 %	0 %	20 %	40 %	392376275
41	NC_014796	AATTT	2	10	77748	77757	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014796	AAAGA	2	10	78177	78186	80 %	0 %	20 %	0 %	392376276
43	NC_014796	AGTTC	2	10	79182	79191	20 %	40 %	20 %	20 %	392376276
44	NC_014796	CGTAT	2	10	81551	81560	20 %	40 %	20 %	20 %	392376278
45	NC_014796	GAAAA	2	10	82761	82770	80 %	0 %	20 %	0 %	392376279
46	NC_014796	AGGAA	2	10	84760	84769	60 %	0 %	40 %	0 %	392376281
47	NC_014796	CTTTT	2	10	85649	85658	0 %	80 %	0 %	20 %	392376283
48	NC_014796	CAAAG	2	10	87120	87129	60 %	0 %	20 %	20 %	392376285
49	NC_014796	AACAA	2	10	87287	87296	80 %	0 %	0 %	20 %	392376285
50	NC_014796	AGAAA	2	10	87357	87366	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014796	AAAGA	2	10	89193	89202	80 %	0 %	20 %	0 %	392376287
52	NC_014796	TTTTC	2	10	90208	90217	0 %	80 %	0 %	20 %	392376287
53	NC_014796	AGGAT	2	10	90731	90740	40 %	20 %	40 %	0 %	392376287
54	NC_014796	ATAAC	2	10	90817	90826	60 %	20 %	0 %	20 %	392376287
55	NC_014796	TGGCA	2	10	93302	93311	20 %	20 %	40 %	20 %	392376288
56	NC_014796	AATTA	2	10	93966	93975	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014796	TGTTT	2	10	95027	95036	0 %	80 %	20 %	0 %	392376290
58	NC_014796	TCACC	2	10	96601	96610	20 %	20 %	0 %	60 %	392376291
59	NC_014796	AAAAT	2	10	96736	96745	80 %	20 %	0 %	0 %	392376291
60	NC_014796	TTAAT	2	10	97780	97789	40 %	60 %	0 %	0 %	392376292
61	NC_014796	ATTTG	2	10	98963	98972	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014796	AAAAT	2	10	99684	99693	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014796	ATTAC	2	10	102912	102921	40 %	40 %	0 %	20 %	392376299
64	NC_014796	CTACA	2	10	103286	103295	40 %	20 %	0 %	40 %	392376299
65	NC_014796	AATTA	2	10	104833	104842	60 %	40 %	0 %	0 %	392376301
66	NC_014796	CTATA	2	10	105823	105832	40 %	40 %	0 %	20 %	392376302
67	NC_014796	CTTTT	2	10	108366	108375	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_014796	AGCTT	2	10	108477	108486	20 %	40 %	20 %	20 %	392376305
69	NC_014796	GTTTG	2	10	108784	108793	0 %	60 %	40 %	0 %	392376305
70	NC_014796	AGTTA	2	10	115589	115598	40 %	40 %	20 %	0 %	392376320
71	NC_014796	AGTTT	2	10	116079	116088	20 %	60 %	20 %	0 %	392376321
72	NC_014796	TTTGC	2	10	116994	117003	0 %	60 %	20 %	20 %	392376323
73	NC_014796	TTTAC	2	10	119191	119200	20 %	60 %	0 %	20 %	392376326
74	NC_014796	AATTA	2	10	122084	122093	60 %	40 %	0 %	0 %	392376329
75	NC_014796	CTTTT	2	10	122882	122891	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_014796	GAGAT	2	10	123438	123447	40 %	20 %	40 %	0 %	392376330
77	NC_014796	GTCAA	2	10	124757	124766	40 %	20 %	20 %	20 %	392376332
78	NC_014796	TAGGG	2	10	127229	127238	20 %	20 %	60 %	0 %	392376335
79	NC_014796	AACTT	2	10	128161	128170	40 %	40 %	0 %	20 %	392376335
80	NC_014796	TTCTT	2	10	131365	131374	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_014796	TGTCA	2	10	132046	132055	20 %	40 %	20 %	20 %	392376338
82	NC_014796	AAAAG	2	10	135452	135461	80 %	0 %	20 %	0 %	392376340
83	NC_014796	TAAAA	2	10	135733	135742	80 %	20 %	0 %	0 %	392376340
84	NC_014796	GATTT	2	10	137992	138001	20 %	60 %	20 %	0 %	392376342
85	NC_014796	TTGTT	2	10	138334	138343	0 %	80 %	20 %	0 %	392376342
86	NC_014796	AAGAA	2	10	138815	138824	80 %	0 %	20 %	0 %	392376342
87	NC_014796	TTCTT	2	10	139408	139417	0 %	80 %	0 %	20 %	392376343
88	NC_014796	CTTTG	2	10	141312	141321	0 %	60 %	20 %	20 %	392376345
89	NC_014796	AGAAA	2	10	143349	143358	80 %	0 %	20 %	0 %	392376348
