MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Candidatus Liberibacter solanacearum CLso-ZC1 chromosome

Total Repeats: 1036

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014774	ATTCA	2	10	960	969	40 %	40 %	0 %	20 %	315121752
2	NC_014774	TTTTG	2	10	1012	1021	0 %	80 %	20 %	0 %	315121752
3	NC_014774	TAGAA	2	10	1725	1734	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014774	TCAAA	2	10	2598	2607	60 %	20 %	0 %	20 %	315121753
5	NC_014774	TAATT	2	10	2886	2895	40 %	60 %	0 %	0 %	315121754
6	NC_014774	CATAA	2	10	3636	3645	60 %	20 %	0 %	20 %	315121754
7	NC_014774	AAATT	2	10	3849	3858	60 %	40 %	0 %	0 %	315121754
8	NC_014774	TTCCA	2	10	4877	4886	20 %	40 %	0 %	40 %	315121755
9	NC_014774	TTTTA	2	10	5092	5101	20 %	80 %	0 %	0 %	315121755
10	NC_014774	ATTAT	2	10	6381	6390	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014774	ACAAT	2	10	7967	7976	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_014774	AAAAC	2	10	8339	8348	80 %	0 %	0 %	20 %	315121759
13	NC_014774	TAAGT	2	10	8577	8586	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014774	CATCA	2	10	8666	8675	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_014774	TCAAA	2	10	9939	9948	60 %	20 %	0 %	20 %	315121761
16	NC_014774	GAAAA	2	10	10548	10557	80 %	0 %	20 %	0 %	315121762
17	NC_014774	TTAAT	2	10	15174	15183	40 %	60 %	0 %	0 %	315121767
18	NC_014774	AATAT	2	10	16334	16343	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014774	ATGCC	2	10	18180	18189	20 %	20 %	20 %	40 %	315121769
20	NC_014774	TTTTC	2	10	18620	18629	0 %	80 %	0 %	20 %	315121769
21	NC_014774	GATAC	2	10	18980	18989	40 %	20 %	20 %	20 %	315121769
22	NC_014774	AAAAT	2	10	21426	21435	80 %	20 %	0 %	0 %	315121772
23	NC_014774	CCCTG	2	10	23287	23296	0 %	20 %	20 %	60 %	315121774
24	NC_014774	TGTCA	2	10	24677	24686	20 %	40 %	20 %	20 %	315121776
25	NC_014774	TGCTC	2	10	25373	25382	0 %	40 %	20 %	40 %	315121777
26	NC_014774	ATAGG	2	10	25822	25831	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014774	TAAAA	2	10	26262	26271	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014774	ACTAT	2	10	29677	29686	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014774	ATTTT	3	15	30387	30401	20 %	80 %	0 %	0 %	315121784
30	NC_014774	AAAAT	2	10	31095	31104	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014774	TACGC	2	10	35292	35301	20 %	20 %	20 %	40 %	315121792
32	NC_014774	GAAAA	2	10	36170	36179	80 %	0 %	20 %	0 %	315121793
33	NC_014774	TACAT	2	10	36973	36982	40 %	40 %	0 %	20 %	315121794
34	NC_014774	TGGAT	2	10	37593	37602	20 %	40 %	40 %	0 %	315121795
35	NC_014774	AAAAC	2	10	39694	39703	80 %	0 %	0 %	20 %	315121797
36	NC_014774	TCCCC	2	10	42302	42311	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
37	NC_014774	ACAAA	2	10	42871	42880	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_014774	CGCAT	2	10	43033	43042	20 %	20 %	20 %	40 %	315121799
39	NC_014774	GAAAA	2	10	43905	43914	80 %	0 %	20 %	0 %	315121799
40	NC_014774	AATTT	2	10	44140	44149	40 %	60 %	0 %	0 %	315121799
41	NC_014774	TGGAA	2	10	44414	44423	40 %	20 %	40 %	0 %	315121799
42	NC_014774	TTTAT	2	10	44479	44488	20 %	80 %	0 %	0 %	315121799
43	NC_014774	ACATA	2	10	45848	45857	60 %	20 %	0 %	20 %	315121801
44	NC_014774	TGAGA	2	10	46867	46876	40 %	20 %	40 %	0 %	315121801
45	NC_014774	TCCTT	2	10	47115	47124	0 %	60 %	0 %	40 %	315121801
