MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydophila psittaci RD1

Total Repeats: 14078

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014796	CGA	2	6	170	175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392376214
2	NC_014796	AGA	2	6	188	193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376214
3	NC_014796	CTT	2	6	225	230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392376214
4	NC_014796	TCT	2	6	331	336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392376214
5	NC_014796	TAT	2	6	553	558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392376214
6	NC_014796	ATG	2	6	579	584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376214
7	NC_014796	TGT	2	6	640	645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392376214
8	NC_014796	ATG	2	6	659	664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376214
9	NC_014796	ACA	2	6	950	955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392376214
10	NC_014796	AGC	2	6	964	969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392376214
11	NC_014796	GTG	2	6	981	986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392376214
12	NC_014796	AGC	3	9	1000	1008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392376214
13	NC_014796	CTA	2	6	1011	1016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392376214
14	NC_014796	GGT	2	6	1020	1025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392376214
15	NC_014796	CTT	2	6	1128	1133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392376214
16	NC_014796	CTT	2	6	1225	1230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392376215
17	NC_014796	ACA	2	6	1365	1370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392376215
18	NC_014796	ATG	2	6	1413	1418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376215
19	NC_014796	TTA	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392376215
20	NC_014796	TAG	2	6	1576	1581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376215
21	NC_014796	TAG	2	6	1714	1719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376215
22	NC_014796	CTA	2	6	1768	1773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392376215
23	NC_014796	TTC	2	6	1789	1794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392376215
24	NC_014796	ATA	2	6	1989	1994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392376215
25	NC_014796	CTT	2	6	2056	2061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392376215
26	NC_014796	GAA	2	6	2067	2072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376215
27	NC_014796	TGA	2	6	2128	2133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376215
28	NC_014796	GAT	2	6	2146	2151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376215
29	NC_014796	GTT	2	6	2182	2187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392376215
30	NC_014796	CTT	2	6	2206	2211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392376215
31	NC_014796	TAA	2	6	2368	2373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392376215
32	NC_014796	GAA	2	6	2415	2420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376215
33	NC_014796	AGT	2	6	2643	2648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376216
34	NC_014796	TTA	2	6	2656	2661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392376216
35	NC_014796	TCC	2	6	2685	2690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392376216
36	NC_014796	TTC	2	6	2778	2783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392376216
37	NC_014796	TTA	2	6	2803	2808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392376216
38	NC_014796	AGA	2	6	2934	2939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376216
39	NC_014796	TAT	2	6	2972	2977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392376216
40	NC_014796	TAT	2	6	3006	3011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392376216
41	NC_014796	GAA	2	6	3217	3222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376217
42	NC_014796	ATG	2	6	3422	3427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376217
43	NC_014796	AGT	2	6	3489	3494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376217
44	NC_014796	CTT	2	6	3543	3548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392376217
45	NC_014796	CAA	2	6	3628	3633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392376217
46	NC_014796	ATG	2	6	3661	3666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376217
47	NC_014796	ATC	2	6	3779	3784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392376217
48	NC_014796	TGG	2	6	3892	3897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392376217
49	NC_014796	AGA	2	6	4143	4148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376217
50	NC_014796	TAA	2	6	4209	4214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392376217
51	NC_014796	GAA	2	6	4246	4251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376217
52	NC_014796	AGC	2	6	4284	4289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392376217
53	NC_014796	TAA	2	6	4313	4318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392376217
54	NC_014796	AGA	2	6	4433	4438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376217
55	NC_014796	CTT	2	6	4450	4455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392376217
56	NC_014796	ATG	2	6	4474	4479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376217
57	NC_014796	GAT	2	6	4525	4530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376217
58	NC_014796	GCT	2	6	4579	4584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392376217
59	NC_014796	GAA	2	6	4809	4814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376217
60	NC_014796	AAG	2	6	4832	4837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376217
61	NC_014796	TGG	2	6	4910	4915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392376217
62	NC_014796	AAG	2	6	5009	5014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376217
63	NC_014796	AGA	2	6	5112	5117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376217
64	NC_014796	TTA	2	6	5132	5137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392376217
65	NC_014796	CAA	2	6	5220	5225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392376217
