MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Calditerrivibrio nitroreducens DSM 19672 chromosome

Total Repeats: 1648

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014758	AAATG	2	10	1814	1823	60 %	20 %	20 %	0 %	313671971
2	NC_014758	TATCC	2	10	2404	2413	20 %	40 %	0 %	40 %	313671971
3	NC_014758	TCAAT	2	10	2769	2778	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_014758	CAGAT	2	10	3722	3731	40 %	20 %	20 %	20 %	313671972
5	NC_014758	TAAAT	2	10	3774	3783	60 %	40 %	0 %	0 %	313671972
6	NC_014758	AGGGA	2	10	5955	5964	40 %	0 %	60 %	0 %	313671974
7	NC_014758	CTTAC	2	10	8103	8112	20 %	40 %	0 %	40 %	313671975
8	NC_014758	GATTT	2	10	14238	14247	20 %	60 %	20 %	0 %	313671979
9	NC_014758	AGAAA	2	10	17290	17299	80 %	0 %	20 %	0 %	313671983
10	NC_014758	AGTTG	2	10	18767	18776	20 %	40 %	40 %	0 %	313671986
11	NC_014758	GCAGA	2	10	20207	20216	40 %	0 %	40 %	20 %	313671989
12	NC_014758	TGTGG	2	10	22200	22209	0 %	40 %	60 %	0 %	313671991
13	NC_014758	TAAAT	2	10	23798	23807	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014758	CCATG	2	10	24006	24015	20 %	20 %	20 %	40 %	313671993
15	NC_014758	AGGGG	2	10	24203	24212	20 %	0 %	80 %	0 %	313671994
16	NC_014758	ACATA	2	10	25459	25468	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_014758	TATTT	2	10	27736	27745	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014758	GATGG	2	10	29637	29646	20 %	20 %	60 %	0 %	313672000
19	NC_014758	CATTG	2	10	33246	33255	20 %	40 %	20 %	20 %	313672003
20	NC_014758	TAATT	2	10	33722	33731	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014758	GGTCA	2	10	34079	34088	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014758	GAAAT	2	10	36050	36059	60 %	20 %	20 %	0 %	313672005
23	NC_014758	AAATA	2	10	37511	37520	80 %	20 %	0 %	0 %	313672006
24	NC_014758	TAAGA	2	10	37823	37832	60 %	20 %	20 %	0 %	313672006
25	NC_014758	GATAG	2	10	38676	38685	40 %	20 %	40 %	0 %	313672007
26	NC_014758	TTTCC	2	10	42227	42236	0 %	60 %	0 %	40 %	313672009
27	NC_014758	GATAA	2	10	48140	48149	60 %	20 %	20 %	0 %	313672018
28	NC_014758	ATGGT	2	10	48726	48735	20 %	40 %	40 %	0 %	313672018
29	NC_014758	ACCTC	2	10	49035	49044	20 %	20 %	0 %	60 %	313672019
30	NC_014758	TTATA	2	10	50069	50078	40 %	60 %	0 %	0 %	313672020
31	NC_014758	AAGGG	2	10	50234	50243	40 %	0 %	60 %	0 %	313672020
32	NC_014758	CCCAT	2	10	56031	56040	20 %	20 %	0 %	60 %	313672025
33	NC_014758	CGGAT	2	10	56177	56186	20 %	20 %	40 %	20 %	313672025
34	NC_014758	TGGAG	2	10	56407	56416	20 %	20 %	60 %	0 %	313672025
35	NC_014758	ATTGA	2	10	57193	57202	40 %	40 %	20 %	0 %	313672026
36	NC_014758	ATTAT	2	10	58073	58082	40 %	60 %	0 %	0 %	313672026
37	NC_014758	TAAAT	2	10	58152	58161	60 %	40 %	0 %	0 %	313672026
38	NC_014758	ACCAT	2	10	61326	61335	40 %	20 %	0 %	40 %	313672030
39	NC_014758	ATTTT	2	10	61782	61791	20 %	80 %	0 %	0 %	313672031
40	NC_014758	TATAT	2	10	63397	63406	40 %	60 %	0 %	0 %	313672032
41	NC_014758	AGCAG	2	10	65362	65371	40 %	0 %	40 %	20 %	313672033
42	NC_014758	TATAA	2	10	65497	65506	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014758	ATGGG	2	10	66741	66750	20 %	20 %	60 %	0 %	313672036
44	NC_014758	ATTCA	2	10	66946	66955	40 %	40 %	0 %	20 %	313672037
