MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Candidatus Liberibacter solanacearum CLso-ZC1 chromosome

Total Repeats: 3413

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014774	AAAC	2	8	130	137	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014774	GATT	2	8	716	723	25 %	50 %	25 %	0 %	315121752
3	NC_014774	AGCG	2	8	1065	1072	25 %	0 %	50 %	25 %	315121752
4	NC_014774	ATTT	2	8	1205	1212	25 %	75 %	0 %	0 %	315121752
5	NC_014774	AATC	2	8	1269	1276	50 %	25 %	0 %	25 %	315121752
6	NC_014774	CCCT	2	8	1783	1790	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_014774	ATTT	2	8	1829	1836	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014774	TTGA	2	8	3149	3156	25 %	50 %	25 %	0 %	315121754
9	NC_014774	CAAA	2	8	3491	3498	75 %	0 %	0 %	25 %	315121754
10	NC_014774	AGAA	2	8	3515	3522	75 %	0 %	25 %	0 %	315121754
11	NC_014774	GCTA	2	8	3791	3798	25 %	25 %	25 %	25 %	315121754
12	NC_014774	ATCC	2	8	3894	3901	25 %	25 %	0 %	50 %	315121754
13	NC_014774	TGCC	2	8	4067	4074	0 %	25 %	25 %	50 %	315121754
14	NC_014774	ATAA	2	8	4099	4106	75 %	25 %	0 %	0 %	315121754
15	NC_014774	AAAT	2	8	4114	4121	75 %	25 %	0 %	0 %	315121754
16	NC_014774	TGAC	2	8	4235	4242	25 %	25 %	25 %	25 %	315121754
17	NC_014774	ATAA	2	8	4750	4757	75 %	25 %	0 %	0 %	315121755
18	NC_014774	ATAA	2	8	4828	4835	75 %	25 %	0 %	0 %	315121755
19	NC_014774	AAAC	2	8	4927	4934	75 %	0 %	0 %	25 %	315121755
20	NC_014774	ACTA	2	8	5200	5207	50 %	25 %	0 %	25 %	315121755
21	NC_014774	TCTA	2	8	5319	5326	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014774	ATTT	2	8	5804	5811	25 %	75 %	0 %	0 %	315121756
23	NC_014774	TTAA	2	8	6081	6088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014774	ATTT	2	8	6108	6115	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014774	AAAC	2	8	6265	6272	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014774	TATC	2	8	6294	6301	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014774	AGTA	2	8	6404	6411	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014774	ATTT	2	8	6676	6683	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014774	ATTT	2	8	6883	6890	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014774	AAGG	2	8	7239	7246	50 %	0 %	50 %	0 %	315121757
31	NC_014774	GGTT	2	8	7362	7369	0 %	50 %	50 %	0 %	315121757
32	NC_014774	ACTT	2	8	7497	7504	25 %	50 %	0 %	25 %	315121758
33	NC_014774	TATT	2	8	7928	7935	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014774	AATA	2	8	8069	8076	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014774	TTTG	2	8	8198	8205	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014774	TCCC	2	8	8436	8443	0 %	25 %	0 %	75 %	315121759
37	NC_014774	CAAA	2	8	9159	9166	75 %	0 %	0 %	25 %	315121760
38	NC_014774	ATTT	2	8	9493	9500	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014774	ATTT	2	8	9530	9537	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014774	TATC	2	8	9984	9991	25 %	50 %	0 %	25 %	315121761
41	NC_014774	CTTT	2	8	10233	10240	0 %	75 %	0 %	25 %	315121761
42	NC_014774	AAGC	2	8	10899	10906	50 %	0 %	25 %	25 %	315121762
43	NC_014774	ATCC	2	8	11175	11182	25 %	25 %	0 %	50 %	315121762
44	NC_014774	ATTT	2	8	11360	11367	25 %	75 %	0 %	0 %	315121762
45	NC_014774	ATAC	2	8	11968	11975	50 %	25 %	0 %	25 %	315121763
46	NC_014774	ACAA	2	8	12378	12385	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014774	TCAA	2	8	12489	12496	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014774	ATAA	2	8	13450	13457	75 %	25 %	0 %	0 %	315121765