66	NC_014796	AGA	2	6	5520	5525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376218
67	NC_014796	TGG	2	6	5586	5591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392376218
68	NC_014796	TAT	2	6	5621	5626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392376218
69	NC_014796	GTT	2	6	5667	5672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392376218
70	NC_014796	CAA	2	6	5683	5688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392376218
71	NC_014796	GAT	2	6	5710	5715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376218
72	NC_014796	TGT	2	6	5730	5735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392376218
73	NC_014796	GGA	2	6	5752	5757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392376218
74	NC_014796	CAA	2	6	5863	5868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392376218
75	NC_014796	TGA	2	6	5925	5930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376218
76	NC_014796	GAT	2	6	5931	5936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376218
77	NC_014796	TGT	3	9	5983	5991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392376218
78	NC_014796	TGA	2	6	6047	6052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376218
79	NC_014796	GCT	2	6	6063	6068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392376218
80	NC_014796	TGC	2	6	6222	6227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392376218
81	NC_014796	TGA	2	6	6243	6248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376218
82	NC_014796	GAA	2	6	6274	6279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376218
83	NC_014796	GAG	2	6	6287	6292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392376218
84	NC_014796	TTC	2	6	6297	6302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392376218
85	NC_014796	CCT	2	6	6304	6309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392376218
86	NC_014796	CTT	2	6	6350	6355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392376218
87	NC_014796	GTT	2	6	6392	6397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392376218
88	NC_014796	ACA	2	6	6550	6555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392376218
89	NC_014796	ATA	2	6	6590	6595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392376218
90	NC_014796	CAA	2	6	6634	6639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392376218
91	NC_014796	GAA	2	6	6910	6915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376219
92	NC_014796	CAT	2	6	6916	6921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392376219
93	NC_014796	ACA	2	6	6934	6939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392376219
94	NC_014796	GTG	2	6	6988	6993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392376219
95	NC_014796	TGT	2	6	7013	7018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392376219
96	NC_014796	TTC	2	6	7104	7109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392376219
97	NC_014796	GTT	2	6	7115	7120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392376219
98	NC_014796	CAT	2	6	7140	7145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392376219
99	NC_014796	AGA	2	6	7170	7175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376219
100	NC_014796	TAA	2	6	7253	7258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392376219
101	NC_014796	TTG	2	6	7302	7307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392376219
102	NC_014796	CTC	2	6	7344	7349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392376219
103	NC_014796	GGA	2	6	7462	7467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392376219
104	NC_014796	TGA	2	6	7608	7613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376219
105	NC_014796	ATT	2	6	7779	7784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392376219
106	NC_014796	TGC	2	6	7857	7862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392376219
107	NC_014796	TTC	2	6	7892	7897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392376219
108	NC_014796	TTG	2	6	8054	8059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392376220
109	NC_014796	TGC	2	6	8072	8077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392376220
110	NC_014796	AAG	2	6	8169	8174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376220
111	NC_014796	TTA	2	6	8253	8258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392376220
112	NC_014796	CTT	2	6	8272	8277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392376220
113	NC_014796	GAA	2	6	8343	8348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376220
114	NC_014796	TTC	2	6	8378	8383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392376220
115	NC_014796	TTC	2	6	8503	8508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392376220
116	NC_014796	AGG	2	6	8710	8715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392376220
117	NC_014796	CCT	2	6	8767	8772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392376220
118	NC_014796	AAG	2	6	8815	8820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376220
119	NC_014796	GTT	2	6	8839	8844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392376220
120	NC_014796	GAA	2	6	8889	8894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376220
121	NC_014796	CAT	2	6	8938	8943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392376220
122	NC_014796	TTC	2	6	9023	9028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392376220
123	NC_014796	GAA	2	6	9084	9089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376220
124	NC_014796	GAG	2	6	9145	9150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392376220
125	NC_014796	AGT	2	6	9250	9255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376220
126	NC_014796	TTA	2	6	9442	9447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392376220
127	NC_014796	AGA	2	6	9691	9696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376220
128	NC_014796	GTT	2	6	9737	9742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392376220
129	NC_014796	CTT	2	6	9976	9981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392376220
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