MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydophila psittaci RD1

Total Repeats: 2106

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014796	TA	3	6	93	98	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014796	GT	3	6	309	314	0 %	50 %	50 %	0 %	392376214
3	NC_014796	TG	3	6	498	503	0 %	50 %	50 %	0 %	392376214
4	NC_014796	TC	3	6	727	732	0 %	50 %	0 %	50 %	392376214
5	NC_014796	AC	3	6	1295	1300	50 %	0 %	0 %	50 %	392376215
6	NC_014796	GT	3	6	1461	1466	0 %	50 %	50 %	0 %	392376215
7	NC_014796	TC	3	6	1584	1589	0 %	50 %	0 %	50 %	392376215
8	NC_014796	TG	3	6	1888	1893	0 %	50 %	50 %	0 %	392376215
9	NC_014796	GA	3	6	2786	2791	50 %	0 %	50 %	0 %	392376216
10	NC_014796	GA	3	6	3340	3345	50 %	0 %	50 %	0 %	392376217
11	NC_014796	AT	3	6	4227	4232	50 %	50 %	0 %	0 %	392376217
12	NC_014796	CT	3	6	4729	4734	0 %	50 %	0 %	50 %	392376217
13	NC_014796	CT	3	6	6469	6474	0 %	50 %	0 %	50 %	392376218
14	NC_014796	GA	3	6	6893	6898	50 %	0 %	50 %	0 %	392376219
15	NC_014796	GT	3	6	7804	7809	0 %	50 %	50 %	0 %	392376219
16	NC_014796	TC	3	6	7875	7880	0 %	50 %	0 %	50 %	392376219
17	NC_014796	AT	3	6	8464	8469	50 %	50 %	0 %	0 %	392376220
18	NC_014796	GT	3	6	8687	8692	0 %	50 %	50 %	0 %	392376220
19	NC_014796	AG	3	6	9231	9236	50 %	0 %	50 %	0 %	392376220
20	NC_014796	TG	3	6	10493	10498	0 %	50 %	50 %	0 %	392376220
21	NC_014796	TC	3	6	11263	11268	0 %	50 %	0 %	50 %	392376221
22	NC_014796	AC	3	6	11279	11284	50 %	0 %	0 %	50 %	392376221
23	NC_014796	AT	3	6	11523	11528	50 %	50 %	0 %	0 %	392376221
24	NC_014796	GA	3	6	11602	11607	50 %	0 %	50 %	0 %	392376221
25	NC_014796	AG	3	6	11790	11795	50 %	0 %	50 %	0 %	392376221
26	NC_014796	TC	3	6	11843	11848	0 %	50 %	0 %	50 %	392376221
27	NC_014796	GT	3	6	12058	12063	0 %	50 %	50 %	0 %	392376221
28	NC_014796	GA	3	6	12446	12451	50 %	0 %	50 %	0 %	392376221
29	NC_014796	AG	3	6	12515	12520	50 %	0 %	50 %	0 %	392376221
30	NC_014796	GA	3	6	12586	12591	50 %	0 %	50 %	0 %	392376221
31	NC_014796	GT	3	6	12867	12872	0 %	50 %	50 %	0 %	392376221
32	NC_014796	TA	3	6	13807	13812	50 %	50 %	0 %	0 %	392376221
33	NC_014796	TA	3	6	13827	13832	50 %	50 %	0 %	0 %	392376221
34	NC_014796	AT	3	6	14111	14116	50 %	50 %	0 %	0 %	392376222
35	NC_014796	CT	3	6	14791	14796	0 %	50 %	0 %	50 %	392376222
36	NC_014796	TA	3	6	15121	15126	50 %	50 %	0 %	0 %	392376222
37	NC_014796	TG	4	8	15659	15666	0 %	50 %	50 %	0 %	392376222
38	NC_014796	AG	3	6	17698	17703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014796	TC	3	6	18953	18958	0 %	50 %	0 %	50 %	392376226
40	NC_014796	GT	3	6	19394	19399	0 %	50 %	50 %	0 %	392376226
41	NC_014796	TA	3	6	19438	19443	50 %	50 %	0 %	0 %	392376226
42	NC_014796	TC	3	6	19544	19549	0 %	50 %	0 %	50 %	392376226
43	NC_014796	GT	3	6	19673	19678	0 %	50 %	50 %	0 %	392376226
44	NC_014796	AC	3	6	20114	20119	50 %	0 %	0 %	50 %	392376226
45	NC_014796	TC	3	6	21145	21150	0 %	50 %	0 %	50 %	392376227
46	NC_014796	GA	3	6	22447	22452	50 %	0 %	50 %	0 %	392376228
47	NC_014796	GA	3	6	23670	23675	50 %	0 %	50 %	0 %	392376228
48	NC_014796	TA	3	6	25504	25509	50 %	50 %	0 %	0 %	392376229
49	NC_014796	AG	3	6	25611	25616	50 %	0 %	50 %	0 %	392376229
50	NC_014796	TA	3	6	26514	26519	50 %	50 %	0 %	0 %	392376229
51	NC_014796	TA	3	6	27374	27379	50 %	50 %	0 %	0 %	392376230
52	NC_014796	TC	3	6	27459	27464	0 %	50 %	0 %	50 %	392376230
53	NC_014796	TA	3	6	28051	28056	50 %	50 %	0 %	0 %	392376230
54	NC_014796	AG	3	6	29926	29931	50 %	0 %	50 %	0 %	392376232
55	NC_014796	AG	3	6	30587	30592	50 %	0 %	50 %	0 %	392376233
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57	NC_014796	GA	4	8	31239	31246	50 %	0 %	50 %	0 %	392376234
