MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Calditerrivibrio nitroreducens DSM 19672 chromosome

Total Repeats: 406

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014758	ACAA	2	8	2679	2686	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014758	TAAA	2	8	16250	16257	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014758	AAAC	2	8	18221	18228	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014758	AAAC	2	8	24801	24808	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014758	AAGA	2	8	25221	25228	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014758	TAAA	2	8	25239	25246	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014758	AGGT	2	8	27306	27313	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014758	TTGT	2	8	30302	30309	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014758	TTTA	2	8	32482	32489	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014758	CTTG	2	8	34066	34073	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014758	GATT	2	8	34206	34213	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014758	TAAT	2	8	46433	46440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014758	TTAG	2	8	63726	63733	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014758	GAAA	2	8	63765	63772	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014758	TAAT	2	8	65433	65440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014758	TAAA	2	8	66814	66821	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014758	CTGG	2	8	71930	71937	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014758	ATAA	2	8	81226	81233	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014758	AAAG	2	8	81321	81328	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014758	CAAA	2	8	81347	81354	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014758	GAAG	2	8	81549	81556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014758	GATG	2	8	81686	81693	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014758	GTAG	2	8	81711	81718	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014758	TTAC	2	8	104099	104106	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014758	TTAT	2	8	104121	104128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014758	GATG	2	8	109928	109935	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014758	TAAA	2	8	138009	138016	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014758	TGTT	2	8	138086	138093	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014758	ATTA	2	8	138128	138135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014758	TCAG	2	8	138268	138275	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014758	GATG	2	8	139583	139590	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014758	AAAT	2	8	139602	139609	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014758	ATTT	2	8	139763	139770	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014758	TAAA	2	8	153804	153811	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014758	ATTA	2	8	153937	153944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014758	TAAT	2	8	161627	161634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014758	ATTT	2	8	165413	165420	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014758	TGTA	2	8	167960	167967	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014758	TAAA	2	8	177996	178003	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014758	TATT	2	8	179630	179637	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014758	TTTA	2	8	179855	179862	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014758	TTCG	2	8	180827	180834	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014758	AATA	2	8	189081	189088	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014758	GGAA	2	8	191117	191124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014758	ATGG	2	8	197806	197813	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014758	ATTT	2	8	198690	198697	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014758	TAAT	2	8	199559	199566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014758	CTGA	2	8	200947	200954	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014758	AAGA	2	8	207551	207558	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014758	ATAG	2	8	209900	209907	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014758	AAAT	2	8	210902	210909	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014758	TTTG	2	8	211405	211412	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014758	ATTG	2	8	211460	211467	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014758	AAAT	2	8	227211	227218	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014758	GCCT	2	8	227514	227521	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_014758	AAGG	2	8	227862	227869	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014758	AATA	2	8	230121	230128	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014758	TTGT	2	8	230227	230234	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014758	GGTG	2	8	260012	260019	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014758	ATCT	2	8	264038	264045	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_014758	AAGC	2	8	264051	264058	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014758	TAAA	2	8	270619	270626	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014758	ATTT	2	8	275642	275649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014758	AAAT	2	8	280948	280955	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014758	TGTA	2	8	290310	290317	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014758	ATGT	2	8	292990	292997	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014758	TTCG	2	8	294358	294365	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_014758	TTAA	2	8	294498	294505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014758	TTTG	2	8	295445	295452	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014758	AATT	2	8	319106	319113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014758	TATG	2	8	319126	319133	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014758	ATAA	2	8	319253	319260	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014758	ATTA	2	8	345991	345998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014758	AATA	2	8	347952	347959	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014758	ATAA	2	8	348008	348015	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014758	ATGA	2	8	348065	348072	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014758	ATTA	2	8	348086	348093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014758	AAAT	2	8	362340	362347	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014758	ATAA	2	8	365109	365116	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014758	TTTG	2	8	378795	378802	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014758	ATAA	2	8	382962	382969	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014758	GTAG	2	8	384377	384384	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014758	ATGG	2	8	399666	399673	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014758	CATT	2	8	418158	418165	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_014758	AATT	2	8	418278	418285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014758	AAAT	2	8	418303	418310	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014758	AAAT	2	8	429861	429868	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014758	ATTT	2	8	435794	435801	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014758	AGTA	2	8	438442	438449	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014758	GTTG	2	8	441807	441814	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014758	AAAT	2	8	447509	447516	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014758	AAAG	2	8	454602	454609	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014758	TAGA	2	8	455046	455053	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014758	TAAA	2	8	467510	467517	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014758	TAAA	2	8	467560	467567	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014758	ATTT	2	8	476011	476018	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014758	GATG	2	8	476506	476513	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014758	TAAT	2	8	485234	485241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014758	TATT	2	8	493717	493724	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014758	ATAA	2	8	495730	495737	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014758	AGGT	2	8	500400	500407	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014758	TCTA	2	8	503234	503241	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_014758	GATA	2	8	506326	506333	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014758	TAAA	2	8	514537	514544	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014758	ATTT	2	8	514598	514605	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014758	GTTT	2	8	514611	514618	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014758	AGAA	2	8	514627	514634	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014758	GATA	2	8	514655	514662	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014758	TATT	2	8	517199	517206	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014758	TAAA	2	8	518733	518740	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014758	CTGA	2	8	523128	523135	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014758	TATT	2	8	539496	539503	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014758	GTTT	2	8	547379	547386	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014758	ATTT	2	8	593886	593893	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014758	TACA	2	8	595447	595454	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_014758	TAAA	2	8	621267	621274	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014758	CTAA	2	8	621280	621287	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014758	TGTT	2	8	633332	633339	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014758	TTGG	2	8	633401	633408	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014758	ACAA	2	8	633467	633474	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_014758	AAAT	2	8	633504	633511	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014758	TAAA	2	8	658656	658663	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014758	GGCT	2	8	677205	677212	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_014758	AGAT	2	8	677379	677386	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014758	GATA	2	8	677514	677521	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014758	CCAG	2	8	693961	693968	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_014758	ATCT	2	8	705253	705260	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_014758	AGAT	2	8	706512	706519	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014758	TATG	2	8	708752	708759	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014758	CTTT	2	8	713970	713977	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_014758	AATA	2	8	714001	714008	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014758	ATTA	2	8	714130	714137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014758	CAAT	2	8	720597	720604	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014758	TTAG	2	8	727494	727501	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014758	TTTG	2	8	727595	727602	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014758	TAAA	2	8	728207	728214	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014758	TAAA	2	8	740060	740067	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014758	TTAC	2	8	751820	751827	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_014758	CTTC	2	8	753855	753862	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_014758	GTTT	2	8	755275	755282	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014758	ATAA	2	8	756448	756455	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014758	TAGT	2	8	767622	767629	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014758	ATTT	2	8	768661	768668	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014758	GATA	2	8	791613	791620	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014758	ATTA	2	8	801788	801795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014758	TAAT	2	8	801906	801913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014758	ATAG	2	8	802166	802173	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014758	AAAT	2	8	806635	806642	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014758	ACAA	2	8	806737	806744	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_014758	GGGA	2	8	807159	807166	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014758	ATCA	2	8	811135	811142	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.