MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Neisseria lactamica 020-06 chromosome

Total Repeats: 155

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014752	GGCTTG	2	12	7770	7781	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014752	GCAGCC	2	12	10286	10297	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014752	TTGTAT	2	12	10339	10350	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014752	TTAAAT	2	12	13927	13938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014752	TTGCCG	2	12	16012	16023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014752	ACAAAG	2	12	33215	33226	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014752	AGTTTG	2	12	36430	36441	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014752	CGCGCC	2	12	36998	37009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_014752	CTGCGC	2	12	47498	47509	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014752	TTAAAT	2	12	53921	53932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014752	GGAAAA	2	12	72683	72694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014752	CTATTT	2	12	91269	91280	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_014752	AAATGT	2	12	106880	106891	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014752	TAAAAT	2	12	125407	125418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014752	TAAACC	2	12	127317	127328	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014752	CAAAAA	2	12	149182	149193	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014752	TTCGGT	2	12	155692	155703	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014752	TTTAAG	2	12	195488	195499	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014752	TTTTGT	2	12	200357	200368	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014752	CTTAAA	2	12	207804	207815	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014752	TTAAAT	2	12	217819	217830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014752	TATTTT	2	12	222994	223005	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014752	TTTAAT	2	12	288742	288753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014752	ACAAAG	2	12	332397	332408	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_014752	AGTTTG	2	12	335612	335623	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014752	GCTGCG	2	12	336402	336413	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014752	TTCGGT	2	12	341527	341538	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014752	AAATAA	2	12	348210	348221	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014752	GTTCAG	3	18	409343	409360	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_014752	ATTTAA	2	12	409855	409866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014752	ATCTTT	2	12	424679	424690	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014752	ATTTAA	2	12	425826	425837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014752	AAACGC	2	12	449645	449656	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014752	AAAAGG	2	12	463694	463705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014752	TTCGGT	2	12	483251	483262	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_014752	TTAAAT	2	12	501097	501108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014752	CGTTTG	2	12	501253	501264	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014752	GGTTTT	2	12	505323	505334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014752	ACAAAA	2	12	517781	517792	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014752	ATTTAA	2	12	528428	528439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014752	GCGGAG	2	12	543805	543816	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014752	ACAAAG	2	12	628651	628662	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014752	AGTTTG	2	12	631866	631877	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014752	CGCGCC	2	12	632434	632445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_014752	TGATTT	2	12	636586	636597	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014752	CATTTG	2	12	689358	689369	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014752	CCCGAA	2	12	693210	693221	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014752	ACTGCC	2	12	694954	694965	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
49	NC_014752	TCTGAA	2	12	705336	705347	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014752	CGGATA	2	12	776291	776302	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_014752	TTAAAT	2	12	801720	801731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014752	TTTTTG	2	12	823428	823439	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014752	TGCCTG	2	12	839490	839501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014752	TAAAAT	2	12	842436	842447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014752	TTAAAT	2	12	864076	864087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014752	TTGGTG	2	12	879265	879276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014752	GATGTC	2	12	879588	879599	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014752	ATTTAA	2	12	923443	923454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014752	TTAAAT	2	12	924934	924945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014752	GCCATA	2	12	946978	946989	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014752	CAGCGA	2	12	947546	947557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014752	CAGCGA	2	12	952344	952355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014752	GGTATA	2	12	953407	953418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014752	GCCATA	2	12	957415	957426	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014752	CAGCGA	2	12	957604	957615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014752	ACCAAC	2	12	960156	960167	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_014752	GGCGCA	2	12	968362	968373	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014752	GAAGGC	2	12	969245	969256	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_014752	AATTTG	2	12	997246	997257	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014752	ATTTCA	2	12	1008634	1008645	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_014752	CAAAAA	2	12	1010988	1010999	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_014752	CAAAAA	2	12	1011230	1011241	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_014752	