58	NC_014796	TC	3	6	31852	31857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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60	NC_014796	AG	3	6	34612	34617	50 %	0 %	50 %	0 %	392376239
61	NC_014796	AG	3	6	34684	34689	50 %	0 %	50 %	0 %	392376239
62	NC_014796	AT	3	6	34730	34735	50 %	50 %	0 %	0 %	392376239
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64	NC_014796	CG	3	6	35131	35136	0 %	0 %	50 %	50 %	392376239
65	NC_014796	AT	3	6	35450	35455	50 %	50 %	0 %	0 %	392376239
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67	NC_014796	TA	3	6	37504	37509	50 %	50 %	0 %	0 %	392376240
68	NC_014796	TC	3	6	37742	37747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014796	GA	3	6	38474	38479	50 %	0 %	50 %	0 %	392376241
70	NC_014796	CG	3	6	38503	38508	0 %	0 %	50 %	50 %	392376241
71	NC_014796	TA	3	6	38509	38514	50 %	50 %	0 %	0 %	392376241
72	NC_014796	GC	3	6	39841	39846	0 %	0 %	50 %	50 %	392376243
73	NC_014796	AG	3	6	39852	39857	50 %	0 %	50 %	0 %	392376243
74	NC_014796	AG	3	6	40732	40737	50 %	0 %	50 %	0 %	392376244
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83	NC_014796	TA	3	6	48254	48259	50 %	50 %	0 %	0 %	392376253
84	NC_014796	AT	3	6	48268	48273	50 %	50 %	0 %	0 %	392376253
85	NC_014796	AT	3	6	48520	48525	50 %	50 %	0 %	0 %	392376253
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87	NC_014796	TA	3	6	48880	48885	50 %	50 %	0 %	0 %	392376253
88	NC_014796	AG	3	6	49408	49413	50 %	0 %	50 %	0 %	392376253
89	NC_014796	GC	3	6	49977	49982	0 %	0 %	50 %	50 %	392376254
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91	NC_014796	TA	3	6	50555	50560	50 %	50 %	0 %	0 %	392376254
92	NC_014796	TA	3	6	52217	52222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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103	NC_014796	AG	3	6	60610	60615	50 %	0 %	50 %	0 %	392376262
104	NC_014796	GA	3	6	61854	61859	50 %	0 %	50 %	0 %	392376262
105	NC_014796	AG	3	6	62142	62147	50 %	0 %	50 %	0 %	392376262
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107	NC_014796	AG	3	6	63237	63242	50 %	0 %	50 %	0 %	392376262
108	NC_014796	TG	3	6	63310	63315	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014796	TC	3	6	64790	64795	0 %	50 %	0 %	50 %	392376264
110	NC_014796	TG	3	6	65555	65560	0 %	50 %	50 %	0 %	392376264
111	NC_014796	CA	4	8	65842	65849	50 %	0 %	0 %	50 %	392376264
112	NC_014796	GA	4	8	66581	66588	50 %	0 %	50 %	0 %	392376265
113	NC_014796	AT	3	6	67360	67365	50 %	50 %	0 %	0 %	392376266
114	NC_014796	GA	4	8	67467	67474	50 %	0 %	50 %	0 %	392376266
115	NC_014796	AG	3	6	67580	67585	50 %	0 %	50 %	0 %	392376266
116	NC_014796	TG	3	6	67929	67934	0 %	50 %	50 %	0 %	392376266
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118	NC_014796	TA	3	6	68614	68619	50 %	50 %	0 %	0 %	392376267
119	NC_014796	TA	3	6	69317	69322	50 %	50 %	0 %	0 %	392376267
120	NC_014796	AG	3	6	70240	70245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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122	NC_014796	GT	3	6	72039	72044	0 %	50 %	50 %	0 %	392376270
123	NC_014796	GT	3	6	73701	73706	0 %	50 %	50 %	0 %	392376272
124	NC_014796	GA	3	6	74643	74648	50 %	0 %	50 %	0 %	392376273
125	NC_014796	TC	3	6	75231	75236	0 %	50 %	0 %	50 %	392376274
126	NC_014796	TC	3	6	76036	76041	0 %	50 %	0 %	50 %	392376274
127	NC_014796	GC	3	6	76268	76273	0 %	0 %	50 %	50 %	392376275
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129	NC_014796	TC	3	6	76438	76443	0 %	50 %	0 %	50 %	392376275
130	NC_014796	CA	3	6	76573	76578	50 %	0 %	0 %	50 %	392376275
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132	NC_014796	CG	3	6	76871	76876	0 %	0 %	50 %	50 %	392376275
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