MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Calditerrivibrio nitroreducens DSM 19672 plasmid pCALNI01

Total Repeats: 170

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014749	TCGC	2	8	490	497	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014749	TTAT	2	8	2209	2216	25 %	75 %	0 %	0 %	313652022
3	NC_014749	TAGG	2	8	2707	2714	25 %	25 %	50 %	0 %	313652022
4	NC_014749	TGTT	2	8	2735	2742	0 %	75 %	25 %	0 %	313652022
5	NC_014749	TTTC	2	8	3086	3093	0 %	75 %	0 %	25 %	313652022
6	NC_014749	TTTC	2	8	3284	3291	0 %	75 %	0 %	25 %	313652022
7	NC_014749	CTTT	2	8	4264	4271	0 %	75 %	0 %	25 %	313652023
8	NC_014749	CTTC	2	8	4314	4321	0 %	50 %	0 %	50 %	313652023
9	NC_014749	TCTT	2	8	4547	4554	0 %	75 %	0 %	25 %	313652023
10	NC_014749	TTGT	2	8	4805	4812	0 %	75 %	25 %	0 %	313652023
11	NC_014749	AATT	2	8	4880	4887	50 %	50 %	0 %	0 %	313652023
12	NC_014749	CTAC	2	8	5046	5053	25 %	25 %	0 %	50 %	313652023
13	NC_014749	TCTA	2	8	5795	5802	25 %	50 %	0 %	25 %	313652023
14	NC_014749	CTTC	2	8	5851	5858	0 %	50 %	0 %	50 %	313652023
15	NC_014749	CGTT	2	8	6115	6122	0 %	50 %	25 %	25 %	313652024
16	NC_014749	TTTC	2	8	6223	6230	0 %	75 %	0 %	25 %	313652024
17	NC_014749	GTTG	2	8	6317	6324	0 %	50 %	50 %	0 %	313652024
18	NC_014749	AGTT	2	8	6436	6443	25 %	50 %	25 %	0 %	313652024
19	NC_014749	TAAG	2	8	6968	6975	50 %	25 %	25 %	0 %	313652024
20	NC_014749	AAGA	2	8	7455	7462	75 %	0 %	25 %	0 %	313652024
21	NC_014749	ACTT	2	8	7914	7921	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014749	TTAT	2	8	8120	8127	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014749	ATGA	2	8	8305	8312	50 %	25 %	25 %	0 %	313652026
24	NC_014749	GCAG	2	8	8630	8637	25 %	0 %	50 %	25 %	313652027
25	NC_014749	TTCT	2	8	8686	8693	0 %	75 %	0 %	25 %	313652027
26	NC_014749	TGGA	2	8	9569	9576	25 %	25 %	50 %	0 %	313652027
27	NC_014749	TAAA	2	8	9905	9912	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014749	TAAT	2	8	10438	10445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014749	AAAG	2	8	10514	10521	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014749	TTCC	2	8	10579	10586	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014749	TATG	2	8	10900	10907	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014749	TTAC	2	8	11102	11109	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014749	GAGT	2	8	11708	11715	25 %	25 %	50 %	0 %	313652029
34	NC_014749	GATT	2	8	12465	12472	25 %	50 %	25 %	0 %	313652029
35	NC_014749	AGGA	2	8	12905	12912	50 %	0 %	50 %	0 %	313652030
36	NC_014749	TAAA	2	8	13330	13337	75 %	25 %	0 %	0 %	313652030
37	NC_014749	TTTA	2	8	13363	13370	25 %	75 %	0 %	0 %	313652030
38	NC_014749	AATG	2	8	13646	13653	50 %	25 %	25 %	0 %	313652030
39	NC_014749	TTAT	2	8	14837	14844	25 %	75 %	0 %	0 %	313652030
40	NC_014749	GGAT	2	8	14921	14928	25 %	25 %	50 %	0 %	313652030
41	NC_014749	AAGA	2	8	15654	15661	75 %	0 %	25 %	0 %	313652031
42	NC_014749	AATG	2	8	15864	15871	50 %	25 %	25 %	0 %	313652031
43	NC_014749	AAAG	2	8	16257	16264	75 %	0 %	25 %	0 %	313652031
44	NC_014749	CTTT	2	8	16353	16360	0 %	75 %	0 %	25 %	313652031
45	NC_014749	GAAA	2	8	16481	16488	75 %	0 %	25 %	0 %	313652031
46	NC_014749	GAAA	2	8	16528	16535	75 %	0 %	25 %	0 %	313652032
47	NC_014749	AATT	2	8	16635	16642	50 %	50 %	0 %	0 %	313652032
48	NC_014749	ATGA	2	8	16860	16867	50 %	25 %	25 %	0 %	313652033
49	NC_014749	GAAA	2	8	17045	17052	75 %	0 %	25 %	0 %	313652033
