MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR03

Total Repeats: 399

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014736	AAC	2	6	41	46	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014736	ACA	2	6	95	100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014736	CGT	2	6	216	221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014736	TCT	2	6	245	250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014736	TAT	2	6	258	263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014736	TCG	2	6	461	466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014736	CAT	2	6	501	506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014736	GAT	2	6	741	746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014736	AGA	2	6	768	773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014736	ACC	2	6	2444	2449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_014736	TGT	2	6	2461	2466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014736	GAC	2	6	2702	2707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014736	AGC	2	6	3071	3076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014736	CGA	2	6	3216	3221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014736	GTG	2	6	3289	3294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014736	GTA	2	6	3299	3304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014736	TCG	2	6	3309	3314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014736	GAA	2	6	6793	6798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014736	GAT	2	6	8069	8074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014736	TCA	2	6	8101	8106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014736	TAG	2	6	9601	9606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014736	AAC	2	6	12610	12615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014736	GAC	2	6	12670	12675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014736	CTC	2	6	12708	12713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_014736	ATA	2	6	12818	12823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014736	TAC	2	6	12863	12868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014736	CTC	2	6	14288	14293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_014736	CTG	2	6	14301	14306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014736	CTA	2	6	14344	14349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014736	ATC	2	6	14410	14415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014736	GTC	2	6	14740	14745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014736	TGT	2	6	14752	14757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014736	TGC	2	6	15099	15104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014736	GAG	2	6	15190	15195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014736	ACG	2	6	15207	15212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014736	CGC	2	6	15249	15254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_014736	CGA	2	6	15281	15286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014736	CAT	2	6	15313	15318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014736	CGC	2	6	17548	17553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_014736	TAA	2	6	17569	17574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014736	GAT	2	6	17719	17724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014736	AGT	2	6	17800	17805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014736	CGA	2	6	20012	20017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014736	TTG	2	6	20084	20089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014736	TAG	2	6	20122	20127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014736	TGA	2	6	20170	20175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014736	CGA	3	9	20506	20514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014736	CGT	2	6	20919	20924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014736	ACA	2	6	20995	21000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014736	ACG	2	6	21368	21373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014736	TTA	2	6	21396	21401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014736	GTC	2	6	21407	21412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014736	CAG	2	6	23602	23607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014736	TCT	2	6	23649	23654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014736	CAA	2	6	24781	24786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014736	ACG	2	6	25784	25789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014736	ACA	2	6	25826	25831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014736	GAG	2	6	25864	25869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014736	TCT	2	6	26832	26837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014736	TTG	2	6	28469	28474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014736	TTG	2	6	32201	32206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014736	TAG	2	6	34303	34308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014736	CAT	2	6	34348	34353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014736	TTC	2	6	34832	34837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014736	CGG	2	6	34864	34869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014736	CTC	2	6	36740	36745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_014736	GCG	2	6	36884	36889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014736	TAA	2	6	38376	38381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014736	AGG	2	6	43304	43309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014736	CGA	2	6	44132	44137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014736	GGT	2	6	44144	44149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014736	AGT	2	6	44234	44239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014736	TGG	2	6	44319	44324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014736	GGC	2	6	44592	44597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014736	CGG	2	6	44622	44627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014736	ACG	2	6	46056	46061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014736	AGC	2	6	46170	46175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014736	CGG	2	6	46195	46200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014736	ATC	2	6	46226	46231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014736	CAA	2	6	46239	46244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014736	AAG	2	6	46584	46589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014736	GCT	2	6	47901	47906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014736	TAA	2	6	47951	47956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014736	CTC	2	6	48501	48506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_014736	AGT	2	6	48521	48526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014736	GTT	2	6	48721	48726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014736	TGG	2	6	48752	48757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014736	GCG	2	6	48856	48861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014736	TCC	2	6	48893	48898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_014736	ATT	2	6	48966	48971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014736	CCG	2	6	49557	49562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_014736	CGT	2	6	49564	49569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014736	TCG	3	9	49572	49580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014736	CAC	2	6	49667	49672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_014736	CAA	2	6	49707	49712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014736	ACT	2	6	50459	50464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014736	TCA	2	6	50503	50508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014736	ACA	2	6	50539	50544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014736	TTG	2	6	50816	50821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014736	CGC	2	6	50879	50884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_014736	GAC	2	6	50994	50999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014736	CAT	2	6	51089	51094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014736	TAC	2	6	51104	51109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014736	ACA	2	6	51118	51123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014736	TCG	2	6	51455	51460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014736	GTC	2	6	51498	51503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014736	TCA	2	6	51556	51561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014736	GAC	2	6	51567	51572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014736	AGA	2	6	52111	52116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014736	GAA	2	6	52151	52156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014736	TGA	2	6	52200	52205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014736	CAA	2	6	52231	52236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_014736	ATC	2	6	52268	52273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014736	ACC	2	6	55756	55761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_014736	CGG	2	6	55770	55775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014736	CGT	2	6	55795	55800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014736	CAC	2	6	55814	55819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_014736	ACG	2	6	56336	56341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014736	CTT	2	6	56393	56398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014736	GTT	2	6	56412	56417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014736	CCG	2	6	57124	57129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_014736	ACT	2	6	57139	57144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_014736	TTC	2	6	57158	57163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014736	TTC	2	6	58826	58831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_014736	AAG	2	6	60161	60166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014736	TGT	2	6	60175	60180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014736	TGT	2	6	60186	60191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014736	AGC	2	6	60201	60206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014736	CCG	2	6	60220	60225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_014736	TGA	2	6	63427	63432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014736	ATT	2	6	63503	63508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014736	ACG	2	6	63514	63519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014736	GGT	2	6	63697	63702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014736	CCA	2	6	63789	63794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_014736	ACT	2	6	63810	63815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014736	GAC	2	6	63883	63888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_014736	TAC	2	6	63950	63955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_014736	AAG	2	6	63957	63962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014736	ACT	2	6	63978	63983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.