MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycoplasma bovis PG45 chromosome

Total Repeats: 474

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014760	AAATAT	2	12	1911	1922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313678136
2	NC_014760	AATTAG	2	12	4551	4562	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	313678139
3	NC_014760	AACTTC	2	12	7968	7979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313678142
4	NC_014760	TTCCTT	2	12	8421	8432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313678143
5	NC_014760	CCAATA	2	12	8915	8926	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	313678143
6	NC_014760	TTTTCA	2	12	9051	9062	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	313678144
7	NC_014760	TTAAAA	2	12	12663	12674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313678147
8	NC_014760	CAAAAT	2	12	17479	17490	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	313678151
9	NC_014760	CCACTA	2	12	17648	17659	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	313678151
10	NC_014760	ATGAAG	2	12	20559	20570	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	313678154
11	NC_014760	AATATT	2	12	22346	22357	50 %	50 %	0 %	0 %	313678156
12	NC_014760	CCATTT	2	12	22446	22457	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	313678156
13	NC_014760	TTTACA	2	12	26701	26712	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	313678160
14	NC_014760	AGTTAA	2	12	27726	27737	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	313678160
15	NC_014760	AATTTC	2	12	29243	29254	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	313678161
16	NC_014760	AAAATA	2	12	30339	30350	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	313678163
17	NC_014760	TTGACT	2	12	31441	31452	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	313678164
18	NC_014760	CTTTTC	2	12	31811	31822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313678165
19	NC_014760	ACCAGA	2	12	32750	32761	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	313678165
20	NC_014760	ATTCAT	2	12	34593	34604	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	313678166
21	NC_014760	TTCTCT	2	12	35568	35579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313678167
22	NC_014760	ACCTTT	2	12	39968	39979	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	313678170
23	NC_014760	AGCTCT	2	12	40316	40327	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	313678170
24	NC_014760	TTAGTT	2	12	44436	44447	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	313678170
25	NC_014760	AGTTTA	2	12	47937	47948	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	313678170
26	NC_014760	GAAAAT	2	12	53576	53587	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	313678172
27	NC_014760	TAAGTA	2	12	55152	55163	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	313678174
28	NC_014760	AAATGA	2	12	58584	58595	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	313678179
29	NC_014760	TGAACA	2	12	58932	58943	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	313678179
30	NC_014760	TAAGTG	2	12	59637	59648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313678180
31	NC_014760	CCAATT	2	12	66434	66445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313678186
32	NC_014760	TCAGTT	2	12	67997	68008	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	313678188
33	NC_014760	GAAAAT	2	12	70073	70084	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	313678190
34	NC_014760	TAAGAA	2	12	70179	70190	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	313678190
35	NC_014760	AGCTCT	2	12	72277	72288	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	313678192
36	NC_014760	TCAAAA	2	12	72757	72768	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	313678192
37	NC_014760	TAATTT	2	12	73542	73553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313678193
38	NC_014760	TTTTGA	2	12	75728	75739	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	313678196
39	NC_014760	GACAAA	2	12	75756	75767	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	313678196
40	NC_014760	ATGCAA	2	12	77523	77534	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	313678197
41	NC_014760	TGAAAA	2	12	78025	78036	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	313678197
42	NC_014760	AAAGGC	2	12	84912	84923	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	313678200
43	NC_014760	GCTTCA	2	12	86972	86983	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	313678201
44	NC_014760	GAAATT	2	12	89624	89635	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	313678204
45	NC_014760	AATTGA	2	12	97604	97615	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	313678211
46	NC_014760	ATATAA	2	12	99431	99442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313678214
47	NC_014760	TGTTCG	2	12	101022	101033	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	313678216
48	NC_014760	CCTGTT	2	12	101152	101163	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	313678216
49	NC_014760	CTTTGA	2	12	101801	101812	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	313678217
50	NC_014760	AACTCC	2	12	101912	101923	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	313678217
51	NC_014760	GTTAAA	2	12	102141	102152	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	313678217
52	NC_014760	AGAATT	2	12	103771	103782	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	313678219
53	NC_014760	ACTAAA	2	12	105728	105739	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	313678222
54	NC_014760	TGAAAA	2	12	106075	106086	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	313678222
55	NC_014760	TGTTTT	2	12	110291	110302	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	313678228
56	NC_014760	TTGATG	2	12	111844	111855	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	313678230
57	NC_014760	GAAAAA	2	12	112626	112637	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	313678230
58	NC_014760	TTAGCT	2	12	116445	116456	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	313678233
59	NC_014760	CACCCA	2	12	116499	116510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313678233
60	NC_014760	GAATCT	2	12	117341	117352	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	313678235
61	NC_014760	TTAGAA	2	12	119182	119193	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	313678237
62	NC_014760	TGTATT	2	12	122377	122388	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	313678238
63	NC_014760	AATTAA	2	12	124308	124319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313678239
64	NC_014760	TCTGGT	2	12	124566	124577	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	313678240
65	NC_014760	TTTAAA	2	12	124787	124798	50 %	50 %	0 %	0 %	313678240
66	NC_014760	TGAAGT	2	12	127140	127151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313678241
67	NC_014760	ATGAAT	2	12	128849	128860	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	313678242
68	NC_014760	ATATTT	2	12	129161	129172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313678243
