MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Sulfuricurvum kujiense DSM 16994 plasmid pSULKU01

Total Repeats: 307

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014754	AAAG	2	8	105	112	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014754	CTTG	2	8	390	397	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014754	AATA	2	8	525	532	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014754	AGAA	2	8	1250	1257	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014754	GTTT	2	8	1371	1378	0 %	75 %	25 %	0 %	313669334
6	NC_014754	TGAT	2	8	1711	1718	25 %	50 %	25 %	0 %	313669334
7	NC_014754	TTTG	2	8	2369	2376	0 %	75 %	25 %	0 %	313669335
8	NC_014754	TTTG	2	8	2526	2533	0 %	75 %	25 %	0 %	313669335
9	NC_014754	CTTT	2	8	2829	2836	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014754	TTGT	2	8	3327	3334	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014754	GATT	2	8	3339	3346	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014754	AGTG	2	8	3369	3376	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014754	TCAG	2	8	3471	3478	25 %	25 %	25 %	25 %	313669337
14	NC_014754	TTGG	2	8	4379	4386	0 %	50 %	50 %	0 %	313669339
15	NC_014754	TCCC	2	8	4945	4952	0 %	25 %	0 %	75 %	313669341
16	NC_014754	AATT	2	8	5791	5798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014754	ATTT	2	8	6340	6347	25 %	75 %	0 %	0 %	313669342
18	NC_014754	GAAC	2	8	6699	6706	50 %	0 %	25 %	25 %	313669342
19	NC_014754	AAAT	2	8	6879	6886	75 %	25 %	0 %	0 %	313669342
20	NC_014754	AATC	2	8	7037	7044	50 %	25 %	0 %	25 %	313669342
21	NC_014754	TATT	2	8	7083	7090	25 %	75 %	0 %	0 %	313669342
22	NC_014754	AAAG	2	8	7387	7394	75 %	0 %	25 %	0 %	313669342
23	NC_014754	GAAA	2	8	7516	7523	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014754	TTCT	2	8	7598	7605	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014754	ATCA	2	8	9156	9163	50 %	25 %	0 %	25 %	313669345
26	NC_014754	TAGA	2	8	9275	9282	50 %	25 %	25 %	0 %	313669345
27	NC_014754	TTCG	2	8	9921	9928	0 %	50 %	25 %	25 %	313669345
28	NC_014754	GCTG	2	8	10220	10227	0 %	25 %	50 %	25 %	313669346
29	NC_014754	AAAC	2	8	11061	11068	75 %	0 %	0 %	25 %	313669347
30	NC_014754	CCTT	2	8	11310	11317	0 %	50 %	0 %	50 %	313669348
31	NC_014754	CGGT	2	8	11620	11627	0 %	25 %	50 %	25 %	313669348
32	NC_014754	AATA	2	8	12390	12397	75 %	25 %	0 %	0 %	313669348
33	NC_014754	GATC	2	8	14465	14472	25 %	25 %	25 %	25 %	313669350
34	NC_014754	TCGA	2	8	14584	14591	25 %	25 %	25 %	25 %	313669350
35	NC_014754	CATC	2	8	14637	14644	25 %	25 %	0 %	50 %	313669350
36	NC_014754	CCAA	2	8	15235	15242	50 %	0 %	0 %	50 %	313669351
37	NC_014754	AATT	2	8	15554	15561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014754	AATA	2	8	15711	15718	75 %	25 %	0 %	0 %	313669352
39	NC_014754	TCCA	2	8	15767	15774	25 %	25 %	0 %	50 %	313669352
40	NC_014754	TTTG	2	8	15934	15941	0 %	75 %	25 %	0 %	313669352
41	NC_014754	CGAG	2	8	16136	16143	25 %	0 %	50 %	25 %	313669352
42	NC_014754	TGAA	2	8	16210	16217	50 %	25 %	25 %	0 %	313669352
43	NC_014754	CCTC	2	8	17384	17391	0 %	25 %	0 %	75 %	313669354
44	NC_014754	GGTC	2	8	17449	17456	0 %	25 %	50 %	25 %	313669354
45	NC_014754	GTTT	2	8	18711	18718	0 %	75 %	25 %	0 %	313669354
46	NC_014754	AATT	2	8	18770	18777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014754	AATC	2	8	18942	18949	50 %	25 %	0 %	25 %	313669355
