MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Calditerrivibrio nitroreducens DSM 19672 plasmid pCALNI01

Total Repeats: 17

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014749	TTTTTC	2	12	3114	3125	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	313652022
2	NC_014749	TCTTTT	2	12	6723	6734	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	313652024
3	NC_014749	ATAAAA	2	12	14860	14871	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	313652030
4	NC_014749	TTATTC	2	12	19239	19250	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014749	GTTTCT	2	12	19572	19583	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	313652035
6	NC_014749	CATTTA	2	12	19630	19641	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	313652035
7	NC_014749	TATATT	2	12	21093	21104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014749	GATCTG	2	12	21400	21411	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014749	AAATTT	2	12	24997	25008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014749	TTTAAT	2	12	25281	25292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313652039
11	NC_014749	TTTTTC	2	12	28389	28400	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	313652041
12	NC_014749	ATTTCT	2	12	29596	29607	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	313652043
13	NC_014749	TAAAAA	2	12	29710	29721	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	313652043
14	NC_014749	ATTTTT	2	12	44137	44148	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	313652059
15	NC_014749	TTTTCT	2	12	45150	45161	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	313652060
16	NC_014749	TGATTT	2	12	49086	49097	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	313652065
17	NC_014749	ATATTT	2	12	55821	55832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313652072

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.