MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Liberibacter solanacearum CLso-ZC1 chromosome

Total Repeats: 716

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014774	ATTCA	2	10	960	969	40 %	40 %	0 %	20 %	315121752
2	NC_014774	TTTTG	2	10	1012	1021	0 %	80 %	20 %	0 %	315121752
3	NC_014774	TCAAA	2	10	2598	2607	60 %	20 %	0 %	20 %	315121753
4	NC_014774	TAATT	2	10	2886	2895	40 %	60 %	0 %	0 %	315121754
5	NC_014774	CATAA	2	10	3636	3645	60 %	20 %	0 %	20 %	315121754
6	NC_014774	AAATT	2	10	3849	3858	60 %	40 %	0 %	0 %	315121754
7	NC_014774	TTCCA	2	10	4877	4886	20 %	40 %	0 %	40 %	315121755
8	NC_014774	TTTTA	2	10	5092	5101	20 %	80 %	0 %	0 %	315121755
9	NC_014774	AAAAC	2	10	8339	8348	80 %	0 %	0 %	20 %	315121759
10	NC_014774	TCAAA	2	10	9939	9948	60 %	20 %	0 %	20 %	315121761
11	NC_014774	GAAAA	2	10	10548	10557	80 %	0 %	20 %	0 %	315121762
12	NC_014774	TTAAT	2	10	15174	15183	40 %	60 %	0 %	0 %	315121767
13	NC_014774	ATGCC	2	10	18180	18189	20 %	20 %	20 %	40 %	315121769
14	NC_014774	TTTTC	2	10	18620	18629	0 %	80 %	0 %	20 %	315121769
15	NC_014774	GATAC	2	10	18980	18989	40 %	20 %	20 %	20 %	315121769
16	NC_014774	AAAAT	2	10	21426	21435	80 %	20 %	0 %	0 %	315121772
17	NC_014774	CCCTG	2	10	23287	23296	0 %	20 %	20 %	60 %	315121774
18	NC_014774	TGTCA	2	10	24677	24686	20 %	40 %	20 %	20 %	315121776
19	NC_014774	TGCTC	2	10	25373	25382	0 %	40 %	20 %	40 %	315121777
20	NC_014774	ATTTT	3	15	30387	30401	20 %	80 %	0 %	0 %	315121784
21	NC_014774	TACGC	2	10	35292	35301	20 %	20 %	20 %	40 %	315121792
22	NC_014774	GAAAA	2	10	36170	36179	80 %	0 %	20 %	0 %	315121793
23	NC_014774	TACAT	2	10	36973	36982	40 %	40 %	0 %	20 %	315121794
24	NC_014774	TGGAT	2	10	37593	37602	20 %	40 %	40 %	0 %	315121795
25	NC_014774	AAAAC	2	10	39694	39703	80 %	0 %	0 %	20 %	315121797
26	NC_014774	CGCAT	2	10	43033	43042	20 %	20 %	20 %	40 %	315121799
27	NC_014774	GAAAA	2	10	43905	43914	80 %	0 %	20 %	0 %	315121799
28	NC_014774	AATTT	2	10	44140	44149	40 %	60 %	0 %	0 %	315121799
29	NC_014774	TGGAA	2	10	44414	44423	40 %	20 %	40 %	0 %	315121799
30	NC_014774	TTTAT	2	10	44479	44488	20 %	80 %	0 %	0 %	315121799
31	NC_014774	ACATA	2	10	45848	45857	60 %	20 %	0 %	20 %	315121801
32	NC_014774	TGAGA	2	10	46867	46876	40 %	20 %	40 %	0 %	315121801
33	NC_014774	TCCTT	2	10	47115	47124	0 %	60 %	0 %	40 %	315121801
34	NC_014774	ACAAT	2	10	49770	49779	60 %	20 %	0 %	20 %	315121804
35	NC_014774	ATCAA	2	10	50846	50855	60 %	20 %	0 %	20 %	315121805
36	NC_014774	AATCC	2	10	53524	53533	40 %	20 %	0 %	40 %	315121806