46	NC_014774	ACAAT	2	10	49770	49779	60 %	20 %	0 %	20 %	315121804
47	NC_014774	ATCAA	2	10	50846	50855	60 %	20 %	0 %	20 %	315121805
48	NC_014774	AATCC	2	10	53524	53533	40 %	20 %	0 %	40 %	315121806
49	NC_014774	TCATA	2	10	56670	56679	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014774	TATAA	2	10	56689	56698	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014774	TACAC	2	10	56764	56773	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_014774	ATCGA	2	10	59984	59993	40 %	20 %	20 %	20 %	315121810
53	NC_014774	TCTTT	2	10	60916	60925	0 %	80 %	0 %	20 %	315121811
54	NC_014774	TCTTT	2	10	61934	61943	0 %	80 %	0 %	20 %	315121812
55	NC_014774	ACTTC	2	10	67771	67780	20 %	40 %	0 %	40 %	315121816
56	NC_014774	CTAAA	2	10	69356	69365	60 %	20 %	0 %	20 %	315121817
57	NC_014774	CTTTT	2	10	71040	71049	0 %	80 %	0 %	20 %	315121820
58	NC_014774	AAAAT	2	10	73113	73122	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014774	ATCAA	2	10	74567	74576	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_014774	AATAA	2	10	74585	74594	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014774	TAAAA	2	10	75995	76004	80 %	20 %	0 %	0 %	315121824
62	NC_014774	ATCTT	2	10	77243	77252	20 %	60 %	0 %	20 %	315121824
63	NC_014774	CAAAA	2	10	77401	77410	80 %	0 %	0 %	20 %	315121824
64	NC_014774	TATTT	3	15	78427	78441	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014774	ATTTT	2	10	80255	80264	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014774	TGTTT	2	10	82110	82119	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014774	ATTTC	2	10	83599	83608	20 %	60 %	0 %	20 %	315121829
68	NC_014774	ATCAG	2	10	84316	84325	40 %	20 %	20 %	20 %	315121831
69	NC_014774	AATCT	2	10	88741	88750	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_014774	CTATA	2	10	88811	88820	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_014774	TAAAA	2	10	88845	88854	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014774	TCTCC	2	10	88887	88896	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
73	NC_014774	AATCA	2	10	89437	89446	60 %	20 %	0 %	20 %	315121836
74	NC_014774	GAAAA	2	10	89667	89676	80 %	0 %	20 %	0 %	315121836
75	NC_014774	CAATT	2	10	91951	91960	40 %	40 %	0 %	20 %	315121838
76	NC_014774	CTCCG	2	10	93406	93415	0 %	20 %	20 %	60 %	315121839
77	NC_014774	GTTCT	2	10	94578	94587	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_014774	TGAGA	2	10	94656	94665	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014774	CAACA	2	10	101665	101674	60 %	0 %	0 %	40 %	315121851
80	NC_014774	GAACT	2	10	103904	103913	40 %	20 %	20 %	20 %	315121853
81	NC_014774	AAATA	2	10	107002	107011	80 %	20 %	0 %	0 %	315121856
82	NC_014774	TGATT	2	10	108917	108926	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014774	TAAAT	2	10	109837	109846	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014774	TTTCT	2	10	110326	110335	0 %	80 %	0 %	20 %	315121860
85	NC_014774	AATCA	2	10	110339	110348	60 %	20 %	0 %	20 %	315121860
86	NC_014774	CTATT	2	10	110572	110581	20 %	60 %	0 %	20 %	315121860
87	NC_014774	AACTC	2	10	115242	115251	40 %	20 %	0 %	40 %	315121863
88	NC_014774	TCAAG	2	10	115751	115760	40 %	20 %	20 %	20 %	315121864
89	NC_014774	AAATC	2	10	117499	117508	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_014774	GCTCA	2	10	118390	118399	20 %	20 %	20 %	40 %	315121866
