MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR03

Total Repeats: 2722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014736	GTC	2	6	801	806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122550
2	NC_014736	CGA	2	6	893	898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122550
3	NC_014736	AGC	2	6	922	927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122550
4	NC_014736	CAT	2	6	999	1004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122550
5	NC_014736	GAA	2	6	1008	1013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122550
6	NC_014736	CAC	2	6	1030	1035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122550
7	NC_014736	CCG	2	6	1094	1099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122550
8	NC_014736	TGA	2	6	1112	1117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122550
9	NC_014736	CAG	2	6	1208	1213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122550
10	NC_014736	ATG	2	6	1219	1224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122550
11	NC_014736	CCG	2	6	1264	1269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122550
12	NC_014736	GAC	2	6	1317	1322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122550
13	NC_014736	CGA	2	6	1373	1378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122550
14	NC_014736	CCA	2	6	1395	1400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122550
15	NC_014736	CCA	2	6	1404	1409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122550
16	NC_014736	AGC	2	6	1549	1554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122550
17	NC_014736	TCG	2	6	1580	1585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122550
18	NC_014736	GCA	2	6	1591	1596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122550
19	NC_014736	CGT	2	6	1743	1748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122550
20	NC_014736	GCC	2	6	1755	1760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122550
21	NC_014736	TAG	2	6	1763	1768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122550
22	NC_014736	CGA	2	6	1823	1828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122550
23	NC_014736	GAT	2	6	1881	1886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122550
24	NC_014736	CGG	3	9	2004	2012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122550
25	NC_014736	CCG	2	6	2131	2136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122550
26	NC_014736	ACA	2	6	2176	2181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313122550
27	NC_014736	GAG	2	6	2199	2204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122550
28	NC_014736	ACC	2	6	2210	2215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122550
29	NC_014736	ACG	2	6	2323	2328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122550
30	NC_014736	TCT	2	6	2336	2341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122550
31	NC_014736	CAG	2	6	2806	2811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122551
32	NC_014736	ATC	2	6	2822	2827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122551
33	NC_014736	TCG	2	6	2829	2834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122551
34	NC_014736	TCG	2	6	2973	2978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122551
35	NC_014736	GCG	2	6	3343	3348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122552
36	NC_014736	GCC	2	6	3513	3518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122552
37	NC_014736	TCA	2	6	3662	3667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122552
38	NC_014736	CGA	2	6	3689	3694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122552
39	NC_014736	TCG	2	6	3716	3721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122552
40	NC_014736	TAA	2	6	3747	3752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313122552
41	NC_014736	GAT	2	6	3765	3770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122552
42	NC_014736	CGC	2	6	3771	3776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122552
43	NC_014736	CTT	2	6	3961	3966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122553
44	NC_014736	GAT	2	6	3977	3982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122553
45	NC_014736	CGA	3	9	3991	3999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122553
46	NC_014736	AGA	2	6	4015	4020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122553
47	NC_014736	CGG	2	6	4033	4038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122553
48	NC_014736	ACT	2	6	4041	4046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122553
49	NC_014736	GTG	2	6	4083	4088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122553
50	NC_014736	GTA	2	6	4124	4129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122553
51	NC_014736	GTT	2	6	4130	4135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313122553
52	NC_014736	GAC	2	6	4169	4174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122553
53	NC_014736	TGA	2	6	4183	4188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122553
54	NC_014736	CCT	2	6	4246	4251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122553
55	NC_014736	GAC	2	6	4286	4291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122553
56	NC_014736	CGA	2	6	4360	4365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122553
57	NC_014736	GAA	2	6	4409	4414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122553
58	NC_014736	CAG	2	6	4430	4435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122553
59	NC_014736	CCG	2	6	4485	4490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122553
60	NC_014736	GAT	2	6	4496	4501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122553
61	NC_014736	TGA	2	6	4507	4512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122553
62	NC_014736	GAA	2	6	4622	4627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313122553
63	NC_014736	CGT	2	6	4633	4638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122553
64	NC_014736	ACG	2	6	4642	4647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122553
65	NC_014736	CAG	2	6	4661	4666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122553
66	NC_014736	CCA	2	6	4687	4692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313122553
67	NC_014736	GGA	2	6	4806	4811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313122554
68	NC_014736	TGA	2	6	4812	4817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122554
69	NC_014736	TGA	2	6	4833	4838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122554
70	NC_014736	AGT	2	6	4896	4901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122554
71	NC_014736	CCG	3	9	4931	4939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122554
72	NC_014736	GAT	3	9	4996	5004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122554
73	NC_014736	GCA	2	6	5022	5027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122554
74	NC_014736	GCC	2	6	5072	5077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122554
75	NC_014736	CGT	2	6	5083	5088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122554
76	NC_014736	GTC	2	6	5150	5155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122554
77	NC_014736	GAT	2	6	5161	5166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122554
