MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Calditerrivibrio nitroreducens DSM 19672 chromosome

Total Repeats: 26257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014758	TAG	2	6	90	95	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313671970
2	NC_014758	TAC	2	6	140	145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313671970
3	NC_014758	AAT	2	6	149	154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313671970
4	NC_014758	ACG	2	6	438	443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313671970
5	NC_014758	CGG	2	6	595	600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313671970
6	NC_014758	TAG	2	6	646	651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313671970
7	NC_014758	ATT	2	6	818	823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313671970
8	NC_014758	TGG	2	6	885	890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313671970
9	NC_014758	ATG	2	6	1149	1154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313671970
10	NC_014758	CAA	2	6	1173	1178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313671970
11	NC_014758	GAG	2	6	1220	1225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313671970
12	NC_014758	ATA	2	6	1273	1278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313671970
13	NC_014758	CAC	2	6	1321	1326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313671971
14	NC_014758	GAG	2	6	1372	1377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313671971
15	NC_014758	GGA	2	6	1463	1468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313671971
16	NC_014758	ACA	2	6	1471	1476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313671971
17	NC_014758	ATC	2	6	1505	1510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313671971
18	NC_014758	AAC	2	6	1528	1533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313671971
19	NC_014758	CAA	2	6	1579	1584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313671971
20	NC_014758	TGG	2	6	1618	1623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313671971
21	NC_014758	TTC	2	6	1625	1630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313671971
22	NC_014758	GGT	2	6	1707	1712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313671971
23	NC_014758	TAA	2	6	1751	1756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313671971
24	NC_014758	TAT	2	6	1885	1890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313671971
25	NC_014758	GAT	2	6	1896	1901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313671971
26	NC_014758	GAG	2	6	2028	2033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313671971
27	NC_014758	ACC	2	6	2078	2083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313671971
28	NC_014758	ATA	2	6	2188	2193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313671971
29	NC_014758	TAA	2	6	2296	2301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313671971
30	NC_014758	TTA	2	6	2332	2337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313671971
31	NC_014758	CAG	2	6	2367	2372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313671971
32	NC_014758	TAC	2	6	2506	2511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313671971
33	NC_014758	AAT	2	6	2877	2882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313671972
34	NC_014758	TTC	2	6	2951	2956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313671972
35	NC_014758	ATT	2	6	3084	3089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313671972
36	NC_014758	TTC	2	6	3133	3138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313671972
37	NC_014758	ATC	2	6	3159	3164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313671972
38	NC_014758	TTC	2	6	3255	3260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313671972
39	NC_014758	CGA	2	6	3311	3316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313671972
40	NC_014758	ATC	2	6	3393	3398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313671972
41	NC_014758	TTA	2	6	3404	3409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313671972
42	NC_014758	TGA	2	6	3429	3434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313671972
43	NC_014758	ATT	2	6	3600	3605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313671972
44	NC_014758	GTC	2	6	3631	3636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313671972
45	NC_014758	ATA	2	6	3656	3661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313671972
46	NC_014758	TTC	2	6	3671	3676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313671972
47	NC_014758	TCT	2	6	4036	4041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313671973
48	NC_014758	TAA	2	6	4142	4147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313671973
49	NC_014758	TAA	2	6	4159	4164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313671973
50	NC_014758	TGA	2	6	4205	4210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313671973
51	NC_014758	TAT	2	6	4236	4241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313671973
52	NC_014758	AAG	2	6	4367	4372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313671973
53	NC_014758	TAA	2	6	4436	4441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313671973
54	NC_014758	TAA	2	6	4561	4566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313671973
55	NC_014758	ATC	2	6	4651	4656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313671973
56	NC_014758	TGA	2	6	4658	4663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313671973
57	NC_014758	TCT	2	6	4667	4672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313671973
58	NC_014758	TAT	2	6	4699	4704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313671973
59	NC_014758	CTT	2	6	4765	4770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313671973
60	NC_014758	TGT	2	6	4797	4802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313671973
61	NC_014758	GTT	2	6	4821	4826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313671973
62	NC_014758	TTC	2	6	4852	4857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313671973
63	NC_014758	TAT	2	6	4994	4999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313671974
64	NC_014758	AAT	2	6	5013	5018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313671974
65	NC_014758	GAA	2	6	5037	5042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313671974
66	NC_014758	CAT	2	6	5124	5129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313671974
67	NC_014758	GAT	2	6	5232	5237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313671974
