MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Marivirga tractuosa DSM 4126 chromosome

Total Repeats: 238

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014759	ATATTT	2	12	22462	22473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014759	TGATTT	2	12	25554	25565	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014759	AAAAAT	2	12	27436	27447	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014759	TGGTTA	2	12	71153	71164	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014759	TATTTC	2	12	85450	85461	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_014759	TACACT	2	12	106493	106504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014759	TTCTAC	2	12	113774	113785	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014759	ATTAAA	2	12	114147	114158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014759	AAGATT	2	12	116424	116435	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014759	ATGCAT	2	12	128655	128666	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014759	AAATTA	2	12	227397	227408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014759	ATTTAT	2	12	248635	248646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014759	ATGTCA	2	12	252121	252132	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014759	TTAATT	2	12	257144	257155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014759	AATTAA	2	12	277727	277738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014759	TTTAAA	2	12	285654	285665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014759	CTTTTA	2	12	287719	287730	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014759	TGTAAT	2	12	287774	287785	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014759	AAAATT	2	12	316503	316514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014759	ATATTT	2	12	318450	318461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014759	AAAGGA	2	12	343164	343175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014759	AAAATG	2	12	353292	353303	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014759	CTATTT	2	12	363676	363687	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_014759	TGAAAT	2	12	417478	417489	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014759	ATCCAA	2	12	436157	436168	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014759	ATAATC	2	12	438407	438418	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_014759	ATTAGG	2	12	470526	470537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014759	TCTTTT	2	12	471607	471618	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_014759	AAAGGA	2	12	484254	484265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014759	TATAAT	2	12	485866	485877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014759	TGTCCG	2	12	486172	486183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014759	GACGAA	2	12	547378	547389	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_014759	CTAATA	2	12	557683	557694	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014759	AAACTA	2	12	597875	597886	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014759	TTTATT	2	12	624277	624288	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014759	TTTTAG	2	12	627635	627646	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014759	TAAACA	2	12	718005	718016	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014759	AAATAA	2	12	718733	718744	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014759	ACTTCA	2	12	733213	733224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014759	TAAATC	2	12	754822	754833	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_014759	GTTTTT	2	12	831729	831740	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014759	TAAAAT	2	12	928961	928972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014759	AAAATA	2	12	943095	943106	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014759	GAAAAA	2	12	947799	947810	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014759	TTTTTA	2	12	952358	952369	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014759	TTATAA	2	12	959689	959700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014759	AAAATT	2	12	970558	970569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014759	GAATAT	2	12	981485	981496	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014759	CTAAAA	2	12	983102	983113	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014759	TACTTC	2	12	1011198	1011209	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014759	GAAATT	2	12	1038988	1038999	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014759	CAAGTT	2	12	1043187	1043198	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_014759	AGGCCT	2	12	1056750	1056761	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014759	TAAAAA	2	12	1098460	1098471	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014759	TTAAAC	2	12	1101282	1101293	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014759	AATATA	2	12	1104148	1104159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014759	AAATTA	2	12	1118682	1118693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014759	TATAAA	2	12	1138965	1138976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014759	AAAAGC	2	12	1171770	1171781	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_014759	AAATTA	2	12	1181954	1181965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014759	ACCTGG	2	12	1182122	1182133	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014759	AAAAAT	2	12	1183570	1183581	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014759	AGATAG	2	12	1250282	1250293	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014759	GCTAGC	2	12	1263938	1263949	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014759	ATTTTC	2	12	1293214	1293225	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_014759	AGCTGA	2	12	1311645	1311656	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_014759	AAAATC	2	12	1344438	1344449	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_014759	GAAAAT	2	12	1368208	1368219	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014759	TAAAAA	2	12	1376032	1376043	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014759	TAGTTT	2	12	1389669	1389680	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014759	GATTTA	2	12	1418330	1418341	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014759	TTATCT	2	12	1421099	1421110	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_014759	ATTTAA	2	12	1457252	1457263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014759	AAACTT	2	12	1477372	1477383	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_014759	CTAATA	2	12	1478249	1478260	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_014759	TTTGCT	2	12	1481613	1481624	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_014759	GCTCTT	2	12	1481625	1481636	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014759	CTAAAC	2	12	1499875	1499886	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014759	TTCGTC	2	12	1508162	1508173	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014759	GTTTTA	2	12	1508265	1508276	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014759	TCCCAA	2	12	1510640	1510651	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_014759	ATGAAA	2	12	1531021	1531032	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014759	GTTGTA	2	12	1535035	1535046	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014759	AAAATA	2	12	1543487	1543498	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014759	AATATA	2	12	1559134	1559145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014759	ACAATT	2	12	1561177	1561188	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_014759	ACAAAC	2	12	1575722	1575733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014759	AAATAG	2	12	1575785	1575796	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014759	TTCCTT	2	12	1591598	1591609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014759	AAAAGA	2	12	1591757	1591768	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014759	ATTTCA	2	12	1610318	1610329	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_014759	TTCGAA	2	12	1610869	1610880	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_014759	TTAAAA	2	12	1630768	1630779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014759	ACAAAG	2	12	1638431	1638442	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_014759	TAATTA	2	12	1656385	1656396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014759	TCAAAT	2	12	1678161	1678172	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_014759	AATTTA	2	12	1684205	1684216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014759	ATGAAA	2	12	1688712	1688723	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014759	TTCTAT	2	12	1691487	1691498	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_014759	TTTTTC	2	12	1706199	1706210	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_014759	TTTCAT	2	12	1707861	1707872	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_014759	CATTTA	2	12	1794950	1794961	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_014759	TGGGCT	2	12	1800561	1800572	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_014759	TAAAAT	2	12	1809372	1809383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014759	TAAACC	2	12	1821521	1821532	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014759	TTTCAA	2	12	1874106	1874117	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_014759	GAAAAA	2	12	1874417	1874428	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014759	ATTAAA	2	12	1878263	1878274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014759	TAAAAT	2	12	1924307	1924318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014759	CCCATT	2	12	1929297	1929308	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_014759	ATAAAA	2	12	1930389	1930400	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014759	TTGTAT	2	12	1934818	1934829	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014759	AAAAAT	2	12	1937495	1937506	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014759	ATTTAC	2	12	1953089	1953100	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_014759	CAAAAA	2	12	1984427	1984438	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_014759	AAAAAG	2	12	1988861	1988872	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014759	GAATGA	2	12	1990167	1990178	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014759	AGTAAA	2	12	1991909	1991920	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014759	TTAATT	2	12	1993247	1993258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014759	CAATGT	2	12	2008170	2008181	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_014759	TCGCTT	2	12	2009618	2009629	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014759	GTTCAT	2	12	2009959	2009970	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_014759	TTGCCG	2	12	2011144	2011155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014759	ATTTAT	2	12	2028543	2028554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014759	AAGGAA	2	12	2081735	2081746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014759	AACTTA	2	12	2100926	2100937	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_014759	ATAAAA	2	12	2138308	2138319	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.