MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Calditerrivibrio nitroreducens DSM 19672 chromosome

Total Repeats: 183

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014758	TCAAT	2	10	2769	2778	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014758	TAAAT	2	10	23798	23807	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014758	ACATA	2	10	25459	25468	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_014758	TATTT	2	10	27736	27745	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014758	TAATT	2	10	33722	33731	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014758	GGTCA	2	10	34079	34088	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_014758	TATAA	2	10	65497	65506	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014758	GATCA	2	10	82170	82179	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_014758	GCACA	2	10	82311	82320	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_014758	TAAAA	2	10	82528	82537	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014758	TTAGG	2	10	96981	96990	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014758	TGTAA	2	10	138410	138419	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014758	TTTTA	2	10	161608	161617	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014758	TTATT	2	10	174801	174810	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014758	GTAAA	2	10	177983	177992	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014758	TTTTC	2	10	179736	179745	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_014758	TTTTA	2	10	193268	193277	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014758	TTTAC	2	10	200813	200822	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_014758	TATAA	2	10	211487	211496	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014758	TTAAT	2	10	214697	214706	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014758	ATTGA	2	10	227668	227677	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014758	TTTGA	2	10	256344	256353	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014758	TAAAA	2	10	290269	290278	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014758	AAGAA	2	10	300521	300530	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014758	AGGGG	2	10	346012	346021	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014758	TTATC	2	10	417111	417120	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014758	TATAA	2	10	424436	424445	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014758	TGAAA	2	10	476273	476282	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014758	TATTG	2	10	476306	476315	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014758	ATTAA	2	10	493533	493542	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014758	ATATA	2	10	493649	493658	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014758	TAAAA	2	10	493665	493674	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014758	GTTTT	2	10	523102	523111	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014758	ATTTT	2	10	523116	523125	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014758	TTAAT	2	10	547445	547454	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014758	ATTAT	2	10	547456	547465	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014758	AAAAT	2	10	560584	560593	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014758	TAATT	2	10	585557	585566	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014758	ATTAT	2	10	585595	585604	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014758	TAAAA	2	10	585623	585632	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014758	ATTAA	2	10	586806	586815	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014758	TTTTA	2	10	621250	621259	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014758	ATATT	2	10	630662	630671	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014758	TATAA	2	10	633355	633364	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014758	AAATT	2	10	642539	642548	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014758	TAAAA	2	10	645427	645436	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014758	ATTTA	2	10	658681	658690	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014758	TTTAC	2	10	669657	669666	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_014758	TATAT	2	10	690000	690009	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014758	TGTTA	2	10	713143	713152	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014758	TTTAT	2	10	720761	720770	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014758	TGTTA	2	10	732212	732221	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014758	AGAAA	2	10	741753	741762	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014758	TGTTT	2	10	755230	755239	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014758	CTTTT	2	10	773815	773824	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_014758	TTTTA	2	10	783182	783191	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014758	ATGAA	2	10	788596	788605	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014758	TAAAA	2	10	791636	791645	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014758	AAAAG	2	10	801962	801971	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014758	TTTTA	2	10	804495	804504	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014758	ATAGT	2	10	811088	811097	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014758	TTTAG	2	10	814723	814732	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014758	AAGAA	2	10	826858	826867	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014758	AAAAC	2	10	827152	827161	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_014758	TTTAG	2	10	843479	843488	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014758	AAAGT	2	10	885303	885312	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014758	AAATA	2	10	906447	906456	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014758	TATTT	2	10	925253	925262	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014758	AATTA	2	10	946747	946756	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014758	ACCCC	2	10	950433	950442	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
