MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR03

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014736	CGAG	2	8	677	684	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014736	CAGT	2	8	12694	12701	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014736	ACCG	2	8	14228	14235	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014736	CTGT	2	8	14429	14436	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014736	CTGT	2	8	14442	14449	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014736	ACTA	2	8	14463	14470	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014736	ACTC	2	8	14532	14539	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014736	TCAC	2	8	14579	14586	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014736	TAAC	2	8	14779	14786	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014736	GGTG	2	8	20445	20452	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014736	TGAT	2	8	20955	20962	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014736	CTAT	2	8	23370	23377	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014736	GCCC	2	8	23573	23580	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_014736	CTGG	2	8	25961	25968	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014736	ATAA	2	8	28444	28451	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014736	CAGT	2	8	29980	29987	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014736	TCGT	2	8	34172	34179	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014736	ATCT	2	8	34252	34259	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014736	AGCC	2	8	34260	34267	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_014736	CGGA	2	8	43279	43286	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014736	ACCG	2	8	44117	44124	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_014736	TCCA	2	8	44184	44191	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014736	CAAT	2	8	46844	46851	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014736	TAAT	2	8	46941	46948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014736	AGTA	2	8	46954	46961	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014736	TTTA	2	8	48538	48545	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014736	CTCA	2	8	49023	49030	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014736	GAAC	2	8	49160	49167	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_014736	GGAG	2	8	49193	49200	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014736	GATA	2	8	50658	50665	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014736	CAAC	2	8	51056	51063	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014736	CTCA	2	8	51079	51086	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014736	TTCT	2	8	51596	51603	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014736	GGTA	2	8	52128	52135	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014736	TCTT	2	8	60388	60395	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014736	CTAT	2	8	61303	61310	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014736	GAAT	2	8	63536	63543	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014736	CGTG	2	8	63549	63556	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014736	CTGT	2	8	64203	64210	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014736	TCTT	2	8	64296	64303	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014736	TTCG	2	8	65579	65586	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_014736	GACC	2	8	65596	65603	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_014736	ATTA	2	8	93309	93316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014736	CTAA	2	8	95123	95130	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_014736	AACA	2	8	99998	100005	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_014736	TGAG	2	8	104869	104876	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014736	GACA	2	8	105155	105162	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014736	CGCT	2	8	105199	105206	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_014736	CATT	2	8	105534	105541	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014736	CGAG	2	8	108619	108626	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014736	ACTG	2	8	109957	109964	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014736	TACC	2	8	110231	110238	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_014736	ATTT	2	8	110278	110285	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014736	GAAC	2	8	110390	110397	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014736	CAGA	2	8	111411	111418	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014736	ACTT	2	8	112940	112947	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_014736	AAAT	2	8	113379	113386	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014736	GATG	2	8	116954	116961	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014736	CACC	2	8	117143	117150	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
60	NC_014736	GAGT	2	8	118221	118228	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014736	GATT	2	8	118509	118516	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014736	CAGA	2	8	118678	118685	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014736	TGAG	2	8	118734	118741	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014736	GTAC	2	8	118840	118847	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_014736	TCTT	2	8	121213	121220	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014736	GTCC	2	8	123128	123135	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_014736	TCAC	2	8	123183	123190	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_014736	TACC	2	8	123512	123519	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014736	TTCT	2	8	126601	126608	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_014736	TGAG	2	8	127464	127471	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014736	ACAA	2	8	135074	135081	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014736	GGCC	2	8	135428	135435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_014736	CGAG	2	8	142455	142462	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014736	CTCA	2	8	142571	142578	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014736	GGTG	2	8	143693	143700	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014736	CTCG	2	8	151487	151494	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_014736	GTGA	2	8	153538	153545	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014736	CTTG	2	8	154405	154412	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014736	CTGT	2	8	154423	154430	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_014736	GTCT	5	20	156920	156939	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_014736	CTAG	2	8	157882	157889	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_014736	GTCG	2	8	158335	158342	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_014736	AGGA	2	8	161310	161317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014736	ACCG	2	8	164023	164030	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_014736	TCAT	2	8	165882	165889	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_014736	GAAT	2	8	170735	170742	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014736	TGCA	2	8	172265	172272	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_014736	CTGT	2	8	172277	172284	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014736	ATCT	2	8	180715	180722	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_014736	GAGT	2	8	180736	180743	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014736	CTGC	2	8	183171	183178	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_014736	ATTG	2	8	185691	185698	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014736	ATTG	2	8	187410	187417	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014736	TGCC	2	8	188752	188759	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_014736	AGAC	2	8	190449	190456	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_014736	TGGC	2	8	190644	190651	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_014736	ACCG	2	8	190762	190769	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_014736	TCCC	2	8	191718	191725	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
99	NC_014736	TCTT	2	8	201998	202005	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_014736	GATT	2	8	203841	203848	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014736	CGTA	2	8	204081	204088	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014736	AGTT	2	8	204198	204205	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014736	ACGG	2	8	204233	204240	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_014736	TGGT	2	8	204492	204499	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.