37	NC_014774	ATCGA	2	10	59984	59993	40 %	20 %	20 %	20 %	315121810
38	NC_014774	TCTTT	2	10	60916	60925	0 %	80 %	0 %	20 %	315121811
39	NC_014774	TCTTT	2	10	61934	61943	0 %	80 %	0 %	20 %	315121812
40	NC_014774	ACTTC	2	10	67771	67780	20 %	40 %	0 %	40 %	315121816
41	NC_014774	CTAAA	2	10	69356	69365	60 %	20 %	0 %	20 %	315121817
42	NC_014774	CTTTT	2	10	71040	71049	0 %	80 %	0 %	20 %	315121820
43	NC_014774	TAAAA	2	10	75995	76004	80 %	20 %	0 %	0 %	315121824
44	NC_014774	ATCTT	2	10	77243	77252	20 %	60 %	0 %	20 %	315121824
45	NC_014774	CAAAA	2	10	77401	77410	80 %	0 %	0 %	20 %	315121824
46	NC_014774	ATTTC	2	10	83599	83608	20 %	60 %	0 %	20 %	315121829
47	NC_014774	ATCAG	2	10	84316	84325	40 %	20 %	20 %	20 %	315121831
48	NC_014774	AATCA	2	10	89437	89446	60 %	20 %	0 %	20 %	315121836
49	NC_014774	GAAAA	2	10	89667	89676	80 %	0 %	20 %	0 %	315121836
50	NC_014774	CAATT	2	10	91951	91960	40 %	40 %	0 %	20 %	315121838
51	NC_014774	CTCCG	2	10	93406	93415	0 %	20 %	20 %	60 %	315121839
52	NC_014774	CAACA	2	10	101665	101674	60 %	0 %	0 %	40 %	315121851
53	NC_014774	GAACT	2	10	103904	103913	40 %	20 %	20 %	20 %	315121853
54	NC_014774	AAATA	2	10	107002	107011	80 %	20 %	0 %	0 %	315121856
55	NC_014774	TTTCT	2	10	110326	110335	0 %	80 %	0 %	20 %	315121860
56	NC_014774	AATCA	2	10	110339	110348	60 %	20 %	0 %	20 %	315121860
57	NC_014774	CTATT	2	10	110572	110581	20 %	60 %	0 %	20 %	315121860
58	NC_014774	AACTC	2	10	115242	115251	40 %	20 %	0 %	40 %	315121863
59	NC_014774	TCAAG	2	10	115751	115760	40 %	20 %	20 %	20 %	315121864
60	NC_014774	GCTCA	2	10	118390	118399	20 %	20 %	20 %	40 %	315121866
61	NC_014774	AAATC	2	10	120117	120126	60 %	20 %	0 %	20 %	315121867
62	NC_014774	CATAA	2	10	122174	122183	60 %	20 %	0 %	20 %	315121870
63	NC_014774	CGCCA	2	10	122803	122812	20 %	0 %	20 %	60 %	315121870
64	NC_014774	AAGTA	2	10	123046	123055	60 %	20 %	20 %	0 %	315121870
65	NC_014774	ACAAA	2	10	123489	123498	80 %	0 %	0 %	20 %	315121871
66	NC_014774	ATAAA	2	10	125143	125152	80 %	20 %	0 %	0 %	315121872
67	NC_014774	TAAAA	2	10	126986	126995	80 %	20 %	0 %	0 %	315121873
68	NC_014774	TCAAC	2	10	130932	130941	40 %	20 %	0 %	40 %	315121876
69	NC_014774	TTCTT	2	10	131606	131615	0 %	80 %	0 %	20 %	315121877
70	NC_014774	ATAGA	2	10	135572	135581	60 %	20 %	20 %	0 %	315121882
71	NC_014774	TTAAA	2	10	139626	139635	60 %	40 %	0 %	0 %	315121886
72	NC_014774	CCTTT	2	10	140094	140103	0 %	60 %	0 %	40 %	315121887
73	NC_014774	TTCTT	2	10	140927	140936	0 %	80 %	0 %	20 %	315121888
74	NC_014774	CTACG	2	10	144859	144868	20 %	20 %	20 %	40 %	315121891
