MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Marivirga tractuosa DSM 4126 chromosome

Total Repeats: 1975

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014759	GAAGCA	2	12	5906	5917	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	313674135
2	NC_014759	TAAATT	2	12	10872	10883	50 %	50 %	0 %	0 %	313674141
3	NC_014759	TTATTT	2	12	11059	11070	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	313674141
4	NC_014759	TACGAA	2	12	15389	15400	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	313674144
5	NC_014759	CTAAAT	2	12	16315	16326	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	313674144
6	NC_014759	TGCTTC	2	12	19270	19281	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	313674145
7	NC_014759	CTTTTT	2	12	19557	19568	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	313674145
8	NC_014759	CTTTCT	2	12	19592	19603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313674145
9	NC_014759	ATATTT	2	12	22462	22473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014759	TATGAA	2	12	24279	24290	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	313674150
11	NC_014759	TGATTT	2	12	25554	25565	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014759	TAATCA	2	12	27013	27024	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	313674153
13	NC_014759	AAAAAT	2	12	27436	27447	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014759	CAGAAG	2	12	31291	31302	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	313674158
15	NC_014759	CCAATC	2	12	32690	32701	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	313674158
16	NC_014759	TGATGC	2	12	33435	33446	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	313674159
17	NC_014759	ATGCCA	2	12	34368	34379	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	313674160
18	NC_014759	TCCTGC	2	12	34697	34708	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	313674160
19	NC_014759	TTAATT	2	12	37915	37926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313674160
20	NC_014759	AAATTT	2	12	39195	39206	50 %	50 %	0 %	0 %	313674161
21	NC_014759	TTTTGT	2	12	40002	40013	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	313674161
22	NC_014759	AACAAT	2	12	43391	43402	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	313674165
23	NC_014759	GCAAAA	2	12	44333	44344	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	313674165
24	NC_014759	CTATTC	2	12	45533	45544	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	313674166
25	NC_014759	AAAAGG	2	12	47537	47548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313674169
26	NC_014759	GAATGG	2	12	51730	51741	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	313674174
27	NC_014759	TAAAGA	2	12	54668	54679	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	313674176
28	NC_014759	TATCAA	2	12	60293	60304	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	313674181
29	NC_014759	TGAAAA	2	12	61326	61337	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	313674182
30	NC_014759	ATTCAA	2	12	66409	66420	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	313674184
31	NC_014759	TACTTT	2	12	68959	68970	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	313674186
32	NC_014759	GATTAA	2	12	69891	69902	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	313674188
33	NC_014759	CTTTTC	2	12	70737	70748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313674189
34	NC_014759	TGGTTA	2	12	71153	71164	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014759	CCATTG	2	12	79905	79916	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	313674195
36	NC_014759	TCTCAA	2	12	82263	82274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313674195
37	NC_014759	TATTTC	2	12	85450	85461	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014759	AAAAAG	2	12	87005	87016	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	313674197
39	NC_014759	TTCTTT	2	12	92851	92862	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	313674201
40	NC_014759	TAGTAT	2	12	95154	95165	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	313674202
41	NC_014759	TTTTTG	2	12	101821	101832	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	313674209
42	NC_014759	TATGTT	2	12	102276	102287	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	313674210
43	NC_014759	TTTTTC	2	12	104457	104468	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	313674212
44	NC_014759	TACACT	2	12	106493	106504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014759	AAGAAA	2	12	108190	108201	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	313674214
46	NC_014759	ATTGGA	2	12	109887	109898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313674215
47	NC_014759	TCTATG	2	12	111233	111244	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	313674216
48	NC_014759	TTCTAC	2	12	113774	113785	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014759	ATTAAA	2	12	114147	114158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014759	ATGCTG	2	12	115834	115845	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	313674220
51	NC_014759	AAGATT	2	12	116424	116435	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014759	TTGCAT	2	12	119032	119043	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	313674224
53	NC_014759	AGAGGA	2	12	119706	119717	50 %	0 %	50 %	0 %	313674224
