MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Liberibacter solanacearum CLso-ZC1 chromosome

Total Repeats: 807

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014774	AAAC	2	8	130	137	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014774	CCCT	2	8	1783	1790	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_014774	ATTT	2	8	1829	1836	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014774	TCTA	2	8	5319	5326	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014774	TTAA	2	8	6081	6088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014774	ATTT	2	8	6108	6115	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014774	AAAC	2	8	6265	6272	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014774	TATC	2	8	6294	6301	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014774	AGTA	2	8	6404	6411	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014774	ATTT	2	8	6676	6683	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014774	ATTT	2	8	6883	6890	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014774	TATT	2	8	7928	7935	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014774	AATA	2	8	8069	8076	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014774	TTTG	2	8	8198	8205	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014774	ATTT	2	8	9493	9500	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014774	ATTT	2	8	9530	9537	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014774	ACAA	2	8	12378	12385	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014774	TCAA	2	8	12489	12496	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014774	GATT	2	8	14697	14704	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014774	TACC	2	8	16311	16318	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014774	CAAT	2	8	16326	16333	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014774	TTTA	2	8	17506	17513	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014774	ATTT	2	8	21166	21173	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014774	TAAA	2	8	23507	23514	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014774	ATGT	2	8	24518	24525	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014774	TGAA	2	8	25023	25030	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014774	TGAT	2	8	26313	26320	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014774	TAGC	2	8	26323	26330	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_014774	TCTA	2	8	29568	29575	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014774	CAAA	2	8	31330	31337	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014774	GATT	2	8	32141	32148	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014774	ACTA	2	8	33116	33123	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014774	AATC	2	8	36467	36474	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014774	TCTT	2	8	37227	37234	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_014774	ATCA	2	8	41414	41421	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014774	CAAA	2	8	42354	42361	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014774	TAAT	2	8	42680	42687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014774	TAAA	2	8	42735	42742	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014774	GCAA	2	8	42816	42823	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014774	GAAT	2	8	47405	47412	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014774	GGAG	2	8	49504	49511	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014774	ATCA	2	8	54228	54235	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014774	ACTA	2	8	54291	54298	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014774	GAAA	2	8	54349	54356	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014774	TAGC	2	8	56748	56755	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_014774	TATT	2	8	57929	57936	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014774	CATA	2	8	57960	57967	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014774	ATTT	2	8	58012	58019	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014774	CATT	2	8	64500	64507	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014774	AAAT	2	8	64618	64625	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014774	AAAT	2	8	64789	64796	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014774	CTTT	2	8	64925	64932	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014774	AATA	2	8	70146	70153	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014774	AAAT	2	8	70264	70271	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014774	GCTT	2	8	73048	73055	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014774	GCAA	2	8	73336	73343	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_014774	AAAT	2	8	74468	74475	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014774	CTAT	2	8	79518	79525	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_014774	TTCA	2	8	80063	80070	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_014774	AATA	2	8	80244	80251	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014774	TTCT	2	8	80314	80321	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014774	ATCG	2	8	80403	80410	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014774	TGAA	2	8	80491	80498	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014774	TACA	2	8	82260	82267	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_014774	ACTA	2	8	82375	82382	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014774	CTAT	2	8	82385	82392	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_014774	ACCA	2	8	86050	86057	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_014774	ATTC	2	8	87505	87512	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_014774	AAAT	2	8	90858	90865	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014774	ATAA	2	8	90933	90940	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014774	CTTT	2	8	90967	90974	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014774	TAGT	2	8	94119	94126	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014774	CCGT	2	8	100950	100957	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014774	ATCA	2	8	109718	109725	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_014774	AAAC	2	8	109907	109914	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014774	AATA	2	8	110003	110010	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014774	ATAA	2	8	111964	111971	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014774	CCTT	2	8	113208	113215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_014774	TCAT	2	8	113836	113843	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_014774	AAAT	2	8	114008	114015	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014774	ATCA	2	8	117818	117825	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_014774	ACAT	2	8	129403	129410	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_014774	GATA	2	8	131053	131060	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014774	GTAT	2	8	131827	131834	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014774	AATA	2	8	137238	137245	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014774	TTTA	2	8	138153	138160	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014774	TCTA	2	8	138676	138683	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_014774	TTAT	2	8	143649	143656	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014774	ATCT	2	8	147198	147205	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_014774	AAGA	2	8	147267	147274	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014774	ATTT	2	8	147526	147533	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014774	GAAA	2	8	147562	147569	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014774	TCAT	2	8	147830	147837	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_014774	AATT	2	8	148683	148690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014774	ATTT	2	8	150506	150513	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014774	TTGA	2	8	151221	151228	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014774	TTAT	2	8	152203	152210	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014774	CTAT	2	8	152217	152224	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_014774	AAGA	2	8	152479	152486	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014774	GTTT	2	8	154941	154948	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014774	TCTT	2	8	160720	160727	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014774	TAAA	2	8	163669	163676	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014774	AACT	2	8	166253	166260	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_014774	TAAT	2	8	166551	166558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014774	TAAA	2	8	171448	171455	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014774	TAAA	2	8	173643	173650	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014774	GCTG	2	8	180716	180723	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_014774	ATAG	2	8	195379	195386	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014774	TGAT	2	8	195972	195979	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014774	CTCC	2	8	196230	196237	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
111	NC_014774	GCGT	2	8	196282	196289	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014774	TTAT	2	8	197091	197098	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014774	CTTA	2	8	197133	197140	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_014774	GATA	2	8	197195	197202	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014774	GATA	2	8	206744	206751	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014774	ATAA	2	8	207022	207029	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014774	CCAA	2	8	207514	207521	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_014774	TAAA	2	8	207982	207989	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014774	TTAT	2	8	215720	215727	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014774	GGAA	2	8	215748	215755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014774	AAGA	2	8	215769	215776	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014774	AAAG	2	8	217099	217106	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014774	AATA	2	8	217253	217260	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014774	TAAA	2	8	223228	223235	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014774	TCTT	2	8	223304	223311	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_014774	AATA	2	8	232874	232881	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014774	TGCG	2	8	238986	238993	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_014774	CTAA	2	8	239252	239259	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_014774	TCTT	2	8	239814	239821	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_014774	GAAA	2	8	242153	242160	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014774	TCCA	2	8	242281	242288	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_014774	ACAA	2	8	242421	242428	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_014774	CAAA	2	8	244473	244480	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014774	CATA	2	8	244556	244563	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_014774	TACA	2	8	244872	244879	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_014774	ATAA	2	8	251163	251170	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014774	TCAA	2	8	254402	254409	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_014774	CATA	2	8	257517	257524	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_014774	ATCT	2	8	257567	257574	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_014774	TAGT	2	8	259165	259172	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014774	AATA	2	8	260278	260285	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014774	CAAT	2	8	266363	266370	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_014774	AATA	2	8	266478	266485	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014774	TTCT	2	8	271548	271555	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_014774	ATCA	2	8	279225	279232	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_014774	AAAC	2	8	279239	279246	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_014774	TATG	2	8	281318	281325	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014774	ATTT	3	12	281953	281964	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014774	TGAT	2	8	285907	285914	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014774	GATT	2	8	285917	285924	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014774	AACC	2	8	289824	289831	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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