MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Riemerella anatipestifer ATCC 11845 = DSM 15868 chromosome

Total Repeats: 119

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014738	GGACAG	2	12	47974	47985	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014738	TGTCTG	2	12	49814	49825	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014738	ATAAAA	2	12	84135	84146	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014738	TCTTTT	2	12	109789	109800	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014738	ATTCTA	2	12	121714	121725	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_014738	GATTTA	2	12	130399	130410	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014738	TTAAAA	2	12	148802	148813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014738	ATTATA	2	12	150129	150140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014738	TAAAAC	2	12	156002	156013	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014738	AAACAT	2	12	177689	177700	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014738	ATAAAA	2	12	191375	191386	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014738	GGAGCA	2	12	198549	198560	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_014738	TAAAAA	2	12	204448	204459	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014738	TTACAT	2	12	205599	205610	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014738	TAAATA	2	12	280462	280473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014738	TTTACA	2	12	285015	285026	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014738	CAATTA	2	12	285055	285066	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014738	GTTTTT	2	12	305462	305473	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014738	GTAAAT	2	12	308411	308422	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014738	AATAAA	2	12	324152	324163	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014738	TAAAAA	2	12	338207	338218	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014738	TAATTT	2	12	374217	374228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014738	TTTATT	2	12	396144	396155	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014738	ATTTTT	2	12	445924	445935	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014738	TTTAAA	2	12	455577	455588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014738	TTTTTA	2	12	471672	471683	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014738	TTATAT	2	12	491082	491093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014738	TGTACT	2	12	527949	527960	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_014738	TAATTT	2	12	595338	595349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014738	ATTTAA	2	12	607334	607345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014738	GCGGAG	2	12	623443	623454	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014738	AAATAA	2	12	631450	631461	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014738	TATTTT	2	12	670836	670847	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014738	AAAAAT	2	12	679532	679543	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014738	ACAAAA	2	12	715972	715983	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_014738	AAACTA	2	12	728593	728604	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_014738	TATCTT	2	12	739479	739490	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014738	ATAAAA	2	12	759122	759133	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014738	TTTATT	2	12	764792	764803	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014738	ATAAAT	2	12	766832	766843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014738	AAATTA	2	12	789455	789466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014738	TTAATT	2	12	854980	854991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014738	TTATTT	2	12	863067	863078	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014738	GTTTTG	2	12	889348	889359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014738	TCGCTT	2	12	891907	891918	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014738	ATTATG	2	12	907891	907902	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014738	ATTAAA	2	12	912495	912506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014738	TACTTT	2	12	952448	952459	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014738	CCAAAA	2	12	952576	952587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014738	TTTTCT	2	12	952622	952633	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_014738	TAAAAA	2	12	961320	961331	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014738	TAAAAA	2	12	961393	961404	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014738	TTAAAA	2	12	970930	970941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014738	TTAAAG	2	12	979321	979332	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014738	CATAAA	2	12	1016754	1016765	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014738	GAAATA	2	12	1035697	1035708	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014738	TAAAAA	2	12	1060924	1060935	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014738	ATTTGA	2	12	1134569	1134580	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014738	TCGCTT	2	12	1156386	1156397	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014738	ATTTTA	2	12	1193024	1193035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014738	TTTTAA	2	12	1229491	1229502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014738	TTGAAT	2	12	1239848	1239859	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014738	TATTCA	2	12	1268916	1268927	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_014738	TTTTTA	2	12	1307912	1307923	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014738	AGTAAA	2	12	1308501	1308512	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014738	TAAAAA	2	12	1324199	1324210	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014738	TTATAG	2	12	1334791	1334802	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014738	TGTTTT	2	12	1349662	1349673	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014738	ATTTTT	2	12	1380183	1380194	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014738	ATTTAA	2	12	1381912	1381923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014738	TTCTTT	2	12	1392874	1392885	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_014738	TAAAAG	2	12	1418754	1418765	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014738	TAAAGA	2	12	1471796	1471807	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014738	AATTAA	2	12	1488260	1488271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014738	TTAATG	2	12	1505019	1505030	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014738	TAAAAA	2	12	1507135	1507146	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014738	AAAATT	2	12	1509974	1509985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014738	CTTTTT	2	12	1514599	1514610	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_014738	TTTTTG	2	12	1532905	1532916	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014738	TAAAAT	2	12	1613319	1613330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014738	TGTTTT	2	12	1640363	1640374	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014738	TTTATT	2	12	1641699	1641710	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014738	TTTTAA	2	12	1642622	1642633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014738	TTAAAA	2	12	1647146	1647157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014738	TCAATT	2	12	1662150	1662161	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_014738	TCTAAA	2	12	1664682	1664693	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_014738	AAGCGA	2	12	1680050	1680061	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014738	TTGTAT	2	12	1748370	1748381	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014738	GGGGTG	2	12	1762640	1762651	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014738	CCACAG	2	12	1762675	1762686	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
91	NC_014738	AAAATT	2	12	1771650	1771661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014738	TTTTAC	2	12	1793925	1793936	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_014738	AAAATT	2	12	1797323	1797334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014738	AAAAAT	2	12	1797514	1797525	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014738	CCCTTA	2	12	1840582	1840593	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_014738	TTTATT	2	12	1843292	1843303	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014738	TTTTAT	2	12	1920101	1920112	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014738	TATTCT	2	12	1928038	1928049	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_014738	TAAAAA	2	12	1943208	1943219	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014738	TAAAAT	2	12	1978561	1978572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014738	TAAAGA	2	12	1991403	1991414	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014738	TAATTA	2	12	2002554	2002565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014738	TAAAGA	2	12	2003879	2003890	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014738	TAAAGA	2	12	2005969	2005980	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014738	GAAATG	2	12	2011457	2011468	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014738	TGGAGT	2	12	2011832	2011843	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014738	TGAAAA	2	12	2012464	2012475	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014738	AATTGC	2	12	2012987	2012998	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_014738	TAAAGA	2	12	2020597	2020608	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014738	TCAAAT	2	12	2041290	2041301	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_014738	TTTTAT	3	18	2049002	2049019	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014738	TAGAAA	2	12	2059305	2059316	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014738	TAAAGT	2	12	2068407	2068418	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014738	TTTAGT	2	12	2082833	2082844	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014738	AAAAAG	2	12	2094007	2094018	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014738	AAATAT	2	12	2094144	2094155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014738	TTTAAC	2	12	2116676	2116687	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_014738	GATTTT	2	12	2124093	2124104	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014738	TACCTT	2	12	2133828	2133839	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.