90	NC_014796	AAAGA	2	10	146014	146023	80 %	0 %	20 %	0 %	392376350
91	NC_014796	TTTTA	2	10	148193	148202	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014796	TACTC	2	10	149645	149654	20 %	40 %	0 %	40 %	392376353
93	NC_014796	CGTTT	2	10	149692	149701	0 %	60 %	20 %	20 %	392376353
94	NC_014796	ATTTT	2	10	149832	149841	20 %	80 %	0 %	0 %	392376353
95	NC_014796	ACCAT	2	10	151863	151872	40 %	20 %	0 %	40 %	392376354
96	NC_014796	CAGAA	2	10	152828	152837	60 %	0 %	20 %	20 %	392376355
97	NC_014796	TTCAT	2	10	153398	153407	20 %	60 %	0 %	20 %	392376355
98	NC_014796	AAAGG	2	10	154228	154237	60 %	0 %	40 %	0 %	392376356
99	NC_014796	ATAGG	2	10	155920	155929	40 %	20 %	40 %	0 %	392376358
100	NC_014796	TTTGA	2	10	156006	156015	20 %	60 %	20 %	0 %	392376358
101	NC_014796	AAGGT	2	10	160947	160956	40 %	20 %	40 %	0 %	392376362
102	NC_014796	TTTTG	2	10	161887	161896	0 %	80 %	20 %	0 %	392376363
103	NC_014796	GGGGC	2	10	162034	162043	0 %	0 %	80 %	20 %	392376363
104	NC_014796	AGCAT	2	10	163325	163334	40 %	20 %	20 %	20 %	392376364
105	NC_014796	TAAAT	2	10	164512	164521	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014796	AAATG	2	10	166440	166449	60 %	20 %	20 %	0 %	392376365
107	NC_014796	GGGGA	2	10	168215	168224	20 %	0 %	80 %	0 %	392376366
108	NC_014796	TTTTC	2	10	169264	169273	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_014796	CTGTT	2	10	169743	169752	0 %	60 %	20 %	20 %	392376368
110	NC_014796	AATGA	2	10	169778	169787	60 %	20 %	20 %	0 %	392376368
111	NC_014796	ATTTT	2	10	173237	173246	20 %	80 %	0 %	0 %	392376373
112	NC_014796	GAGAG	2	10	173254	173263	40 %	0 %	60 %	0 %	392376373
113	NC_014796	CAAAA	2	10	173584	173593	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_014796	CGCAT	2	10	173954	173963	20 %	20 %	20 %	40 %	392376374
115	NC_014796	CTAAG	2	10	181195	181204	40 %	20 %	20 %	20 %	392376380
116	NC_014796	TTTTC	2	10	181795	181804	0 %	80 %	0 %	20 %	392376380
117	NC_014796	GGTAC	2	10	183790	183799	20 %	20 %	40 %	20 %	392376382
118	NC_014796	AGGGA	2	10	186977	186986	40 %	0 %	60 %	0 %	392376385
119	NC_014796	AATGT	2	10	187386	187395	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014796	AGGAA	2	10	188000	188009	60 %	0 %	40 %	0 %	392376386
121	NC_014796	TTCTT	2	10	188379	188388	0 %	80 %	0 %	20 %	392376386
122	NC_014796	GATAA	2	10	191022	191031	60 %	20 %	20 %	0 %	392376386
123	NC_014796	CCCTT	2	10	193226	193235	0 %	40 %	0 %	60 %	392376387
124	NC_014796	TTTTA	2	10	193927	193936	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014796	AGTTA	2	10	194217	194226	40 %	40 %	20 %	0 %	392376388
126	NC_014796	TTATT	2	10	194237	194246	20 %	80 %	0 %	0 %	392376388
127	NC_014796	CCCTA	2	10	195290	195299	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
128	NC_014796	AGGGT	2	10	197161	197170	20 %	20 %	60 %	0 %	392376390
129	NC_014796	TGGAT	2	10	197602	197611	20 %	40 %	40 %	0 %	392376390
130	NC_014796	CTAAA	2	10	197659	197668	60 %	20 %	0 %	20 %	392376390
131	NC_014796	CTTTA	2	10	197962	197971	20 %	60 %	0 %	20 %	392376390
132	NC_014796	AAAAT	2	10	198139	198148	80 %	20 %	0 %	0 %	392376390
133	NC_014796	GTTTT	2	10	198642	198651	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014796	ATTAA	2	10	201066	201075	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014796	TTGGT	2	10	201442	201451	0 %	60 %	40 %	0 %	392376393
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137	NC_014796	TAATG	2	10	205034	205043	40 %	40 %	20 %	0 %	392376396
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