MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfuricurvum kujiense DSM 16994 chromosome

Total Repeats: 467

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014762	TGAA	2	8	1459	1466	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014762	TCAT	2	8	15315	15322	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014762	GGTC	2	8	39411	39418	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014762	CAAA	2	8	42876	42883	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014762	CACG	2	8	48056	48063	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_014762	GTAG	2	8	54330	54337	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014762	TACG	2	8	54471	54478	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014762	AAAC	2	8	60547	60554	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014762	ATAC	2	8	80292	80299	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014762	ATTT	2	8	83425	83432	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014762	TTTA	2	8	84630	84637	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014762	AGAA	2	8	86570	86577	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014762	AATC	2	8	89640	89647	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014762	AGAA	2	8	89693	89700	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014762	AAAC	2	8	89755	89762	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014762	AACA	2	8	91607	91614	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014762	AATA	2	8	91631	91638	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014762	CATA	2	8	91758	91765	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014762	TACT	2	8	100252	100259	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014762	ACGC	2	8	100340	100347	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014762	AAAT	2	8	102033	102040	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014762	CAAT	2	8	103994	104001	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014762	AATT	2	8	113814	113821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014762	TCAC	2	8	120758	120765	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014762	ATCA	2	8	121025	121032	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014762	AATC	2	8	121204	121211	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014762	CAAT	2	8	121290	121297	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014762	TTTG	2	8	121405	121412	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014762	CGGC	2	8	121642	121649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014762	CAAA	2	8	121780	121787	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014762	ATAG	2	8	130768	130775	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014762	AAAG	2	8	132386	132393	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014762	TCTG	2	8	142263	142270	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014762	CAGA	2	8	142327	142334	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_014762	TTAA	2	8	148592	148599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014762	TTGA	2	8	148622	148629	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014762	GATA	2	8	148790	148797	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014762	GTCC	2	8	149430	149437	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014762	TAAG	2	8	152030	152037	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014762	AGTT	2	8	173274	173281	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014762	ATTG	2	8	177796	177803	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014762	ATTC	2	8	183099	183106	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014762	TGAC	2	8	192445	192452	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014762	TTTA	2	8	211408	211415	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014762	ATTT	2	8	211955	211962	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014762	TTTA	2	8	212016	212023	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014762	TTTA	2	8	213029	213036	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014762	CTTT	2	8	226459	226466	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014762	ATGA	2	8	228421	228428	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014762	TGAA	2	8	233294	233301	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014762	TTGA	2	8	239764	239771	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014762	GTTT	2	8	252900	252907	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014762	GTAT	2	8	286320	286327	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014762	CACG	2	8	286730	286737	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_014762	CGCC	2	8	328681	328688	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
56	NC_014762	TTTA	2	8	328749	328756	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014762	CAAG	2	8	336956	336963	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_014762	AAAT	2	8	343540	343547	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014762	GAAA	2	8	343719	343726	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014762	AAAT	2	8	345308	345315	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014762	CAAA	2	8	361962	361969	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014762	AGCT	2	8	366322	366329	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014762	AAAT	2	8	371394	371401	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014762	TCCC	2	8	377976	377983	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
65	NC_014762	GGGA	2	8	395304	395311	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014762	ATGA	2	8	396171	396178	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014762	TAAG	2	8	405473	405480	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014762	TTCG	2	8	483112	483119	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_014762	GAAT	2	8	483186	483193	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014762	ATTC	2	8	487271	487278	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_014762	TCAT	2	8	506152	506159	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014762	ATGT	2	8	515360	515367	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014762	TTTA	2	8	515422	515429	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014762	AGTG	2	8	515837	515844	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014762	CTTT	2	8	515933	515940	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014762	ATCC	2	8	516121	516128	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_014762	CGTC	2	8	516434	516441	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014762	TTGA	2	8	517035	517042	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014762	CACT	2	8	517454	517461	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_014762	AATT	2	8	517491	517498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014762	