48	NC_014754	TTGA	2	8	19382	19389	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014754	GGTT	2	8	19512	19519	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014754	AAAT	2	8	19692	19699	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014754	ATAA	2	8	19765	19772	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014754	TTTC	2	8	20405	20412	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014754	TTGA	2	8	21234	21241	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014754	AACA	2	8	21509	21516	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014754	ATGG	2	8	21599	21606	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014754	CTAA	2	8	21864	21871	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_014754	TAAA	2	8	22013	22020	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014754	AGAA	2	8	22459	22466	75 %	0 %	25 %	0 %	313669358
59	NC_014754	ATTC	2	8	23140	23147	25 %	50 %	0 %	25 %	313669358
60	NC_014754	TCGT	2	8	23409	23416	0 %	50 %	25 %	25 %	313669358
61	NC_014754	TTTG	2	8	23654	23661	0 %	75 %	25 %	0 %	313669358
62	NC_014754	AAAT	2	8	23794	23801	75 %	25 %	0 %	0 %	313669358
63	NC_014754	ATCG	2	8	23842	23849	25 %	25 %	25 %	25 %	313669358
64	NC_014754	ATAG	3	12	24312	24323	50 %	25 %	25 %	0 %	313669358
65	NC_014754	ATCC	2	8	24329	24336	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_014754	GGAT	2	8	24337	24344	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014754	ATTC	2	8	24364	24371	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_014754	ATCC	2	8	24439	24446	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014754	GGAT	2	8	24447	24454	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014754	CTGA	2	8	24603	24610	25 %	25 %	25 %	25 %	313669359
71	NC_014754	ATCG	2	8	25160	25167	25 %	25 %	25 %	25 %	313669359
72	NC_014754	TGAT	2	8	25787	25794	25 %	50 %	25 %	0 %	313669360
73	NC_014754	GAAA	2	8	25896	25903	75 %	0 %	25 %	0 %	313669360
74	NC_014754	ATGA	2	8	25915	25922	50 %	25 %	25 %	0 %	313669360
75	NC_014754	AAAC	2	8	26219	26226	75 %	0 %	0 %	25 %	313669360
76	NC_014754	ATCC	2	8	26368	26375	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_014754	TGAA	2	8	26561	26568	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014754	TCTA	2	8	27146	27153	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014754	AAAG	2	8	27560	27567	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014754	AAAC	2	8	27677	27684	75 %	0 %	0 %	25 %	313669361
81	NC_014754	TCCA	2	8	27769	27776	25 %	25 %	0 %	50 %	313669361
82	NC_014754	CAAT	2	8	28345	28352	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_014754	CGAT	2	8	28675	28682	25 %	25 %	25 %	25 %	313669364
84	NC_014754	TAAA	2	8	28966	28973	75 %	25 %	0 %	0 %	313669365
85	NC_014754	GATA	2	8	29706	29713	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014754	GATC	2	8	30019	30026	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_014754	ATAA	2	8	30141	30148	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014754	TTGT	2	8	30445	30452	0 %	75 %	25 %	0 %	313669366
89	NC_014754	TAAT	2	8	30594	30601	50 %	50 %	0 %	0 %	313669366
90	NC_014754	AAGA	2	8	30644	30651	75 %	0 %	25 %	0 %	313669366
91	NC_014754	GATC	2	8	31327	31334	25 %	25 %	25 %	25 %	313669367
92	NC_014754	CGAT	2	8	32285	32292	25 %	25 %	25 %	25 %	313669368
