MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Calditerrivibrio nitroreducens DSM 19672 plasmid pCALNI01

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014749	CTCTT	2	10	2118	2127	0 %	60 %	0 %	40 %	313652022
2	NC_014749	ATTCT	2	10	2870	2879	20 %	60 %	0 %	20 %	313652022
3	NC_014749	TCGTT	2	10	3052	3061	0 %	60 %	20 %	20 %	313652022
4	NC_014749	TCTTT	2	10	4625	4634	0 %	80 %	0 %	20 %	313652023
5	NC_014749	ATAGT	2	10	5883	5892	40 %	40 %	20 %	0 %	313652023
6	NC_014749	CTGAT	2	10	7589	7598	20 %	40 %	20 %	20 %	313652024
7	NC_014749	AGATA	2	10	12489	12498	60 %	20 %	20 %	0 %	313652029
8	NC_014749	TATGG	2	10	14593	14602	20 %	40 %	40 %	0 %	313652030
9	NC_014749	AAAGA	2	10	15015	15024	80 %	0 %	20 %	0 %	313652031
10	NC_014749	TCAAA	2	10	18058	18067	60 %	20 %	0 %	20 %	313652034
11	NC_014749	GCTTT	2	10	18295	18304	0 %	60 %	20 %	20 %	313652034
12	NC_014749	TATTT	2	10	18707	18716	20 %	80 %	0 %	0 %	313652034
13	NC_014749	CTTTT	2	10	19652	19661	0 %	80 %	0 %	20 %	313652035
14	NC_014749	TAAAA	2	10	20278	20287	80 %	20 %	0 %	0 %	313652036
15	NC_014749	ATAAA	2	10	22744	22753	80 %	20 %	0 %	0 %	313652037
16	NC_014749	TGATA	2	10	22898	22907	40 %	40 %	20 %	0 %	313652037
17	NC_014749	TAAAA	2	10	24773	24782	80 %	20 %	0 %	0 %	313652038
18	NC_014749	ATTTC	2	10	25326	25335	20 %	60 %	0 %	20 %	313652039
19	NC_014749	AGGAT	2	10	26037	26046	40 %	20 %	40 %	0 %	313652039
20	NC_014749	TATAA	2	10	26394	26403	60 %	40 %	0 %	0 %	313652040
21	NC_014749	TGTTT	2	10	26450	26459	0 %	80 %	20 %	0 %	313652040
22	NC_014749	TGAAA	2	10	27259	27268	60 %	20 %	20 %	0 %	313652041
23	NC_014749	CTTTT	2	10	27432	27441	0 %	80 %	0 %	20 %	313652041
24	NC_014749	ATTCA	2	10	27744	27753	40 %	40 %	0 %	20 %	313652041
25	NC_014749	ATTAT	2	10	29002	29011	40 %	60 %	0 %	0 %	313652042
26	NC_014749	AGAAA	2	10	29549	29558	80 %	0 %	20 %	0 %	313652043
27	NC_014749	AAATC	2	10	29790	29799	60 %	20 %	0 %	20 %	313652043
28	NC_014749	AAATC	2	10	29838	29847	60 %	20 %	0 %	20 %	313652043
29	NC_014749	TGGTA	2	10	30320	30329	20 %	40 %	40 %	0 %	313652043
30	NC_014749	ATTTT	2	10	31203	31212	20 %	80 %	0 %	0 %	313652044
31	NC_014749	ATTAT	2	10	32705	32714	40 %	60 %	0 %	0 %	313652046
32	NC_014749	TTTGA	2	10	34285	34294	20 %	60 %	20 %	0 %	313652048
33	NC_014749	TAGTA	2	10	36546	36555	40 %	40 %	20 %	0 %	313652051
34	NC_014749	ATTAC	2	10	37076	37085	40 %	40 %	0 %	20 %	313652053
35	NC_014749	TTTGA	2	10	38718	38727	20 %	60 %	20 %	0 %	313652054
36	NC_014749	AAGGC	2	10	40497	40506	40 %	0 %	40 %	20 %	313652055
37	NC_014749	ATAAA	2	10	41838	41847	80 %	20 %	0 %	0 %	313652057
38	NC_014749	ATAAA	2	10	44642	44651	80 %	20 %	0 %	0 %	313652059
39	NC_014749	TTAAA	2	10	47127	47136	60 %	40 %	0 %	0 %	313652062
40	NC_014749	ATATA	2	10	49854	49863	60 %	40 %	0 %	0 %	313652066
41	NC_014749	TGAAA	2	10	52613	52622	60 %	20 %	20 %	0 %	313652068
42	NC_014749	AAACA	2	10	52874	52883	80 %	0 %	0 %	20 %	313652068
43	NC_014749	ACAAA	2	10	53791	53800	80 %	0 %	0 %	20 %	313652069
44	NC_014749	TGGAG	2	10	54508	54517	20 %	20 %	60 %	0 %	313652071
45	NC_014749	ATTTT	2	10	56772	56781	20 %	80 %	0 %	0 %	313652074

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.