TTGA	2	8	517543	517550	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014762	AAAT	3	12	517965	517976	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014762	TTTA	2	8	517999	518006	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014762	TTTG	2	8	518120	518127	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014762	ATTT	2	8	523455	523462	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014762	ATTA	2	8	536577	536584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014762	TAAG	2	8	553731	553738	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014762	AATT	2	8	567441	567448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014762	CAAT	2	8	588123	588130	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_014762	TTAA	2	8	595491	595498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014762	GATT	2	8	597191	597198	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014762	TGTT	2	8	598804	598811	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014762	CTAT	2	8	605422	605429	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_014762	TAAA	2	8	605478	605485	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014762	CTGC	2	8	605583	605590	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_014762	AATG	2	8	606073	606080	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014762	GAAG	2	8	611978	611985	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014762	ATAG	2	8	628542	628549	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014762	TTAT	2	8	637873	637880	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014762	ATGA	2	8	642460	642467	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014762	TAAA	2	8	644496	644503	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014762	AAAG	2	8	649013	649020	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014762	TTGG	2	8	657139	657146	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014762	TCAT	2	8	658760	658767	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_014762	AAAT	2	8	659451	659458	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014762	GACA	2	8	659615	659622	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_014762	GGTG	2	8	660220	660227	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014762	AATC	2	8	660232	660239	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_014762	AAAG	2	8	660355	660362	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014762	GGTG	2	8	660903	660910	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014762	TCCC	2	8	661047	661054	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
112	NC_014762	GACT	2	8	661624	661631	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_014762	GACA	2	8	661636	661643	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_014762	AATC	2	8	662454	662461	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_014762	CTTT	2	8	662514	662521	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_014762	ATGC	2	8	669134	669141	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_014762	TATC	2	8	670123	670130	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014762	GTAT	2	8	670263	670270	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014762	TGCA	2	8	673852	673859	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_014762	CAAA	2	8	685189	685196	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_014762	ATTC	2	8	685233	685240	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_014762	TGAT	2	8	685678	685685	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014762	AATA	2	8	695173	695180	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014762	TTTA	2	8	697205	697212	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014762	TATT	2	8	697250	697257	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014762	TACT	2	8	698601	698608	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_014762	TAAA	2	8	699777	699784	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014762	TTTG	2	8	700539	700546	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014762	TAAA	2	8	733232	733239	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014762	AATA	2	8	737358	737365	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014762	GCAT	2	8	741367	741374	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014762	TAAA	2	8	741400	741407	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014762	GTAA	2	8	741441	741448	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014762	TATT	2	8	756081	756088	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014762	CAGG	2	8	774975	774982	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_014762	CAGG	2	8	775171	775178	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_014762	TAGA	2	8	779778	779785	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014762	GGGT	2	8	796147	796154	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014762	TCCA	2	8	805086	805093	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_014762	AATA	2	8	806055	806062	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014762	AATA	2	8	808191	808198	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014762	ACAT	2	8	808209	808216	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_014762	TTTG	2	8	808260	808267	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014762	ATTT	2	8	827272	827279	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014762	TTTA	2	8	827324	827331	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014762	TGAG	2	8	833607	833614	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014762	CTGT	2	8	833637	833644	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_014762	AGCC	2	8	843565	843572	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_014762	AGCC	2	8	843600	843607	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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151	NC_014762	CAAT	2	8	856432	856439	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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437	NC_014762	CTAT	2	8	2440883	2440890	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
438	NC_014762	TAAA	2	8	2440995	2441002	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NC_014762	ATTT	2	8	2442395	2442402	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
440	NC_014762	TGAA	2	8	2442572	2442579	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
441	NC_014762	AAAC	2	8	2462937	2462944	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
442	NC_014762	CTGA	2	8	2468559	2468566	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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447	NC_014762	ATTT	2	8	2519127	2519134	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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467	NC_014762	AAAT	2	8	2573864	2573871	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.