MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Riemerella anatipestifer ATCC 11845 = DSM 15868 chromosome

Total Repeats: 28426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014738	ACA	2	6	11	16	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313205512
2	NC_014738	ATT	2	6	34	39	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205512
3	NC_014738	TGT	2	6	128	133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313205512
4	NC_014738	TAA	2	6	162	167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205512
5	NC_014738	ATT	2	6	231	236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205512
6	NC_014738	CAG	2	6	239	244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313205512
7	NC_014738	ACA	3	9	324	332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313205512
8	NC_014738	GTA	2	6	427	432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205512
9	NC_014738	TAA	2	6	510	515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205512
10	NC_014738	CTG	2	6	527	532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313205512
11	NC_014738	CTT	2	6	563	568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205512
12	NC_014738	TGG	2	6	588	593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313205512
13	NC_014738	ATT	2	6	671	676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205512
14	NC_014738	ATC	2	6	678	683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205512
15	NC_014738	CAG	2	6	697	702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313205512
16	NC_014738	AGA	2	6	747	752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313205512
17	NC_014738	GAT	2	6	793	798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205512
18	NC_014738	TTC	2	6	838	843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205512
19	NC_014738	CAG	2	6	905	910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313205512
20	NC_014738	GAG	2	6	925	930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313205512
21	NC_014738	AGT	2	6	933	938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205512
22	NC_014738	CGG	2	6	962	967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313205512
23	NC_014738	AGA	2	6	994	999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313205512
24	NC_014738	CTA	2	6	1130	1135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205512
25	NC_014738	TTA	2	6	1208	1213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205512
26	NC_014738	AGG	2	6	1229	1234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313205512
27	NC_014738	ATT	2	6	1269	1274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205512
28	NC_014738	GAG	2	6	1369	1374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313205512
29	NC_014738	AAT	2	6	1490	1495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205512
30	NC_014738	AGA	2	6	1665	1670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313205513
31	NC_014738	CAG	2	6	1685	1690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313205513
32	NC_014738	GAG	2	6	1876	1881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313205513
33	NC_014738	AAT	2	6	1912	1917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205513
34	NC_014738	TTA	2	6	1935	1940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205513
35	NC_014738	TGG	2	6	1941	1946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313205513
36	NC_014738	AGA	2	6	2063	2068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313205514
37	NC_014738	TAT	2	6	2093	2098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205514
38	NC_014738	ATT	2	6	2122	2127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205514
39	NC_014738	TGA	2	6	2260	2265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205514
40	NC_014738	TAT	2	6	2393	2398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205514
41	NC_014738	AGC	2	6	2500	2505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313205514
42	NC_014738	GAA	2	6	2640	2645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313205514
43	NC_014738	TTA	2	6	2647	2652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205514
44	NC_014738	GAA	2	6	2675	2680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313205514
45	NC_014738	CTA	2	6	2728	2733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205514
46	NC_014738	AAT	2	6	2936	2941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205515
47	NC_014738	GTT	2	6	2965	2970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313205515
48	NC_014738	TGT	2	6	3036	3041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313205515
49	NC_014738	ATT	2	6	3189	3194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205516
50	NC_014738	ATC	2	6	3218	3223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205516
51	NC_014738	TAA	2	6	3385	3390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205516
52	NC_014738	TCA	2	6	3539	3544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205516
53	NC_014738	AGT	2	6	3549	3554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205516
54	NC_014738	CTT	2	6	3605	3610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014738	TTA	2	6	3623	3628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205517
56	NC_014738	GTC	2	6	3716	3721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313205517
57	NC_014738	TCT	2	6	3747	3752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205517
58	NC_014738	TGT	2	6	3781	3786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313205517
59	NC_014738	TAC	2	6	3797	3802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205517
60	NC_014738	CTT	2	6	3847	3852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205517
61	NC_014738	AGA	2	6	3932	3937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313205517
62	NC_014738	AAT	2	6	3944	3949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205517
63	NC_014738	AAT	2	6	4051	4056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205517
64	NC_014738	TAT	2	6	4117	4122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014738	TTA	2	6	4175	4180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014738	GAA	2	6	4290	4295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313205518
67	NC_014738	CAT	2	6	4415	4420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205518
