MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Calditerrivibrio nitroreducens DSM 19672 plasmid pCALNI01

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014749	TCGC	2	8	490	497	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014749	ACTT	2	8	7914	7921	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014749	TTAT	2	8	8120	8127	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014749	TAAA	2	8	9905	9912	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014749	TAAT	2	8	10438	10445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014749	AAAG	2	8	10514	10521	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014749	TTCC	2	8	10579	10586	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014749	TATG	2	8	10900	10907	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014749	TTAC	2	8	11102	11109	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014749	TTAT	2	8	17524	17531	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014749	AGAA	2	8	17559	17566	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014749	TTAC	2	8	17707	17714	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014749	GATA	2	8	18931	18938	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014749	ATTC	2	8	18984	18991	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014749	TAAT	2	8	19750	19757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014749	CATG	2	8	19792	19799	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014749	TTTC	2	8	21153	21160	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014749	TGAT	2	8	21476	21483	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014749	AAAT	2	8	21846	21853	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014749	TCAG	2	8	22017	22024	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014749	ACAA	2	8	22261	22268	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014749	GATT	2	8	22371	22378	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014749	TGGA	2	8	24062	24069	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014749	ATTG	2	8	25042	25049	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014749	CTTC	2	8	25237	25244	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014749	TTTA	2	8	28614	28621	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014749	TTTC	2	8	30774	30781	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014749	AGAT	2	8	30866	30873	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014749	TTTA	2	8	31258	31265	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014749	TAAT	2	8	31418	31425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014749	CTTT	2	8	33081	33088	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014749	CACC	2	8	33423	33430	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
33	NC_014749	TCTT	2	8	35580	35587	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014749	TAAT	2	8	36845	36852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014749	TTAC	2	8	37393	37400	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014749	TGGG	2	8	42639	42646	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014749	ATAA	2	8	50273	50280	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014749	ACAA	2	8	50388	50395	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014749	TACT	2	8	58198	58205	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014749	TCTG	2	8	58632	58639	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.