MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Calditerrivibrio nitroreducens DSM 19672 plasmid pCALNI01

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014749	ATATA	2	10	29	38	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014749	ATTTT	2	10	217	226	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014749	TTTAC	2	10	1418	1427	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_014749	TATGA	2	10	1546	1555	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014749	CTTTT	2	10	1775	1784	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_014749	CTATA	2	10	8166	8175	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_014749	AATAT	2	10	19800	19809	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014749	TTGAT	2	10	20906	20915	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014749	ATCAA	2	10	21910	21919	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014749	AGTGT	2	10	22300	22309	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014749	TTTGA	2	10	22333	22342	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014749	AGATA	2	10	22395	22404	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014749	GGTTT	2	10	24077	24086	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014749	TTTAT	2	10	28659	28668	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014749	TATGT	2	10	31376	31385	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014749	ATGAC	2	10	32795	32804	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_014749	CAAAC	2	10	33804	33813	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_014749	TAAAA	2	10	33848	33857	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014749	AAATC	2	10	35647	35656	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.