45	NC_014758	TCTTA	2	10	67185	67194	20 %	60 %	0 %	20 %	313672038
46	NC_014758	CAGGT	2	10	68923	68932	20 %	20 %	40 %	20 %	313672040
47	NC_014758	GATCT	2	10	70209	70218	20 %	40 %	20 %	20 %	313672041
48	NC_014758	CTATG	2	10	71342	71351	20 %	40 %	20 %	20 %	313672042
49	NC_014758	TCTCT	2	10	73613	73622	0 %	60 %	0 %	40 %	313672044
50	NC_014758	CTTCA	2	10	74054	74063	20 %	40 %	0 %	40 %	313672045
51	NC_014758	TATCT	2	10	75273	75282	20 %	60 %	0 %	20 %	313672046
52	NC_014758	ACATA	2	10	75645	75654	60 %	20 %	0 %	20 %	313672046
53	NC_014758	TCATA	2	10	76815	76824	40 %	40 %	0 %	20 %	313672048
54	NC_014758	ATTTT	2	10	76970	76979	20 %	80 %	0 %	0 %	313672048
55	NC_014758	TATAT	2	10	79455	79464	40 %	60 %	0 %	0 %	313672051
56	NC_014758	GATCA	2	10	82170	82179	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_014758	GCACA	2	10	82311	82320	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_014758	TAAAA	2	10	82528	82537	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014758	AATAA	2	10	86960	86969	80 %	20 %	0 %	0 %	313672058
60	NC_014758	ATAGA	2	10	87014	87023	60 %	20 %	20 %	0 %	313672059
61	NC_014758	AAGAT	2	10	87748	87757	60 %	20 %	20 %	0 %	313672059
62	NC_014758	CAGGA	2	10	87777	87786	40 %	0 %	40 %	20 %	313672059
63	NC_014758	AAAAT	2	10	90233	90242	80 %	20 %	0 %	0 %	313672062
64	NC_014758	TGGAG	2	10	92590	92599	20 %	20 %	60 %	0 %	313672063
65	NC_014758	AAAAG	2	10	95672	95681	80 %	0 %	20 %	0 %	313672066
66	NC_014758	TTAGG	2	10	96981	96990	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014758	TATGG	2	10	101750	101759	20 %	40 %	40 %	0 %	313672072
68	NC_014758	TTTCT	2	10	102459	102468	0 %	80 %	0 %	20 %	313672073
69	NC_014758	AAACA	2	10	108471	108480	80 %	0 %	0 %	20 %	313672078
70	NC_014758	AGATA	2	10	108879	108888	60 %	20 %	20 %	0 %	313672078
71	NC_014758	ACCCA	2	10	110496	110505	40 %	0 %	0 %	60 %	313672079
72	NC_014758	TGAAA	2	10	110583	110592	60 %	20 %	20 %	0 %	313672079
73	NC_014758	TAAAG	2	10	111011	111020	60 %	20 %	20 %	0 %	313672081
74	NC_014758	CCTTC	2	10	111536	111545	0 %	40 %	0 %	60 %	313672081
75	NC_014758	GCAGG	2	10	113787	113796	20 %	0 %	60 %	20 %	313672084
76	NC_014758	TGATA	2	10	115966	115975	40 %	40 %	20 %	0 %	313672088
77	NC_014758	GGGAT	2	10	116738	116747	20 %	20 %	60 %	0 %	313672089
78	NC_014758	AAAAG	2	10	116750	116759	80 %	0 %	20 %	0 %	313672089
79	NC_014758	GATAC	2	10	119789	119798	40 %	20 %	20 %	20 %	313672091
80	NC_014758	GCCCC	2	10	120797	120806	0 %	0 %	20 %	80 %	313672092
81	NC_014758	TTTTA	2	10	121173	121182	20 %	80 %	0 %	0 %	313672092
82	NC_014758	ACCAC	2	10	126282	126291	40 %	0 %	0 %	60 %	313672097
83	NC_014758	TTTAA	2	10	128218	128227	40 %	60 %	0 %	0 %	313672099
84	NC_014758	TCTAT	2	10	128431	128440	20 %	60 %	0 %	20 %	313672099
85	NC_014758	CACTT	2	10	131602	131611	20 %	40 %	0 %	40 %	313672101
86	NC_014758	CTTCT	2	10	134461	134470	0 %	60 %	0 %	40 %	313672105
87	NC_014758	GAGTT	2	10	135379	135388	20 %	40 %	40 %	0 %	313672106
88	NC_014758	TCTTT	2	10	135921	135930	0 %	80 %	0 %	20 %	313672107
89	NC_014758	TAGCA	2	10	136293	136302	40 %	20 %	20 %	20 %	313672107
90	NC_014758	ATTAC	2	10	136914	136923	40 %	40 %	0 %	20 %	313672108
