MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Riemerella anatipestifer ATCC 11845 = DSM 15868 chromosome

Total Repeats: 1047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014738	TAGTCC	2	12	2888	2899	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	313205515
2	NC_014738	GATTAA	2	12	6395	6406	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	313205518
3	NC_014738	TCTAAA	2	12	6850	6861	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	313205518
4	NC_014738	TGCATT	2	12	9540	9551	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	313205519
5	NC_014738	CAAACT	2	12	10434	10445	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	313205520
6	NC_014738	CTAAAA	2	12	11201	11212	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	313205521
7	NC_014738	ACTCCA	2	12	11953	11964	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	313205523
8	NC_014738	ATAAGA	2	12	12658	12669	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	313205523
9	NC_014738	GGATAC	2	12	14314	14325	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	313205525
10	NC_014738	GTAAAT	2	12	16072	16083	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	313205527
11	NC_014738	CTTTTT	2	12	20447	20458	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	313205533
12	NC_014738	CCAAAA	2	12	22664	22675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313205535
13	NC_014738	TCTAAC	2	12	23743	23754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205535
14	NC_014738	AATGCT	2	12	24967	24978	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	313205535
15	NC_014738	TACAGA	2	12	26537	26548	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	313205536
16	NC_014738	AGAATA	2	12	27385	27396	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	313205537
17	NC_014738	GTAAAT	2	12	30216	30227	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	313205538
18	NC_014738	ATCTAA	2	12	37735	37746	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	313205545
19	NC_014738	GTAATG	2	12	39994	40005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205546
20	NC_014738	AGCATT	2	12	42516	42527	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	313205548
21	NC_014738	AGCTCC	2	12	44285	44296	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	313205549
22	NC_014738	GGACAG	2	12	47974	47985	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014738	TGTCTG	2	12	49814	49825	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_014738	ATAGCC	2	12	50811	50822	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	313205551
25	NC_014738	CCTGTG	2	12	56302	56313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313205558
26	NC_014738	TGGTGC	2	12	57773	57784	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	313205560
27	NC_014738	TATAGA	2	12	60447	60458	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	313205563
28	NC_014738	GTTAAA	2	12	63993	64004	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	313205566
29	NC_014738	TATGGG	2	12	68035	68046	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	313205569
30	NC_014738	CAAAAA	2	12	68786	68797	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	313205570
31	NC_014738	TTAGAG	2	12	71104	71115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205571
32	NC_014738	GTTTGG	2	12	71479	71490	0 %	50 %	50 %	0 %	313205572
33	NC_014738	AATGTA	2	12	72518	72529	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	313205573
34	NC_014738	CGTCAG	2	12	72919	72930	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	313205574
35	NC_014738	TTTGTT	2	12	73190	73201	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	313205574
36	NC_014738	TTGGCT	2	12	75048	75059	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	313205576
37	NC_014738	CATTTC	2	12	79978	79989	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	313205582
38	NC_014738	TTCTTT	2	12	81921	81932	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	313205585
39	NC_014738	ATAAAA	2	12	84135	84146	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014738	AAACTG	2	12	85056	85067	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	313205588
41	NC_014738	ATGAAA	2	12	86772	86783	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	313205589
42	NC_014738	GCTAGA	2	12	89112	89123	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	313205591
43	NC_014738	TGAAAG	2	12	97404	97415	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	313205598
44	NC_014738	TTAGGA	2	12	99434	99445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205599
45	NC_014738	TTAGCA	2	12	99461	99472	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	313205599
46	NC_014738	ATGCTT	2	12	100840	100851	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	313205600
47	NC_014738	TCCTTA	2	12	104879	104890	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	313205604
48	NC_014738	TTTATT	2	12	107078	107089	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	313205605
49	NC_014738	AAGAAA	2	12	108904	108915	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	313205607
50	NC_014738	TCTTTT	2	12	109789	109800	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_014738	TGAAAA	2	12	110196	110207	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	313205608
52	NC_014738	TTTAAC	2	12	112980	112991	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	313205608
53	NC_014738	AGGAGA	2	12	116571	116582	50 %	0 %	50 %	0 %	313205614
54	NC_014738	ATTCTA	2	12	121714	121725	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_014738	ACTAAA	2	12	123363	123374	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	313205622
56	NC_014738	GTTTTC	2	12	124703	124714	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	313205624
57	NC_014738	ATCTAC	2	12	125519	125530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205624
58	NC_014738	ATTTCA	2	12	128300	128311	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	313205627
59	NC_014738	ATTAGC	2	12	129361	129372	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	313205628
60	NC_014738	GGTTAG	2	12	130234	130245	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	313205629
61	NC_014738	GATTTA	2	12	130399	130410	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014738	GTTTTG	2	12	132183	132194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313205631
63	NC_014738	AAATTA	2	12	137759	137770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205635
64	NC_014738	TAAACT	2	12	138912	138923	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	313205637
65	NC_014738	TAGGTT	2	12	142396	142407	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	313205641
66	NC_014738	GTTCAG	2	12	145697	145708	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	313205645
67	NC_014738	AGGCAA	2	12	147904	147915	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	313205648
68	NC_014738	TAGTGG	2	12	148367	148378	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	313205648
69	NC_014738	TTAAAA	2	12	148802	148813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014738	ATTATA	2	12	150129	150140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014738	AAGATA	2	12	150684	150695	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	313205650