91	NC_014774	AAATC	2	10	120117	120126	60 %	20 %	0 %	20 %	315121867
92	NC_014774	AGGAA	2	10	120530	120539	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014774	CATAA	2	10	122174	122183	60 %	20 %	0 %	20 %	315121870
94	NC_014774	CGCCA	2	10	122803	122812	20 %	0 %	20 %	60 %	315121870
95	NC_014774	AAGTA	2	10	123046	123055	60 %	20 %	20 %	0 %	315121870
96	NC_014774	ACAAA	2	10	123489	123498	80 %	0 %	0 %	20 %	315121871
97	NC_014774	ATAAA	2	10	125143	125152	80 %	20 %	0 %	0 %	315121872
98	NC_014774	TAAAA	2	10	126986	126995	80 %	20 %	0 %	0 %	315121873
99	NC_014774	TCAAC	2	10	130932	130941	40 %	20 %	0 %	40 %	315121876
100	NC_014774	TTCTT	2	10	131606	131615	0 %	80 %	0 %	20 %	315121877
101	NC_014774	ATTTA	2	10	133899	133908	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014774	ATAGA	2	10	135572	135581	60 %	20 %	20 %	0 %	315121882
103	NC_014774	AGATG	2	10	138688	138697	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014774	TTAAA	2	10	139626	139635	60 %	40 %	0 %	0 %	315121886
105	NC_014774	CCTTT	2	10	140094	140103	0 %	60 %	0 %	40 %	315121887
106	NC_014774	TTCTT	2	10	140927	140936	0 %	80 %	0 %	20 %	315121888
107	NC_014774	CTACG	2	10	144859	144868	20 %	20 %	20 %	40 %	315121891
108	NC_014774	TACCT	2	10	145577	145586	20 %	40 %	0 %	40 %	315121891
109	NC_014774	ATTTT	2	10	146747	146756	20 %	80 %	0 %	0 %	315121893
110	NC_014774	ATAAA	2	10	146863	146872	80 %	20 %	0 %	0 %	315121893
111	NC_014774	AGAAA	2	10	146956	146965	80 %	0 %	20 %	0 %	315121893
112	NC_014774	CCCAA	2	10	147026	147035	40 %	0 %	0 %	60 %	315121893
113	NC_014774	TTAAA	2	10	148573	148582	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014774	TAAAA	2	10	148666	148675	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014774	AAAAT	2	10	149105	149114	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014774	TTGTT	2	10	149996	150005	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014774	CTATC	2	10	151706	151715	20 %	40 %	0 %	40 %	315121903
118	NC_014774	TATAA	2	10	151836	151845	60 %	40 %	0 %	0 %	315121903
119	NC_014774	AAAAG	2	10	152019	152028	80 %	0 %	20 %	0 %	315121903
120	NC_014774	ATTTT	2	10	153063	153072	20 %	80 %	0 %	0 %	315121904
121	NC_014774	CTTGC	2	10	153387	153396	0 %	40 %	20 %	40 %	315121904
122	NC_014774	AACAA	2	10	155676	155685	80 %	0 %	0 %	20 %	315121906
123	NC_014774	GCAAT	2	10	155908	155917	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_014774	ATTAT	2	10	157111	157120	40 %	60 %	0 %	0 %	315121907
125	NC_014774	ATAAA	2	10	158124	158133	80 %	20 %	0 %	0 %	315121909
126	NC_014774	AAATC	2	10	159890	159899	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_014774	GTTAT	2	10	160464	160473	20 %	60 %	20 %	0 %	315121912
128	NC_014774	TAAAA	2	10	160616	160625	80 %	20 %	0 %	0 %	315121912
129	NC_014774	CAAAT	2	10	161302	161311	60 %	20 %	0 %	20 %	315121913
130	NC_014774	AATGA	2	10	163418	163427	60 %	20 %	20 %	0 %	315121913
131	NC_014774	TAAAA	2	10	166465	166474	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014774	ATAAA	2	10	166771	166780	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014774	TGTAT	2	10	166818	166827	20 %	60 %	20 %	0 %	315121915
134	NC_014774	TATTC	2	10	166873	166882	20 %	60 %	0 %	20 %	315121915
135	NC_014774	CTCCA	2	10	170673	170682	20 %	20 %	0 %	60 %	315121917
136	NC_014774	TTCTT	2	10	171719	171728	0 %	80 %	0 %	20 %	315121918
137	NC_014774	ACCTC	2	10	171818	171827	20 %	20 %	0 %	60 %	315121918
