MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Marivirga tractuosa DSM 4126 chromosome

Total Repeats: 1737

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014759	GAAGCA	2	12	5906	5917	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	313674135
2	NC_014759	TAAATT	2	12	10872	10883	50 %	50 %	0 %	0 %	313674141
3	NC_014759	TTATTT	2	12	11059	11070	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	313674141
4	NC_014759	TACGAA	2	12	15389	15400	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	313674144
5	NC_014759	CTAAAT	2	12	16315	16326	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	313674144
6	NC_014759	TGCTTC	2	12	19270	19281	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	313674145
7	NC_014759	CTTTTT	2	12	19557	19568	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	313674145
8	NC_014759	CTTTCT	2	12	19592	19603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313674145
9	NC_014759	TATGAA	2	12	24279	24290	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	313674150
10	NC_014759	TAATCA	2	12	27013	27024	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	313674153
11	NC_014759	CAGAAG	2	12	31291	31302	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	313674158
12	NC_014759	CCAATC	2	12	32690	32701	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	313674158
13	NC_014759	TGATGC	2	12	33435	33446	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	313674159
14	NC_014759	ATGCCA	2	12	34368	34379	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	313674160
15	NC_014759	TCCTGC	2	12	34697	34708	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	313674160
16	NC_014759	TTAATT	2	12	37915	37926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313674160
17	NC_014759	AAATTT	2	12	39195	39206	50 %	50 %	0 %	0 %	313674161
18	NC_014759	TTTTGT	2	12	40002	40013	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	313674161
19	NC_014759	AACAAT	2	12	43391	43402	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	313674165
20	NC_014759	GCAAAA	2	12	44333	44344	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	313674165
21	NC_014759	CTATTC	2	12	45533	45544	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	313674166
22	NC_014759	AAAAGG	2	12	47537	47548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313674169
23	NC_014759	GAATGG	2	12	51730	51741	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	313674174
24	NC_014759	TAAAGA	2	12	54668	54679	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	313674176
25	NC_014759	TATCAA	2	12	60293	60304	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	313674181
26	NC_014759	TGAAAA	2	12	61326	61337	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	313674182
27	NC_014759	ATTCAA	2	12	66409	66420	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	313674184
28	NC_014759	TACTTT	2	12	68959	68970	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	313674186
29	NC_014759	GATTAA	2	12	69891	69902	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	313674188
30	NC_014759	CTTTTC	2	12	70737	70748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313674189
31	NC_014759	CCATTG	2	12	79905	79916	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	313674195
32	NC_014759	TCTCAA	2	12	82263	82274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313674195
33	NC_014759	AAAAAG	2	12	87005	87016	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	313674197
34	NC_014759	TTCTTT	2	12	92851	92862	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	313674201
35	NC_014759	TAGTAT	2	12	95154	95165	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	313674202
36	NC_014759	TTTTTG	2	12	101821	101832	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	313674209
37	NC_014759	TATGTT	2	12	102276	102287	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	313674210
38	NC_014759	TTTTTC	2	12	104457	104468	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	313674212
39	NC_014759	AAGAAA	2	12	108190	108201	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	313674214
40	NC_014759	ATTGGA	2	12	109887	109898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313674215
41	NC_014759	TCTATG	2	12	111233	111244	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	313674216
42	NC_014759	ATGCTG	2	12	115834	115845	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	313674220
43	NC_014759	TTGCAT	2	12	119032	119043	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	313674224
44	NC_014759	AGAGGA	2	12	119706	119717	50 %	0 %	50 %	0 %	313674224
45	NC_014759	GAGCCA	2	12	119824	119835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313674224
46	NC_014759	TTTTCA	2	12	130346	130357	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	313674233
47	NC_014759	ATTGTC	2	12	131122	131133	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	313674233
48	NC_014759	TTTTGA	2	12	135961	135972	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	313674239
49	NC_014759	AATGAG	2	12	144696	144707	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	313674246
50	NC_014759	TTGTAT	2	12	144898	144909	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	313674246
51	NC_014759	TTTCAA	2	12	147268	147279	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	313674249
52	NC_014759	AGCTTG	2	12	150035	150046	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	313674250
53	NC_014759	ATTTTC	2	12	150590	150601	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	313674250
54	NC_014759	ATAGTA	2	12	155259	155270	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	313674254
55	NC_014759	GGTTGT	2	12	155850	155861	0 %	50 %	50 %	0 %	313674255
56	NC_014759	TAATTC	2	12	156903	156914	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	313674255
57	NC_014759	TAGAGG	2	12	158689	158700	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	313674256
58	NC_014759	GGTTTC	2	12	159648	159659	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	313674256
59	NC_014759	AGCTGA	2	12	159863	159874	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	313674256
60	NC_014759	CTATGG	2	12	166004	166015	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	313674258
61	NC_014759	CGATGG	2	12	166280	166291	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	313674258
62	NC_014759	TCTGGT	2	12	171675	171686	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	313674261
63	NC_014759	CTGATA	2	12	172369	172380	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	313674262
64	NC_014759	ATTTCT	2	12	173965	173976	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	313674264
65	NC_014759	GTTTTT	2	12	174479	174490	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	313674264
66	NC_014759	ACTGAT	2	12	174764	174775	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	313674264
67	NC_014759	TGACAA	2	12	176139	176150	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	313674265
68	NC_014759	AGGTTT	2	12	176784	176795	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	313674265