50	NC_014749	TTAT	2	8	17524	17531	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014749	AGAA	2	8	17559	17566	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014749	TTAC	2	8	17707	17714	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014749	GATC	2	8	18218	18225	25 %	25 %	25 %	25 %	313652034
54	NC_014749	AATG	2	8	18546	18553	50 %	25 %	25 %	0 %	313652034
55	NC_014749	GATA	2	8	18931	18938	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014749	ATTC	2	8	18984	18991	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_014749	TAAT	2	8	19750	19757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014749	CATG	2	8	19792	19799	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_014749	AATG	2	8	20242	20249	50 %	25 %	25 %	0 %	313652036
60	NC_014749	TTTA	2	8	20269	20276	25 %	75 %	0 %	0 %	313652036
61	NC_014749	TAAA	2	8	20712	20719	75 %	25 %	0 %	0 %	313652036
62	NC_014749	AGAT	2	8	20877	20884	50 %	25 %	25 %	0 %	313652036
63	NC_014749	TTTC	2	8	21153	21160	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014749	TGAT	2	8	21476	21483	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014749	AAAT	2	8	21846	21853	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014749	TCAG	2	8	22017	22024	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_014749	ACAA	2	8	22261	22268	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_014749	GATT	2	8	22371	22378	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014749	TAAA	2	8	23464	23471	75 %	25 %	0 %	0 %	313652037
70	NC_014749	TGAT	2	8	23971	23978	25 %	50 %	25 %	0 %	313652037
71	NC_014749	ACTA	2	8	24025	24032	50 %	25 %	0 %	25 %	313652037
72	NC_014749	TGGA	2	8	24062	24069	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014749	ATTG	2	8	25042	25049	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014749	CTTC	2	8	25237	25244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014749	ACTA	2	8	25481	25488	50 %	25 %	0 %	25 %	313652039
76	NC_014749	ATTT	2	8	25508	25515	25 %	75 %	0 %	0 %	313652039
77	NC_014749	ATAA	2	8	25575	25582	75 %	25 %	0 %	0 %	313652039
78	NC_014749	TTTG	2	8	26160	26167	0 %	75 %	25 %	0 %	313652039
79	NC_014749	AATC	2	8	26261	26268	50 %	25 %	0 %	25 %	313652040
80	NC_014749	TTTA	2	8	26463	26470	25 %	75 %	0 %	0 %	313652040
81	NC_014749	TTTA	2	8	26535	26542	25 %	75 %	0 %	0 %	313652040
82	NC_014749	AATC	2	8	26783	26790	50 %	25 %	0 %	25 %	313652040
83	NC_014749	TGTT	2	8	26958	26965	0 %	75 %	25 %	0 %	313652040
84	NC_014749	ATCA	2	8	27006	27013	50 %	25 %	0 %	25 %	313652040
85	NC_014749	TATT	2	8	27277	27284	25 %	75 %	0 %	0 %	313652041
86	NC_014749	TATT	2	8	28310	28317	25 %	75 %	0 %	0 %	313652041
87	NC_014749	TGTA	2	8	28546	28553	25 %	50 %	25 %	0 %	313652041
88	NC_014749	TTTA	2	8	28614	28621	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014749	TAAA	2	8	29018	29025	75 %	25 %	0 %	0 %	313652042
90	NC_014749	ATAC	2	8	29148	29155	50 %	25 %	0 %	25 %	313652042
91	NC_014749	GATT	2	8	29282	29289	25 %	50 %	25 %	0 %	313652042
92	NC_014749	GAAA	2	8	29414	29421	75 %	0 %	25 %	0 %	313652042
93	NC_014749	TTTG	2	8	29504	29511	0 %	75 %	25 %	0 %	313652043
94	NC_014749	AAGA	2	8	29588	29595	75 %	0 %	25 %	0 %	313652043
95	NC_014749	ATCT	2	8	30252	30259	25 %	50 %	0 %	25 %	313652043
96	NC_014749	ATCA	2	8	30392	30399	50 %	25 %	0 %	25 %	313652043
97	NC_014749	TGGT	2	8	30622	30629	0 %	50 %	50 %	0 %	313652043
98	NC_014749	TTTC	2	8	30774	30781	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_014749	AGAT	2	8	30866	30873	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014749	TTTA	2	8	31258	31265	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014749	TAAT	2	8	31418	31425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014749	CCAT	2	8	31705	31712	25 %	25 %	0 %	50 %	313652045
