MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR05

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014737	GCAG	2	8	1195	1202	25 %	0 %	50 %	25 %	313122740
2	NC_014737	GCCA	2	8	1296	1303	25 %	0 %	25 %	50 %	313122740
3	NC_014737	CAGC	2	8	1342	1349	25 %	0 %	25 %	50 %	313122740
4	NC_014737	GTCG	2	8	2053	2060	0 %	25 %	50 %	25 %	313122741
5	NC_014737	GGTC	2	8	2193	2200	0 %	25 %	50 %	25 %	313122741
6	NC_014737	CGGT	2	8	2444	2451	0 %	25 %	50 %	25 %	313122741
7	NC_014737	CCGA	2	8	3207	3214	25 %	0 %	25 %	50 %	313122742
8	NC_014737	CAGC	2	8	3357	3364	25 %	0 %	25 %	50 %	313122743
9	NC_014737	GGGT	2	8	4275	4282	0 %	25 %	75 %	0 %	313122743
10	NC_014737	TGGG	2	8	4897	4904	0 %	25 %	75 %	0 %	313122744
11	NC_014737	CGAC	2	8	5976	5983	25 %	0 %	25 %	50 %	313122746
12	NC_014737	TGGA	2	8	6329	6336	25 %	25 %	50 %	0 %	313122746
13	NC_014737	CCCA	2	8	6404	6411	25 %	0 %	0 %	75 %	313122746
14	NC_014737	GAGG	2	8	6929	6936	25 %	0 %	75 %	0 %	313122746
15	NC_014737	TGAG	2	8	6937	6944	25 %	25 %	50 %	0 %	313122746
16	NC_014737	TCGC	2	8	7006	7013	0 %	25 %	25 %	50 %	313122747
17	NC_014737	CGCT	2	8	7126	7133	0 %	25 %	25 %	50 %	313122747
18	NC_014737	TGGA	2	8	7648	7655	25 %	25 %	50 %	0 %	313122747
19	NC_014737	CTAC	2	8	7769	7776	25 %	25 %	0 %	50 %	313122747
20	NC_014737	GACG	2	8	7852	7859	25 %	0 %	50 %	25 %	313122747
21	NC_014737	TCGC	2	8	8061	8068	0 %	25 %	25 %	50 %	313122747
22	NC_014737	CCGA	2	8	9423	9430	25 %	0 %	25 %	50 %	313122748
23	NC_014737	GCTG	2	8	9895	9902	0 %	25 %	50 %	25 %	313122748
24	NC_014737	CACC	2	8	10659	10666	25 %	0 %	0 %	75 %	313122749
25	NC_014737	GGAA	2	8	10709	10716	50 %	0 %	50 %	0 %	313122749
26	NC_014737	GCCA	2	8	11340	11347	25 %	0 %	25 %	50 %	313122750
27	NC_014737	ACCT	2	8	11715	11722	25 %	25 %	0 %	50 %	313122750
28	NC_014737	TTCG	2	8	12844	12851	0 %	50 %	25 %	25 %	313122751
29	NC_014737	GTGG	2	8	12859	12866	0 %	25 %	75 %	0 %	313122751
30	NC_014737	GGTA	2	8	14461	14468	25 %	25 %	50 %	0 %	313122755
31	NC_014737	TCGT	2	8	15974	15981	0 %	50 %	25 %	25 %	313122758

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.