69	NC_014760	ATATAG	2	12	132264	132275	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	313678245
70	NC_014760	GTTCCT	2	12	144499	144510	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	313678257
71	NC_014760	AAGCAA	2	12	145829	145840	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	313678257
72	NC_014760	TAATGG	2	12	152435	152446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313678262
73	NC_014760	ACAAAA	2	12	154124	154135	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	313678264
74	NC_014760	TGATAA	2	12	154719	154730	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	313678264
75	NC_014760	AAAATT	2	12	165952	165963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313678269
76	NC_014760	ACAAGC	2	12	166748	166759	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	313678269
77	NC_014760	ACTTTG	2	12	167837	167848	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	313678269
78	NC_014760	CTTTTT	2	12	169794	169805	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	313678270
79	NC_014760	CAAAAA	2	12	171941	171952	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	313678272
80	NC_014760	GGAAAT	2	12	172975	172986	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	313678273
81	NC_014760	ACAAAG	2	12	173444	173455	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	313678273
82	NC_014760	TGGTTA	2	12	174700	174711	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	313678275
83	NC_014760	TAATGC	2	12	175906	175917	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	313678276
84	NC_014760	TGTAAA	2	12	179703	179714	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	313678279
85	NC_014760	AATGGC	2	12	180153	180164	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	313678279
86	NC_014760	TAAGAT	2	12	180369	180380	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	313678279
87	NC_014760	TAGCAC	2	12	181577	181588	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	313678280
88	NC_014760	CATATG	2	12	188242	188253	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	313678286
89	NC_014760	GTTTTG	2	12	196797	196808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313678287
90	NC_014760	TTAAAT	2	12	200276	200287	50 %	50 %	0 %	0 %	313678290
91	NC_014760	ATTTTT	2	12	200617	200628	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	313678290
92	NC_014760	TTTATA	2	12	201477	201488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313678291
93	NC_014760	TTTTCT	2	12	202350	202361	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	313678291
94	NC_014760	ATCAAA	2	12	202383	202394	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	313678291
95	NC_014760	AATTTT	2	12	202848	202859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313678291
96	NC_014760	TCAAAT	2	12	204045	204056	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	313678292
97	NC_014760	TCAAAT	2	12	204129	204140	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	313678292
98	NC_014760	AAATAT	2	12	204577	204588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313678292
99	NC_014760	TATACA	2	12	211874	211885	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	313678293
100	NC_014760	CAAAGC	2	12	215037	215048	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	313678296
101	NC_014760	GCTTTA	2	12	216871	216882	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	313678297
102	NC_014760	TCATTT	2	12	219011	219022	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	313678299
103	NC_014760	AAAAAG	2	12	219673	219684	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	313678299
104	NC_014760	TACACT	2	12	236647	236658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313678309
105	NC_014760	CTTCAA	2	12	237519	237530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313678309
106	NC_014760	TGATCC	2	12	238661	238672	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	313678310
107	NC_014760	CAAAAA	2	12	239304	239315	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	313678310
108	NC_014760	CATCTT	2	12	240368	240379	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	313678312
109	NC_014760	AATTAG	2	12	241358	241369	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	313678313
110	NC_014760	TTCATT	2	12	241710	241721	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	313678313
111	NC_014760	TAAAAT	2	12	242748	242759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313678314
112	NC_014760	CTTTTT	2	12	242799	242810	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	313678315
113	NC_014760	TCTTTT	2	12	243449	243460	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	313678316
114	NC_014760	TTAATG	2	12	243849	243860	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	313678316
115	NC_014760	TGATTT	2	12	252291	252302	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	313678323
116	NC_014760	ATTTTC	2	12	252551	252562	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	313678323
117	NC_014760	AAAGAA	2	12	259784	259795	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	313678330
118	NC_014760	TTCTGA	2	12	261268	261279	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	313678331
119	NC_014760	CATTAA	2	12	267848	267859	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	313678337
120	NC_014760	CCTAAT	2	12	269182	269193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313678337
121	NC_014760	TGGCTC	2	12	273640	273651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313678340
122	NC_014760	TAAATT	2	12	276604	276615	50 %	50 %	0 %	0 %	313678341
123	NC_014760	AATGCA	2	12	278306	278317	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	313678342
124	NC_014760	GAAAAA	2	12	278457	278468	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	313678342
125	NC_014760	AATATC	2	12	279585	279596	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	313678342
126	NC_014760	TTAATG	2	12	279777	279788	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	313678342
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130	NC_014760	ACCTTT	2	12	283364	283375	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	313678345
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139	NC_014760	AAAGAA	2	12	305121	305132	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	313678365
140	NC_014760	GAAAAA	2	12	306433	306444	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	313678367
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150	NC_014760	CATAGT	2	12	336772	336783	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	313678399
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229	NC_014760	GAAAAT	2	12	498910	498921	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	313678524
230	NC_014760	AAATCA	2	12	499170	499181	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	313678524
231	NC_014760	ACCAAA	2	12	503844	503855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313678527
232	NC_014760	ATGAAT	2	12	504108	504119	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	313678528
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