MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR05

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014737	CG	5	10	50	59	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014737	GC	4	8	105	112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014737	CG	3	6	127	132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014737	AG	4	8	172	179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014737	TC	3	6	185	190	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_014737	TC	3	6	258	263	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014737	CG	3	6	289	294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014737	AC	3	6	457	462	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014737	GC	3	6	479	484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014737	CG	3	6	771	776	0 %	0 %	50 %	50 %	313122740
11	NC_014737	GC	3	6	1251	1256	0 %	0 %	50 %	50 %	313122740
12	NC_014737	TG	3	6	1653	1658	0 %	50 %	50 %	0 %	313122740
13	NC_014737	GA	3	6	1866	1871	50 %	0 %	50 %	0 %	313122741
14	NC_014737	GC	3	6	2668	2673	0 %	0 %	50 %	50 %	313122742
15	NC_014737	CG	3	6	3150	3155	0 %	0 %	50 %	50 %	313122742
16	NC_014737	GC	3	6	3230	3235	0 %	0 %	50 %	50 %	313122742
17	NC_014737	GC	4	8	3721	3728	0 %	0 %	50 %	50 %	313122743
18	NC_014737	CG	3	6	3737	3742	0 %	0 %	50 %	50 %	313122743
19	NC_014737	GC	3	6	4014	4019	0 %	0 %	50 %	50 %	313122743
20	NC_014737	CG	3	6	4918	4923	0 %	0 %	50 %	50 %	313122744
21	NC_014737	CT	3	6	7634	7639	0 %	50 %	0 %	50 %	313122747
22	NC_014737	GA	3	6	8624	8629	50 %	0 %	50 %	0 %	313122747
23	NC_014737	GT	3	6	9212	9217	0 %	50 %	50 %	0 %	313122748
24	NC_014737	GA	3	6	9583	9588	50 %	0 %	50 %	0 %	313122748
25	NC_014737	GA	3	6	9676	9681	50 %	0 %	50 %	0 %	313122748
26	NC_014737	CG	3	6	9813	9818	0 %	0 %	50 %	50 %	313122748
27	NC_014737	CT	3	6	10213	10218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014737	CA	3	6	10768	10773	50 %	0 %	0 %	50 %	313122749
29	NC_014737	AC	3	6	11780	11785	50 %	0 %	0 %	50 %	313122750
30	NC_014737	CG	3	6	11987	11992	0 %	0 %	50 %	50 %	313122750
31	NC_014737	CT	3	6	12444	12449	0 %	50 %	0 %	50 %	313122751
32	NC_014737	CG	3	6	13918	13923	0 %	0 %	50 %	50 %	313122754
33	NC_014737	CG	3	6	13970	13975	0 %	0 %	50 %	50 %	313122754
34	NC_014737	GC	3	6	13994	13999	0 %	0 %	50 %	50 %	313122754
35	NC_014737	CA	4	8	15091	15098	50 %	0 %	0 %	50 %	313122756
36	NC_014737	CG	3	6	15220	15225	0 %	0 %	50 %	50 %	313122757
37	NC_014737	CT	3	6	15752	15757	0 %	50 %	0 %	50 %	313122758
38	NC_014737	GC	3	6	16254	16259	0 %	0 %	50 %	50 %	313122759
39	NC_014737	GC	3	6	16319	16324	0 %	0 %	50 %	50 %	313122759
40	NC_014737	GC	3	6	16775	16780	0 %	0 %	50 %	50 %	313122761
41	NC_014737	TC	3	6	16953	16958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014737	GC	3	6	17039	17044	0 %	0 %	50 %	50 %	313122762

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.