69	NC_014759	TTGATT	2	12	183511	183522	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	313674272
70	NC_014759	TTAAAT	2	12	183539	183550	50 %	50 %	0 %	0 %	313674272
71	NC_014759	TTTTAT	2	12	186565	186576	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	313674273
72	NC_014759	CCTTGT	2	12	189151	189162	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	313674274
73	NC_014759	TTTCTT	2	12	191232	191243	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	313674275
74	NC_014759	AAGACT	2	12	191297	191308	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	313674275
75	NC_014759	TTAGTG	2	12	194812	194823	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	313674276
76	NC_014759	TTTATC	2	12	197670	197681	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	313674277
77	NC_014759	GTTTTG	2	12	203496	203507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313674280
78	NC_014759	AAATAT	2	12	206743	206754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313674283
79	NC_014759	TATTTT	2	12	208366	208377	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	313674286
80	NC_014759	TGGAAA	2	12	210584	210595	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	313674288
81	NC_014759	TCATGA	2	12	215548	215559	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	313674294
82	NC_014759	AAATCC	2	12	216013	216024	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	313674294
83	NC_014759	TGAGCT	2	12	218271	218282	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	313674295
84	NC_014759	TGATAA	2	12	218415	218426	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	313674295
85	NC_014759	TTTTAT	2	12	222131	222142	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	313674297
86	NC_014759	TTGAGT	2	12	223787	223798	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	313674297
87	NC_014759	AGATTT	2	12	226485	226496	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	313674300
88	NC_014759	CAATTC	2	12	228267	228278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313674301
89	NC_014759	ATCTTC	2	12	228708	228719	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	313674302
90	NC_014759	TAAAAC	2	12	228938	228949	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	313674302
91	NC_014759	CATAAG	2	12	229736	229747	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	313674302
92	NC_014759	TAATGT	2	12	233472	233483	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	313674304
93	NC_014759	GCGGAG	2	12	238211	238222	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	313674306
94	NC_014759	TCATTT	2	12	252984	252995	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	313674315
95	NC_014759	ACTATA	2	12	254387	254398	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	313674315
96	NC_014759	GATTAA	2	12	255198	255209	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	313674316
97	NC_014759	CAAATA	2	12	255380	255391	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	313674316
98	NC_014759	ATAGCA	2	12	255504	255515	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	313674317
99	NC_014759	TAATTG	2	12	259486	259497	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	313674319
100	NC_014759	TTTCAT	2	12	269719	269730	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	313674324
101	NC_014759	TTCATC	2	12	271371	271382	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	313674326
102	NC_014759	AGTATT	2	12	276561	276572	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	313674329
103	NC_014759	GGAAAA	2	12	276981	276992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313674329
104	NC_014759	AAAAGA	2	12	278261	278272	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	313674333
105	NC_014759	TATTTA	2	12	280495	280506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313674335
106	NC_014759	ATGAAG	2	12	280723	280734	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	313674335
107	NC_014759	AAAATG	2	12	282082	282093	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	313674336
108	NC_014759	TGATAT	2	12	283962	283973	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	313674338
109	NC_014759	AAAAGG	2	12	293850	293861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313674346
110	NC_014759	ATTACA	2	12	294398	294409	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	313674347
111	NC_014759	TATTTC	2	12	299297	299308	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	313674351
112	NC_014759	GAGAAA	2	12	299774	299785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313674351
113	NC_014759	TTATAT	2	12	303891	303902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313674354
114	NC_014759	CATATC	2	12	305599	305610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313674355
115	NC_014759	ATCTAA	2	12	308461	308472	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	313674358
116	NC_014759	TTCTTT	2	12	308771	308782	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	313674358
117	NC_014759	CAAAAA	2	12	317564	317575	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	313674364
118	NC_014759	TTGGTT	2	12	320031	320042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313674367
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233	NC_014759	ACATGC	2	12	583631	583642	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	313674568
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340	NC_014759	GATTTA	2	12	892716	892727	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	313674830
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344	NC_014759	TCATTT	2	12	906090	906101	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	313674845
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346	NC_014759	GGTAAT	2	12	911283	911294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313674846
347	NC_014759	GTAAGT	2	12	911643	911654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313674847
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457	NC_014759	CTAAAA	2	12	1181584	1181595	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	313675062
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459	NC_014759	ATTTCT	2	12	1187838	1187849	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	313675067
460	NC_014759	TTTTCA	2	12	1191375	1191386	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	313675071
461	NC_014759	TTTCTG	2	12	1196691	1196702	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	313675076
462	NC_014759	CCTTTT	2	12	1197365	1197376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313675076
463	NC_014759	CTTCTG	2	12	1199364	1199375	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	313675076
464	NC_014759	AATCGG	2	12	1199637	1199648	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	313675076
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499	NC_014759	GCTTTT	2	12	1278922	1278933	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	313675129
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