49	NC_014774	ACAA	2	8	13999	14006	75 %	0 %	0 %	25 %	315121766
50	NC_014774	CATA	2	8	14245	14252	50 %	25 %	0 %	25 %	315121766
51	NC_014774	GATT	2	8	14697	14704	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014774	ATGT	2	8	14858	14865	25 %	50 %	25 %	0 %	315121767
53	NC_014774	CATC	3	12	15035	15046	25 %	25 %	0 %	50 %	315121767
54	NC_014774	TGGG	2	8	15382	15389	0 %	25 %	75 %	0 %	315121767
55	NC_014774	TTTA	2	8	15838	15845	25 %	75 %	0 %	0 %	315121767
56	NC_014774	TACC	2	8	16311	16318	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_014774	CAAT	2	8	16326	16333	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_014774	TCTT	2	8	16836	16843	0 %	75 %	0 %	25 %	315121768
59	NC_014774	TTTA	2	8	17506	17513	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014774	AATC	2	8	17720	17727	50 %	25 %	0 %	25 %	315121769
61	NC_014774	ATCT	2	8	18300	18307	25 %	50 %	0 %	25 %	315121769
62	NC_014774	GGTT	2	8	18319	18326	0 %	50 %	50 %	0 %	315121769
63	NC_014774	AAGG	2	8	19232	19239	50 %	0 %	50 %	0 %	315121769
64	NC_014774	CCAT	2	8	19539	19546	25 %	25 %	0 %	50 %	315121770
65	NC_014774	TGGC	2	8	19552	19559	0 %	25 %	50 %	25 %	315121770
66	NC_014774	GAAA	2	8	20318	20325	75 %	0 %	25 %	0 %	315121771
67	NC_014774	ATGA	2	8	20670	20677	50 %	25 %	25 %	0 %	315121771
68	NC_014774	ATTT	2	8	21166	21173	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014774	TTAT	2	8	21314	21321	25 %	75 %	0 %	0 %	315121772
70	NC_014774	ATTT	2	8	22750	22757	25 %	75 %	0 %	0 %	315121774
71	NC_014774	GGGA	2	8	22953	22960	25 %	0 %	75 %	0 %	315121774
72	NC_014774	TAAA	2	8	23507	23514	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014774	AAAG	2	8	24238	24245	75 %	0 %	25 %	0 %	315121775
74	NC_014774	TAAA	2	8	24355	24362	75 %	25 %	0 %	0 %	315121775
75	NC_014774	ATGT	2	8	24518	24525	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014774	AACT	2	8	24661	24668	50 %	25 %	0 %	25 %	315121776
77	NC_014774	TGAA	2	8	25023	25030	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014774	TGAT	2	8	26313	26320	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014774	TAGC	2	8	26323	26330	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_014774	TAAA	2	8	26562	26569	75 %	25 %	0 %	0 %	315121779
81	NC_014774	CTTA	2	8	26998	27005	25 %	50 %	0 %	25 %	315121780
82	NC_014774	GTGA	2	8	27294	27301	25 %	25 %	50 %	0 %	315121780
83	NC_014774	ACAA	2	8	27557	27564	75 %	0 %	0 %	25 %	315121780
84	NC_014774	GACA	2	8	29117	29124	50 %	0 %	25 %	25 %	315121782
85	NC_014774	TATC	2	8	29183	29190	25 %	50 %	0 %	25 %	315121782
86	NC_014774	AATG	2	8	29290	29297	50 %	25 %	25 %	0 %	315121782
87	NC_014774	TCTA	2	8	29568	29575	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_014774	CGAG	2	8	30086	30093	25 %	0 %	50 %	25 %	315121783
89	NC_014774	TAAA	3	12	30102	30113	75 %	25 %	0 %	0 %	315121783
90	NC_014774	AAAT	2	8	30231	30238	75 %	25 %	0 %	0 %	315121784
91	NC_014774	AAAT	2	8	30439	30446	75 %	25 %	0 %	0 %	315121784
92	NC_014774	AATT	2	8	30680	30687	50 %	50 %	0 %	0 %	315121784
93	NC_014774	CAAA	2	8	31330	31337	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_014774	GATT	2	8	32141	32148	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014774	AAAG	2	8	32886	32893	75 %	0 %	25 %	0 %	315121789