54	NC_014759	GAGCCA	2	12	119824	119835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313674224
55	NC_014759	ATGCAT	2	12	128655	128666	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014759	TTTTCA	2	12	130346	130357	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	313674233
57	NC_014759	ATTGTC	2	12	131122	131133	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	313674233
58	NC_014759	TTTTGA	2	12	135961	135972	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	313674239
59	NC_014759	AATGAG	2	12	144696	144707	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	313674246
60	NC_014759	TTGTAT	2	12	144898	144909	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	313674246
61	NC_014759	TTTCAA	2	12	147268	147279	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	313674249
62	NC_014759	AGCTTG	2	12	150035	150046	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	313674250
63	NC_014759	ATTTTC	2	12	150590	150601	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	313674250
64	NC_014759	ATAGTA	2	12	155259	155270	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	313674254
65	NC_014759	GGTTGT	2	12	155850	155861	0 %	50 %	50 %	0 %	313674255
66	NC_014759	TAATTC	2	12	156903	156914	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	313674255
67	NC_014759	TAGAGG	2	12	158689	158700	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	313674256
68	NC_014759	GGTTTC	2	12	159648	159659	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	313674256
69	NC_014759	AGCTGA	2	12	159863	159874	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	313674256
70	NC_014759	CTATGG	2	12	166004	166015	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	313674258
71	NC_014759	CGATGG	2	12	166280	166291	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	313674258
72	NC_014759	TCTGGT	2	12	171675	171686	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	313674261
73	NC_014759	CTGATA	2	12	172369	172380	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	313674262
74	NC_014759	ATTTCT	2	12	173965	173976	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	313674264
75	NC_014759	GTTTTT	2	12	174479	174490	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	313674264
76	NC_014759	ACTGAT	2	12	174764	174775	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	313674264
77	NC_014759	TGACAA	2	12	176139	176150	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	313674265
78	NC_014759	AGGTTT	2	12	176784	176795	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	313674265
79	NC_014759	TTGATT	2	12	183511	183522	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	313674272
80	NC_014759	TTAAAT	2	12	183539	183550	50 %	50 %	0 %	0 %	313674272
81	NC_014759	TTTTAT	2	12	186565	186576	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	313674273
82	NC_014759	CCTTGT	2	12	189151	189162	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	313674274
83	NC_014759	TTTCTT	2	12	191232	191243	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	313674275
84	NC_014759	AAGACT	2	12	191297	191308	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	313674275
85	NC_014759	TTAGTG	2	12	194812	194823	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	313674276
86	NC_014759	TTTATC	2	12	197670	197681	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	313674277
87	NC_014759	GTTTTG	2	12	203496	203507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313674280
88	NC_014759	AAATAT	2	12	206743	206754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313674283
89	NC_014759	TATTTT	2	12	208366	208377	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	313674286
90	NC_014759	TGGAAA	2	12	210584	210595	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	313674288
91	NC_014759	TCATGA	2	12	215548	215559	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	313674294
92	NC_014759	AAATCC	2	12	216013	216024	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	313674294
93	NC_014759	TGAGCT	2	12	218271	218282	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	313674295
94	NC_014759	TGATAA	2	12	218415	218426	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	313674295
95	NC_014759	TTTTAT	2	12	222131	222142	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	313674297
96	NC_014759	TTGAGT	2	12	223787	223798	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	313674297
97	NC_014759	AGATTT	2	12	226485	226496	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	313674300
98	NC_014759	AAATTA	2	12	227397	227408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014759	CAATTC	2	12	228267	228278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313674301
100	NC_014759	ATCTTC	2	12	228708	228719	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	313674302
101	NC_014759	TAAAAC	2	12	228938	228949	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	313674302
102	NC_014759	CATAAG	2	12	229736	229747	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	313674302
103	NC_014759	TAATGT	2	12	233472	233483	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	313674304
104	NC_014759	GCGGAG	2	12	238211	238222	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	313674306
105	NC_014759	ATTTAT	2	12	248635	248646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014759	ATGTCA	2	12	252121	252132	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_014759	TCATTT	2	12	252984	252995	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	313674315