TTTGAA	2	12	1015040	1015051	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014752	GGAATC	2	12	1028310	1028321	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_014752	ACATTT	2	12	1062302	1062313	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_014752	GGGGAT	2	12	1081547	1081558	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014752	GGCTTT	2	12	1110411	1110422	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_014752	GATGCG	2	12	1133628	1133639	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_014752	GTTTGG	2	12	1135906	1135917	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014752	AATCAA	2	12	1140676	1140687	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_014752	TGCCGA	2	12	1145863	1145874	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014752	CAAACC	2	12	1160894	1160905	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_014752	TTTCAG	2	12	1207717	1207728	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_014752	TTAAAT	2	12	1208569	1208580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014752	AAACAC	2	12	1223957	1223968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014752	AAATTT	2	12	1246813	1246824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014752	TTTTCT	2	12	1276519	1276530	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014752	AGCATA	2	12	1276548	1276559	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_014752	GTAAGT	2	12	1305996	1306007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014752	TTTATT	2	12	1312226	1312237	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014752	AACAAA	2	12	1319071	1319082	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_014752	TGCCTT	2	12	1327393	1327404	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014752	CTTTTT	2	12	1331370	1331381	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_014752	TTGTTT	2	12	1347396	1347407	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014752	CAAACA	2	12	1374624	1374635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014752	ATGCCG	2	12	1387298	1387309	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014752	ATTTCT	2	12	1415290	1415301	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_014752	CAAAGA	2	12	1428684	1428695	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_014752	ATTTCG	2	12	1467310	1467321	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_014752	AGCAAT	2	12	1479361	1479372	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_014752	TTCCTT	2	12	1490050	1490061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014752	CTGAAA	2	12	1490967	1490978	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_014752	ATCCTT	2	12	1507907	1507918	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014752	ATTTAA	2	12	1536431	1536442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014752	TTCCGA	2	12	1551512	1551523	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014752	GCAACA	2	12	1555858	1555869	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014752	TCCGAA	2	12	1600324	1600335	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014752	ATCGGA	2	12	1604752	1604763	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_014752	TATTTT	2	12	1611600	1611611	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014752	CCGATA	2	12	1615179	1615190	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014752	GGAATG	2	12	1649232	1649243	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014752	TTAAGG	2	12	1649334	1649345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014752	GCAAAC	2	12	1654574	1654585	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014752	ACATAA	2	12	1702771	1702782	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_014752	ATCCGA	2	12	1711325	1711336	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014752	GTGTCC	2	12	1733970	1733981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014752	GAAATG	2	12	1776629	1776640	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014752	TGAAAA	2	12	1778144	1778155	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014752	TTAAAT	2	12	1781576	1781587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014752	CGGCAT	2	12	1788095	1788106	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014752	TAAATT	2	12	1794893	1794904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014752	CCCAAG	2	12	1797500	1797511	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
123	NC_014752	TTAAAT	2	12	1835454	1835465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014752	GCAAAA	2	12	1847814	1847825	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_014752	AAAGAT	2	12	1849302	1849313	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014752	TTCGGT	2	12	1868814	1868825	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_014752	GCCTAC	2	12	1876520	1876531	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
128	NC_014752	TGGCAA	2	12	1894799	1894810	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_014752	GAAACC	2	12	1902086	1902097	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_014752	CGCAGG	2	12	1907413	1907424	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_014752	AACAAA	2	12	1921280	1921291	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_014752	TTGGAT	2	12	1923922	1923933	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014752	ATCAAA	2	12	1970683	1970694	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_014752	AGAAAA	2	12	1983617	1983628	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014752	TTAAAT	2	12	2001983	2001994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014752	CTGATG	2	12	2027048	2027059	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_014752	AAACTA	2	12	2038625	2038636	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_014752	CGGAAG	2	12	2052118	2052129	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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141	NC_014752	GAAACC	2	12	2057786	2057797	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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153	NC_014752	TTAAAT	2	12	2127181	2127192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014752	TTAAAT	2	12	2185168	2185179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014752	TTGAAG	2	12	2204611	2204622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.