96	NC_014774	ACTA	2	8	33116	33123	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_014774	ATAA	2	8	33271	33278	75 %	25 %	0 %	0 %	315121790
98	NC_014774	TATG	2	8	34930	34937	25 %	50 %	25 %	0 %	315121792
99	NC_014774	AAGG	2	8	35364	35371	50 %	0 %	50 %	0 %	315121792
100	NC_014774	ACAA	2	8	35528	35535	75 %	0 %	0 %	25 %	315121792
101	NC_014774	AATC	2	8	35604	35611	50 %	25 %	0 %	25 %	315121793
102	NC_014774	AGAA	3	12	35818	35829	75 %	0 %	25 %	0 %	315121793
103	NC_014774	TTGA	2	8	35981	35988	25 %	50 %	25 %	0 %	315121793
104	NC_014774	GCAA	2	8	36289	36296	50 %	0 %	25 %	25 %	315121793
105	NC_014774	GAAT	2	8	36320	36327	50 %	25 %	25 %	0 %	315121793
106	NC_014774	AATC	2	8	36467	36474	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_014774	TCTT	2	8	37227	37234	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_014774	ATAC	2	8	37371	37378	50 %	25 %	0 %	25 %	315121795
109	NC_014774	CAAA	2	8	37808	37815	75 %	0 %	0 %	25 %	315121795
110	NC_014774	ATTA	2	8	37829	37836	50 %	50 %	0 %	0 %	315121795
111	NC_014774	AACA	2	8	39567	39574	75 %	0 %	0 %	25 %	315121796
112	NC_014774	TAAA	2	8	40433	40440	75 %	25 %	0 %	0 %	315121797
113	NC_014774	TGAT	2	8	40923	40930	25 %	50 %	25 %	0 %	315121797
114	NC_014774	AATG	2	8	41139	41146	50 %	25 %	25 %	0 %	315121797
115	NC_014774	ATCA	2	8	41414	41421	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_014774	TTTC	2	8	42055	42062	0 %	75 %	0 %	25 %	315121798
117	NC_014774	CAAA	2	8	42354	42361	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014774	TAAT	2	8	42680	42687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014774	TAAA	2	8	42735	42742	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014774	GCAA	2	8	42816	42823	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_014774	CAAA	2	8	42908	42915	75 %	0 %	0 %	25 %	315121799
122	NC_014774	CTTT	2	8	43711	43718	0 %	75 %	0 %	25 %	315121799
123	NC_014774	TCAA	2	8	43733	43740	50 %	25 %	0 %	25 %	315121799
124	NC_014774	TTCC	2	8	44273	44280	0 %	50 %	0 %	50 %	315121799
125	NC_014774	AAAC	2	8	46235	46242	75 %	0 %	0 %	25 %	315121801
126	NC_014774	GAAT	2	8	47405	47412	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014774	GCCA	2	8	48555	48562	25 %	0 %	25 %	50 %	315121803
128	NC_014774	ATAA	2	8	48658	48665	75 %	25 %	0 %	0 %	315121803
129	NC_014774	GCTC	2	8	48815	48822	0 %	25 %	25 %	50 %	315121803
130	NC_014774	TGCC	2	8	49086	49093	0 %	25 %	25 %	50 %	315121803
131	NC_014774	AGAA	2	8	49279	49286	75 %	0 %	25 %	0 %	315121803
132	NC_014774	GGAG	2	8	49504	49511	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014774	CAAA	2	8	49748	49755	75 %	0 %	0 %	25 %	315121804
134	NC_014774	AATT	2	8	49881	49888	50 %	50 %	0 %	0 %	315121804
135	NC_014774	AAAC	2	8	49909	49916	75 %	0 %	0 %	25 %	315121804
136	NC_014774	TATT	2	8	51375	51382	25 %	75 %	0 %	0 %	315121805
137	NC_014774	ATGG	2	8	51385	51392	25 %	25 %	50 %	0 %	315121805
138	NC_014774	CGAA	2	8	51717	51724	50 %	0 %	25 %	25 %	315121805
139	NC_014774	CCAA	2	8	51885	51892	50 %	0 %	0 %	50 %	315121805
140	NC_014774	ATTC	2	8	52376	52383	25 %	50 %	0 %	25 %	315121806
141	NC_014774	GCCT	2	8	52460	52467	0 %	25 %	25 %	50 %	315121806
142	NC_014774	AAGA	2	8	52873	52880	75 %	0 %	25 %	0 %	315121806
143	NC_014774	AAAC	2	8	52881	52888	75 %	0 %	0 %	25 %	315121806
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145	NC_014774	ATCA	2	8	53093	53100	50 %	25 %	0 %	25 %	315121806
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