108	NC_014759	ACTATA	2	12	254387	254398	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	313674315
109	NC_014759	GATTAA	2	12	255198	255209	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	313674316
110	NC_014759	CAAATA	2	12	255380	255391	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	313674316
111	NC_014759	ATAGCA	2	12	255504	255515	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	313674317
112	NC_014759	TTAATT	2	12	257144	257155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014759	TAATTG	2	12	259486	259497	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	313674319
114	NC_014759	TTTCAT	2	12	269719	269730	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	313674324
115	NC_014759	TTCATC	2	12	271371	271382	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	313674326
116	NC_014759	AGTATT	2	12	276561	276572	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	313674329
117	NC_014759	GGAAAA	2	12	276981	276992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313674329
118	NC_014759	AATTAA	2	12	277727	277738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014759	AAAAGA	2	12	278261	278272	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	313674333
120	NC_014759	TATTTA	2	12	280495	280506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313674335
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224	NC_014759	ATGAAA	2	12	485575	485586	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	313674497
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227	NC_014759	TGTCCG	2	12	486172	486183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
228	NC_014759	TGCTGG	2	12	486576	486587	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	313674498
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230	NC_014759	TTTTCT	2	12	491908	491919	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	313674500
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234	NC_014759	AAATTG	2	12	507727	507738	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	313674510
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236	NC_014759	GAGGAA	2	12	508820	508831	50 %	0 %	50 %	0 %	313674511
237	NC_014759	AGGAAA	2	12	520820	520831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313674518
238	NC_014759	ATTGAA	2	12	523443	523454	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	313674518
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241	NC_014759	ATCCCA	2	12	533331	533342	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	313674526
242	NC_014759	TTTAAA	2	12	533704	533715	50 %	50 %	0 %	0 %	313674526
243	NC_014759	GTTAAA	2	12	539388	539399	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	313674528
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339	NC_014759	ATCTTT	2	12	756610	756621	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	313674704
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341	NC_014759	TTTAAT	2	12	759846	759857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313674708
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343	NC_014759	CCATAG	2	12	769960	769971	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	313674717
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346	NC_014759	TCTTCC	2	12	782292	782303	0 %	50 %	0 %	50 %	313674726
347	NC_014759	CTGTTC	2	12	783400	783411	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	313674726
348	NC_014759	TCTTTT	2	12	787295	787306	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	313674729
349	NC_014759	GCAGAA	2	12	789241	789252	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	313674732
350	NC_014759	AAATGA	2	12	800302	800313	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	313674744
351	NC_014759	TTTCAG	2	12	801283	801294	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	313674745
352	NC_014759	CACAGA	2	12	805687	805698	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	313674751
353	NC_014759	CATTTT	2	12	809251	809262	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	313674753
354	NC_014759	CAAAAT	2	12	810160	810171	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	313674754
355	NC_014759	TTGATT	2	12	810801	810812	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	313674754
356	NC_014759	CTTTTC	2	12	812555	812566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313674756
357	NC_014759	CTGAAA	2	12	812641	812652	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	313674756
358	NC_014759	TGCCTA	2	12	818463	818474	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	313674761
359	NC_014759	CATGAT	2	12	823857	823868	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	313674767
360	NC_014759	GAATCT	2	12	828650	828661	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	313674770
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459	NC_014759	AACTTT	2	12	1059165	1059176	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	313674969
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462	NC_014759	ACTGAA	2	12	1066477	1066488	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	313674975
463	NC_014759	TCTGAT	2	12	1067888	1067899	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	313674976
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