103	NC_014749	GTAT	2	8	32271	32278	25 %	50 %	25 %	0 %	313652045
104	NC_014749	AAAT	2	8	32375	32382	75 %	25 %	0 %	0 %	313652045
105	NC_014749	ATTT	2	8	32694	32701	25 %	75 %	0 %	0 %	313652046
106	NC_014749	CTTT	2	8	33081	33088	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_014749	CACC	2	8	33423	33430	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
108	NC_014749	TGCT	2	8	33552	33559	0 %	50 %	25 %	25 %	313652047
109	NC_014749	AAAG	2	8	35175	35182	75 %	0 %	25 %	0 %	313652049
110	NC_014749	AGAA	2	8	35407	35414	75 %	0 %	25 %	0 %	313652049
111	NC_014749	TCTT	2	8	35580	35587	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014749	TAGA	2	8	36036	36043	50 %	25 %	25 %	0 %	313652050
113	NC_014749	TATT	2	8	36444	36451	25 %	75 %	0 %	0 %	313652051
114	NC_014749	TTTA	2	8	36607	36614	25 %	75 %	0 %	0 %	313652051
115	NC_014749	TAAT	2	8	36845	36852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014749	TTAC	2	8	37393	37400	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_014749	GAGT	2	8	37999	38006	25 %	25 %	50 %	0 %	313652054
118	NC_014749	GATT	2	8	38756	38763	25 %	50 %	25 %	0 %	313652054
119	NC_014749	ATTT	2	8	39469	39476	25 %	75 %	0 %	0 %	313652055
120	NC_014749	AAGC	2	8	40005	40012	50 %	0 %	25 %	25 %	313652055
121	NC_014749	ACAG	2	8	40547	40554	50 %	0 %	25 %	25 %	313652055
122	NC_014749	TAAT	2	8	40928	40935	50 %	50 %	0 %	0 %	313652056
123	NC_014749	ATGG	2	8	41038	41045	25 %	25 %	50 %	0 %	313652056
124	NC_014749	TAAT	2	8	41423	41430	50 %	50 %	0 %	0 %	313652056
125	NC_014749	ATAA	2	8	41447	41454	75 %	25 %	0 %	0 %	313652056
126	NC_014749	TGAA	2	8	42158	42165	50 %	25 %	25 %	0 %	313652057
127	NC_014749	TGGG	2	8	42639	42646	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014749	ATAA	2	8	42981	42988	75 %	25 %	0 %	0 %	313652058
129	NC_014749	TAAA	2	8	44987	44994	75 %	25 %	0 %	0 %	313652059
130	NC_014749	CTGG	2	8	45489	45496	0 %	25 %	50 %	25 %	313652060
131	NC_014749	AAAC	2	8	46236	46243	75 %	0 %	0 %	25 %	313652061
132	NC_014749	CTTT	2	8	46949	46956	0 %	75 %	0 %	25 %	313652062
133	NC_014749	CAGA	2	8	46998	47005	50 %	0 %	25 %	25 %	313652062
134	NC_014749	TAAA	2	8	47163	47170	75 %	25 %	0 %	0 %	313652062
135	NC_014749	ATGA	2	8	47360	47367	50 %	25 %	25 %	0 %	313652062
136	NC_014749	GATA	2	8	47467	47474	50 %	25 %	25 %	0 %	313652062
137	NC_014749	AAAT	2	8	47708	47715	75 %	25 %	0 %	0 %	313652063
138	NC_014749	AATT	2	8	48274	48281	50 %	50 %	0 %	0 %	313652063
139	NC_014749	TATC	2	8	48930	48937	25 %	50 %	0 %	25 %	313652064
140	NC_014749	AAAG	2	8	48991	48998	75 %	0 %	25 %	0 %	313652065
141	NC_014749	AAGT	2	8	50184	50191	50 %	25 %	25 %	0 %	313652066
142	NC_014749	ATAA	2	8	50273	50280	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014749	ACAA	2	8	50388	50395	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_014749	TTAA	2	8	50741	50748	50 %	50 %	0 %	0 %	313652067
145	NC_014749	AGTA	2	8	51190	51197	50 %	25 %	25 %	0 %	313652067
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165	NC_014749	TATC	2	8	56431	56438	25 %	50 %	0 %	25 %	313652073
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167	NC_014749	GGTA	2	8	57480	57487	25 %	25 %	50 %	0 %	313652075
168	NC_014749	TTAC	2	8	57862	57869	25 %	50 %	0 %	25 %	313652075
169	NC_014749	TACT	2	8	58198	58205	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
170	NC_014749	TCTG	2	8	58632	58639	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.