75	NC_014774	TACCT	2	10	145577	145586	20 %	40 %	0 %	40 %	315121891
76	NC_014774	ATTTT	2	10	146747	146756	20 %	80 %	0 %	0 %	315121893
77	NC_014774	ATAAA	2	10	146863	146872	80 %	20 %	0 %	0 %	315121893
78	NC_014774	AGAAA	2	10	146956	146965	80 %	0 %	20 %	0 %	315121893
79	NC_014774	CCCAA	2	10	147026	147035	40 %	0 %	0 %	60 %	315121893
80	NC_014774	CTATC	2	10	151706	151715	20 %	40 %	0 %	40 %	315121903
81	NC_014774	TATAA	2	10	151836	151845	60 %	40 %	0 %	0 %	315121903
82	NC_014774	AAAAG	2	10	152019	152028	80 %	0 %	20 %	0 %	315121903
83	NC_014774	ATTTT	2	10	153063	153072	20 %	80 %	0 %	0 %	315121904
84	NC_014774	CTTGC	2	10	153387	153396	0 %	40 %	20 %	40 %	315121904
85	NC_014774	AACAA	2	10	155676	155685	80 %	0 %	0 %	20 %	315121906
86	NC_014774	ATTAT	2	10	157111	157120	40 %	60 %	0 %	0 %	315121907
87	NC_014774	ATAAA	2	10	158124	158133	80 %	20 %	0 %	0 %	315121909
88	NC_014774	GTTAT	2	10	160464	160473	20 %	60 %	20 %	0 %	315121912
89	NC_014774	TAAAA	2	10	160616	160625	80 %	20 %	0 %	0 %	315121912
90	NC_014774	CAAAT	2	10	161302	161311	60 %	20 %	0 %	20 %	315121913
91	NC_014774	AATGA	2	10	163418	163427	60 %	20 %	20 %	0 %	315121913
92	NC_014774	TGTAT	2	10	166818	166827	20 %	60 %	20 %	0 %	315121915
93	NC_014774	TATTC	2	10	166873	166882	20 %	60 %	0 %	20 %	315121915
94	NC_014774	CTCCA	2	10	170673	170682	20 %	20 %	0 %	60 %	315121917
95	NC_014774	TTCTT	2	10	171719	171728	0 %	80 %	0 %	20 %	315121918
96	NC_014774	ACCTC	2	10	171818	171827	20 %	20 %	0 %	60 %	315121918
97	NC_014774	ACGCT	2	10	173877	173886	20 %	20 %	20 %	40 %	315121920
98	NC_014774	TGGGA	2	10	174065	174074	20 %	20 %	60 %	0 %	315121920
99	NC_014774	ATGGA	2	10	174086	174095	40 %	20 %	40 %	0 %	315121920
100	NC_014774	GTCAT	2	10	175120	175129	20 %	40 %	20 %	20 %	315121921
101	NC_014774	CATAA	2	10	181108	181117	60 %	20 %	0 %	20 %	315121928
102	NC_014774	TCATC	2	10	181530	181539	20 %	40 %	0 %	40 %	315121928
103	NC_014774	AGCTT	2	10	181943	181952	20 %	40 %	20 %	20 %	315121928
104	NC_014774	AATGC	2	10	182768	182777	40 %	20 %	20 %	20 %	315121929
105	NC_014774	ACAAT	2	10	183702	183711	60 %	20 %	0 %	20 %	315121931
106	NC_014774	TTGAT	2	10	185429	185438	20 %	60 %	20 %	0 %	315121932
107	NC_014774	AACCA	2	10	186741	186750	60 %	0 %	0 %	40 %	315121933
108	NC_014774	ATCCC	2	10	188750	188759	20 %	20 %	0 %	60 %	315121934
109	NC_014774	ATATT	2	10	189611	189620	40 %	60 %	0 %	0 %	315121935
110	NC_014774	TATCC	2	10	190432	190441	20 %	40 %	0 %	40 %	315121937
111	NC_014774	CTTCA	2	10	191259	191268	20 %	40 %	0 %	40 %	315121938