91	NC_014758	TGTAA	2	10	138410	138419	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014758	ATTAC	2	10	140105	140114	40 %	40 %	0 %	20 %	313672111
93	NC_014758	GATAA	2	10	140743	140752	60 %	20 %	20 %	0 %	313672111
94	NC_014758	TTTAT	2	10	140861	140870	20 %	80 %	0 %	0 %	313672111
95	NC_014758	GGTAT	2	10	141028	141037	20 %	40 %	40 %	0 %	313672111
96	NC_014758	TTATG	2	10	141246	141255	20 %	60 %	20 %	0 %	313672111
97	NC_014758	TCAAC	2	10	144006	144015	40 %	20 %	0 %	40 %	313672113
98	NC_014758	TAATT	2	10	148534	148543	40 %	60 %	0 %	0 %	313672117
99	NC_014758	AAAAC	2	10	149106	149115	80 %	0 %	0 %	20 %	313672117
100	NC_014758	TTGTT	2	10	149302	149311	0 %	80 %	20 %	0 %	313672117
101	NC_014758	TATGG	2	10	150084	150093	20 %	40 %	40 %	0 %	313672118
102	NC_014758	ATTAT	2	10	150156	150165	40 %	60 %	0 %	0 %	313672119
103	NC_014758	ATCTT	2	10	151602	151611	20 %	60 %	0 %	20 %	313672121
104	NC_014758	ATTTA	2	10	152054	152063	40 %	60 %	0 %	0 %	313672121
105	NC_014758	CATTA	2	10	154240	154249	40 %	40 %	0 %	20 %	313672124
106	NC_014758	GTTTT	2	10	155025	155034	0 %	80 %	20 %	0 %	313672125
107	NC_014758	GAATG	2	10	155241	155250	40 %	20 %	40 %	0 %	313672125
108	NC_014758	GAGAA	2	10	155646	155655	60 %	0 %	40 %	0 %	313672125
109	NC_014758	CCTTA	2	10	156450	156459	20 %	40 %	0 %	40 %	313672125
110	NC_014758	TTTAA	2	10	159053	159062	40 %	60 %	0 %	0 %	313672128
111	NC_014758	TCTGC	2	10	159417	159426	0 %	40 %	20 %	40 %	313672128
112	NC_014758	TCGTA	2	10	160912	160921	20 %	40 %	20 %	20 %	313672131
113	NC_014758	TTTTA	2	10	161608	161617	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014758	GAAGG	2	10	164659	164668	40 %	0 %	60 %	0 %	313672133
115	NC_014758	TTCTC	2	10	165505	165514	0 %	60 %	0 %	40 %	313672134
116	NC_014758	AAGAG	2	10	165548	165557	60 %	0 %	40 %	0 %	313672134
117	NC_014758	TATTT	2	10	166742	166751	20 %	80 %	0 %	0 %	313672134
118	NC_014758	ATTTA	2	10	167597	167606	40 %	60 %	0 %	0 %	313672134
119	NC_014758	ATGGT	2	10	167698	167707	20 %	40 %	40 %	0 %	313672134
120	NC_014758	TGGTA	2	10	167882	167891	20 %	40 %	40 %	0 %	313672134
121	NC_014758	GGTAT	2	10	168320	168329	20 %	40 %	40 %	0 %	313672135
122	NC_014758	GATAA	2	10	169815	169824	60 %	20 %	20 %	0 %	313672136
123	NC_014758	GGTAA	2	10	172057	172066	40 %	20 %	40 %	0 %	313672137
124	NC_014758	TTTAG	2	10	173747	173756	20 %	60 %	20 %	0 %	313672138
125	NC_014758	TCTTT	2	10	174107	174116	0 %	80 %	0 %	20 %	313672138
126	NC_014758	TTATT	2	10	174801	174810	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014758	GCAAA	2	10	176148	176157	60 %	0 %	20 %	20 %	313672140
128	NC_014758	AAAAG	2	10	177283	177292	80 %	0 %	20 %	0 %	313672141
129	NC_014758	AGTTA	2	10	177521	177530	40 %	40 %	20 %	0 %	313672141
130	NC_014758	GTAAA	2	10	177983	177992	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014758	TTTTC	2	10	179736	179745	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_014758	ATTAT	2	10	181527	181536	40 %	60 %	0 %	0 %	313672147
133	NC_014758	TAATC	2	10	182344	182353	40 %	40 %	0 %	20 %	313672148
134	NC_014758	TATCA	2	10	182389	182398	40 %	40 %	0 %	20 %	313672148
135	NC_014758	ATATG	2	10	187804	187813	40 %	40 %	20 %	0 %	313672152
