MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Riemerella anatipestifer ATCC 11845 = DSM 15868 chromosome

Total Repeats: 456

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014738	GA	3	6	15606	15611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014738	TA	3	6	18963	18968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014738	GA	3	6	22431	22436	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014738	AT	3	6	22499	22504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014738	TA	3	6	26996	27001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014738	TA	3	6	29245	29250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014738	AG	4	8	29281	29288	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014738	GA	3	6	41669	41674	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014738	CT	3	6	41817	41822	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014738	AT	3	6	41928	41933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014738	AG	4	8	42156	42163	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014738	TA	3	6	44519	44524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014738	TA	3	6	45572	45577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014738	AG	3	6	46732	46737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014738	AT	3	6	46930	46935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014738	AG	3	6	47337	47342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014738	AT	3	6	47520	47525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014738	AT	3	6	47996	48001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014738	TC	3	6	48557	48562	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_014738	TC	3	6	48679	48684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014738	AG	3	6	48706	48711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014738	TG	3	6	48813	48818	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014738	CA	3	6	48981	48986	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_014738	AG	3	6	49189	49194	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014738	AT	3	6	49365	49370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014738	AT	4	8	52263	52270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014738	AT	3	6	52313	52318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014738	CT	3	6	54531	54536	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014738	TA	3	6	55759	55764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014738	CA	3	6	59967	59972	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014738	AT	3	6	60061	60066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014738	TA	3	6	76705	76710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014738	TA	3	6	84175	84180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014738	TC	3	6	89264	89269	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014738	TA	3	6	89377	89382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014738	AT	3	6	95498	95503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014738	TA	3	6	100611	100616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014738	AT	3	6	113372	113377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014738	GA	3	6	113429	113434	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014738	AT	4	8	119177	119184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014738	TA	3	6	120608	120613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014738	TA	3	6	125903	125908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014738	TC	3	6	159603	159608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_014738	TG	3	6	159710	159715	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014738	AT	3	6	177569	177574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014738	AT	3	6	182455	182460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014738	TA	3	6	187300	187305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014738	AT	3	6	192953	192958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014738	AT	4	8	193001	193008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014738	AT	4	8	197751	197758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014738	AG	3	6	198156	198161	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014738	AT	3	6	198464	198469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014738	CT	3	6	204944	204949	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_014738	TC	3	6	205109	205114	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_014738	TG	3	6	205119	205124	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014738	CA	3	6	205438	205443	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_014738	TA	3	6	205654	205659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014738	TA	3	6	205732	205737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014738	AT	3	6	214794	214799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014738	AT	3	6	214921	214926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014738	AC	3	6	214978	214983	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_014738	AT	3	6	214998	215003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014738	AT	3	6	219675	219680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014738	AT	3	6	219704	219709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014738	TA	3	6	225769	225774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014738	GA	3	6	225882	225887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014738	AT	4	8	240677	240684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014738	TA	3	6	241552	241557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014738	TA	3	6	242006	242011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014738	TA	4	8	243601	243608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014738	CA	3	6	243817	243822	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_014738	TA	3	6	253411	253416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014738	TA	4	8	256024	256031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014738	AT	3	6	264249	264254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014738	AT	4	8	267431	267438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014738	AT	3	6	274143	274148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014738	TA	3	6	279257	279262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014738	AT	3	6	293749	293754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014738	AG	3	6	294349	294354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014738	AT	3	6	294624	294629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014738	CT	3	6	294845	294850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_014738	AT	3	6	298748	298753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014738	AT	3	6	308376	308381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014738	AT	3	6	309570	309575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014738	TA	3	6	311590	311595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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87	NC_014738	TA	3	6	312898	312903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014738	AT	3	6	326667	326672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014738	AT	3	6	328455	328460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014738	TA	3	6	338136	338141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014738	AT	3	6	338165	338170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014738	AT	3	6	342768	342773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014738	AC	3	6	345429	345434	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_014738	TA	3	6	347885	347890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014738	AT	4	8	353862	353869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014738	TA	3	6	358961	358966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014738	TA	3	6	362400	362405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014738	TA	4	8	362432	362439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014738	CT	3	6	396611	396616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_014738	AG	3	6	410719	410724	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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103	NC_014738	CT	4	8	423800	423807	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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105	NC_014738	AT	3	6	439244	439249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014738	AT	3	6	451585	451590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014738	TA	3	6	469843	469848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014738	AG	3	6	481531	481536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014738	AT	3	6	485263	485268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014738	TA	3	6	485313	485318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014738	AG	3	6	486457	486462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014738	CT	3	6	486537	486542	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_014738	AG	3	6	487068	487073	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014738	TA	4	8	487281	487288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014738	TA	3	6	492150	492155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014738	TA	3	6	497250	497255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014738	TA	3	6	499449	499454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014738	TA	3	6	508957	508962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014738	AT	3	6	514363	514368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014738	TA	3	6	518106	518111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014738	AT	3	6	518503	518508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014738	TA	3	6	518534	518539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014738	TA	3	6	529904	529909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014738	TG	3	6	530089	530094	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014738	AG	3	6	535752	535757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014738	AC	3	6	549651	549656	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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128	NC_014738	AG	3	6	563827	563832	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014738	CT	3	6	563840	563845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_014738	TA	3	6	567089	567094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014738	TA	3	6	567649	567654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014738	AT	3	6	570103	570108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014738	AT	3	6	577944	577949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014738	AT	3	6	580762	580767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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136	NC_014738	AT	3	6	607829	607834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014738	TA	3	6	620071	620076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014738	TA	3	6	621067	621072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014738	TA	3	6	623646	623651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_014738	TA	4	8	624741	624748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014738	AC	4	8	625074	625081	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_014738	TA	3	6	627045	627050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014738	AG	3	6	632875	632880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014738	TA	3	6	636459	636464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014738	AT	3	6	636634	636639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_014738	GA	3	6	656514	656519	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_014738	GA	3	6	659240	659245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.