112	NC_014774	TTGTG	2	10	191515	191524	0 %	60 %	40 %	0 %	315121938
113	NC_014774	CTCTT	2	10	192705	192714	0 %	60 %	0 %	40 %	315121938
114	NC_014774	CAACA	2	10	193620	193629	60 %	0 %	0 %	40 %	315121940
115	NC_014774	GGTCG	2	10	194311	194320	0 %	20 %	60 %	20 %	315121940
116	NC_014774	TTCGC	2	10	194503	194512	0 %	40 %	20 %	40 %	315121940
117	NC_014774	ACTTA	2	10	194872	194881	40 %	40 %	0 %	20 %	315121941
118	NC_014774	TGATT	5	25	196543	196567	20 %	60 %	20 %	0 %	315121942
119	NC_014774	TGCTT	3	15	196568	196582	0 %	60 %	20 %	20 %	315121942
120	NC_014774	CTATT	2	10	198682	198691	20 %	60 %	0 %	20 %	315121946
121	NC_014774	AGTTA	2	10	199181	199190	40 %	40 %	20 %	0 %	315121946
122	NC_014774	CAGAT	2	10	199586	199595	40 %	20 %	20 %	20 %	315121947
123	NC_014774	GGATG	2	10	199635	199644	20 %	20 %	60 %	0 %	315121947
124	NC_014774	CAGAT	2	10	201542	201551	40 %	20 %	20 %	20 %	315121953
125	NC_014774	TGAAT	2	10	201642	201651	40 %	40 %	20 %	0 %	315121953
126	NC_014774	GATAG	2	10	201853	201862	40 %	20 %	40 %	0 %	315121953
127	NC_014774	GAACA	2	10	202216	202225	60 %	0 %	20 %	20 %	315121953
128	NC_014774	CTATT	2	10	209525	209534	20 %	60 %	0 %	20 %	315121965
129	NC_014774	GCTGT	2	10	213276	213285	0 %	40 %	40 %	20 %	315121969
130	NC_014774	TAATG	2	10	220298	220307	40 %	40 %	20 %	0 %	315121977
131	NC_014774	AAAGA	2	10	223718	223727	80 %	0 %	20 %	0 %	315121981
132	NC_014774	CAATC	2	10	226402	226411	40 %	20 %	0 %	40 %	315121984
133	NC_014774	CACGC	2	10	226909	226918	20 %	0 %	20 %	60 %	315121984
134	NC_014774	TATAT	2	10	227941	227950	40 %	60 %	0 %	0 %	315121985
135	NC_014774	TAAAA	2	10	228602	228611	80 %	20 %	0 %	0 %	315121986
136	NC_014774	CTACA	2	10	230265	230274	40 %	20 %	0 %	40 %	315121988
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149	NC_014774	TGCAA	2	10	257210	257219	40 %	20 %	20 %	20 %	315122014
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255	NC_014774	AACTA	2	10	442639	442648	60 %	20 %	0 %	20 %	315122161
256	NC_014774	AAATT	2	10	444367	444376	60 %	40 %	0 %	0 %	315122163
257	NC_014774	ATTCA	2	10	444879	444888	40 %	40 %	0 %	20 %	315122164
258	NC_014774	TTTAA	2	10	446343	446352	40 %	60 %	0 %	0 %	315122166
259	NC_014774	GTACA	2	10	448840	448849	40 %	20 %	20 %	20 %	315122170
260	NC_014774	AATTA	2	10	451427	451436	60 %	40 %	0 %	0 %	315122171
261	NC_014774	CTATT	2	10	457323	457332	20 %	60 %	0 %	20 %	315122176
262	NC_014774	ATAGA	2	10	458143	458152	60 %	20 %	20 %	0 %	315122177
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