72	NC_014738	AGTAAA	2	12	151743	151754	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	313205650
73	NC_014738	TGCGGG	2	12	152098	152109	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	313205651
74	NC_014738	GCTTTA	2	12	155172	155183	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	313205654
75	NC_014738	TAAAAC	2	12	156002	156013	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_014738	GCATCT	2	12	156242	156253	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	313205655
77	NC_014738	CTTTTT	2	12	158458	158469	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	313205658
78	NC_014738	AAAATA	2	12	162814	162825	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	313205663
79	NC_014738	GCTAAA	2	12	163065	163076	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	313205663
80	NC_014738	GGTGCT	2	12	165005	165016	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	313205666
81	NC_014738	AATAAA	2	12	167710	167721	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	313205668
82	NC_014738	TCAATA	2	12	167853	167864	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	313205668
83	NC_014738	TCTTCG	2	12	168829	168840	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	313205668
84	NC_014738	TAATCA	2	12	169083	169094	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	313205668
85	NC_014738	TAAAGC	2	12	170439	170450	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	313205668
86	NC_014738	GCTGAT	2	12	171259	171270	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	313205669
87	NC_014738	ATTTGG	2	12	171458	171469	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	313205669
88	NC_014738	TAACCT	2	12	173044	173055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205671
89	NC_014738	ACGGTA	2	12	174720	174731	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	313205672
90	NC_014738	AAACAT	2	12	177689	177700	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_014738	AGTATT	2	12	185659	185670	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	313205687
92	NC_014738	CTTTTT	2	12	190871	190882	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	313205690
93	NC_014738	AAAATA	2	12	191297	191308	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	313205690
94	NC_014738	ATAAAA	2	12	191375	191386	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014738	TCAAAA	2	12	191964	191975	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	313205691
96	NC_014738	ACCTAA	2	12	192820	192831	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	313205691
97	NC_014738	AGGTAC	2	12	193572	193583	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	313205692
98	NC_014738	TGGAGT	2	12	194337	194348	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	313205692
99	NC_014738	TGAAGA	2	12	196581	196592	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	313205692
100	NC_014738	TACTTA	2	12	197340	197351	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	313205692
101	NC_014738	GGAGCA	2	12	198549	198560	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_014738	ATTTCT	2	12	202317	202328	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	313205695
103	NC_014738	TAAAAA	2	12	204448	204459	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014738	TTACAT	2	12	205599	205610	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_014738	AGCTCT	2	12	206629	206640	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	313205697
106	NC_014738	TAAAGG	2	12	211247	211258	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	313205699
107	NC_014738	ATGAAA	2	12	211363	211374	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	313205699
108	NC_014738	GAGGAA	2	12	211825	211836	50 %	0 %	50 %	0 %	313205700
109	NC_014738	TTTCTT	2	12	214268	214279	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	313205701
110	NC_014738	AGGTAC	2	12	215487	215498	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	313205702
111	NC_014738	AGGTGA	2	12	218063	218074	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	313205703
112	NC_014738	TGTTGA	2	12	218636	218647	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	313205703
113	NC_014738	TTCTAA	2	12	219119	219130	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	313205703
114	NC_014738	TACTTA	2	12	219257	219268	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	313205703
115	NC_014738	TTATAG	2	12	220636	220647	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	313205705
116	NC_014738	AACGAA	2	12	221016	221027	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	313205705
117	NC_014738	TTTTTA	2	12	221265	221276	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	313205705
118	NC_014738	TACATT	2	12	222533	222544	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	313205707
119	NC_014738	TAGAAT	2	12	224167	224178	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	313205708
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121	NC_014738	AACACA	2	12	229798	229809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313205711
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216	NC_014738	CTAAAA	2	12	449830	449841	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	313205911
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219	NC_014738	TTTAAA	2	12	455577	455588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
220	NC_014738	CCTCAT	2	12	456433	456444	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	313205919
221	NC_014738	TAAAAA	2	12	458462	458473	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	313205921
222	NC_014738	TTTTAG	2	12	458521	458532	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	313205922
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224	NC_014738	TTTACT	2	12	460950	460961	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	313205925
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226	NC_014738	ATTGCT	2	12	464741	464752	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	313205928
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228	NC_014738	TATCCT	2	12	469060	469071	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	313205931
229	NC_014738	TTTTTA	2	12	471672	471683	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
230	NC_014738	CTAGCT	2	12	475148	475159	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	313205936
231	NC_014738	GGCAAG	2	12	475819	475830	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	313205937
232	NC_014738	TCTACC	2	12	479042	479053	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	313205940
233	NC_014738	CGTGAG	2	12	483484	483495	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	313205943
234	NC_014738	TTTTAA	2	12	485489	485500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205945
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236	NC_014738	ATCTAT	2	12	488711	488722	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	313205949
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238	NC_014738	TTGAAT	2	12	489371	489382	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	313205949
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346	NC_014738	CGAAGG	2	12	713091	713102	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	313206154
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