68	NC_014758	AGT	2	6	5291	5296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313671974
69	NC_014758	TGG	2	6	5669	5674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313671974
70	NC_014758	CTT	2	6	5715	5720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313671974
71	NC_014758	TGA	2	6	5723	5728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313671974
72	NC_014758	TGT	3	9	5759	5767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313671974
73	NC_014758	TGA	2	6	5798	5803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313671974
74	NC_014758	AAT	2	6	5823	5828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313671974
75	NC_014758	AGA	2	6	5837	5842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313671974
76	NC_014758	GGT	2	6	5844	5849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313671974
77	NC_014758	TCT	2	6	5871	5876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313671974
78	NC_014758	TAA	2	6	5891	5896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313671974
79	NC_014758	TCA	2	6	5899	5904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313671974
80	NC_014758	GAC	2	6	5946	5951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313671974
81	NC_014758	AGT	3	9	6104	6112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313671974
82	NC_014758	AGA	2	6	6186	6191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313671974
83	NC_014758	GGT	2	6	6294	6299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313671974
84	NC_014758	CTT	2	6	6390	6395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313671974
85	NC_014758	CAA	2	6	6398	6403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313671974
86	NC_014758	ATA	2	6	6417	6422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313671974
87	NC_014758	ATC	2	6	6489	6494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313671974
88	NC_014758	ACT	3	9	6533	6541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313671974
89	NC_014758	TCA	2	6	6827	6832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313671974
90	NC_014758	TGA	2	6	6880	6885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313671974
91	NC_014758	GAA	2	6	6945	6950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313671974
92	NC_014758	TGG	2	6	7096	7101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313671974
93	NC_014758	AAG	2	6	7247	7252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313671974
94	NC_014758	GAA	2	6	7284	7289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313671974
95	NC_014758	TGG	2	6	7324	7329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313671974
96	NC_014758	AGA	2	6	7349	7354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313671974
97	NC_014758	TAA	2	6	7414	7419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313671975
98	NC_014758	TAT	2	6	7429	7434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313671975
99	NC_014758	TTG	2	6	7494	7499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313671975
100	NC_014758	ATA	2	6	7584	7589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313671975
101	NC_014758	GTG	2	6	7613	7618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313671975
102	NC_014758	CCG	2	6	7755	7760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313671975
103	NC_014758	ATG	2	6	7854	7859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313671975
104	NC_014758	GAG	2	6	7868	7873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313671975
105	NC_014758	GGT	2	6	7975	7980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313671975
106	NC_014758	TGA	2	6	8023	8028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313671975
107	NC_014758	CTG	2	6	8064	8069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313671975
108	NC_014758	ATC	2	6	8215	8220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313671975
109	NC_014758	CAT	2	6	8590	8595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313671975
110	NC_014758	GAG	2	6	8729	8734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313671975
111	NC_014758	ATC	2	6	8784	8789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313671975
112	NC_014758	TAT	2	6	8803	8808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313671975
113	NC_014758	AGA	2	6	8852	8857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313671975
114	NC_014758	GGT	2	6	8990	8995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313671975
115	NC_014758	CTT	2	6	9103	9108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313671975
116	NC_014758	TCT	2	6	9166	9171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313671975
117	NC_014758	CAG	2	6	9276	9281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313671975
118	NC_014758	GGA	2	6	9283	9288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313671975
119	NC_014758	ATG	2	6	9336	9341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313671975
120	NC_014758	AAG	2	6	9426	9431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313671975
121	NC_014758	GAA	2	6	9444	9449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313671975
122	NC_014758	AGA	2	6	9478	9483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313671975
123	NC_014758	GAT	2	6	9485	9490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313671975
124	NC_014758	TTG	2	6	9648	9653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313671975
125	NC_014758	GAT	2	6	9677	9682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313671975
126	NC_014758	TGA	2	6	9690	9695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313671975
127	NC_014758	GAT	2	6	9785	9790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313671975
128	NC_014758	AGG	2	6	9816	9821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313671975
129	NC_014758	TTG	2	6	9943	9948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313671976
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131	NC_014758	TCT	2	6	10058	10063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313671976
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255	NC_014758	TTG	2	6	19035	19040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313671987
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259	NC_014758	GAT	3	9	19117	19125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313671987
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