136	NC_014758	TATTC	2	10	187861	187870	20 %	60 %	0 %	20 %	313672152
137	NC_014758	TCTTT	2	10	188930	188939	0 %	80 %	0 %	20 %	313672153
138	NC_014758	ATCTA	2	10	189714	189723	40 %	40 %	0 %	20 %	313672154
139	NC_014758	GCTAA	2	10	191879	191888	40 %	20 %	20 %	20 %	313672156
140	NC_014758	TTTTA	2	10	193268	193277	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014758	AATCT	2	10	198549	198558	40 %	40 %	0 %	20 %	313672161
142	NC_014758	TCAAG	2	10	199379	199388	40 %	20 %	20 %	20 %	313672162
143	NC_014758	TTTAC	2	10	200813	200822	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_014758	AGCTT	2	10	201461	201470	20 %	40 %	20 %	20 %	313672164
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146	NC_014758	TTAAA	2	10	203867	203876	60 %	40 %	0 %	0 %	313672166
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150	NC_014758	GTAAA	2	10	208188	208197	60 %	20 %	20 %	0 %	313672168
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154	NC_014758	GTTAT	2	10	211523	211532	20 %	60 %	20 %	0 %	313672173
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157	NC_014758	TTAAT	2	10	214697	214706	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014758	TGATA	2	10	215855	215864	40 %	40 %	20 %	0 %	313672178
159	NC_014758	GATGG	2	10	220146	220155	20 %	20 %	60 %	0 %	313672182
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161	NC_014758	TATTT	2	10	224189	224198	20 %	80 %	0 %	0 %	313672184
162	NC_014758	GCTTT	2	10	225463	225472	0 %	60 %	20 %	20 %	313672187
163	NC_014758	ATTGA	2	10	227668	227677	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_014758	CTGAT	2	10	251227	251236	20 %	40 %	20 %	20 %	313672212
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197	NC_014758	TGGGG	2	10	282415	282424	0 %	20 %	80 %	0 %	313672240
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205	NC_014758	TAAAA	2	10	290269	290278	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
206	NC_014758	TGATG	2	10	291511	291520	20 %	40 %	40 %	0 %	313672248
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214	NC_014758	TTATG	2	10	300369	300378	20 %	60 %	20 %	0 %	313672256
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248	NC_014758	AGGGG	2	10	346012	346021	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
249	NC_014758	TTTTA	2	10	346047	346056	20 %	80 %	0 %	0 %	313672305
250	NC_014758	AGAAA	2	10	352736	352745	80 %	0 %	20 %	0 %	313672310
251	NC_014758	TCTAT	2	10	355421	355430	20 %	60 %	0 %	20 %	313672314
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256	NC_014758	ATATT	2	10	361014	361023	40 %	60 %	0 %	0 %	313672317
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259	NC_014758	GATGT	2	10	367039	367048	20 %	40 %	40 %	0 %	313672323
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261	NC_014758	CAGAG	2	10	367235	367244	40 %	0 %	40 %	20 %	313672323
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263	NC_014758	TTCCA	2	10	368958	368967	20 %	40 %	0 %	40 %	313672325
264	NC_014758	TTTAA	2	10	373902	373911	40 %	60 %	0 %	0 %	313672330
265	NC_014758	CACAT	2	10	374976	374985	40 %	20 %	0 %	40 %	313672331
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