93	NC_014754	GAAC	2	8	32314	32321	50 %	0 %	25 %	25 %	313669368
94	NC_014754	AAAC	2	8	32583	32590	75 %	0 %	0 %	25 %	313669368
95	NC_014754	TACC	2	8	32684	32691	25 %	25 %	0 %	50 %	313669368
96	NC_014754	ATAC	2	8	33034	33041	50 %	25 %	0 %	25 %	313669368
97	NC_014754	ATGG	3	12	33197	33208	25 %	25 %	50 %	0 %	313669368
98	NC_014754	ATTC	2	8	33465	33472	25 %	50 %	0 %	25 %	313669368
99	NC_014754	TCGA	2	8	33922	33929	25 %	25 %	25 %	25 %	313669368
100	NC_014754	GTCC	2	8	34019	34026	0 %	25 %	25 %	50 %	313669368
101	NC_014754	AATC	2	8	34514	34521	50 %	25 %	0 %	25 %	313669368
102	NC_014754	ATGA	2	8	34618	34625	50 %	25 %	25 %	0 %	313669368
103	NC_014754	ATAA	2	8	34846	34853	75 %	25 %	0 %	0 %	313669368
104	NC_014754	ATGG	2	8	35144	35151	25 %	25 %	50 %	0 %	313669369
105	NC_014754	TTTG	2	8	35625	35632	0 %	75 %	25 %	0 %	313669369
106	NC_014754	CAAT	2	8	35936	35943	50 %	25 %	0 %	25 %	313669369
107	NC_014754	CAAA	2	8	36000	36007	75 %	0 %	0 %	25 %	313669369
108	NC_014754	CAAG	2	8	36097	36104	50 %	0 %	25 %	25 %	313669369
109	NC_014754	CATG	2	8	36420	36427	25 %	25 %	25 %	25 %	313669369
110	NC_014754	ATTA	2	8	36804	36811	50 %	50 %	0 %	0 %	313669369
111	NC_014754	GAAA	2	8	36917	36924	75 %	0 %	25 %	0 %	313669370
112	NC_014754	ATGA	2	8	37356	37363	50 %	25 %	25 %	0 %	313669370
113	NC_014754	ATTT	2	8	37824	37831	25 %	75 %	0 %	0 %	313669371
114	NC_014754	GTAA	2	8	37928	37935	50 %	25 %	25 %	0 %	313669371
115	NC_014754	GATA	2	8	38131	38138	50 %	25 %	25 %	0 %	313669371
116	NC_014754	CATA	2	8	39889	39896	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_014754	ACTA	2	8	40092	40099	50 %	25 %	0 %	25 %	313669373
118	NC_014754	GGAT	2	8	40306	40313	25 %	25 %	50 %	0 %	313669373
119	NC_014754	TTAT	2	8	40778	40785	25 %	75 %	0 %	0 %	313669374
120	NC_014754	TTTG	2	8	41000	41007	0 %	75 %	25 %	0 %	313669374
121	NC_014754	TTTG	2	8	41309	41316	0 %	75 %	25 %	0 %	313669374
122	NC_014754	ACTG	2	8	41654	41661	25 %	25 %	25 %	25 %	313669374
123	NC_014754	TCCA	2	8	42017	42024	25 %	25 %	0 %	50 %	313669375
124	NC_014754	CTTG	2	8	42077	42084	0 %	50 %	25 %	25 %	313669375
125	NC_014754	AGTG	2	8	42229	42236	25 %	25 %	50 %	0 %	313669375
126	NC_014754	GACG	2	8	42520	42527	25 %	0 %	50 %	25 %	313669375
127	NC_014754	CGAT	2	8	43491	43498	25 %	25 %	25 %	25 %	313669375
128	NC_014754	GGTC	2	8	43823	43830	0 %	25 %	50 %	25 %	313669376
129	NC_014754	CCGT	2	8	43885	43892	0 %	25 %	25 %	50 %	313669376
130	NC_014754	ATCG	2	8	43989	43996	25 %	25 %	25 %	25 %	313669376
131	NC_014754	TTAT	2	8	44269	44276	25 %	75 %	0 %	0 %	313669376
132	NC_014754	ATTG	2	8	44285	44292	25 %	50 %	25 %	0 %	313669376
133	NC_014754	TTAC	2	8	45964	45971	25 %	50 %	0 %	25 %	313669380
134	NC_014754	ATCG	2	8	46653	46660	25 %	25 %	25 %	25 %	313669380
135	NC_014754	AGCA	2	8	46988	46995	50 %	0 %	25 %	25 %	313669380
136	NC_014754	TTTA	2	8	48093	48100	25 %	75 %	0 %	0 %	313669381
137	NC_014754	CAAT	2	8	49004	49011	50 %	25 %	0 %	25 %	313669382
138	NC_014754	TGTT	2	8	49196	49203	0 %	75 %	25 %	0 %	313669382
139	NC_014754	TGAA	2	8	49652	49659	50 %	25 %	25 %	0 %	313669383
140	NC_014754	ATCC	2	8	50224	50231	25 %	25 %	0 %	50 %	313669384
141	NC_014754	ATCC	2	8	50857	50864	25 %	25 %	0 %	50 %	313669385
142	NC_014754	CCAT	2	8	50886	50893	25 %	25 %	0 %	50 %	313669385
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.