68	NC_014738	ATT	2	6	4467	4472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205518
69	NC_014738	GCT	2	6	4655	4660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313205518
70	NC_014738	AGA	2	6	4666	4671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313205518
71	NC_014738	CCT	2	6	4717	4722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313205518
72	NC_014738	CTT	2	6	4811	4816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205518
73	NC_014738	GGA	2	6	4912	4917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313205518
74	NC_014738	TCA	2	6	4994	4999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205518
75	NC_014738	ATT	2	6	5001	5006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205518
76	NC_014738	ATC	2	6	5178	5183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205518
77	NC_014738	AAG	2	6	5487	5492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313205518
78	NC_014738	TAA	2	6	5510	5515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205518
79	NC_014738	GTC	2	6	5541	5546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313205518
80	NC_014738	TTC	2	6	5585	5590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205518
81	NC_014738	ATT	2	6	5607	5612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205518
82	NC_014738	TCA	2	6	5650	5655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205518
83	NC_014738	ATA	2	6	5658	5663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205518
84	NC_014738	TGT	2	6	5729	5734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313205518
85	NC_014738	GAA	2	6	5923	5928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313205518
86	NC_014738	TGA	2	6	5981	5986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205518
87	NC_014738	CTT	2	6	6122	6127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205518
88	NC_014738	GTC	2	6	6225	6230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313205518
89	NC_014738	TCT	2	6	6571	6576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205518
90	NC_014738	TAT	2	6	6647	6652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205518
91	NC_014738	AGT	2	6	6901	6906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205518
92	NC_014738	CTA	2	6	6974	6979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205518
93	NC_014738	CTG	2	6	7211	7216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313205518
94	NC_014738	TCA	2	6	7282	7287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205518
95	NC_014738	ATT	2	6	7344	7349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205518
96	NC_014738	TGG	2	6	7481	7486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313205518
97	NC_014738	TAA	2	6	7509	7514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205518
98	NC_014738	ATC	2	6	7659	7664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205518
99	NC_014738	GAT	2	6	7795	7800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205518
100	NC_014738	TTA	2	6	7852	7857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205518
101	NC_014738	TTG	2	6	7981	7986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313205518
102	NC_014738	GTA	2	6	8036	8041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205518
103	NC_014738	TGA	2	6	8057	8062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205518
104	NC_014738	TAA	2	6	8297	8302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205518
105	NC_014738	TAA	2	6	8519	8524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205518
106	NC_014738	AAT	2	6	8579	8584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205518
107	NC_014738	CAA	2	6	8733	8738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313205518
108	NC_014738	CCA	2	6	8748	8753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313205518
109	NC_014738	TTC	2	6	8793	8798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205518
110	NC_014738	TGT	2	6	8869	8874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313205518
111	NC_014738	TTA	3	9	8923	8931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205518
112	NC_014738	TAT	2	6	8961	8966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205519
113	NC_014738	TGA	2	6	8988	8993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205519
114	NC_014738	TAT	2	6	9006	9011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205519
115	NC_014738	TGG	2	6	9069	9074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313205519
116	NC_014738	ACA	2	6	9156	9161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313205519
117	NC_014738	TAG	2	6	9218	9223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205519
118	NC_014738	AGA	2	6	9315	9320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313205519
119	NC_014738	GTG	2	6	9368	9373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313205519
120	NC_014738	GAT	2	6	9381	9386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205519
121	NC_014738	ATT	2	6	9418	9423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205519
122	NC_014738	TGC	2	6	9441	9446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313205519
123	NC_014738	CTG	2	6	9494	9499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313205519
124	NC_014738	TAA	2	6	9552	9557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205519
125	NC_014738	GAT	2	6	9667	9672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205519
126	NC_014738	ATT	2	6	9697	9702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205519
127	NC_014738	TGA	2	6	9710	9715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205519
128	NC_014738	TGG	2	6	9768	9773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313205519
129	NC_014738	ATT	2	6	9992	9997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205520
130	NC_014738	TAA	2	6	10024	10029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205520
131	NC_014738	TGA	2	6	10037	10042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205520
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258	NC_014738	TAA	2	6	18569	18574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205530
259	NC_014738	TGG	2	6	18716	18721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313205530
260	NC_014738	CAT	2	6	18724	18729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205530
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