78	NC_014736	CAT	2	6	5182	5187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122554
79	NC_014736	GAT	2	6	5299	5304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122554
80	NC_014736	CAG	2	6	5311	5316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122554
81	NC_014736	CGC	2	6	5359	5364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122554
82	NC_014736	GTC	2	6	5384	5389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122554
83	NC_014736	GAC	2	6	5410	5415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122554
84	NC_014736	TGA	2	6	5466	5471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122554
85	NC_014736	TCG	2	6	5474	5479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122554
86	NC_014736	CGA	2	6	5565	5570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122554
87	NC_014736	CAG	3	9	5578	5586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122554
88	NC_014736	GCA	2	6	5598	5603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122554
89	NC_014736	CGT	2	6	5658	5663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122554
90	NC_014736	ATT	2	6	5696	5701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313122554
91	NC_014736	CCG	2	6	5822	5827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122555
92	NC_014736	TGT	2	6	5864	5869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313122555
93	NC_014736	CGA	2	6	5912	5917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122555
94	NC_014736	ACG	2	6	5935	5940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122555
95	NC_014736	CGG	2	6	5949	5954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122555
96	NC_014736	CCG	2	6	6019	6024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122555
97	NC_014736	TTG	2	6	6085	6090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313122555
98	NC_014736	TCA	2	6	6167	6172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122555
99	NC_014736	GCC	2	6	6178	6183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122555
100	NC_014736	CAG	2	6	6300	6305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122555
101	NC_014736	CCG	2	6	6358	6363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122555
102	NC_014736	CTC	2	6	6426	6431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122555
103	NC_014736	GCA	2	6	6626	6631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122555
104	NC_014736	CGT	2	6	6633	6638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122555
105	NC_014736	CGA	2	6	6659	6664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122555
106	NC_014736	CGT	2	6	6701	6706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122555
107	NC_014736	CGA	2	6	6713	6718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122555
108	NC_014736	GTC	2	6	6899	6904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122556
109	NC_014736	GAC	2	6	6962	6967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122556
110	NC_014736	TGC	2	6	7017	7022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122556
111	NC_014736	GTC	2	6	7077	7082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122556
112	NC_014736	CGC	2	6	7096	7101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122556
113	NC_014736	CTT	2	6	7102	7107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313122556
114	NC_014736	CCT	2	6	7291	7296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313122556
115	NC_014736	GCA	2	6	7333	7338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122556
116	NC_014736	CGT	2	6	7381	7386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122556
117	NC_014736	CGC	2	6	7400	7405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122556
118	NC_014736	GTC	2	6	7421	7426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122556
119	NC_014736	ACG	2	6	7449	7454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122556
120	NC_014736	ACG	2	6	7456	7461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122556
121	NC_014736	GTC	2	6	7517	7522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122556
122	NC_014736	TGG	2	6	7674	7679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122556
123	NC_014736	CGT	2	6	7795	7800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122556
124	NC_014736	GGT	2	6	7816	7821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122556
125	NC_014736	CGT	2	6	7867	7872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122556
126	NC_014736	CCG	2	6	7917	7922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122556
127	NC_014736	CGC	3	9	7936	7944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122556
128	NC_014736	GTC	2	6	7977	7982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122556
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251	NC_014736	GTT	2	6	17338	17343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313122562
252	NC_014736	TCG	2	6	17366	17371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122562
253	NC_014736	CGG	2	6	17433	17438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122562
254	NC_014736	TGA	2	6	17449	17454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313122562
255	NC_014736	CGC	2	6	17885	17890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122563
256	NC_014736	ACG	2	6	17917	17922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122563
257	NC_014736	CAG	2	6	17928	17933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122563
258	NC_014736	TCG	2	6	17974	17979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122563
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260	NC_014736	GCA	2	6	18111	18116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122563
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282	NC_014736	AAT	2	6	20202	20207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313122566
283	NC_014736	ACG	2	6	20261	20266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122566
284	NC_014736	GGC	2	6	20345	20350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122566
285	NC_014736	CGA	2	6	20354	20359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313122566
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359	NC_014736	ATC	2	6	27136	27141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313122574
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374	NC_014736	GCG	2	6	27701	27706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313122574
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495	NC_014736	TTG	2	6	36343	36348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313122580
496	NC_014736	GTC	2	6	36373	36378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122580
497	NC_014736	TCG	2	6	36454	36459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122580
498	NC_014736	GGT	2	6	36551	36556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313122580
499	NC_014736	TCG	3	9	36580	36588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313122580
500	NC_014736	CCG	2	6	36590	36595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313122580

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