138	NC_014774	AATAA	2	10	173478	173487	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014774	GTACT	2	10	173497	173506	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_014774	ACGCT	2	10	173877	173886	20 %	20 %	20 %	40 %	315121920
141	NC_014774	TGGGA	2	10	174065	174074	20 %	20 %	60 %	0 %	315121920
142	NC_014774	ATGGA	2	10	174086	174095	40 %	20 %	40 %	0 %	315121920
143	NC_014774	GTCAT	2	10	175120	175129	20 %	40 %	20 %	20 %	315121921
144	NC_014774	TATCT	2	10	176062	176071	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_014774	CATAA	2	10	181108	181117	60 %	20 %	0 %	20 %	315121928
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154	NC_014774	TATCC	2	10	190432	190441	20 %	40 %	0 %	40 %	315121937
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156	NC_014774	CTTCA	2	10	191259	191268	20 %	40 %	0 %	40 %	315121938
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158	NC_014774	CTCTT	2	10	192705	192714	0 %	60 %	0 %	40 %	315121938
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163	NC_014774	ACTTA	2	10	194872	194881	40 %	40 %	0 %	20 %	315121941
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171	NC_014774	TGAAT	2	10	201642	201651	40 %	40 %	20 %	0 %	315121953
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174	NC_014774	TATAA	2	10	202677	202686	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_014774	CTATT	2	10	209525	209534	20 %	60 %	0 %	20 %	315121965
176	NC_014774	GCTGT	2	10	213276	213285	0 %	40 %	40 %	20 %	315121969
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181	NC_014774	ATAAA	2	10	226066	226075	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_014774	CAATC	2	10	226402	226411	40 %	20 %	0 %	40 %	315121984
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248	NC_014774	AATTT	2	10	303706	303715	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
249	NC_014774	GAATA	2	10	305814	305823	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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251	NC_014774	TCGTG	2	10	306997	307006	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
252	NC_014774	TGGGC	2	10	307156	307165	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
253	NC_014774	ATAGC	2	10	310710	310719	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
254	NC_014774	TTATT	2	10	311091	311100	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_014774	TGGCT	2	10	327740	327749	0 %	40 %	40 %	20 %	315122070
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390	NC_014774	TACTA	2	10	496262	496271	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
391	NC_014774	TTTTA	2	10	496439	496448	20 %	80 %	0 %	0 %	315122210
392	NC_014774	AATGA	2	10	496922	496931	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
393	NC_014774	ACGAT	2	10	498079	498088	40 %	20 %	20 %	20 %	315122212
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398	NC_014774	TTTAC	2	10	504951	504960	20 %	60 %	0 %	20 %	315122218
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403	NC_014774	ATTGT	2	10	513316	513325	20 %	60 %	20 %	0 %	315122223
404	NC_014774	ATATT	2	10	516143	516152	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
405	NC_014774	ATTTT	3	15	516900	516914	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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