71	NC_014758	ATCAA	2	10	1042485	1042494	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_014758	TAAAA	2	10	1046036	1046045	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014758	AGATG	2	10	1052773	1052782	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014758	TATAT	2	10	1052846	1052855	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014758	TTTAA	2	10	1054502	1054511	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014758	GTTAA	2	10	1071958	1071967	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014758	TTAAA	2	10	1074359	1074368	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014758	ATATA	2	10	1074502	1074511	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014758	TATTT	2	10	1074769	1074778	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014758	TAAAA	2	10	1096461	1096470	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014758	CTTTT	2	10	1156627	1156636	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_014758	ATATT	2	10	1174764	1174773	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014758	AAAAT	2	10	1183073	1183082	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014758	TATAA	2	10	1188631	1188640	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014758	ATAAA	2	10	1193266	1193275	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014758	GATTC	2	10	1202655	1202664	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_014758	GTTTC	2	10	1207663	1207672	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_014758	ATAAA	2	10	1208760	1208769	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014758	ACATA	2	10	1209525	1209534	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_014758	TCTTT	2	10	1229217	1229226	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_014758	ATATT	2	10	1235461	1235470	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014758	TTTTA	2	10	1240963	1240972	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014758	CTTTA	2	10	1246384	1246393	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_014758	TTACA	2	10	1251621	1251630	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_014758	TAAAT	2	10	1269782	1269791	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014758	TTTAA	2	10	1300081	1300090	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014758	AAAAT	2	10	1300229	1300238	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014758	CTAAA	2	10	1307590	1307599	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_014758	TATAT	2	10	1307706	1307715	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014758	AATAA	2	10	1315757	1315766	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014758	TATTT	2	10	1320956	1320965	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014758	TTTTA	2	10	1328840	1328849	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014758	TAATA	2	10	1328869	1328878	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014758	AATAC	2	10	1359608	1359617	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_014758	ATTTT	2	10	1364454	1364463	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014758	TATAA	2	10	1396962	1396971	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014758	TATTT	2	10	1397221	1397230	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014758	ATCTT	2	10	1398500	1398509	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_014758	TTCGG	2	10	1399393	1399402	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_014758	CCCCT	2	10	1399422	1399431	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
111	NC_014758	TCGCC	2	10	1399652	1399661	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
112	NC_014758	TCTCT	2	10	1401315	1401324	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_014758	TAACT	2	10	1403421	1403430	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_014758	TCAAA	2	10	1413342	1413351	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_014758	TAAAA	2	10	1420112	1420121	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014758	CCCTC	2	10	1420165	1420174	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
117	NC_014758	ATATA	2	10	1429750	1429759	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014758	GTTAT	2	10	1440172	1440181	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014758	TTAAT	2	10	1450956	1450965	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014758	ATTTT	2	10	1459828	1459837	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014758	TAATA	2	10	1472127	1472136	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014758	TAAAG	2	10	1535387	1535396	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014758	TTTAG	2	10	1599428	1599437	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014758	CTATT	2	10	1650944	1650953	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_014758	AAGAT	2	10	1651001	1651010	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014758	TTAAA	2	10	1652781	1652790	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014758	TAAAA	2	10	1653016	1653025	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014758	AAAAT	2	10	1654682	1654691	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014758	TTATA	2	10	1658491	1658500	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014758	GATCT	2	10	1669483	1669492	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_014758	ATATT	2	10	1685406	1685415	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014758	ACTAT	2	10	1700552	1700561	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_014758	ATTAT	2	10	1744144	1744153	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014758	GATAT	2	10	1762531	1762540	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014758	CAAAA	2	10	1762572	1762581	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_014758	AAATC	2	10	1762625	1762634	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_014758	TAAAA	2	10	1762730	1762739	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014758	ATTTT	2	10	1789818	1789827	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014758	AATAA	2	10	1803694	1803703	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014758	TGATT	2	10	1812327	1812336	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014758	TTAAA	2	10	1838630	1838639	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014758	ATATA	2	10	1910190	1910199	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014758	TTTAT	2	10	1912944	1912953	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014758	TACCC	2	10	1942607	1942616	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
145	NC_014758	TAATA	2	10	1958476	1958485	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.